{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA846086\" and tax_phylum = \"Spirochaetota\"", "rows": [[2108334, "PRJNA846086_P_NODE_4042_length_247_cov_0.885057_g3976_i0", "PRJNA846086", "4042", "247", "0.885057", "2.18609079", "Treponema denticola", "158", "Bacteria", "Bacteria", "429", "8.83e-116", "", "NTclustered", "gi|2265166044|gb|CP051303.1|", "158", "g3976", "i0", "97.976", "19.0485829959514", "247", "5", "100", "0", "1", "247", "1156555", "1156801", "Treponema denticola strain OT2B chromosome, complete genome", "blastn", "4705", "429", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [2108342, "PRJNA846086_P_NODE_4442_length_245_cov_1.540698_g4376_i0", "PRJNA846086", "4442", "245", "1.540698", "3.7747101", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "329", "9.12e-86", "", "NTclustered", "gi|2265115921|gb|CP051153.1|", "69710", "g4376", "i0", "91.02", "7.48571428571429", "245", "21", "100", "1", "1", "245", "551882", "551639", "Treponema vincentii strain OMZ 862 chromosome, complete genome", "blastn", "1834", "329", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [3783091, "PRJNA846086_P_NODE_1643_length_297_cov_0.888393_g1577_i0", "PRJNA846086", "1643", "297", "0.888393", "2.63852721", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "531", "2.9099999999999992e-146", "", "NTclustered", "gi|285184822|gb|GU420695.1|", "51160", "g1577", "i0", "98.986", "99.7340067340067", "296", "3", "99", "0", "2", "297", "200", "495", "Treponema maltophilum clone GF004 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "29621", "531", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"], [5936021, "PRJNA846086_P_NODE_2205_length_275_cov_1.301980_g2139_i0", "PRJNA846086", "2205", "275", "1.30198", "3.580445", "Brucepastera parasyntrophica", "2880008", "Bacteria", "Bacteria", "54.7", "0.007", "", "NTclustered", "gi|2198899484|gb|CP084606.1|", "2880008", "g2139", "i0", "100", "0.221818181818182", "29", "0", "12", "0", "85", "113", "553531", "553503", "Brucepastera parasyntrophica strain RmG11 chromosome, complete genome", "blastn", "61", "54.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Brucepastera", "Brucepastera parasyntrophica"], [8485744, "PRJNA846086_P_NODE_727_length_433_cov_2.272222_g661_i0", "PRJNA846086", "727", "433", "2.272222", "9.83872126", "Treponema denticola", "158", "Bacteria", "Bacteria", "750", "0", "", "NTclustered", "gi|2265172126|gb|CP051522.1|", "158", "g661", "i0", "97.926", "182.713625866051", "434", "7", "100", "2", "1", "433", "513806", "513374", "Treponema denticola strain OMZ 910 chromosome, complete genome", "blastn", "79115", "750", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [9760899, "PRJNA846086_P_NODE_2868_length_256_cov_1.327869_g2802_i0", "PRJNA846086", "2868", "256", "1.327869", "3.39934464", "Treponema sp. OMZ 906", "2563662", "Bacteria", "Bacteria", "374", "4.369999999999998e-99", "", "NTclustered", "gi|2265130757|gb|CP051196.1|", "2563662", "g2802", "i0", "94.606", "10.390625", "241", "13", "94", "0", "1", "241", "930621", "930861", "Treponema sp. OMZ 906 chromosome, complete genome", "blastn", "2660", "374", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. OMZ 906"], [10159738, "PRJNA846086_P_NODE_4208_length_246_cov_0.890173_g4142_i0", "PRJNA846086", "4208", "246", "0.890173", "2.18982558", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "433", "6.79e-117", "", "NTclustered", "gi|719625061|gb|CP009227.1|", "1539298", "g4142", "i0", "98.374", "29.8333333333333", "246", "4", "100", "0", "1", "246", "1066361", "1066116", "Treponema sp. OMZ 838, complete genome", "blastn", "7339", "433", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. OMZ 