{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA853203\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[841435, "PRJNA853203_P_NODE_30581_length_251_cov_0.876404_g30432_i0", "PRJNA853203", "30581", "251", "0.876404", "2.19977404", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "91.7", "1.5700000000000001e-19", "", "NR", "MCC7405359.1", "2053517", "g30432", "i0", "50.6", "1.67330677290837", "83", "41", "99.2", "0", "3", "251", "81", "163", "MCC7405359.1 S8 family serine peptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "420", "91.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [2116967, "PRJNA853203_P_NODE_5142_length_333_cov_0.900000_g4993_i0", "PRJNA853203", "5142", "333", "0.9", "2.997", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "333", "1e-86", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g4993", "i0", "85.849", "4.94294294294294", "318", "40", "95", "3", "1", "317", "3251283", "3251596", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "1646", "333", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [10163238, "PRJNA853203_P_NODE_50368_length_203_cov_4.230769_g50219_i0", "PRJNA853203", "50368", "203", "4.230769", "8.58846107", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "130", "6.62e-34", "", "NR", "MBY0517277.1", "2081706", "g50219", "i0", "92.5", "0.990147783251232", "67", "5", "99", "0", "3", "203", "63", "129", "MBY0517277.1 sodium:alanine symporter family protein [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "201", "130", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [17419786, "PRJNA853203_P_NODE_49094_length_234_cov_2.881988_g48945_i0", "PRJNA853203", "49094", "234", "2.881988", "6.74385192", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "74.3", "9.06e-14", "", "NR", "MFL5785836.1", "2081706", "g48945", "i0", "63.5", "0.666666666666667", "52", "19", "66.7", "0", "5", "160", "193", "244", "MFL5785836.1 DNA-formamidopyrimidine glycosylase family protein [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "156", "74.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [21636764, "PRJNA853203_P_NODE_32157_length_250_cov_0.881356_g32008_i0", "PRJNA853203", "32157", "250", "0.881356", "2.20339", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "126", "6.25e-33", "", "NR", "MCC7403422.1", "2053517", "g32008", "i0", "71.6", "1.908", "81", "23", "97.2", "0", "248", "6", "252", "332", "MCC7403422.1 D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "477", "126", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27149413, "PRJNA853203_P_NODE_41262_length_245_cov_0.906977_g41113_i0", "PRJNA853203", "41262", "245", "0.906977", "2.22209365", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "86.3", "2.54e-19", "", "NR", "MBY0415735.1", "2053517", "g41113", "i0", "50.6", "0.991836734693878", "81", "40", "99.2", "0", "243", "1", "21", "101", "MBY0415735.1 universal stress protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "243", "86.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27347898, "PRJNA853203_P_NODE_43023_length_244_cov_1.257310_g42874_i0", "PRJNA853203", "43023", "244", "1.25731", "3.0678364", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "119", "1.05e-31", "", "NR", "WP_284605181.1", "958", "g42874", "i0", "65.4", "9.95901639344262", "81", "28", "99.6", "0", "2", "244", "74", "154", "WP_284605181.1 MULTISPECIES: HIT family protein [Bdellovibrio]", "diamond", "2430", "119", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", null], [27844536, "PRJNA853203_P_NODE_17724_length_271_cov_1.424242_g17575_i0", "PRJNA853203", "17724", "271", "1.424242", "3.8596958200000002", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "65.5", "5.03e-10", "", "NR", "MBX3021255.1", "2053517", "g17575", "i0", "50.8", "0.675276752767528", "61", "30", "67.5", "0", "184", "2", "17", "77", "MBX3021255.1 oligosaccharide flippase family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "183", "65.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28286536, "PRJNA853203_P_NODE_21146_length_264_cov_1.062827_g20997_i0", "PRJNA853203", "21146", "264", "1.062827", "2.80586328", "Halobacteriovorax sp. HLS", "2234000", "Bacteria", "Bacteria", "90.5", "7.99e-20", "", "NR", "WP_127716242.1", "2234000", "g20997", "i0", "58.1", "0.840909090909091", "74", "27", "84.1", "1", "250", "29", "26", "95", "WP_127716242.1 substrate-binding periplasmic protein [Halobacteriovorax sp. HLS]", "diamond", "222", "90.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax sp. HLS"], [28349880, "PRJNA853203_P_NODE_46386_length_243_cov_0.858824_g46237_i0", "PRJNA853203", "46386", "243", "0.858824", "2.08694232", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "55.8", "4.71e-7", "", "NR", "MBX3021024.1", "2053517", "g46237", "i0", "71.4", "0.432098765432099", "35", "10", "43.2", "0", "106", "2", "1", "35", "MBX3021024.1 endonuclease III [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "105", "55.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28484448, "PRJNA853203_P_NODE_26766_length_253_cov_0.866667_g26617_i0", "PRJNA853203", "26766", "253", "0.866667", "2.19266751", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "80.9", "4.48e-16", "", "NR", "WP_374074901.1", "958", "g26617", "i0", "51.2", "2.05138339920949", "86", "40", "99.6", "2", "2", "253", "59", "144", "WP_374074901.1 MULTISPECIES: cysteine hydrolase family protein [Bdellovibrio]", "diamond", "519", "81.3", "0.995079950799508", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", null], [29013259, "PRJNA853203_P_NODE_10068_length_289_cov_1.199074_g9919_i0", "PRJNA853203", "10068", "289", "1.199074", "3.46532386", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "137", "5.87e-40", "", "NR", "MBX3040068.1", "2026715", "g9919", "i0", "72.8", "0.84083044982699", "81", "22", "84.1", "0", "253", "11", "4", "84", "MBX3040068.