{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA734348\", tax_clade = \"PVC group\" and tax_phylum = \"Chlamydiota\"", "rows": [[7097325, "PRJNA734348_P_NODE_63106_length_276_cov_2.561576_g62409_i0", "PRJNA734348", "63106", "276", "2.561576", "7.06994976", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "89.4", "2.25e-18", "", "NR", "HEV8052951.1", "2052176", "g62409", "i0", "88.5", "1.17391304347826", "52", "6", "56.5", "0", "3", "158", "677", "728", "HEV8052951.1 CusA/CzcA family heavy metal efflux RND transporter [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "324", "89.4", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [9645406, "PRJNA734348_P_NODE_111208_length_246_cov_1.173410_g110510_i0", "PRJNA734348", "111208", "246", "1.17341", "2.8865886", "uncultured Parachlamydiaceae bacterium", "464461", "Bacteria", "Bacteria", "339", "1.5199999999999998e-88", "", "NTclustered", "gi|2874253811|emb|OY969795.1|", "464461", "g110510", "i0", "91.6", "125.467479674797", "250", "14", "100", "5", "1", "246", "2059367", "2059613", "MAG: uncultured Parachlamydiaceae bacterium isolate MFD05502.bin.c.3 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "30865", "339", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "uncultured Parachlamydiaceae bacterium"], [12197425, "PRJNA734348_P_NODE_35050_length_329_cov_3.332031_g34354_i0", "PRJNA734348", "35050", "329", "3.332031", "10.96238199", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "226", "1.7199999999999998e-54", "", "NTclustered", "gi|1869331976|gb|CP058704.1|", "2052176", "g34354", "i0", "79.341", "145.386018237082", "334", "59", "100", "10", "1", "329", "835896", "836224", "Parachlamydiaceae bacterium isolate SSA5 chromosome", "blastn", "47832", "226", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [13951092, "PRJNA734348_P_NODE_30191_length_354_cov_1.291815_g29495_i0", "PRJNA734348", "30191", "354", "1.291815", "4.5730251", "Candidatus Protochlamydia", "282132", "Bacteria", "Bacteria", "560", "4.5e-155", "", "NTclustered", "gi|1691252667|emb|BX908798.2|", "264201", "g29495", "i0", "95.211", "119.276836158192", "355", "15", "100", "2", "1", "354", "1249473", "1249120", "Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 complete genome", "blastn", "42224", "560", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Candidatus Protochlamydia", "Candidatus Protochlamydia amoebophila"], [14747241, "PRJNA734348_P_NODE_46072_length_297_cov_1.763393_g45375_i0", "PRJNA734348", "46072", "297", "1.763393", "5.23727721", "uncultured Parachlamydiaceae bacterium", "464461", "Bacteria", "Bacteria", "429", "1.09e-115", "", "NTclustered", "gi|2874253811|emb|OY969795.1|", "464461", "g45375", "i0", "93.448", "127.434343434343", "290", "17", "97", "2", "9", "297", "654216", "654504", "MAG: uncultured Parachlamydiaceae bacterium isolate MFD05502.bin.c.3 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "37848", "429", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "uncultured Parachlamydiaceae bacterium"], [18570843, "PRJNA734348_P_NODE_86255_length_255_cov_1.912088_g85557_i0", "PRJNA734348", "86255", "255", "1.912088", "4.8758244", "Chlamydiales bacterium", "2047757", "Bacteria", "Bacteria", "128", "5.6999999999999996e-33", "", "NR", "MCH9627008.1", "2047757", "g85557", "i0", "75.9", "3.94117647058824", "83", "20", "97.6", "0", "2", "250", "309", "391", "MCH9627008.1 hypothetical protein [Chlamydiales bacterium]", "diamond", "1005", "128", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", null, null, "Chlamydiales bacterium"], [18571084, "PRJNA734348_P_NODE_99755_length_249_cov_0.875000_g99057_i0", "PRJNA734348", "99755", "249", "0.875", "2.17875", "Chlamydiia", "204429", "Bacteria", "Bacteria", "165", "4.04e-45", "", "NR", "WP_013181685.1", "71667", "g99057", "i0", "93.9", "21.7349397590361", "82", "5", "98.8", "0", "248", "3", "67", "148", "WP_013181685.1 DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Waddlia chondrophila]", "diamond", "5412", "165", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Waddliaceae", "Waddlia", "Waddlia chondrophila"], [19049332, "PRJNA734348_P_NODE_9155_length_793_cov_3.327778_g8555_i0", "PRJNA734348", "9155", "793", "3.327778", "26.38927954", "Neochlamydia", "112987", "Bacteria", "Bacteria", "798", "0", "", "NTclustered", "gi|2874253811|emb|OY969795.1|", "464461", "g8555", "i0", "85.808", "189.255989911728", "761", "99", "95", "7", "39", "793", "654190", "654947", "MAG: uncultured Parachlamydiaceae bacterium isolate MFD05502.bin.c.3 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "150080", "806", "0.990074441687345", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "uncultured Parachlamydiaceae bacterium"], [22394305, "PRJNA734348_P_NODE_103118_length_248_cov_1.405714_g102420_i0", "PRJNA734348", "103118", "248", "1.405714", "3.48617072", "Candidatus Protochlamydia naegleriophila", "389348", "Bacteria", "Bacteria", "141", "4.65e-29", "", "NTclustered", "gi|971146634|emb|LN879502.1|", "389348", "g102420", "i0", "77.734", "21.4354838709677", "256", "39", "100", "14", "1", "248", "1249574", "1249329", "Protochlamydia naegleriophila genome assembly PNK1, chromosome : cPNK", "blastn", "5316", "141", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Candidatus Protochlamydia", "Candidatus Protochlamydia naegleriophila"], [25423730, "PRJNA734348_P_NODE_23160_length_409_cov_2.735119_g22465_i0", "PRJNA734348", "23160", "409", "2.735119", "11.18663671", "Chlamydiia", "204429", "Bacteria", "Bacteria", "207", "7.92e-49", "", "NTclustered", "gi|2874253688|emb|OY969414.1|", "174324", "g22465", "i0", "76.651", "170.704156479218", "424", "69", "100", "26", "1", "409", "2362997", "2362589", "MAG: uncultured Chlamydiales bacterium isolate MFD04463.bin.c.14 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "69818", "207", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", null, null, "uncultured Chlamydiales bacterium"], [26640864, "PRJNA734348_P_NODE_127381_length_242_cov_1.366864_g126683_i0", "PRJNA734348", "127381", "242", "1.366864", "3.30781088", "Chlamydia psittaci C1/97", "1112248", "Bacteria", "Bacteria", "82.4", "9.18e-19", "", "NR", "EPP30915.1", "1112248", "g126683", "i0", "80", "0.619834710743802", "50", "10", "62", "0", "152", "3", "1", "50", "EPP30915.1 hypothetical protein CPC197_1309, partial [Chlamydia psittaci C1/97]", "diamond", "150", "82.4", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [26894502, "PRJNA734348_P_NODE_89281_length_253_cov_1.250000_g88583_i0", "PRJNA734348", "89281", "253", "1.25", "3.1625", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "75.5", "4.68e-16", "", "NR", "EPL05657.1", "1112253", "g88583", "i0", "71.7", "0.628458498023715", "53", "15", "62.8", "0", "236", "78", "1", "53", "EPL05657.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 02DC14]", "diamond", "159", "75.5", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27210286, "PRJNA734348_P_NODE_38822_length_314_cov_1.792531_g38126_i0", "PRJNA734348", "38822", "314", "1.792531", "5.62854734", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "55.5", "7.23e-8", "", "NR", "EPJ17938.1", "1112257", "g38126", "i0", "67.6", "0.32484076433121", "34", "11", "32.5", "0", "303", "202", "19", "52", "EPJ17938.1 hypothetical protein CP02DC21_1499 [Chlamydia psittaci 02DC21]", "diamond", "102", "55.5", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27210303, "PRJNA734348_P_NODE_82582_length_258_cov_2.232432_g81884_i0", "PRJNA734348", "82582", "258", "2.232432", "5.75967456", "Candidatus Neptunochlamydia