{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA796753\", tax_clade = \"Amoebozoa\" and tax_phylum = \"Tubulinea\"", "rows": [[2056744, "PRJNA796753_P_NODE_582_length_1445_cov_27.463557_g480_i0", "PRJNA796753", "582", "1445", "27.463557", "396.84839865", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "1546", "0", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g480", "i0", "86.876", "68.9640138408304", "1402", "158", "96", "14", "43", "1422", "1398", "1", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "99653", "1546", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [3331799, "PRJNA796753_P_NODE_35463_length_262_cov_1.222222_g35151_i0", "PRJNA796753", "35463", "262", "1.222222", "3.20222164", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "126", "8.14e-33", "", "NR", "AAY34140.1", "5778", "g35151", "i0", "72.3", "0.950381679389313", "83", "23", "95", "0", "14", "262", "105", "187", "AAY34140.1 Nop58p, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "249", "126", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [4609024, "PRJNA796753_P_NODE_26004_length_295_cov_0.873874_g25692_i0", "PRJNA796753", "26004", "295", "0.873874", "2.5779283", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "239", "1.9600000000000003e-58", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g25692", "i0", "82.374", "0.942372881355932", "278", "45", "94", "4", "20", "295", "1386", "1111", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "278", "239", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [7158971, "PRJNA796753_P_NODE_1166_length_1122_cov_3.301239_g989_i0", "PRJNA796753", "1166", "1122", "3.301239", "37.03990158", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "393", "1.1099999999999998e-131", "", "NR", "AAD37351.1", "5775", "g989", "i0", "60.8", "0.941176470588235", "352", "131", "93.3", "4", "3", "1049", "19", "366", "AAD37351.1 pepstatin-insensitive carboxyl proteinase 1, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "1056", "393", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [8433909, "PRJNA796753_P_NODE_47487_length_245_cov_2.087209_g47175_i0", "PRJNA796753", "47487", "245", "2.087209", "5.11366205", "Glaeseria mira", "242547", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "303", "5.53e-78", "", "NTclustered", "gi|33946352|gb|AY294155.1|", "242547", "g47175", "i0", "89.024", "93.6040816326531", "246", "26", "100", "1", "1", "245", "270", "25", "Glaeseria mira actin mRNA, partial cds", "blastn", "22933", "303", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Glaeseria", "Glaeseria mira"], [11420567, "PRJNA796753_P_NODE_32709_length_271_cov_1.555556_g32397_i0", "PRJNA796753", "32709", "271", "1.555556", "4.21555676", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "160", "1.34e-45", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g32397", "i0", "84.3", "0.985239852398524", "89", "14", "98.5", "0", "5", "271", "5", "93", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "267", "160", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [13534559, "PRJNA796753_P_NODE_931_length_1218_cov_5.951965_g775_i0", "PRJNA796753", "931", "1218", "5.951965", "72.4949337", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "680", "7.520000000000001e-245", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g775", "i0", "84.3", "0.955665024630542", "388", "61", "95.6", "0", "1217", "54", "2", "389", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "1164", "680", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [16083121, "PRJNA796753_P_NODE_13053_length_389_cov_2.506329_g12741_i0", "PRJNA796753", "13053", "389", "2.506329", "9.74961981", "Saccamoeba limax", "136464", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "713", "0", "", "NTclustered", "gi|213950421|gb|EU869301.1|", "136464", "g12741", "i0", "99.743", "23.4858611825193", "389", "1", "100", "0", "1", "389", "1498", "1886", "Saccamoeba limax strain NTSHR small subunit ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "9136", "713", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba limax"], [16083151, "PRJNA796753_P_NODE_18813_length_337_cov_1.575758_g18501_i0", "PRJNA796753", "18813", "337", "1.575758", "5.31030446", "Hartmannella cantabrigiensis", "239731", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "425", "1.63e-114", "", "NTclustered", "gi|33946358|gb|AY294158.1|", "239731", "g18501", "i0", "93.95", "77.7181008902077", "281", "17", "83", "0", "57", "337", "1151", "871", "Hartmannella cantabrigiensis actin mRNA, complete cds", "blastn", "26191", "425", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Hartmannella", "Hartmannella cantabrigiensis"], [16083393, "PRJNA796753_P_NODE_9233_length_454_cov_1.711286_g8921_i0", "PRJNA796753", "9233", "454", "1.711286", "7.76923844", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "616", "1.2399999999999999e-171", "", "NTclustered", "gi|62910949|gb|AY925001.1|", "5778", "g8921", "i0", "94.911", "1.06828193832599", "393", "20", "87", "0", "62", "454", "1", "393", "Hartmannella vermiformis Rpl7A mRNA, partial cds", "blastn", "485", "616", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [17358936, "PRJNA796753_P_NODE_10214_length_433_cov_2.288889_g9902_i0", "PRJNA796753", "10214", "433", "2.288889", "9.91088937", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "226", "1.69e-69", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g9902", "i0", "84.6", "0.900692840646651", "130", "20", "90.1", "0", "433", "44", "335", "464", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "390", "226", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [19907421, "PRJNA796753_P_NODE_17096_length_349_cov_1.952899_g16784_i0", "PRJNA796753", "17096", "349", "1.952899", "6.81561751", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "398", "3.6699999999999982e-106", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g16784", "i0", "88.889", "33.7994269340974", "324", "34", "93", "2", "6", "328", "221", "543", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "11796", "398", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [22457737, "PRJNA796753_P_NODE_13218_length_387_cov_1.961783_g12906_i0", "PRJNA796753", "13218", "387", "1.961783", "7.59210021", "Saccamoeba