{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA980587\", tax_kingdom = \"Pseudomonadati\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[1269591, "PRJNA980587_P_NODE_6981_length_1077_cov_8.260956_g6423_i0", "PRJNA980587", "6981", "1077", "8.260956", "88.97049612", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "124", "4.54e-30", "", "NR", "MCB0369154.1", "2053517", "g6423", "i0", "48.9", "0.799442896935933", "141", "62", "39", "4", "412", "831", "16", "147", "MCB0369154.1 C39 family peptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "861", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [11159197, "PRJNA980587_P_NODE_54349_length_311_cov_0.945378_g53556_i0", "PRJNA980587", "54349", "311", "0.945378", "2.94012558", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "555", "1.8199999999999994e-153", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g53556", "i0", "99.032", "58.6237942122186", "310", "2", "99", "1", "1", "309", "512008", "512317", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "18232", "555", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [12434492, "PRJNA980587_P_NODE_10250_length_868_cov_2.031447_g9573_i0", "PRJNA980587", "10250", "868", "2.031447", "17.63295996", "Halobacteriovorax sp.", "2020862", "Bacteria", "Bacteria", "201", "1.44e-58", "", "NR", "MBK23259.1", "2020862", "g9573", "i0", "58.6", "2.39861751152074", "174", "70", "59.8", "2", "1", "519", "197", "369", "MBK23259.1 S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase [Halobacteriovorax sp.]", "diamond", "2082", "201", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax sp."], [25182328, "PRJNA980587_P_NODE_81720_length_249_cov_0.875000_g80927_i0", "PRJNA980587", "81720", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "155", "4.9099999999999996e-42", "", "NR", "MBX3021635.1", "2053517", "g80927", "i0", "85.5", "1", "83", "12", "100", "0", "249", "1", "116", "198", "MBX3021635.1 elongation factor G [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "249", "155", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [26804581, "PRJNA980587_P_NODE_51841_length_319_cov_1.252033_g51048_i0", "PRJNA980587", "51841", "319", "1.252033", "3.99398527", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "52.8", "2.69e-5", "", "NR", "MDY0008143.1", "2053517", "g51048", "i0", "36.1", "3.70532915360502", "83", "52", "78.1", "1", "254", "6", "463", "544", "MDY0008143.1 ankyrin repeat domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "1182", "52.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27437313, "PRJNA980587_P_NODE_82563_length_249_cov_0.875000_g81770_i0", "PRJNA980587", "82563", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionia bacterium", "3034169", "Bacteria", "Bacteria", "84", "1.22e-16", "", "NR", "MFL5813012.1", "3034169", "g81770", "i0", "53.8", "0.963855421686747", "80", "35", "96.4", "2", "247", "8", "537", "614", "MFL5813012.1 M3 family metallopeptidase [Bdellovibrionia bacterium]", "diamond", "240", "84", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", null, null, null, "Bdellovibrionia bacterium"], [27531776, "PRJNA980587_P_NODE_75803_length_256_cov_2.295082_g75010_i0", "PRJNA980587", "75803", "256", "2.295082", "5.87540992", "Micavibrio sp.", "2024841", "Bacteria", "Bacteria", "43.9", "0.0176", "", "NR", "MAS87354.1", "2024841", "g75010", "i0", "34.6", "0.94921875", "81", "51", "94.9", "1", "2", "244", "489", "567", "MAS87354.1 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component [Micavibrio sp.]", "diamond", "243", "43.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio sp."], [27595074, "PRJNA980587_P_NODE_92984_length_242_cov_0.911243_g92191_i0", "PRJNA980587", "92984", "242", "0.911243", "2.20520806", "Halobacteriovorax marinus", "97084", "Bacteria", "Bacteria", "69.3", "1.6e-11", "", "NR", "OUR98507.1", "97084", "g92191", "i0", "39.7", "3.86776859504132", "78", "47", "96.7", "0", "235", "2", "852", "929", "OUR98507.1 isoleucine--tRNA ligase [Halobacteriovorax marinus]", "diamond", "936", "69.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax marinus"], [27910401, "PRJNA980587_P_NODE_72025_length_265_cov_1.458333_g71232_i0", "PRJNA980587", "72025", "265", "1.458333", "3.86458245", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "126", "2.4e-34", "", "NR", "MBX3020991.1", "2053517", "g71232", "i0", "75.6", "0.883018867924528", "78", "19", "88.3", "0", "31", "264", "1", "78", "MBX3020991.1 DNA-3-methyladenine glycosylase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "234", "126", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27973812, "PRJNA980587_P_NODE_50845_length_322_cov_1.823293_g50052_i0", "PRJNA980587", "50845", "322", "1.823293", "5.87100346", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "127", "1.23e-31", "", "NR", "MBC7370521.1", "2026715", "g50052", "i0", "55.7", "0.987577639751553", "106", "47", "98.8", "0", "320", "3", "506", "611", "MBC7370521.1 5-histidylcysteine sulfoxide synthase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "318", "127", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28668580, "PRJNA980587_P_NODE_96687_length_225_cov_4.026316_g95894_i0", "PRJNA980587", "96687", "225", "4.026316", "9.059211", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "55.8", "6.71e-7", "", "NR", "MFN8792340.1", "2053517", "g95894", "i0", "69.4", "0.933333333333333", "36", "11", "48", "0", "2", "109", "349", "384", "MFN8792340.1 cystathionine gamma-synthase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "210", "55.