838"], [11036549, "PRJNA846086_P_NODE_3009_length_251_cov_1.612360_g2943_i0", "PRJNA846086", "3009", "251", "1.61236", "4.0470236", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "176", "1.2899999999999999e-39", "", "NTclustered", "gi|2265136109|gb|CP051197.1|", "69710", "g2943", "i0", "85.294", "5.02788844621514", "170", "25", "68", "0", "1", "170", "1484938", "1484769", "Treponema vincentii strain OMZ 802 chromosome, complete genome", "blastn", "1262", "176", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [11435018, "PRJNA846086_P_NODE_4429_length_245_cov_1.784884_g4363_i0", "PRJNA846086", "4429", "245", "1.784884", "4.3729658", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "383", "6.899999999999998e-102", "", "NTclustered", "gi|2265199313|gb|CP058624.1|", "158", "g4363", "i0", "99.524", "72.8326530612245", "210", "1", "100", "0", "1", "210", "2740608", "2740399", "Treponema denticola strain OMZ 854 chromosome, complete genome", "blastn", "17844", "383", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [12710838, "PRJNA846086_P_NODE_4490_length_245_cov_0.895349_g4424_i0", "PRJNA846086", "4490", "245", "0.895349", "2.19360505", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "425", "1.1299999999999999e-114", "", "NTclustered", "gi|2265168914|gb|CP051304.1|", "158", "g4424", "i0", "97.959", "19.8448979591837", "245", "5", "100", "0", "1", "245", "2231376", "2231620", "Treponema denticola strain CD-1 chromosome, complete genome", "blastn", "4862", "425", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [13586475, "PRJNA846086_P_NODE_1331_length_325_cov_2.738095_g1265_i0", "PRJNA846086", "1331", "325", "2.738095", "8.89880875", "Treponema socranskii", "53419", "Bacteria", "Bacteria", "475", "1.53e-129", "", "NTclustered", "gi|1868715119|emb|LR796240.1|", "69713", "g1265", "i0", "93.189", "183.338461538462", "323", "22", "99", "0", "3", "325", "790166", "789844", "Treponema socranskii subsp. buccale strain Marseille-CSURQ0203 genome assembly, chromosome: contig00001", "blastn", "59585", "475", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema socranskii"], [14860776, "PRJNA846086_P_NODE_3552_length_249_cov_0.875000_g3486_i0", "PRJNA846086", "3552", "249", "0.875", "2.17875", "Treponema denticola", "158", "Bacteria", "Bacteria", "460", "3.16e-125", "", "NTclustered", "gi|2277007739|gb|CP038800.1|", "158", "g3486", "i0", "100", "1", "249", "0", "100", "0", "1", "249", "2753141", "2752893", "Treponema denticola strain ATCC 700768 chromosome, complete genome", "blastn", "249", "460", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [15259190, "PRJNA846086_P_NODE_1132_length_348_cov_4.349091_g1066_i0", "PRJNA846086", "1132", "348", "4.349091", "15.13483668", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "604", "2.0199999999999992e-168", "", "NTclustered", "gi|1996296230|gb|CP031393.1|", "58231", "g1066", "i0", "97.989", "182.772988505747", "348", "7", "100", "0", "1", "348", "1014322", "1013975", "Treponema medium strain ATCC 700293 chromosome, complete genome", "blastn", "63605", "610", "0.99016393442623", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [16135603, "PRJNA846086_P_NODE_4873_length_244_cov_0.900585_g4807_i0", "PRJNA846086", "4873", "244", "0.900585", "2.1974274", "Treponema denticola", "158", "Bacteria", "Bacteria", "451", "1.86e-122", "", "NTclustered", "gi|2265190365|gb|CP054477.1|", "158", "g4807", "i0", "100", "24.3524590163934", "244", "0", "100", "0", "1", "244", "1161788", "1162031", "Treponema denticola strain OMZ 823 chromosome, complete genome", "blastn", "5942", "451", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [16135606, "PRJNA846086_P_NODE_5013_length_243_cov_0.905882_g4947_i0", "PRJNA846086", "5013", "243", "0.905882", "2.20129326", "Treponema