{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA700095\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[5012448, "PRJNA700095_P_NODE_24744_length_346_cov_1.663004_g23480_i0", "PRJNA700095", "24744", "346", "1.663004", "5.75399384", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "424", "6.02e-114", "", "NTclustered", "gi|2313021230|gb|CP102930.1|", "959", "g23480", "i0", "88.986", "142.884393063584", "345", "34", "99", "4", "5", "346", "2386487", "2386144", "Bdellovibrio bacteriovorus strain kdesi chromosome, complete genome", "blastn", "49438", "424", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [10112850, "PRJNA700095_P_NODE_53148_length_249_cov_1.806818_g51884_i0", "PRJNA700095", "53148", "249", "1.806818", "4.49897682", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "449", "6.840000000000001e-122", "", "NTclustered", "gi|2771112236|gb|CP160486.1|", "959", "g51884", "i0", "99.197", "173.461847389558", "249", "2", "100", "0", "1", "249", "823700", "823452", "Bdellovibrio bacteriovorus strain MHI39 chromosome", "blastn", "43192", "449", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [10887431, "PRJNA700095_P_NODE_69289_length_226_cov_2.888889_g68024_i0", "PRJNA700095", "69289", "226", "2.888889", "6.52888914", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "287", "5.059999999999999e-73", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g68024", "i0", "89.868", "220.101769911504", "227", "17", "100", "6", "1", "226", "3250546", "3250767", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "49743", "287", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [19810088, "PRJNA700095_P_NODE_31716_length_303_cov_3.404348_g30452_i0", "PRJNA700095", "31716", "303", "3.404348", "10.31517444", "Bdellovibrio sp. HCB-162", "3394234", "Bacteria", "Bacteria", "527", "3.8499999999999985e-145", "", "NTclustered", "gi|2898207634|gb|CP178861.1|", "3394234", "g30452", "i0", "98.02", "87.3267326732673", "303", "6", "100", "0", "1", "303", "843042", "842740", "Bdellovibrio sp. HCB-162 chromosome, complete genome", "blastn", "26460", "527", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB-162"], [19810226, "PRJNA700095_P_NODE_57696_length_246_cov_1.150289_g56432_i0", "PRJNA700095", "57696", "246", "1.150289", "2.82971094", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "110", "1.3e-19", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g56432", "i0", "83.193", "2.32926829268293", "119", "20", "48", "0", "117", "235", "609805", "609687", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "573", "110", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [21586525, "PRJNA700095_P_NODE_68637_length_229_cov_2.782051_g67372_i0", "PRJNA700095", "68637", "229", "2.782051", "6.37089679", "Halobacteriovorax", "1652133", "Bacteria", "Bacteria", "58.4", "4.39e-4", "", "NTclustered", "gi|1249980216|gb|CP017414.1|", "97084", "g67372", "i0", "94.595", "0.323144104803493", "37", "2", "16", "0", "193", "229", "626819", "626855", "Halobacteriovorax marinus strain BE01 chromosome, complete genome", "blastn", "74", "58.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax marinus"], [21586532, "PRJNA700095_P_NODE_70057_length_214_cov_4.943262_g68792_i0", "PRJNA700095", "70057", "214", "4.943262", "10.57858068", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "396", "7.559999999999996e-106", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g68792", "i0", "100", "305.018691588785", "214", "0", "100", "0", "1", "214", "2650", "2863", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "65274", "396", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [23636302, "PRJNA700095_P_NODE_8559_length_675_cov_3.501661_g7374_i0", "PRJNA700095", "8559", "675", "3.501661", "23.63621175", "Bdellovibrio sp. HCB-162", "3394234", "Bacteria", "Bacteria", "1168", "0", "", "NTclustered", "gi|2898207634|gb|CP178861.1|", "3394234", "g7374", "i0", "97.923", "211.185185185185", "674", "14", "99", "0", "1", "674", "841994", "842667", "Bdellovibrio sp. HCB-162 chromosome, complete genome", "blastn", "142550", "1168", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB-162"], [24909707, "PRJNA700095_P_NODE_69880_length_217_cov_5.277778_g68615_i0", "PRJNA700095", "69880", "217", "5.277778", "11.45277826", "Bdellovibrio sp. HCB-162", "3394234", "Bacteria", "Bacteria", "270", "4.86e-68", "", "NTclustered", "gi|2898207634|gb|CP178861.1|", "3394234", "g68615", "i0", "89.498", "3.02764976958525", "219", "15", "99", "7", "1", "214", "1071383", "1071598", "Bdellovibrio sp. HCB-162 chromosome, complete genome", "blastn", "657", "270", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB-162"], [30240759, "PRJNA700095_P_NODE_26152_length_335_cov_2.637405_g24888_i0", "PRJNA700095", "26152", "335", "2.6374050000000002", "8.83530675", "Silvanigrellaceae bacterium", "2654442", "Bacteria", "Bacteria", "70.9", "1.07e-13", "", "NR", "MBX9703359.1", "2654442", "g24888", "i0", "64.3", "0.376119402985075", "42", "15", "37.6", "0", "293", "168", "1", "42", "MBX9703359.1 hypothetical protein [Silvanigrellaceae bacterium]", "diamond", "126", "70.