{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA929922\", tax_kingdom = \"Pseudomonadati\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[6011826, "PRJNA929922_S_NODE_58765_length_254_cov_3.513812_g58541_i0", "PRJNA929922", "58765", "254", "3.513812", "8.92508248", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "372", "1.56e-98", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g58541", "i0", "96.053", "91.2637795275591", "228", "9", "90", "0", "21", "248", "1292537", "1292764", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "23181", "372", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [6357658, "PRJNA929922_P_NODE_159045_length_242_cov_0.911243_g158505_i0", "PRJNA929922", "159045", "242", "0.911243", "2.20520806", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "132", "1.3e-34", "", "NR", "MBS1962476.1", "2053517", "g158505", "i0", "81.3", "0.991735537190083", "80", "15", "99.2", "0", "3", "242", "237", "316", "MBS1962476.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "240", "132", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [26905495, "PRJNA929922_P_NODE_149941_length_243_cov_0.905882_g149401_i0", "PRJNA929922", "149941", "243", "0.905882", "2.20129326", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "53.5", "4.77e-6", "", "NR", "WP_338635669.1", "495820", "g149401", "i0", "48.9", "2.34567901234568", "47", "24", "58", "0", "221", "81", "59", "105", "WP_338635669.1 IS66 family transposase [Spirobacillus cienkowskii]", "diamond", "570", "53.9", "0.992578849721707", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", null, "Spirobacillus", "Spirobacillus cienkowskii"], [26930001, "PRJNA929922_P_NODE_117402_length_249_cov_0.875000_g116862_i0", "PRJNA929922", "117402", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionales bacterium GWB1_55_8", "1797386", "Bacteria", "Bacteria", "111", "1.63e-26", "", "NR", "OFZ21655.1", "1797386", "g116862", "i0", "63.4", "1.97590361445783", "82", "30", "98.8", "0", "3", "248", "318", "399", "OFZ21655.1 MAG: hypothetical protein A2X94_07850 [Bdellovibrionales bacterium GWB1_55_8]", "diamond", "492", "111", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium GWB1_55_8"], [27119452, "PRJNA929922_P_NODE_134042_length_246_cov_0.890173_g133502_i0", "PRJNA929922", "134042", "246", "0.890173", "2.18982558", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "43.9", "0.00143", "", "NR", "WP_088565424.1", "959", "g133502", "i0", "46.3", "0.658536585365854", "54", "24", "65.9", "1", "176", "15", "10", "58", "WP_088565424.1 hypothetical protein [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "162", "43.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [27246112, "PRJNA929922_P_NODE_112463_length_250_cov_0.870056_g111923_i0", "PRJNA929922", "112463", "250", "0.870056", "2.17514", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "48.5", "1.55e-4", "", "NR", "WP_413941755.1", "3394362", "g111923", "i0", "32.2", "0.708", "59", "40", "70.8", "0", "180", "4", "32", "90", "WP_413941755.1 hypothetical protein [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "177", "48.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [27625350, "PRJNA929922_P_NODE_163164_length_241_cov_0.916667_g162624_i0", "PRJNA929922", "163164", "241", "0.916667", "2.20916747", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "70.9", "1.73e-13", "", "NR", "MBS1961324.1", "2053517", "g162624", "i0", "81", "0.522821576763486", "42", "8", "52.3", "0", "111", "236", "1", "42", "MBS1961324.1 helix-turn-helix domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "126", "70.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28509293, "PRJNA929922_P_NODE_117887_length_249_cov_0.875000_g117347_i0", "PRJNA929922", "117887", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "146", "1.28e-41", "", "NR", "MFN8792081.1", "2053517", "g117347", "i0", "78", "0.987951807228916", "82", "18", "98.8", "0", "2", "247", "26", "107", "MFN8792081.1 N-formylglutamate amidohydrolase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "246", "146", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28572376, "PRJNA929922_P_NODE_75747_length_284_cov_1.284360_g75207_i0", "PRJNA929922", "75747", "284", "1.28436", "3.6475824", "Halobacteriovoraceae bacterium", "2026745", "Bacteria", "Bacteria", "44.3", "0.0153", "", "NR", "MCB9095004.1", "2026745", "g75207", "i0", "30.8", "0.823943661971831", "78", "46", "73.9", "2", "257", "48", "43", "120", "MCB9095004.1 Fpg/Nei family DNA glycosylase [Halobacteriovoraceae bacterium]", "diamond", "234", "44.