{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA744060\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[3274392, "PRJNA744060_P_NODE_19123_length_369_cov_2.206081_g18794_i0", "PRJNA744060", "19123", "369", "2.206081", "8.14043889", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "130", "1.57e-25", "", "NTclustered", "gi|289320|gb|M61238.1|BDLDDAI", "28201", "g18794", "i0", "82.468", "19.420054200542", "154", "21", "41", "6", "216", "366", "603", "753", "Bdellovibrio sp. 16S rRNA gene, partial cds", "blastn", "7166", "130", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [4551485, "PRJNA744060_P_NODE_14644_length_420_cov_1.904899_g14315_i0", "PRJNA744060", "14644", "420", "1.904899", "8.0005758", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "223", "1.98e-70", "", "NR", "MBX2996387.1", "2026715", "g14315", "i0", "84.2", "1.98571428571429", "139", "22", "99.3", "0", "418", "2", "36", "174", "MBX2996387.1 flagellin FliC [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "834", "223", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [10927394, "PRJNA744060_P_NODE_3869_length_794_cov_7.024965_g3585_i0", "PRJNA744060", "3869", "794", "7.024965", "55.7782221", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "189", "3.14e-53", "", "NR", "MBC7385198.1", "2599941", "g3585", "i0", "55.4", "2.65617128463476", "177", "77", "66.9", "1", "780", "250", "238", "412", "MBC7385198.1 M20/M25/M40 family metallo-hydrolase [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "2109", "189", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [12678106, "PRJNA744060_P_NODE_29490_length_301_cov_1.368421_g29161_i0", "PRJNA744060", "29490", "301", "1.368421", "4.11894721", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "74.7", "1.35e-13", "", "NR", "MBS1969970.1", "2053517", "g29161", "i0", "49.4", "5.12292358803987", "85", "24", "84.7", "3", "256", "2", "6", "71", "MBS1969970.1 methyltransferase domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "1542", "74.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [13476780, "PRJNA744060_P_NODE_14651_length_420_cov_1.527378_g14322_i0", "PRJNA744060", "14651", "420", "1.527378", "6.4149876", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "189", "3.78e-56", "", "NR", "WP_088566726.1", "959", "g14322", "i0", "70.9", "5.45", "127", "37", "90.7", "0", "412", "32", "256", "382", "WP_088566726.1 cystathionine gamma-synthase [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "2289", "189", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [13476960, "PRJNA744060_P_NODE_24551_length_328_cov_1.376471_g24222_i0", "PRJNA744060", "24551", "328", "1.376471", "4.51482488", "Bdellovibrio sp. HCB209", "3394354", "Bacteria", "Bacteria", "117", "1.08e-21", "", "NTclustered", "gi|2895998570|gb|CP178618.1|", "3394354", "g24222", "i0", "79.191", "5.41158536585366", "173", "32", "52", "4", "8", "178", "2692020", "2691850", "Bdellovibrio sp. HCB209 chromosome, complete genome", "blastn", "1775", "117", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB209"], [24949857, "PRJNA744060_P_NODE_34700_length_280_cov_1.507246_g34371_i0", "PRJNA744060", "34700", "280", "1.507246", "4.2202888", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "416", "7.939999999999998e-112", "", "NTclustered", "gi|2800920897|gb|CP168968.1|", "959", "g34371", "i0", "93.548", "43.9071428571429", "279", "18", "99", "0", "1", "279", "929791", "930069", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd5 chromosome, complete genome", "blastn", "12294", "416", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [26894744, "PRJNA744060_P_NODE_51861_length_240_cov_2.239521_g51532_i0", "PRJNA744060", "51861", "240", "2.239521", "5.3748504", "Oligoflexales bacterium", "2687297", "Bacteria", "Bacteria", "70.9", "4.36e-12", "", "NR", "MFK7873564.1", "2687297", "g51532", "i0", "43.4", "1.0375", "83", "40", "95", "1", "230", "3", "513", "595", "MFK7873564.1 hypothetical protein [Oligoflexales bacterium]", "diamond", "249", "70.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", null, null, "Oligoflexales bacterium"], [27305740, "PRJNA744060_P_NODE_8683_length_542_cov_2.140725_g8358_i0", "PRJNA744060", "8683", "542", "2.140725", "11.6027295", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "99.4", "4.64e-21", "", "NR", "MBN22211.1", "2026715", "g8358", "i0", "41.6", "0.891143911439114", "161", "85", "86.9", "6", "72", "542", "15", "170", "MBN22211.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "483", "99.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28126673, "PRJNA744060_P_NODE_49745_length_244_cov_0.912281_g49416_i0", "PRJNA744060", "49745", "244", "0.912281", "2.22596564", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "112", "4.18e-29", "", "NR", "MEZ0391714.1", "2026715", "g49416", "i0", "70.5", "0.959016393442623", "78", "22", "94.7", "1", "232", "2", "34", "111", "MEZ0391714.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "234", "112", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28442461, "PRJNA744060_P_NODE_39946_length_263_cov_1.642105_g39617_i0", "PRJNA744060", "39946", "263", "1.642105", "4.31873615", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "129", "1.05e-33", "", "NR", "MCB0363622.1", "2053517", "g39617", "i0", "65.5", "1.90494296577947", "84", "29", "95.8", "0", "259", "8", "33", "116", "MCB0363622.1 S9 family peptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "501", "129", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28979210, "PRJNA744060_P_NODE_37308_length_271_cov_2.196970_g36979_i0", "PRJNA744060", "37308", "271", "2.19697", "5.9537887", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "74.3", "3.33e-13", "", "NR", "MDR3608077.1", "2599941", "g36979", "i0", "89.5", "0.885608856088561", "38", "4", "42.1", "0", "270", "157", "277", "314", "MDR3608077.1 cystathionine gamma-synthase [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "240", "74.