{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA753704\", tax_phylum = \"Bdellovibrionota\" and tax_superkingdom = \"Bacteria\"", "rows": [[5834741, "PRJNA753704_P_NODE_29985_length_229_cov_2.141026_g29624_i0", "PRJNA753704", "29985", "229", "2.141026", "4.90294954", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "254", "5.22e-63", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g29624", "i0", "88.208", "107.423580786026", "212", "25", "93", "0", "18", "229", "512268", "512479", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "24600", "254", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [9659452, "PRJNA753704_P_NODE_12828_length_332_cov_1.992278_g12467_i0", "PRJNA753704", "12828", "332", "1.992278", "6.61436296", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "326", "1.67e-84", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g12467", "i0", "84.478", "152.668674698795", "335", "46", "99", "6", "1", "331", "510700", "511032", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "50686", "326", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [9659474, "PRJNA753704_P_NODE_14188_length_317_cov_1.897541_g13827_i0", "PRJNA753704", "14188", "317", "1.897541", "6.01520497", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "267", "9.74e-67", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g13827", "i0", "83.391", "9.85488958990536", "289", "47", "91", "1", "20", "307", "2300060", "2299772", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "3124", "267", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [10130648, "PRJNA753704_P_NODE_14228_length_316_cov_11.382716_g13867_i0", "PRJNA753704", "14228", "316", "11.382716", "35.96938256", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "435", "2.5100000000000003e-117", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g13867", "i0", "91.772", "44.7310126582278", "316", "21", "99", "5", "3", "316", "3504404", "3504716", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "14135", "435", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [12681792, "PRJNA753704_P_NODE_7450_length_426_cov_3.390935_g7089_i0", "PRJNA753704", "7450", "426", "3.390935", "14.4453831", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "259", "2.25e-64", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g7089", "i0", "79.545", "7.37793427230047", "396", "55", "90", "23", "13", "395", "1189662", "1189280", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "3143", "259", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [15230551, "PRJNA753704_P_NODE_17792_length_286_cov_2.164319_g17431_i0", "PRJNA753704", "17792", "286", "2.164319", "6.18995234", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "239", "1.89e-58", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g17431", "i0", "89.84", "20.0174825174825", "187", "18", "65", "1", "84", "269", "3754561", "3754747", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "5725", "239", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [18583043, "PRJNA753704_P_NODE_6235_length_460_cov_7.400517_g5874_i0", "PRJNA753704", "6235", "460", "7.400517", "34.0423782", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "217", "1.5e-51", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g5874", "i0", "75.862", "138.845652173913", "493", "81", "100", "19", "1", "460", "1676368", "1676855", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "63869", "217", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [19857987, "PRJNA753704_P_NODE_14316_length_316_cov_1.283951_g13955_i0", "PRJNA753704", "14316", "316", "1.283951", "4.05728516", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "174", "3.95e-50", "", "NR", "WP_340597006.1", "3136282", "g13955", "i0", "81.6", "5.88607594936709", "103", "19", "97.8", "0", "311", "3", "336", "438", "WP_340597006.1 MFS transporter [Bdellovibrio sp. GT3]", "diamond", "1860", "174", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. GT3"], [26863404, "PRJNA753704_P_NODE_2281_length_724_cov_3.503840_g1946_i0", "PRJNA753704", "2281", "724", "3.50384", "25.3678016", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "319", "8.71e-108", "", "NR", "MBX9767865.1", "2053517", "g1946", "i0", "89.6", "0.716850828729282", "173", "18", "71.7", "0", "206", "724", "1", "173", "MBX9767865.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "519", "319", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27031084, "PRJNA753704_P_NODE_27842_length_243_cov_0.917647_g27481_i0", "PRJNA753704", "27842", "243", "0.917647", "2.22988221", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "102", "3.6899999999999996e-23", "", "NR", "WP_284608231.1", "3044166", "g27481", "i0", "69.6", "1.7037037037037", "69", "21", "85.2", "0", "9", "215", "876", "944", "WP_284608231.1 hypothetical protein [Bdellovibrio sp. 22V]", "diamond", "414", "102", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. 