vexilliferae", "1651774", "Bacteria", "Bacteria", "58.9", "9.04e-8", "", "NR", "WP_194848016.1", "1651774", "g81884", "i0", "34.2", "4.7093023255814", "79", "46", "89.5", "2", "26", "256", "1285", "1359", "WP_194848016.1 AAA family ATPase [Candidatus Neptunochlamydia vexilliferae]", "diamond", "1215", "58.9", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Simkaniaceae", "Candidatus Neptunichlamydia", "Candidatus Neptunichlamydia vexilliferae"], [27305428, "PRJNA734348_P_NODE_150583_length_197_cov_2.161290_g149885_i0", "PRJNA734348", "150583", "197", "2.16129", "4.2577413", "Chlamydia psittaci C6/98", "1112249", "Bacteria", "Bacteria", "69.3", "7.68e-14", "", "NR", "EPP32773.1", "1112249", "g149885", "i0", "79.5", "0.67005076142132", "44", "9", "67", "0", "36", "167", "1", "44", "EPP32773.1 putative lipoprotein, partial [Chlamydia psittaci C6/98]", "diamond", "132", "69.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27442169, "PRJNA734348_P_NODE_43043_length_307_cov_1.196581_g42346_i0", "PRJNA734348", "43043", "307", "1.196581", "3.67350367", "Chlamydia", "810", "Bacteria", "Bacteria", "42", "0.0124", "", "NR", "EPJ19409.1", "1112257", "g42346", "i0", "85.7", "0.41042345276873", "21", "3", "20.5", "0", "306", "244", "18", "38", "EPJ19409.1 hypothetical protein CP02DC21_1087, partial [Chlamydia psittaci 02DC21]", "diamond", "126", "42", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27494880, "PRJNA734348_P_NODE_32603_length_341_cov_1.205224_g31907_i0", "PRJNA734348", "32603", "341", "1.205224", "4.10981384", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "62", "1.98e-10", "", "NR", "EPJ15349.1", "1112252", "g31907", "i0", "77.8", "0.316715542521994", "36", "8", "31.7", "0", "277", "170", "1", "36", "EPJ15349.1 hypothetical protein CP01DC11_1318 [Chlamydia psittaci 01DC11]", "diamond", "108", "62", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27494908, "PRJNA734348_P_NODE_97343_length_250_cov_0.870056_g96645_i0", "PRJNA734348", "97343", "250", "0.870056", "2.17514", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "68.2", "1.24e-11", "", "NR", "MBA3721441.1", "2052176", "g96645", "i0", "64.8", "0.648", "54", "19", "64.8", "0", "84", "245", "1", "54", "MBA3721441.1 amino acid ABC transporter permease [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "162", "68.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [27557736, "PRJNA734348_P_NODE_108464_length_247_cov_0.885057_g107766_i0", "PRJNA734348", "108464", "247", "0.885057", "2.18609079", "Chlamydia psittaci 84-8471/1", "1112230", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.00182", "", "NR", "EPP30705.1", "1112230", "g107766", "i0", "91.3", "0.279352226720648", "23", "2", "27.9", "0", "8", "76", "8", "30", "EPP30705.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 84-8471/1]", "diamond", "69", "43.1", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27757909, "PRJNA734348_P_NODE_115524_length_245_cov_0.895349_g114826_i0", "PRJNA734348", "115524", "245", "0.895349", "2.19360505", "Chlamydia", "810", "Bacteria", "Bacteria", "58.2", "3.61e-9", "", "NR", "EPJ17580.1", "1112257", "g114826", "i0", "58.2", "1.3469387755102", "55", "23", "67.3", "0", "165", "1", "4", "58", "EPJ17580.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 02DC21]", "diamond", "330", "58.5", "0.994871794871795", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [28000249, "PRJNA734348_P_NODE_80845_length_260_cov_1.379679_g80147_i0", "PRJNA734348", "80845", "260", "1.379679", "3.5871654", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "68.2", "5.06e-11", "", "NR", "MBA2727997.1", "2052176", "g80147", "i0", "62.3", "0.611538461538462", "53", "20", "61.2", "0", "160", "2", "28", "80", "MBA2727997.1 hypothetical protein [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "159", "68.