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "243", "137", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [29139555, "PRJNA853203_P_NODE_40589_length_245_cov_2.250000_g40440_i0", "PRJNA853203", "40589", "245", "2.25", "5.5125", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "174", "1.77e-50", "", "NR", "WP_408098179.1", "3383025", "g40440", "i0", "96.3", "0.991836734693878", "81", "3", "99.2", "0", "245", "3", "28", "108", "WP_408098179.1 acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit [Peredibacter sp. HCB2-198]", "diamond", "243", "174", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [29833887, "PRJNA853203_P_NODE_45391_length_243_cov_0.917647_g45242_i0", "PRJNA853203", "45391", "243", "0.917647", "2.22988221", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "68.2", "2.59e-11", "", "NR", "WP_015470256.1", "453816", "g45242", "i0", "60", "1.45679012345679", "60", "17", "71.6", "2", "1", "174", "239", "293", "WP_015470256.1 tRNA pseudouridine(55) synthase TruB [Pseudobdellovibrio exovorus]", "diamond", "354", "68.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [29991896, "PRJNA853203_P_NODE_35111_length_248_cov_1.782857_g34962_i0", "PRJNA853203", "35111", "248", "1.782857", "4.42148536", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "102", "4.06e-25", "", "NR", "MBX3022022.1", "2053517", "g34962", "i0", "64.1", "0.943548387096774", "78", "28", "94.4", "0", "247", "14", "28", "105", "MBX3022022.1 prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "234", "102", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30371420, "PRJNA853203_P_NODE_20852_length_264_cov_1.633508_g20703_i0", "PRJNA853203", "20852", "264", "1.633508", "4.31246112", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "87.8", "6.76e-18", "", "NR", "HVK62061.1", "2053517", "g20703", "i0", "55.3", "0.965909090909091", "85", "36", "96.6", "1", "259", "5", "889", "971", "HVK62061.1 Ig-like domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "255", "87.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30600231, "PRJNA853203_P_NODE_18473_length_269_cov_1.897959_g18324_i0", "PRJNA853203", "18473", "269", "1.897959", "5.10550971", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "164", "3.12e-50", "", "NR", "MBC7466343.1", "28201", "g18324", "i0", "84.3", "1.98513011152416", "89", "14", "99.3", "0", "267", "1", "34", "122", "MBC7466343.1 Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "534", "165", "0.993939393939394", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [30750174, "PRJNA853203_P_NODE_15334_length_276_cov_1.605911_g15185_i0", "PRJNA853203", "15334", "276", "1.605911", "4.43231436", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "125", "1.1699999999999998e-31", "", "NR", "MEK6773043.1", "3034175", "g15185", "i0", "63.7", "0.989130434782609", "91", "33", "98.9", "0", "4", "276", "105", "195", "MEK6773043.1 metallophosphoesterase [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "273", "125", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [30758375, "PRJNA853203_P_NODE_20254_length_266_cov_1.025907_g20105_i0", "PRJNA853203", "20254", "266", "1.025907", "2.72891262", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "114", "4.44e-27", "", "NR", "MBC7692375.1", "2599941", "g20105", "i0", "81.2", "2.33458646616541", "69", "13", "77.8", "0", "59", "265", "327", "395", "MBC7692375.1 fatty acid oxidation complex subunit alpha FadB [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "621", "115", "0.991304347826087", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [30844997, "PRJNA853203_P_NODE_45714_length_243_cov_0.917647_g45565_i0", "PRJNA853203", "45714", "243", "0.917647", "2.22988221", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "137", "4.5299999999999997e-38", "", "NR", "HMN69334.1", "2053517", "g45565", "i0", "78.8", "2.93827160493827", "80", "17", "98.8", "0", "2", "241", "81", "160", "HMN69334.1 type I methionyl aminopeptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "714", "137", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31002971, "PRJNA853203_P_NODE_30114_length_251_cov_0.915730_g29965_i0", "PRJNA853203", "30114", "251", "0.91573", "2.2984823", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "108", "1.6700000000000002e-26", "", "NR", "MBX3021415.1", "2053517", "g29965", "i0", "65", "0.956175298804781", "80", "27", "95.6", "1", "3", "242", "113", "191", "MBX3021415.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "240", "108", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31382353, "PRJNA853203_P_NODE_46956_length_242_cov_1.325444_g46807_i0", "PRJNA853203", "46956", "242", "1.325444", "3.20757448", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "122", "1.16e-30", "", "NR", "MDQ3235709.1", "2026715", "g46807", "i0", "72.8", "1.00413223140496", "81", "21", "99.2", "1", "241", "2", "338", "418", "MDQ3235709.1 O-antigen ligase family protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "243", "122", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [32394646, "PRJNA853203_P_NODE_32419_length_250_cov_0.881356_g32270_i0", "PRJNA853203", "32419", "250", "0.881356", "2.20339", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "45.4", "0.00447", "", "NR", "MBX2988663.1", "2026715", "g32270", "i0", "35.9", "0.936", "78", "46", "92.4", "3", "19", "249", "6", "80", "MBX2988663.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "234", "45.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [32646922, "PRJNA853203_P_NODE_30960_length_251_cov_0.876404_g30811_i0", "PRJNA853203", "30960", "251", "0.876404", "2.19977404", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "84", "1.27e-16", "", "NR", "MBA2404122.1", "2053517", "g30811", "i0", "86.5", "0.621513944223108", "52", "7", "62.2", "0", "250", "95", "128", "179", "MBA2404122.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "156", "84", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 24, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA853203", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA853203", "label": "PRJNA853203", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 1, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA853203", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 219.6556180006155}