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28920867, "PRJNA980587_P_NODE_76288_length_255_cov_1.917582_g75495_i0", "PRJNA980587", "76288", "255", "1.917582", "4.8898341", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "77", "3.59e-14", "", "NR", "WP_015468752.1", "453816", "g75495", "i0", "45.2", "0.988235294117647", "84", "42", "98.8", "2", "253", "2", "298", "377", "WP_015468752.1 thrombospondin type-1 domain-containing protein [Pseudobdellovibrio exovorus]", "diamond", "252", "77", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [29079049, "PRJNA980587_P_NODE_72568_length_264_cov_1.209424_g71775_i0", "PRJNA980587", "72568", "264", "1.209424", "3.19287936", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "63.9", "1.61e-9", "", "NR", "WP_015468758.1", "453816", "g71775", "i0", "47.6", "1.36363636363636", "63", "32", "70.5", "1", "3", "188", "378", "440", "WP_015468758.1 thrombospondin type-1 domain-containing protein [Pseudobdellovibrio exovorus]", "diamond", "360", "63.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [29205377, "PRJNA980587_P_NODE_35169_length_399_cov_2.723926_g34376_i0", "PRJNA980587", "35169", "399", "2.723926", "10.86846474", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "83.6", "1.06e-15", "", "NR", "WP_015468752.1", "453816", "g34376", "i0", "52.1", "0.533834586466165", "71", "32", "51.9", "2", "232", "26", "334", "404", "WP_015468752.1 thrombospondin type-1 domain-containing protein [Pseudobdellovibrio exovorus]", "diamond", "213", "83.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [29741689, "PRJNA980587_P_NODE_66190_length_278_cov_1.502439_g65397_i0", "PRJNA980587", "66190", "278", "1.502439", "4.17678042", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "43.5", "0.0302", "", "NR", "MCM2350925.1", "2081706", "g65397", "i0", "34.9", "0.89568345323741", "83", "45", "79.9", "3", "9", "230", "455", "537", "MCM2350925.1 hypothetical protein [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "249", "43.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [29931640, "PRJNA980587_P_NODE_96031_length_235_cov_2.432099_g95238_i0", "PRJNA980587", "96031", "235", "2.432099", "5.71543265", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "116", "1.12e-30", "", "NR", "MBX9767865.1", "2053517", "g95238", "i0", "66.7", "0.995744680851064", "78", "26", "99.6", "0", "2", "235", "73", "150", "MBX9767865.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "234", "116", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31194845, "PRJNA980587_P_NODE_94595_length_241_cov_0.916667_g93802_i0", "PRJNA980587", "94595", "241", "0.916667", "2.20916747", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "61.6", "7.79e-9", "", "NR", "MCB0393559.1", "2053517", "g93802", "i0", "58.3", "1.3195020746888", "48", "18", "59.8", "1", "155", "12", "45", "90", "MCB0393559.1 biosynthetic arginine decarboxylase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "318", "61.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31897203, "PRJNA980587_P_NODE_89817_length_244_cov_0.900585_g89024_i0", "PRJNA980587", "89817", "244", "0.900585", "2.1974274", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "72", "1.81e-12", "", "NR", "MFN8847391.1", "2053517", "g89024", "i0", "70", "1.95491803278689", "50", "15", "61.5", "0", "155", "6", "1046", "1095", "MFN8847391.1 tail fiber domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "477", "72", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31954277, "PRJNA980587_P_NODE_44137_length_348_cov_1.661818_g43344_i0", "PRJNA980587", "44137", "348", "1.661818", "5.78312664", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "77.4", "8.19e-14", "", "NR", "MFT6069596.1", "2081706", "g43344", "i0", "48.8", "2.12068965517241", "80", "41", "69", "0", "340", "101", "409", "488", "MFT6069596.1 leucyl aminopeptidase [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "738", "77.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [32080860, "PRJNA980587_P_NODE_18678_length_595_cov_1.879310_g17895_i0", "PRJNA980587", "18678", "595", "1.87931", "11.1818945", "Bdellovibrionales bacterium RBG_16_4", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "48.1", "0.0106", "", "NR", "OFZ12118.1", "1797388", "g17895", "i0", "36.9", "0.746218487394958", "65", "41", "32.8", "0", "179", "373", "427", "491", "OFZ12118.1 MAG: hypothetical protein A2Z20_07270 [Bdellovibrionales bacterium RBG_16_40_8]", "diamond", "444", "48.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium RBG_16_40_8"], [32239411, "PRJNA980587_P_NODE_23178_length_519_cov_1.697309_g22387_i0", "PRJNA980587", "23178", "519", "1.697309", "8.80903371", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "90.5", "1.49e-17", "", "NR", "WP_015468752.1", "453816", "g22387", "i0", "55.7", "0.456647398843931", "79", "30", "43.9", "2", "517", "290", "318", "394", "WP_015468752.1 thrombospondin type-1 domain-containing protein [Pseudobdellovibrio exovorus]", "diamond", "237", "90.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 21, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_kingdom\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA980587", "p1": "Pseudomonadati", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA980587", "label": "PRJNA980587", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 20, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 1, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA980587&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 336.5832210001827}