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [28158109, "PRJNA734348_P_NODE_111125_length_246_cov_1.335260_g110427_i0", "PRJNA734348", "111125", "246", "1.33526", "3.2847396", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "65.9", "5.35e-12", "", "NR", "EPL02536.1", "1112253", "g110427", "i0", "56.7", "0.817073170731707", "67", "29", "81.7", "0", "201", "1", "11", "77", "EPL02536.1 hypothetical protein CP02DC14_1809, partial [Chlamydia psittaci 02DC14]", "diamond", "201", "65.9", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [28199447, "PRJNA734348_P_NODE_76286_length_264_cov_1.261780_g75588_i0", "PRJNA734348", "76286", "264", "1.26178", "3.3310992", "Chlamydia", "810", "Bacteria", "Bacteria", "44.3", "8.4e-4", "", "NR", "EPJ19053.1", "1112257", "g75588", "i0", "53.5", "1.45454545454545", "43", "20", "48.9", "0", "51", "179", "1", "43", "EPJ19053.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 02DC21]", "diamond", "384", "44.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [28220894, "PRJNA734348_P_NODE_91506_length_251_cov_1.685393_g90808_i0", "PRJNA734348", "91506", "251", "1.685393", "4.23033643", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "91.3", "2.1e-22", "", "NR", "EPJ19149.1", "1112259", "g90808", "i0", "95.6", "0.537848605577689", "45", "2", "53.8", "0", "90", "224", "1", "45", "EPJ19149.1 hypothetical protein CP02DC23_1170 [Chlamydia psittaci 02DC23]", "diamond", "135", "91.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [28884010, "PRJNA734348_P_NODE_56968_length_283_cov_0.833333_g56271_i0", "PRJNA734348", "56968", "283", "0.833333", "2.35833239", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "77.8", "7.86e-17", "", "NR", "EPJ19409.1", "1112257", "g56271", "i0", "76.6", "0.932862190812721", "47", "11", "49.8", "0", "166", "26", "5", "51", "EPJ19409.1 hypothetical protein CP02DC21_1087, partial [Chlamydia psittaci 02DC21]", "diamond", "264", "77.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [28978960, "PRJNA734348_P_NODE_46688_length_296_cov_0.896861_g45991_i0", "PRJNA734348", "46688", "296", "0.896861", "2.65470856", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "61.6", "2.4e-10", "", "NR", "EPL05657.1", "1112253", "g45991", "i0", "58.5", "1.09459459459459", "53", "22", "53.7", "0", "27", "185", "1", "53", "EPL05657.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 02DC14]", "diamond", "324", "61.6", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [28989251, "PRJNA734348_P_NODE_149448_length_201_cov_4.046875_g148750_i0", "PRJNA734348", "149448", "201", "4.046875", "8.13421875", "Chlamydia", "810", "Bacteria", "Bacteria", "67", "7.07e-13", "", "NR", "EPJ15176.1", "1112252", "g148750", "i0", "76.6", "1.49253731343284", "47", "11", "70.1", "0", "166", "26", "4", "50", "EPJ15176.1 nef attachable domain protein [Chlamydia psittaci 01DC11]", "diamond", "300", "67", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29042158, "PRJNA734348_P_NODE_91848_length_251_cov_1.359551_g91150_i0", "PRJNA734348", "91848", "251", "1.359551", "3.41247301", "Waddlia chondrophila", "71667", "Bacteria", "Bacteria", "82.4", "1.19e-16", "", "NR", "WP_013181156.1", "71667", "g91150", "i0", "42.9", "1.00398406374502", "84", "46", "98", "1", "246", "1", "114", "197", "WP_013181156.1 alpha/beta hydrolase [Waddlia chondrophila]", "diamond", "252", "82.4", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Waddliaceae", "Waddlia", "Waddlia chondrophila"], [29294531, "PRJNA734348_P_NODE_25969_length_383_cov_1.719355_g25274_i0", "PRJNA734348", "25969", "383", "1.719355", "6.58512965", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "75.5", "2.17e-15", "", "NR", "EPJ17584.1", "1112257", "g25274", "i0", "97.1", "0.266318537859008", "34", "1", "26.6", "0", "277", "378", "1", "34", "EPJ17584.1 hypothetical protein CP02DC21_1760, partial [Chlamydia psittaci 02DC21]", "diamond", "102", "75.5", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29578457, "PRJNA734348_P_NODE_127610_length_242_cov_0.911243_g126912_i0", "PRJNA734348", "127610", "242", "0.911243", "2.20520806", "Chlamydia psittaci C1/97", "1112248", "Bacteria", "Bacteria", "45.1", "5.33e-4", "", "NR", "EPP30345.1", "1112248", "g126912", "i0", "48.9", "0.557851239669422", "45", "23", "55.8", "0", "154", "20", "16", "60", "EPP30345.