limax", "136464", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "684", "0", "", "NTclustered", "gi|213950421|gb|EU869301.1|", "136464", "g12906", "i0", "98.462", "72.2093023255814", "390", "3", "100", "1", "1", "387", "1280", "891", "Saccamoeba limax strain NTSHR small subunit ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "27945", "684", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba limax"], [25007039, "PRJNA796753_P_NODE_17940_length_343_cov_1.140741_g17628_i0", "PRJNA796753", "17940", "343", "1.140741", "3.91274163", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "501", "2.6799999999999993e-137", "", "NTclustered", "gi|423292048|gb|JQ519470.1|", "5778", "g17628", "i0", "96.98", "93.2827988338192", "298", "9", "87", "0", "44", "341", "908", "611", "Vermamoeba vermiformis clone JG10.132_b5 alpha tubulin gene, partial cds", "blastn", "31996", "501", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [27243490, "PRJNA796753_P_NODE_43343_length_248_cov_0.880000_g43031_i0", "PRJNA796753", "43343", "248", "0.88", "2.1824", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "113", "3.26e-29", "", "NR", "ABD46563.1", "5778", "g43031", "i0", "63.4", "0.991935483870968", "82", "28", "99.2", "1", "248", "3", "39", "118", "ABD46563.1 succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein A, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "246", "113", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [27749127, "PRJNA796753_P_NODE_52304_length_242_cov_0.911243_g51992_i0", "PRJNA796753", "52304", "242", "0.911243", "2.20520806", "Nolandella sp. LAK-2", "1908693", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "98.6", "4.91e-23", "", "NR", "AFX73095.1", "1260117", "g51992", "i0", "56.3", "3.91735537190083", "80", "35", "99.2", "0", "3", "242", "84", "163", "AFX73095.1 elongation factor 2 alpha, partial [Nolandella sp. LAK-2012]", "diamond", "948", "98.6", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Nolandella", "Nolandella sp. LAK-2012"], [28506636, "PRJNA796753_P_NODE_34867_length_264_cov_1.209424_g34555_i0", "PRJNA796753", "34867", "264", "1.209424", "3.19287936", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "83.6", "2.05e-16", "", "NR", "AAD37352.1", "5775", "g34555", "i0", "48", "1.77272727272727", "75", "38", "85.2", "1", "240", "16", "344", "417", "AAD37352.1 pepstatin-insensitive carboxyl proteinase 2, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "468", "83.6", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [28790639, "PRJNA796753_P_NODE_38607_length_251_cov_1.646067_g38295_i0", "PRJNA796753", "38607", "251", "1.646067", "4.13162817", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "43.9", "0.0163", "", "NR", "AKN09691.1", "5775", "g38295", "i0", "43.9", "0.49003984063745", "41", "22", "47.8", "1", "132", "251", "178", "218", "AKN09691.1 Tom70 [Amoeba proteus]", "diamond", "123", "43.9", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [30622439, "PRJNA796753_P_NODE_4113_length_660_cov_2.064736_g3813_i0", "PRJNA796753", "4113", "660", "2.064736", "13.6272576", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "266", "1.4299999999999995e-87", "", "NR", "AAW58116.1", "5775", "g3813", "i0", "83.6", "0.690909090909091", "152", "25", "69.1", "0", "185", "640", "22", "173", "AAW58116.1 peroxiredoxin, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "456", "266", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [30685622, "PRJNA796753_P_NODE_26073_length_294_cov_1.475113_g25761_i0", "PRJNA796753", "26073", "294", "1.475113", "4.33683222", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "137", "3.52e-36", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g25761", "i0", "67", "1.02040816326531", "100", "30", "99", "1", "3", "293", "176", "275", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "300", "137", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [32330451, "PRJNA796753_P_NODE_26159_length_294_cov_1.045249_g25847_i0", "PRJNA796753", "26159", "294", "1.045249", "3.07303206", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "147", "1.67e-38", "", "NR", "AAD33718.1", "5775", "g25847", "i0", "71", "1.02040816326531", "100", "26", "99", "1", "293", "3", "45", "144", "AAD33718.1 myosin heavy chain [Amoeba proteus]", "diamond", "300", "147", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [32466012, "PRJNA796753_P_NODE_24159_length_305_cov_1.314655_g23847_i0", "PRJNA796753", "24159", "305", "1.314655", "4.00969775", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "135", "3.05e-35", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g23847", "i0", "74.7", "4.34754098360656", "87", "22", "85.6", "0", "44", "304", "4", "90", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "1326", "136", "0.992647058823529", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [32844055, "PRJNA796753_P_NODE_43180_length_248_cov_1.617143_g42868_i0", "PRJNA796753", "43180", "248", "1.617143", "4.01051464", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "133", "4.409999999999999e-37", "", "NR", "AFX73089.1", "497998", "g42868", "i0", "74.4", "4.81451612903226", "78", "20", "94.4", "0", "1", "234", "29", "106", "AFX73089.1 elongation factor 2 alpha, partial [Arcella hemisphaerica]", "diamond", "1194", "134", "0.992537313432836", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Arcellinida", "Arcellidae", "Arcella", "Arcella hemisphaerica"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 23, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_clade\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA796753", "p1": "Amoebozoa", "p2": "Tubulinea"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "PRJNA796753", "label": "PRJNA796753", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 14, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 9, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Amoebozoa", "label": "Amoebozoa", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Tubulinea", "label": "Tubulinea", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA796753&tax_clade=Amoebozoa", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 358.4285649994854}