22V"], [27084566, "PRJNA753704_P_NODE_23802_length_252_cov_1.402235_g23441_i0", "PRJNA753704", "23802", "252", "1.402235", "3.5336322", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "71.6", "8.3e-14", "", "NR", "MBX3041714.1", "2026715", "g23441", "i0", "91.4", "0.416666666666667", "35", "3", "41.7", "0", "147", "251", "1", "35", "MBX3041714.1 DUF1428 domain-containing protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "105", "71.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [27811230, "PRJNA753704_P_NODE_15744_length_302_cov_3.820961_g15383_i0", "PRJNA753704", "15744", "302", "3.820961", "11.53930222", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "78.2", "2.55e-14", "", "NR", "MFN8944049.1", "2026715", "g15383", "i0", "70.2", "3.47682119205298", "57", "17", "56.6", "0", "172", "2", "32", "88", "MFN8944049.1 F0F1 ATP synthase subunit alpha [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "1050", "78.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [27915470, "PRJNA753704_P_NODE_23505_length_253_cov_0.866667_g23144_i0", "PRJNA753704", "23505", "253", "0.866667", "2.19266751", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "122", "2.48e-32", "", "NR", "WP_063244176.1", "959", "g23144", "i0", "68.6", "10.1857707509881", "86", "25", "99.6", "1", "253", "2", "175", "260", "WP_063244176.1 GYF domain-containing protein [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "2577", "122", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [28284426, "PRJNA753704_P_NODE_12586_length_335_cov_1.507634_g12225_i0", "PRJNA753704", "12586", "335", "1.507634", "5.0505739", "Pigmentibacter ruber", "2683196", "Bacteria", "Bacteria", "70.1", "2.46e-11", "", "NR", "WP_158999410.1", "2683196", "g12225", "i0", "40.8", "0.877611940298507", "98", "51", "85.1", "3", "12", "296", "114", "207", "WP_158999410.1 YcaO-like family protein [Pigmentibacter ruber]", "diamond", "294", "70.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Pigmentibacter", "Pigmentibacter ruber"], [28632183, "PRJNA753704_P_NODE_9487_length_381_cov_1.772727_g9126_i0", "PRJNA753704", "9487", "381", "1.772727", "6.75408987", "Bdellovibrio sp. NC", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "87.8", "2.98e-18", "", "NR", "WP_246845436.1", "2220073", "g9126", "i0", "44", "0.78740157480315", "100", "55", "78", "1", "377", "81", "90", "189", "WP_246845436.1 substrate-binding periplasmic protein [Bdellovibrio sp. NC01]", "diamond", "300", "87.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [29389878, "PRJNA753704_P_NODE_23449_length_253_cov_0.866667_g23088_i0", "PRJNA753704", "23449", "253", "0.866667", "2.19266751", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "153", "9.559999999999998e-42", "", "NR", "MBK9323180.1", "2026715", "g23088", "i0", "94", "12.9486166007905", "84", "5", "99.6", "0", "252", "1", "464", "547", "MBK9323180.1 flagellar M-ring protein FliF [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "3276", "153", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [30432456, "PRJNA753704_P_NODE_20073_length_271_cov_2.484848_g19712_i0", "PRJNA753704", "20073", "271", "2.484848", "6.73393808", "Pseudobdellovibrio sp.", "2862747", "Bacteria", "Bacteria", "169", "3.3999999999999997e-48", "", "NR", "MFN3698126.1", "2862747", "g19712", "i0", "92.2", "0.996309963099631", "90", "7", "99.6", "0", "270", "1", "160", "249", "MFN3698126.1 chemotaxis protein CheW [Pseudobdellovibrio sp.]", "diamond", "270", "169", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp."], [31136692, "PRJNA753704_P_NODE_11915_length_344_cov_1.439114_g11554_i0", "PRJNA753704", "11915", "344", "1.439114", "4.95055216", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "89", "8.27e-19", "", "NR", "WP_415062242.1", "28201", "g11554", "i0", "39.5", "2.98255813953488", "114", "69", "99.4", "0", "344", "3", "11", "124", "WP_415062242.1 chemotaxis protein CheW [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "1026", "89.7", "0.992196209587514", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [32180933, "PRJNA753704_P_NODE_24038_length_252_cov_0.871508_g23677_i0", "PRJNA753704", "24038", "252", "0.871508", "2.19620016", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "104", "5.67e-24", "", "NR", "MFM6928398.1", "28201", "g23677", "i0", "61.4", "3.95238095238095", "83", "32", "98.8", "0", "4", "252", "381", "463", "MFM6928398.1 RIP metalloprotease RseP [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "996", "105", "0.990476190476191", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 19, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 and \"tax_superkingdom\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA753704", "p1": "Bdellovibrionota", "p2": "Bacteria"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "PRJNA753704", "label": "PRJNA753704", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA753704&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 231.57461499795318}