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci C1/97]", "diamond", "135", "45.1", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29768075, "PRJNA734348_P_NODE_97811_length_250_cov_0.870056_g97113_i0", "PRJNA734348", "97811", "250", "0.870056", "2.17514", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.00214", "", "NR", "EPJ26271.1", "1112262", "g97113", "i0", "64.5", "0.756", "31", "11", "37.2", "0", "168", "76", "5", "35", "EPJ26271.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 03DC29]", "diamond", "189", "43.1", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29894637, "PRJNA734348_P_NODE_93951_length_251_cov_0.865169_g93253_i0", "PRJNA734348", "93951", "251", "0.865169", "2.17157419", "Chlamydiota bacterium", "2081524", "Bacteria", "Bacteria", "47.8", "6.67e-4", "", "NR", "NGX57726.1", "2081524", "g93253", "i0", "65.6", "0.382470119521912", "32", "11", "38.2", "0", "248", "153", "314", "345", "NGX57726.1 putative signal peptide peptidase SppA [Chlamydiota bacterium]", "diamond", "96", "47.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", null, null, null, null, "Chlamydiota bacterium"], [29957601, "PRJNA734348_P_NODE_129111_length_242_cov_0.911243_g128413_i0", "PRJNA734348", "129111", "242", "0.911243", "2.20520806", "Chlamydia psittaci C6/98", "1112249", "Bacteria", "Bacteria", "46.6", "1.38e-4", "", "NR", "EPP32998.1", "1112249", "g128413", "i0", "48.8", "0.508264462809917", "41", "21", "50.8", "0", "199", "77", "13", "53", "EPP32998.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci C6/98]", "diamond", "123", "46.6", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [30052248, "PRJNA734348_P_NODE_111391_length_246_cov_0.890173_g110693_i0", "PRJNA734348", "111391", "246", "0.890173", "2.18982558", "Chlamydiota bacterium", "2081524", "Bacteria", "Bacteria", "118", "1.27e-29", "", "NR", "MCH9632583.1", "2081524", "g110693", "i0", "67.5", "0.975609756097561", "80", "26", "97.6", "0", "5", "244", "115", "194", "MCH9632583.1 Cysteine desulfurase NifS [Chlamydiota bacterium]", "diamond", "240", "118", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", null, null, null, null, "Chlamydiota bacterium"], [30146910, "PRJNA734348_P_NODE_106472_length_247_cov_1.770115_g105774_i0", "PRJNA734348", "106472", "247", "1.770115", "4.37218405", "Waddliaceae bacterium", "2026802", "Bacteria", "Bacteria", "87.8", "2.58e-18", "", "NR", "MFQ5729157.1", "2026802", "g105774", "i0", "58.1", "0.898785425101215", "74", "31", "89.9", "0", "1", "222", "280", "353", "MFQ5729157.1 thiamine pyrophosphate-dependent dehydrogenase E1 component subunit alpha [Waddliaceae bacterium]", "diamond", "222", "87.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Waddliaceae", null, "Waddliaceae bacterium"], [30378967, "PRJNA734348_P_NODE_83012_length_258_cov_1.502703_g82314_i0", "PRJNA734348", "83012", "258", "1.502703", "3.87697374", "Chlamydia", "810", "Bacteria", "Bacteria", "57", "1.22e-8", "", "NR", "EPP32773.1", "1112249", "g82314", "i0", "77.8", "2.27906976744186", "36", "8", "41.9", "0", "151", "44", "1", "36", "EPP32773.1 putative lipoprotein, partial [Chlamydia psittaci