sp. Marseille-Q4132", "2766701", "Bacteria", "Bacteria", "366", "6.89e-97", "", "NTclustered", "gi|1897717435|gb|CP060591.1|", "2766701", "g4947", "i0", "93.827", "2.94650205761317", "243", "15", "100", "0", "1", "243", "791370", "791612", "Treponema sp. Marseille-Q4132 chromosome", "blastn", "716", "366", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q4132"], [16135621, "PRJNA846086_P_NODE_5713_length_238_cov_2.181818_g5647_i0", "PRJNA846086", "5713", "238", "2.181818", "5.19272684", "Treponema parvum", "138851", "Bacteria", "Bacteria", "222", "1.54e-53", "", "NTclustered", "gi|2023444933|gb|CP054257.1|", "138851", "g5647", "i0", "85.714", "182.90756302521", "217", "24", "89", "7", "27", "238", "1518107", "1517893", "Treponema parvum strain ATCC 700773 chromosome, complete genome", "blastn", "43532", "222", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema parvum"], [16533805, "PRJNA846086_P_NODE_2753_length_259_cov_1.435484_g2687_i0", "PRJNA846086", "2753", "259", "1.435484", "3.71790356", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "457", "4.279999999999999e-124", "", "NTclustered", "gi|2265181513|gb|CP051634.1|", "158", "g2687", "i0", "98.456", "9.98455598455598", "259", "4", "100", "0", "1", "259", "93236", "93494", "Treponema denticola strain OMZ 850 chromosome, complete genome", "blastn", "2586", "457", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [17411037, "PRJNA846086_P_NODE_2334_length_271_cov_1.252525_g2268_i0", "PRJNA846086", "2334", "271", "1.252525", "3.39434275", "Treponema socranskii", "53419", "Bacteria", "Bacteria", "484", "2.07e-132", "", "NTclustered", "gi|2265187740|gb|CP054258.1|", "69713", "g2268", "i0", "98.893", "160.49815498155", "271", "3", "100", "0", "1", "271", "908134", "907864", "Treponema socranskii subsp. buccale strain ATCC 35534 chromosome, complete genome", "blastn", "43495", "484", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema socranskii"], [17411053, "PRJNA846086_P_NODE_3394_length_250_cov_0.870056_g3328_i0", "PRJNA846086", "3394", "250", "0.870056", "2.17514", "Treponema denticola", "158", "Bacteria", "Bacteria", "429", "8.949999999999998e-116", "", "NTclustered", "gi|2265190365|gb|CP054477.1|", "158", "g3328", "i0", "97.6", "29.904", "250", "6", "100", "0", "1", "250", "2019848", "2019599", "Treponema denticola strain OMZ 823 chromosome, complete genome", "blastn", "7476", "429", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [18684141, "PRJNA846086_P_NODE_4055_length_247_cov_0.885057_g3989_i0", "PRJNA846086", "4055", "247", "0.885057", "2.18609079", "Treponema sp. Marseille-Q4132", "2766701", "Bacteria", "Bacteria", "412", "8.89e-111", "", "NTclustered", "gi|1897717435|gb|CP060591.1|", "2766701", "g3989", "i0", "96.761", "2.2995951417004", "247", "8", "100", "0", "1", "247", "2027725", "2027971", "Treponema sp. Marseille-Q4132 chromosome", "blastn", "568", "412", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q4132"], [19959246, "PRJNA846086_P_NODE_1436_length_315_cov_2.223140_g1370_i0", "PRJNA846086", "1436", "315", "2.22314", "7.002891", "Treponema parvum", "138851", "Bacteria", "Bacteria", "254", "7.53e-63", "", "NTclustered", "gi|2023449428|gb|CP058315.1|", "138851", "g1370", "i0", "81.935", "92.9460317460317", "310", "47", "97", "9", "9", "315", "1097575", "1097272", "Treponema parvum strain OMZ 843 chromosome, complete genome", "blastn", "29278", "254", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema parvum"], [19959287, "PRJNA846086_P_NODE_3596_length_249_cov_0.875000_g3530_i0", "PRJNA846086", "3596", "249", "0.875", "2.17875", "Treponema