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", null, "Silvanigrellaceae bacterium"], [30335923, "PRJNA700095_P_NODE_4512_length_928_cov_17.304094_g3582_i0", "PRJNA700095", "4512", "928", "17.304094", "160.58199232", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "375", "4.78e-129", "", "NR", "MBX9767865.1", "2053517", "g3582", "i0", "90.5", "0.649784482758621", "201", "19", "65", "0", "261", "863", "1", "201", "MBX9767865.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "603", "375", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30462310, "PRJNA700095_P_NODE_14893_length_480_cov_3.137592_g13632_i0", "PRJNA700095", "14893", "480", "3.137592", "15.0604416", "Bdellovibrionia bacterium", "3034169", "Bacteria", "Bacteria", "140", "1.69e-39", "", "NR", "MEO5970318.1", "3034169", "g13632", "i0", "57.8", "3.15625", "128", "48", "79.4", "2", "381", "1", "2", "124", "MEO5970318.1 hotdog fold thioesterase [Bdellovibrionia bacterium]", "diamond", "1515", "140", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", null, null, null, "Bdellovibrionia bacterium"], [30493574, "PRJNA700095_P_NODE_58893_length_245_cov_1.691860_g57629_i0", "PRJNA700095", "58893", "245", "1.69186", "4.145057", "Bdellovibrio sp. GT3", "3136282", "Bacteria", "Bacteria", "42.4", "0.0495", "", "NR", "WP_340596188.1", "3136282", "g57629", "i0", "37.9", "0.710204081632653", "58", "36", "71", "0", "6", "179", "75", "132", "WP_340596188.1 hypothetical protein [Bdellovibrio sp. GT3]", "diamond", "174", "42.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. GT3"], [30651210, "PRJNA700095_P_NODE_8173_length_692_cov_4.179321_g7006_i0", "PRJNA700095", "8173", "692", "4.179321", "28.92090132", "Pigmentibacter ruber", "2683196", "Bacteria", "Bacteria", "90.5", "1.37e-19", "", "NR", "WP_158998151.1", "2683196", "g7006", "i0", "52.4", "1.4393063583815", "84", "40", "36.4", "0", "208", "459", "2", "85", "WP_158998151.1 30S ribosomal protein S15 [Pigmentibacter ruber]", "diamond", "996", "90.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Pigmentibacter", "Pigmentibacter ruber"], [30915568, "PRJNA700095_P_NODE_49494_length_254_cov_1.801105_g48230_i0", "PRJNA700095", "49494", "254", "1.801105", "4.5748067", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "64.7", "4.36e-11", "", "NR", "WP_246845325.1", "2220073", "g48230", "i0", "44.6", "7.88976377952756", "56", "31", "66.1", "0", "253", "86", "65", "120", "WP_246845325.1 DOPA 4,5-dioxygenase family protein [Bdellovibrio sp. NC01]", "diamond", "2004", "65.1", "0.993855606758833", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [32528653, "PRJNA700095_P_NODE_15139_length_475_cov_3.256219_g13878_i0", "PRJNA700095", "15139", "475", "3.256219", "15.46704025", "Cyanobacteriota/Melainabacteria group", "1798711", "Bacteria", "Bacteria", "78.6", "1.48e-13", "", "NR", "MBC77950.1", "2026745", "g13878", "i0", "40.4", "7.95789473684211", "99", "40", "62.5", "2", "174", "470", "808", "887", "MBC77950.1 hypothetical protein [Halobacteriovoraceae bacterium]", "diamond", "3780", "78.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", null, "Halobacteriovoraceae bacterium"], [32863804, "PRJNA700095_P_NODE_16940_length_440_cov_2.264305_g15677_i0", "PRJNA700095", "16940", "440", "2.264305", "9.962942", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "213", "1.4e-66", "", "NR", "MBX9767866.1", "2053517", "g15677", "i0", "71.4", "1.00227272727273", "147", "41", "99.5", "1", "3", "440", "2", "148", "MBX9767866.1 GTP-binding protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "441", "213", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 17, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA700095", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA700095", "label": "PRJNA700095", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 9, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 8, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA700095", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 180.5922549974639}