C6/98]", "diamond", "588", "57.4", "0.993031358885017", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [30715880, "PRJNA734348_P_NODE_99254_length_249_cov_1.477273_g98556_i0", "PRJNA734348", "99254", "249", "1.477273", "3.67840977", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "68.6", "4.62e-13", "", "NR", "EPL02536.1", "1112253", "g98556", "i0", "61.3", "0.746987951807229", "62", "24", "74.7", "0", "62", "247", "7", "68", "EPL02536.1 hypothetical protein CP02DC14_1809, partial [Chlamydia psittaci 02DC14]", "diamond", "186", "68.6", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [30873885, "PRJNA734348_P_NODE_111254_length_246_cov_1.017341_g110556_i0", "PRJNA734348", "111254", "246", "1.017341", "2.50265886", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "67.8", "5e-13", "", "NR", "EPL05657.1", "1112253", "g110556", "i0", "71.7", "0.560975609756098", "46", "13", "56.1", "0", "246", "109", "8", "53", "EPL05657.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 02DC14]", "diamond", "138", "67.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [30937277, "PRJNA734348_P_NODE_67554_length_272_cov_1.547739_g66857_i0", "PRJNA734348", "67554", "272", "1.547739", "4.20985008", "Parachlamydia sp.", "2052048", "Bacteria", "Bacteria", "127", "1.1999999999999999e-32", "", "NR", "PJD96279.1", "2052048", "g66857", "i0", "70", "4.90808823529412", "90", "27", "99.3", "0", "1", "270", "288", "377", "PJD96279.1 MAG: tyrosine transporter [Parachlamydia sp.]", "diamond", "1335", "127", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Parachlamydia", "Parachlamydia sp."], [30968878, "PRJNA734348_P_NODE_38154_length_317_cov_0.823770_g37458_i0", "PRJNA734348", "38154", "317", "0.82377", "2.6113509", "Chlamydia psittaci C1/97", "1112248", "Bacteria", "Bacteria", "60.8", "7.75e-10", "", "NR", "EPP30345.1", "1112248", "g37458", "i0", "57.4", "0.511041009463722", "54", "23", "51.1", "0", "1", "162", "9", "62", "EPP30345.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci C1/97]", "diamond", "162", "60.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31126316, "PRJNA734348_P_NODE_47875_length_293_cov_1.063636_g47178_i0", "PRJNA734348", "47875", "293", "1.063636", "3.11645348", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "69.3", "1.94e-13", "", "NR", "EPJ19409.1", "1112257", "g47178", "i0", "70.2", "0.48122866894198", "47", "14", "48.1", "0", "236", "96", "5", "51", "EPJ19409.1 hypothetical protein CP02DC21_1087, partial [Chlamydia psittaci 02DC21]", "diamond", "141", "69.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31221228, "PRJNA734348_P_NODE_145775_length_218_cov_132.924138_g145077_i0", "PRJNA734348", "145775", "218", "132.924138", "289.77462084", "Chlamydia psittaci C6/98", "1112249", "Bacteria", "Bacteria", "48.9", "1.17e-5", "", "NR", "EPP32773.1", "1112249", "g145077", "i0", "84.6", "0.357798165137615", "26", "4", "35.8", "0", "87", "164", "19", "44", "EPP32773.1 putative lipoprotein, partial [Chlamydia psittaci C6/98]", "diamond", "78", "48.9", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31348146, "PRJNA734348_P_NODE_87636_length_254_cov_1.701657_g86938_i0", "PRJNA734348", "87636", "254", "1.701657", "4.32220878", "Rhabdochlamydiaceae bacterium", "2047756", "Bacteria", "Bacteria", "127", "1.93e-34", "", "NR", "MBP7074982.1", "2047756", "g86938", "i0", "80.7", "0.980314960629921", "83", "16", "98", "0", "3", "251", "150", "232", "MBP7074982.1 CT583 family protein [Rhabdochlamydiaceae bacterium]", "diamond", "249", "127", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Candidatus Rhabdochlamydiaceae", null, "Rhabdochlamydiaceae bacterium"], [31632569, "PRJNA734348_P_NODE_131636_length_241_cov_1.267857_g130938_i0", "PRJNA734348", "131636", "241", "1.267857", "3.05553537", "Chlamydia psittaci C1/97", "1112248", "Bacteria", "Bacteria", "66.6", "1.63e-12", "", "NR", "EPP30345.1", "1112248", "g130938", "i0", "62.3", "1.20746887966805", "53", "20", "66", "0", "3", "161", "1", "53", "EPP30345.