parvum", "138851", "Bacteria", "Bacteria", "455", "1.47e-123", "", "NTclustered", "gi|2023447176|gb|CP054142.1|", "138851", "g3530", "i0", "99.598", "3.21686746987952", "249", "1", "100", "0", "1", "249", "2417567", "2417815", "Treponema parvum strain ATCC 700770 chromosome, complete genome", "blastn", "801", "455", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema parvum"], [19959305, "PRJNA846086_P_NODE_4476_length_245_cov_0.895349_g4410_i0", "PRJNA846086", "4476", "245", "0.895349", "2.19360505", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "300", "7.15e-77", "", "NTclustered", "gi|2265115921|gb|CP051153.1|", "69710", "g4410", "i0", "88.538", "2.94285714285714", "253", "21", "100", "2", "1", "245", "2558528", "2558276", "Treponema vincentii strain OMZ 862 chromosome, complete genome", "blastn", "721", "300", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [19959317, "PRJNA846086_P_NODE_5216_length_242_cov_0.911243_g5150_i0", "PRJNA846086", "5216", "242", "0.911243", "2.20520806", "Treponema socranskii", "53419", "Bacteria", "Bacteria", "399", "6.759999999999999e-107", "", "NTclustered", "gi|1868715119|emb|LR796240.1|", "69713", "g5150", "i0", "96.667", "2.98347107438017", "240", "8", "99", "0", "1", "240", "678045", "677806", "Treponema socranskii subsp. buccale strain Marseille-CSURQ0203 genome assembly, chromosome: contig00001", "blastn", "722", "399", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema socranskii"], [21234931, "PRJNA846086_P_NODE_2877_length_255_cov_2.181319_g2811_i0", "PRJNA846086", "2877", "255", "2.181319", "5.56236345", "Treponema sp. 5:22:BH022", "105290", "Bacteria", "Bacteria", "438", "1.52e-118", "", "NTclustered", "gi|6049690|gb|AF182837.1|AF182837", "105290", "g2811", "i0", "97.647", "97.1098039215686", "255", "6", "100", "0", "1", "255", "262", "8", "Treponema sp. 5:22:BH022 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "24763", "438", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. 5:22:BH022"], [21234950, "PRJNA846086_P_NODE_3917_length_248_cov_0.880000_g3851_i0", "PRJNA846086", "3917", "248", "0.88", "2.1824", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "392", "1.1599999999999999e-104", "", "NTclustered", "gi|2034589463|gb|CP050497.1|", "69710", "g3851", "i0", "95.868", "5.86693548387097", "242", "10", "98", "0", "1", "242", "982222", "982463", "Treponema vincentii strain OMZ 806 chromosome, complete genome", "blastn", "1455", "392", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [21234954, "PRJNA846086_P_NODE_4137_length_247_cov_0.885057_g4071_i0", "PRJNA846086", "4137", "247", "0.885057", "2.18609079", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "457", "4.05e-124", "", "NTclustered", "gi|2265136109|gb|CP051197.1|", "69710", "g4071", "i0", "100", "9.85425101214575", "247", "0", "100", "0", "1", "247", "36473", "36719", "Treponema vincentii strain OMZ 802 chromosome, complete genome", "blastn", "2434", "457", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [22908754, "PRJNA846086_P_NODE_4918_length_243_cov_1.705882_g4852_i0", "PRJNA846086", "4918", "243", "1.705882", "4.14529326", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "233", "7.289999999999999e-57", "", "NTclustered", "gi|2034589463|gb|CP050497.1|", "69710", "g4852", "i0", "84.848", "14.1234567901235", "231", "35", "95", "0", "7", "237", "2142116", "2142346", "Treponema vincentii strain OMZ 806 chromosome, complete genome", "blastn", "3432", "233", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [23785168, "PRJNA846086_P_NODE_4659_length_245_cov_0.895349_g4593_i0", "PRJNA846086", "4659", "245", "0.895349", "2.19360505", "Treponema socranskii", "53419", "Bacteria", "Bacteria", "425", "1.1299999999999999e-114", "", "NTclustered", "gi|1868715119|emb|LR796240.1|", "69713", "g4593", "i0", "97.959", "3", "245", "5", "100", "0", "1", "245", "157435", "157679", "Treponema