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [29011015, "PRJNA744060_P_NODE_29588_length_300_cov_2.898678_g29259_i0", "PRJNA744060", "29588", "300", "2.898678", "8.696034", "Pseudobacteriovorax sp.", "2020859", "Bacteria", "Bacteria", "51.6", "3.49e-5", "", "NR", "NRA64141.1", "2020859", "g29259", "i0", "42.9", "0.56", "56", "31", "55", "1", "3", "167", "72", "127", "NRA64141.1 trypsin-like peptidase domain-containing protein [Pseudobacteriovorax sp.]", "diamond", "168", "51.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Pseudobacteriovoracaceae", "Pseudobacteriovorax", "Pseudobacteriovorax sp."], [29263036, "PRJNA744060_P_NODE_45009_length_251_cov_1.589888_g44680_i0", "PRJNA744060", "45009", "251", "1.589888", "3.99061888", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "75.1", "7.1e-14", "", "NR", "WP_102243639.1", "960", "g44680", "i0", "46.2", "5.28286852589641", "78", "41", "93.2", "1", "13", "246", "52", "128", "WP_102243639.1 trypsin-like serine peptidase [Bacteriovorax stolpii]", "diamond", "1326", "75.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [29620090, "PRJNA744060_P_NODE_46170_length_249_cov_2.250000_g45841_i0", "PRJNA744060", "46170", "249", "2.25", "5.6025", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "66.6", "1.57e-10", "", "NR", "WP_015468752.1", "453816", "g45841", "i0", "43.7", "3.07228915662651", "87", "41", "96.4", "3", "249", "10", "309", "394", "WP_015468752.1 thrombospondin type-1 domain-containing protein [Pseudobdellovibrio exovorus]", "diamond", "765", "67", "0.994029850746269", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [29957894, "PRJNA744060_P_NODE_47751_length_247_cov_0.896552_g47422_i0", "PRJNA744060", "47751", "247", "0.896552", "2.21448344", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "43.9", "0.0134", "", "NR", "WP_415062841.1", "28201", "g47422", "i0", "47.8", "0.995951417004049", "46", "24", "55.9", "0", "23", "160", "5", "50", "WP_415062841.1 hypothetical protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "246", "43.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [30347603, "PRJNA744060_P_NODE_46432_length_249_cov_0.886364_g46103_i0", "PRJNA744060", "46432", "249", "0.886364", "2.20704636", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "143", "1.06e-39", "", "NR", "WP_374073910.1", "958", "g46103", "i0", "80.7", "4", "83", "16", "100", "0", "249", "1", "158", "240", "WP_374073910.1 MULTISPECIES: asparaginase [Bdellovibrio]", "diamond", "996", "143", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", null], [30463840, "PRJNA744060_P_NODE_20993_length_353_cov_1.735714_g20664_i0", "PRJNA744060", "20993", "353", "1.735714", "6.12707042", "Silvanigrellaceae bacterium", "2654442", "Bacteria", "Bacteria", "45.4", "0.00112", "", "NR", "MBX9703359.1", "2654442", "g20664", "i0", "40.4", "0.39943342776204", "47", "28", "39.9", "0", "78", "218", "1", "47", "MBX9703359.1 hypothetical protein [Silvanigrellaceae bacterium]", "diamond", "141", "45.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", null, "Silvanigrellaceae bacterium"], [31221504, "PRJNA744060_P_NODE_2935_length_901_cov_2.991546_g2679_i0", "PRJNA744060", "2935", "901", "2.991546", "26.95382946", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "242", "1.28e-76", "", "NR", "MBX9767865.1", "2053517", "g2679", "i0", "55.7", "0.669256381798002", "201", "89", "66.9", "0", "822", "220", "1", "201", "MBX9767865.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "603", "242", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32180881, "PRJNA744060_P_NODE_18238_length_378_cov_1.416393_g17909_i0", "PRJNA744060", "18238", "378", "1.416393", "5.35396554", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "103", "1e-23", "", "NR", "WP_374074152.1", "959", "g17909", "i0", "38.6", "2.01587301587302", "127", "76", "99.2", "1", "375", "1", "60", "186", "WP_374074152.1 trypsin-like serine peptidase [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "762", "104", "0.990384615384615", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [32202392, "PRJNA744060_P_NODE_10098_length_504_cov_2.199536_g9771_i0", "PRJNA744060", "10098", "504", "2.199536", "11.08566144", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "47.4", "0.00584", "", "NR", "MBC6416186.1", "2053517", "g9771", "i0", "60", "0.452380952380952", "35", "14", "20.8", "0", "500", "396", "84", "118", "MBC6416186.1 sel1 repeat family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "228", "47.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32202457, "PRJNA744060_P_NODE_47198_length_248_cov_0.891429_g46869_i0", "PRJNA744060", "47198", "248", "0.891429", "2.21074392", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "127", "1.48e-33", "", "NR", "MEZ0391836.1", "2026715", "g46869", "i0", "73.2", "0.991935483870968", "82", "22", "99.2", "0", "247", "2", "184", "265", "MEZ0391836.1 signal peptide peptidase SppA [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "246", "127", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA744060", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA744060", "label": "PRJNA744060", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 3, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA744060", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 468.7852480001311}