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci C1/97]", "diamond", "291", "66.6", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31895871, "PRJNA734348_P_NODE_100037_length_249_cov_0.875000_g99339_i0", "PRJNA734348", "100037", "249", "0.875", "2.17875", "Chlamydia", "810", "Bacteria", "Bacteria", "81.3", "1.78e-18", "", "NR", "EPJ15104.1", "1112256", "g99339", "i0", "85.4", "1", "41", "6", "49.4", "0", "247", "125", "3", "43", "EPJ15104.1 nef attachable domain protein [Chlamydia psittaci 02DC18]", "diamond", "249", "82", "0.991463414634146", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31917388, "PRJNA734348_P_NODE_80997_length_260_cov_1.197861_g80299_i0", "PRJNA734348", "80997", "260", "1.197861", "3.1144386", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "86.7", "2.51e-20", "", "NR", "EPL02186.1", "1112270", "g80299", "i0", "69", "0.669230769230769", "58", "18", "66.9", "0", "200", "27", "6", "63", "EPL02186.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci 09DC79]", "diamond", "174", "86.7", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [32043926, "PRJNA734348_P_NODE_150298_length_197_cov_23.669355_g149600_i0", "PRJNA734348", "150298", "197", "23.669355", "46.62862935", "Chlamydia psittaci C6/98", "1112249", "Bacteria", "Bacteria", "70.1", "3.81e-14", "", "NR", "EPP32773.1", "1112249", "g149600", "i0", "80", "0.685279187817259", "45", "9", "68.5", "0", "49", "183", "19", "63", "EPP32773.1 putative lipoprotein, partial [Chlamydia psittaci C6/98]", "diamond", "135", "70.1", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [32170686, "PRJNA734348_P_NODE_104358_length_248_cov_0.880000_g103660_i0", "PRJNA734348", "104358", "248", "0.88", "2.1824", "Chlamydia psittaci C6/98", "1112249", "Bacteria", "Bacteria", "42.4", "0.00678", "", "NR", "EPP32998.1", "1112249", "g103660", "i0", "60", "1.05241935483871", "35", "14", "42.3", "0", "104", "208", "6", "40", "EPP32998.1 nef attachable domain protein, partial [Chlamydia psittaci C6/98]", "diamond", "261", "42.4", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [32202181, "PRJNA734348_P_NODE_30558_length_352_cov_0.967742_g29862_i0", "PRJNA734348", "30558", "352", "0.967742", "3.40645184", "Chlamydia psittaci C6/98", "1112249", "Bacteria", "Bacteria", "43.9", "0.0043", "", "NR", "EPP32773.1", "1112249", "g29862", "i0", "65.6", "0.272727272727273", "32", "11", "27.3", "0", "127", "32", "13", "44", "EPP32773.1 putative lipoprotein, partial [Chlamydia psittaci C6/98]", "diamond", "96", "43.9", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [32360593, "PRJNA734348_P_NODE_103599_length_248_cov_0.880000_g102901_i0", "PRJNA734348", "103599", "248", "0.88", "2.1824", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "149", "2.77e-40", "", "NR", "MBA3722971.1", "2052176", "g102901", "i0", "86.6", "2.9758064516129", "82", "11", "99.2", "0", "248", "3", "12", "93", "MBA3722971.1 alpha-glucan family phosphorylase [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "738", "149", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 50, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_clade\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA734348", "p1": "PVC group", "p2": "Chlamydiota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "PRJNA734348", "label": "PRJNA734348", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 43, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "PVC group", "label": "PVC group", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_phylum=Chlamydiota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "Chlamydiota", "label": "Chlamydiota", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA734348&tax_clade=PVC+group", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 232.12018000049284}