{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA751877\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[2002457, "PRJNA751877_P_NODE_26342_length_246_cov_0.890173_g26220_i0", "PRJNA751877", "26342", "246", "0.890173", "2.18982558", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "455", "1.4500000000000002e-123", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g26220", "i0", "100", "1", "246", "0", "100", "0", "1", "246", "2565804", "2566049", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "246", "455", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [3277808, "PRJNA751877_P_NODE_26903_length_245_cov_0.895349_g26781_i0", "PRJNA751877", "26903", "245", "0.895349", "2.19360505", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "148", "5.73e-44", "", "NR", "MBX2988187.1", "2026715", "g26781", "i0", "91.1", "4.8734693877551", "79", "7", "96.7", "0", "243", "7", "30", "108", "MBX2988187.1 nucleoside-diphosphate kinase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "1194", "148", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [13480200, "PRJNA751877_P_NODE_23211_length_250_cov_0.870056_g23089_i0", "PRJNA751877", "23211", "250", "0.870056", "2.17514", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g23089", "i0", "100", "1", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "2580881", "2580632", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "250", "462", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [26809616, "PRJNA751877_P_NODE_27921_length_244_cov_0.900585_g27799_i0", "PRJNA751877", "27921", "244", "0.900585", "2.1974274", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "75.9", "7.75e-14", "", "NR", "WP_347357380.1", "958", "g27799", "i0", "74.5", "1.15573770491803", "47", "12", "57.8", "0", "242", "102", "494", "540", "WP_347357380.1 MULTISPECIES: lytic transglycosylase domain-containing protein [Bdellovibrio]", "diamond", "282", "75.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", null], [28505501, "PRJNA751877_P_NODE_30047_length_241_cov_0.916667_g29925_i0", "PRJNA751877", "30047", "241", "0.916667", "2.20916747", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "132", "5.78e-36", "", "NR", "MBK9324357.1", "2026715", "g29925", "i0", "94.2", "5.15352697095436", "69", "4", "85.9", "0", "35", "241", "1", "69", "MBK9324357.1 LysR family transcriptional regulator [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "1242", "132", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [29484067, "PRJNA751877_P_NODE_20170_length_264_cov_1.612565_g20048_i0", "PRJNA751877", "20170", "264", "1.612565", "4.2571716", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "86.7", "1.56e-17", "", "NR", "MCM2279095.1", "2599941", "g20048", "i0", "51.3", "0.886363636363636", "78", "36", "86.4", "1", "236", "9", "421", "498", "MCM2279095.1 hydroxymethylbilane synthase [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "234", "86.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [29515696, "PRJNA751877_P_NODE_19710_length_267_cov_1.298969_g19588_i0", "PRJNA751877", "19710", "267", "1.298969", "3.46824723", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "140", "1.98e-38", "", "NR", "MFN8791039.1", "2053517", "g19588", "i0", "78.2", "1.96629213483146", "87", "19", "97.8", "0", "265", "5", "92", "178", "MFN8791039.1 type IV pilus assembly protein PilM [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "525", "140", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29515701, "PRJNA751877_P_NODE_29770_length_241_cov_0.916667_g29648_i0", "PRJNA751877", "29770", "241", "0.916667", "2.20916747", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "147", "8.08e-39", "", "NR", "NUM60332.1", "2026715", "g29648", "i0", "91.3", "1.99170124481328", "80", "7", "99.6", "0", "2", "241", "971", "1050", "NUM60332.1 efflux RND transporter permease subunit [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "480", "147", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [29673459, "PRJNA751877_P_NODE_28470_length_243_cov_0.905882_g28348_i0", "PRJNA751877", "28470", "243", "0.905882", "2.20129326", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "82.8", "1.32e-16", "", "NR", "HRO66702.1", "2026715", "g28348", "i0", "48.1", "1.90123456790123", "77", "38", "92.6", "2", "238", "14", "92", "168", "HRO66702.1 PQQ-dependent sugar dehydrogenase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "462", "82.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [29768371, "PRJNA751877_P_NODE_26231_length_246_cov_0.890173_g26109_i0", "PRJNA751877", "26231", "246", "0.890173", "2.18982558", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "55.8", "9.1e-7", "", "NR", "MFN8791216.1", "2053517", "g26109", "i0", "71.1", "0.463414634146341", "38", "11", "46.3", "0", "245", "132", "565", "602", "MFN8791216.1 tetratricopeptide repeat protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "114", "55.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29831624, "PRJNA751877_P_NODE_24111_length_249_cov_0.875000_g23989_i0", "PRJNA751877", "24111", "249", "0.875", "2.17875", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "132", "3.909999999999999e-35", "", "NR", "HXH75518.1", "2081706", "g23989", "i0", "78.3", "1.66265060240964", "69", "15", "83.1", "0", "249", "43", "17", "85", "HXH75518.1 UDP-galactopyranose mutase [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "414", "132", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [29926553, "PRJNA751877_P_NODE_17091_length_283_cov_2.042857_g16969_i0", "PRJNA751877", "17091", "283", "2.042857", "5.78128531", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "139", "2.15e-39", "", "NR", "MFN8790341.1", "2053517", "g16969", "i0", "89.9", "0.837455830388693", "79", "8", "83.7", "0", "3", "239", "118", "196", "MFN8790341.