socranskii subsp. buccale strain Marseille-CSURQ0203 genome assembly, chromosome: contig00001", "blastn", "735", "425", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema socranskii"], [25059052, "PRJNA846086_P_NODE_3900_length_248_cov_0.880000_g3834_i0", "PRJNA846086", "3900", "248", "0.88", "2.1824", "Treponema socranskii", "53419", "Bacteria", "Bacteria", "399", "6.949999999999999e-107", "", "NTclustered", "gi|1868715119|emb|LR796240.1|", "69713", "g3834", "i0", "95.951", "4.75806451612903", "247", "9", "99", "1", "1", "246", "2850021", "2850267", "Treponema socranskii subsp. buccale strain Marseille-CSURQ0203 genome assembly, chromosome: contig00001", "blastn", "1180", "399", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema socranskii"], [25059053, "PRJNA846086_P_NODE_3920_length_248_cov_0.880000_g3854_i0", "PRJNA846086", "3920", "248", "0.88", "2.1824", "Treponema medium", "58231", "Bacteria", "Bacteria", "363", "9.119999999999997e-96", "", "NTclustered", "gi|1996291085|gb|CP027017.1|", "58231", "g3854", "i0", "93.548", "2", "248", "9", "100", "1", "1", "248", "517465", "517225", "Treponema medium strain T19 chromosome, complete genome", "blastn", "496", "363", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [25457790, "PRJNA846086_P_NODE_1580_length_301_cov_3.074561_g1514_i0", "PRJNA846086", "1580", "301", "3.074561", "9.25442861", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "503", "6.43e-138", "", "NTclustered", "gi|1996296230|gb|CP031393.1|", "58231", "g1514", "i0", "96.711", "198.720930232558", "304", "7", "100", "2", "1", "301", "1013377", "1013680", "Treponema medium strain ATCC 700293 chromosome, complete genome", "blastn", "59815", "505", "0.996039603960396", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [26896731, "PRJNA846086_P_NODE_4881_length_244_cov_0.900585_g4815_i0", "PRJNA846086", "4881", "244", "0.900585", "2.1974274", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "144", "7.12e-38", "", "NR", "MEL3906984.1", "166", "g4815", "i0", "82.7", "0.995901639344262", "81", "14", "99.6", "0", "244", "2", "553", "633", "MEL3906984.1 leucine--tRNA ligase [Treponema sp.]", "diamond", "243", "144", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [27086419, "PRJNA846086_P_NODE_2662_length_261_cov_1.638298_g2596_i0", "PRJNA846086", "2662", "261", "1.638298", "4.27595778", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "106", "6.31e-25", "", "NR", "MBE6360698.1", "163", "g2596", "i0", "79.7", "0.67816091954023", "59", "12", "67.8", "0", "178", "2", "301", "359", "MBE6360698.1 DNA methyltransferase [Treponema bryantii]", "diamond", "177", "106", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [27094773, "PRJNA846086_P_NODE_4502_length_245_cov_0.895349_g4436_i0", "PRJNA846086", "4502", "245", "0.895349", "2.19360505", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "149", "9.729999999999999e-41", "", "NR", "MEL3907198.1", "166", "g4436", "i0", "90.1", "1.98367346938776", "81", "8", "99.2", "0", "243", "1", "319", "399", "MEL3907198.1 DNA repair protein RadA [Treponema sp.]", "diamond", "486", "149", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [27180974, "PRJNA846086_P_NODE_3862_length_248_cov_0.880000_g3796_i0", "PRJNA846086", "3862", "248", "0.88", "2.1824", "Treponema maltophilum", "51160", "Bacteria", "Bacteria", "151", "4.41e-43", "", "NR", "WP_040846112.1", "51160", "g3796", "i0", "98.8", "0.991935483870968", "82", "1", "99.2", "0", "248", "3", "36", "117", "WP_040846112.1 carbohydrate ABC transporter permease [Treponema