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", null, "Halobacteriovoraceae bacterium"], [28730301, "PRJNA929922_P_NODE_111787_length_250_cov_0.870056_g111247_i0", "PRJNA929922", "111787", "250", "0.870056", "2.17514", "Bdellovibrio sp. ArHS", "1569284", "Bacteria", "Bacteria", "100", "3.28e-25", "", "NR", "WP_041875367.1", "1569284", "g111247", "i0", "75", "0.816", "68", "17", "81.6", "0", "46", "249", "1", "68", "WP_041875367.1 helix-turn-helix domain-containing protein [Bdellovibrio sp. ArHS]", "diamond", "204", "100", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. ArHS"], [29772049, "PRJNA929922_P_NODE_148251_length_244_cov_0.877193_g147711_i0", "PRJNA929922", "148251", "244", "0.877193", "2.14035092", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "60.1", "2.9e-8", "", "NR", "MBY0314976.1", "2053517", "g147711", "i0", "47.2", "0.885245901639344", "72", "37", "87.3", "1", "26", "238", "3", "74", "MBY0314976.1 response regulator [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "216", "60.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30600602, "PRJNA929922_P_NODE_123433_length_248_cov_0.880000_g122893_i0", "PRJNA929922", "123433", "248", "0.88", "2.1824", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "140", "7.73e-37", "", "NR", "WP_291515649.1", "1569284", "g122893", "i0", "73.8", "3.89516129032258", "80", "21", "96.8", "0", "4", "243", "359", "438", "WP_291515649.1 S8 family serine peptidase [Bdellovibrio sp. ArHS]", "diamond", "966", "140", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. ArHS"], [30846418, "PRJNA929922_P_NODE_138654_length_245_cov_0.895349_g138114_i0", "PRJNA929922", "138654", "245", "0.895349", "2.19360505", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "140", "1.11e-38", "", "NR", "MBX3021331.1", "2053517", "g138114", "i0", "86.4", "2.97551020408163", "81", "11", "99.2", "0", "1", "243", "85", "165", "MBX3021331.1 class II fructose-bisphosphatase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "729", "140", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31295864, "PRJNA929922_P_NODE_120355_length_249_cov_0.875000_g119815_i0", "PRJNA929922", "120355", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "109", "1.07e-25", "", "NR", "WP_374074268.1", "959", "g119815", "i0", "57.8", "6.96385542168675", "83", "35", "100", "0", "1", "249", "410", "492", "WP_374074268.1 transglycosylase SLT domain-containing protein [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "1734", "110", "0.990909090909091", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [32174760, "PRJNA929922_P_NODE_144498_length_244_cov_0.900585_g143958_i0", "PRJNA929922", "144498", "244", "0.900585", "2.1974274", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "52", "2e-5", "", "NR", "MFN7685340.1", "2599941", "g143958", "i0", "43.1", "2.54508196721311", "65", "37", "79.9", "0", "230", "36", "363", "427", "MFN7685340.1 reverse transcriptase domain-containing protein [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "621", "52", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [32269654, "PRJNA929922_P_NODE_123158_length_248_cov_0.880000_g122618_i0", "PRJNA929922", "123158", "248", "0.88", "2.1824", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "100", "2.67e-23", "", "NR", "PZQ46810.1", "349221", "g122618", "i0", "76.7", "0.883064516129032", "73", "14", "88.3", "1", "1", "219", "126", "195", "PZQ46810.1 MAG: ostA-like family protein [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "219", "100", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [32491140, "PRJNA929922_P_NODE_137079_length_246_cov_0.890173_g136539_i0", "PRJNA929922", "137079", "246", "0.890173", "2.18982558", "Oligoflexus sp.", "1971216", "Bacteria", "Bacteria", "110", "5.62e-26", "", "NR", "WP_324952854.1", "1971216", "g136539", "i0", "60.5", "1.97560975609756", "81", "32", "98.8", "0", "244", "2", "88", "168", "WP_324952854.1 M1 family aminopeptidase [Oligoflexus sp.]", "diamond", "486", "110", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Oligoflexaceae", "Oligoflexus", "Oligoflexus sp."]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 17, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_kingdom\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA929922", "p1": "Pseudomonadati", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA929922", "label": "PRJNA929922", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 1, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929922&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 328.97956399938266}