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "237", "139", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29999697, "PRJNA751877_P_NODE_30011_length_241_cov_0.916667_g29889_i0", "PRJNA751877", "30011", "241", "0.916667", "2.20916747", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "138", "1.19e-37", "", "NR", "WP_181605561.1", "2748865", "g29889", "i0", "81.3", "1.99170124481328", "80", "15", "99.6", "0", "2", "241", "67", "146", "WP_181605561.1 alpha/beta fold hydrolase [Bdellovibrio sp. KM01]", "diamond", "480", "139", "0.992805755395683", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. KM01"], [30274232, "PRJNA751877_P_NODE_16792_length_285_cov_1.452830_g16670_i0", "PRJNA751877", "16792", "285", "1.45283", "4.1405655", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "84.3", "4.38e-17", "", "NR", "MFN8791679.1", "2053517", "g16670", "i0", "47.5", "1.04210526315789", "99", "47", "98.9", "1", "3", "284", "166", "264", "MFN8791679.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "297", "84.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30432315, "PRJNA751877_P_NODE_21853_length_253_cov_1.283333_g21731_i0", "PRJNA751877", "21853", "253", "1.283333", "3.24683249", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "60.8", "7.14e-9", "", "NR", "MCB0368971.1", "2053517", "g21731", "i0", "45.8", "0.853754940711462", "72", "38", "85.4", "1", "217", "2", "21", "91", "MCB0368971.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "216", "60.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30652915, "PRJNA751877_P_NODE_27873_length_244_cov_0.900585_g27751_i0", "PRJNA751877", "27873", "244", "0.900585", "2.1974274", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "88.6", "2.79e-18", "", "NR", "MBC7457256.1", "2026715", "g27751", "i0", "51.9", "0.995901639344262", "81", "39", "99.6", "0", "1", "243", "124", "204", "MBC7457256.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "243", "88.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [30747914, "PRJNA751877_P_NODE_26394_length_246_cov_0.890173_g26272_i0", "PRJNA751877", "26394", "246", "0.890173", "2.18982558", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "142", "7.24e-38", "", "NR", "MFN8790050.1", "2053517", "g26272", "i0", "78", "1", "82", "18", "100", "0", "1", "246", "51", "132", "MFN8790050.1 acyl-CoA dehydrogenase family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "246", "142", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31000736, "PRJNA751877_P_NODE_27434_length_244_cov_1.801170_g27312_i0", "PRJNA751877", "27434", "244", "1.80117", "4.3948548", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "144", "4.62e-42", "", "NR", "MCB0369869.1", "2053517", "g27312", "i0", "84", "0.995901639344262", "81", "13", "99.6", "0", "1", "243", "20", "100", "MCB0369869.1 uL15 family ribosomal protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "243", "144", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31000737, "PRJNA751877_P_NODE_28034_length_244_cov_0.900585_g27912_i0", "PRJNA751877", "28034", "244", "0.900585", "2.1974274", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "149", "1.44e-41", "", "NR", "MFN8790556.1", "2053517", "g27912", "i0", "86.4", "0.995901639344262", "81", "11", "99.6", "0", "1", "243", "298", "378", "MFN8790556.1 signal recognition particle-docking protein FtsY [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "243", "149", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31474989, "PRJNA751877_P_NODE_24336_length_249_cov_0.875000_g24214_i0", "PRJNA751877", "24336", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "116", "1.52e-29", "", "NR", "MES2855841.1", "3034175", "g24214", "i0", "62.2", "0.987951807228916", "82", "31", "98.8", "0", "2", "247", "41", "122", "MES2855841.1 DMT family transporter [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "246", "116", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [31854360, "PRJNA751877_P_NODE_29657_length_241_cov_1.744048_g29535_i0", "PRJNA751877", "29657", "241", "1.744048", "4.20315568", "Bdellovibrio sp. ArHS", "1569284", "Bacteria", "Bacteria", "89", "1.05e-18", "", "NR", "WP_041874894.1", "1569284", "g29535", "i0", "50.7", "6.63485477178423", "75", "37", "93.4", "0", "225", "1", "41", "115", "WP_041874894.1 CapA family protein [Bdellovibrio sp. ArHS]", "diamond", "1599", "89", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. ArHS"], [32234408, "PRJNA751877_P_NODE_23578_length_250_cov_0.870056_g23456_i0", "PRJNA751877", "23578", "250", "0.870056", "2.17514", "Bacteriovoracia bacterium", "3058048", "Bacteria", "Bacteria", "62.8", "1.76e-9", "", "NR", "MFP5490308.1", "3058048", "g23456", "i0", "33.8", "1.968", "80", "53", "96", "0", "7", "246", "29", "108", "MFP5490308.1 hypothetical protein [Bacteriovoracia bacterium]", "diamond", "492", "62.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", null, null, null, "Bacteriovoracia bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA751877", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA751877", "label": "PRJNA751877", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 20, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 2, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA751877", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 196.18214100046316}