maltophilum]", "diamond", "246", "151", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"], [27568603, "PRJNA846086_P_NODE_5084_length_243_cov_0.905882_g5018_i0", "PRJNA846086", "5084", "243", "0.905882", "2.20129326", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "158", "8.709999999999999e-45", "", "NR", "WP_187385418.1", "2766702", "g5018", "i0", "98.8", "4.9382716049382704", "80", "1", "98.8", "0", "241", "2", "273", "352", "WP_187385418.1 HD-GYP domain-containing protein [Treponema sp. Marseille-Q4130]", "diamond", "1200", "158", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q4130"], [27875940, "PRJNA846086_P_NODE_3905_length_248_cov_0.880000_g3839_i0", "PRJNA846086", "3905", "248", "0.88", "2.1824", "Treponema maltophilum", "51160", "Bacteria", "Bacteria", "170", "7.96e-48", "", "NR", "WP_156827971.1", "51160", "g3839", "i0", "100", "0.991935483870968", "82", "0", "99.2", "0", "248", "3", "165", "246", "WP_156827971.1 sensor histidine kinase [Treponema maltophilum]", "diamond", "246", "170", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"], [28160384, "PRJNA846086_P_NODE_5685_length_241_cov_0.863095_g5619_i0", "PRJNA846086", "5685", "241", "0.863095", "2.08005895", "uncultured Treponema sp.", "162155", "Bacteria", "Bacteria", "45.8", "5.4e-4", "", "NR", "WP_296327245.1", "162155", "g5619", "i0", "53.1", "0.398340248962656", "32", "15", "39.8", "0", "220", "125", "61", "92", "WP_296327245.1 hypothetical protein [uncultured Treponema sp.]", "diamond", "96", "45.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "uncultured Treponema sp."], [28570566, "PRJNA846086_P_NODE_5047_length_243_cov_0.905882_g4981_i0", "PRJNA846086", "5047", "243", "0.905882", "2.20129326", "Treponema medium", "58231", "Bacteria", "Bacteria", "112", "3.23e-28", "", "NR", "WP_016523716.1", "58231", "g4981", "i0", "86.9", "0.753086419753086", "61", "8", "75.3", "0", "183", "1", "1", "61", "WP_016523716.1 SPFH domain-containing protein [Treponema medium]", "diamond", "183", "112", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [28917731, "PRJNA846086_P_NODE_3648_length_249_cov_0.875000_g3582_i0", "PRJNA846086", "3648", "249", "0.875", "2.17875", "Treponema sp. OMZ 838", "1539298", "Bacteria", "Bacteria", "92", "1.31e-19", "", "NR", "WP_044015713.1", "1539298", "g3582", "i0", "71.7", "1.44578313253012", "60", "17", "72.3", "0", "68", "247", "1", "60", "WP_044015713.1 flagellar biosynthesis protein FlhF [Treponema sp. OMZ 838]", "diamond", "360", "92", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. OMZ 838"], [29928545, "PRJNA846086_P_NODE_3411_length_250_cov_0.870056_g3345_i0", "PRJNA846086", "3411", "250", "0.870056", "2.17514", "Treponema sp. Marseille-Q39", "166", "Bacteria", "Bacteria", "163", "3.769999999999999e-48", "", "NR", "WP_370586908.1", "2766703", "g3345", "i0", "100", "0.984", "82", "0", "98.4", "0", "248", "3", "40", "121", "WP_370586908.1 IS3 family transposase [Treponema sp. Marseille-Q3903]", "diamond", "246", "163", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q3903"], [30244434, "PRJNA846086_P_NODE_5052_length_243_cov_0.905882_g4986_i0", "PRJNA846086", "5052", "243", "0.905882", "2.20129326", "Candidatus Avitreponema avistercoris", "2840705", "Bacteria", "Bacteria", "60.1", "2.88e-8", "", "NR", "MBO8450372.1", "2840705", "g4986", "i0", "38.8", "1.91358024691358", "80", "49", "98.8", "0", "4", "243", "301", "380", "MBO8450372.1 hypothetical protein [Candidatus Avitreponema avistercoris]", "diamond", "465", "60.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", null, "Candidatus Avitreponema", "Candidatus Avitreponema avistercoris"], [30979602, "PRJNA846086_P_NODE_3574_length_249_cov_0.875000_g3508_i0", "PRJNA846086", "3574", "249", "0.875", "2.17875", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "115", "4.58e-29", "", "NR", "WP_002667412.1", "158", "g3508", "i0", "73.8", "1.56626506024096", "65", "17", "78.3", "0", "197", "3", "9", "73", "WP_002667412.1 radical SAM protein [Treponema denticola]", "diamond", "390", "115", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [31350438, "PRJNA846086_P_NODE_5076_length_243_cov_0.905882_g5010_i0", "PRJNA846086", "5076", "243", "0.905882", "2.20129326", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "157", "1.22e-43", "", "NR", "MFC2603297.1", "166", "g5010", "i0", "86.3", "1.97530864197531", "80", "11", "98.8", "0", "241", "2", "181", "260", "MFC2603297.1 hypothetical protein [Treponema sp.]", "diamond", "480", "157", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [31382058, "PRJNA846086_P_NODE_5596_length_241_cov_0.916667_g5530_i0", "PRJNA846086", "5596", "241", "0.916667", "2.20916747", "Spirochaetaceae bacterium", "1898206", "Bacteria", "Bacteria", "121", "1.88e-33", "", "NR", "MBQ7612595.1", "1898206", "g5530", "i0", "72.5", "0.995850622406639", "80", "22", "99.6", "0", "2", "241", "26", "105", "MBQ7612595.1 50S ribosomal protein L18 [Spirochaetaceae bacterium]", "diamond", "240", "121", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Spirochaetaceae", null, "Spirochaetaceae bacterium"], [31603434, "PRJNA846086_P_NODE_3076_length_251_cov_0.865169_g3010_i0", "PRJNA846086", "3076", "251", "0.865169", "2.17157419", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "156", "1.21e-44", "", "NR", "MEL3907061.1", "166", "g3010", "i0", "95.1", "0.9800796812749", "82", "4", "98", "0", "5", "250", "41", "122", "MEL3907061.1 dihydroxyacetone kinase subunit DhaK [Treponema sp.]", "diamond", "246", "156", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [31666510, "PRJNA846086_P_NODE_2417_length_268_cov_1.538462_g2351_i0", "PRJNA846086", "2417", "268", "1.538462", "4.12307816", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "58.9", "1.01e-7", "", "NR", "MFC2330074.1", "166", "g2351", "i0", "38.6", "0.92910447761194", "83", "51", "92.9", "0", "268", "20", "389", "471", "MFC2330074.1 methyl-accepting chemotaxis protein [Treponema sp.]", "diamond", "249", "58.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [32678236, "PRJNA846086_P_NODE_3620_length_249_cov_0.875000_g3554_i0", "PRJNA846086", "3620", "249", "0.875", "2.17875", "Treponema phagedenis", "162", "Bacteria", "Bacteria", "89", "2.02e-18", "", "NR", "WP_148889468.1", "162", "g3554", "i0", "62.7", "0.807228915662651", "67", "25", "80.7", "0", "6", "206", "461", "527", "WP_148889468.1 YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase [Treponema phagedenis]", "diamond", "201", "89", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema phagedenis"], [32709902, "PRJNA846086_P_NODE_2600_length_263_cov_1.278947_g2534_i0", "PRJNA846086", "2600", "263", "1.278947", "3.36363061", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "55.8", "5.07e-7", "", "NR", "HBG65861.1", "166", "g2534", "i0", "49.1", "3.31939163498099", "55", "28", "62.7", "0", "262", "98", "136", "190", "HBG65861.1 YigZ family protein [Treponema sp.]", "diamond", "873", "55.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 50, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA846086", "p1": "Spirochaetota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "PRJNA846086", "label": "PRJNA846086", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Spirochaetota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 32, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Spirochaetota", "label": "Spirochaetota", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA846086", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 280.52222499536583}