{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA690592\" and tax_phylum = \"Tubulinea\"", "rows": [[1947886, "PRJNA690592_S_NODE_6002_length_1117_cov_2.328544_g5442_i0", "PRJNA690592", "6002", "1117", "2.328544", "26.00983648", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "513", "1.66e-179", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g5442", "i0", "74.9", "5.23992837958818", "323", "81", "86.8", "0", "1", "969", "66", "388", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "5853", "516", "0.994186046511628", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [1948154, "PRJNA690592_S_NODE_9762_length_918_cov_8.375148_g9029_i0", "PRJNA690592", "9762", "918", "8.375148", "76.88385864", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "280", "1.4799999999999999e-90", "", "NR", "AAY21191.1", "5778", "g9029", "i0", "61.8", "0.777777777777778", "238", "88", "77.8", "2", "796", "83", "12", "246", "AAY21191.1 Rpl7A, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "714", "280", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [7049627, "PRJNA690592_S_NODE_144866_length_281_cov_1.480769_g143852_i0", "PRJNA690592", "144866", "281", "1.480769", "4.16096089", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "106", "1.96e-18", "", "NTclustered", "gi|292559443|ref|NC_013986.1|", "5778", "g143852", "i0", "87.912", "0.647686832740214", "91", "10", "32", "1", "1", "91", "19957", "19868", "Hartmannella vermiformis mitochondrion, complete genome", "blastn", "182", "106", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [7557007, "PRJNA690592_S_NODE_76346_length_366_cov_1.979522_g75332_i0", "PRJNA690592", "76346", "366", "1.979522", "7.24505052", "Echinamoeba", "136449", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "586", "7.699999999999998e-163", "", "NTclustered", "gi|165968562|gb|EU377602.1|", "136450", "g75332", "i0", "95.628", "70.8032786885246", "366", "15", "100", "1", "1", "366", "388", "24", "Echinamoeba exundans strain CRIB40 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "25914", "586", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, "Echinamoebidae", "Echinamoeba", "Echinamoeba exundans"], [8325215, "PRJNA690592_S_NODE_9167_length_942_cov_5.329114_g8454_i0", "PRJNA690592", "9167", "942", "5.329114", "50.20025388", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "283", "1.25e-91", "", "NR", "AAY21191.1", "5778", "g8454", "i0", "63.1", "0.751592356687898", "236", "86", "75.2", "1", "121", "828", "12", "246", "AAY21191.1 Rpl7A, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "708", "283", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [9600416, "PRJNA690592_S_NODE_72788_length_374_cov_1.279070_g71774_i0", "PRJNA690592", "72788", "374", "1.27907", "4.7837218", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "198", "1.1199999999999999e-60", "", "NR", "AFX84545.1", "5778", "g71774", "i0", "75", "10.9171122994652", "124", "31", "99.5", "0", "372", "1", "22", "145", "AFX84545.1 alpha tubulin, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "4083", "199", "0.994974874371859", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [10876133, "PRJNA690592_S_NODE_88249_length_344_cov_4.904059_g87235_i0", "PRJNA690592", "88249", "344", "4.904059", "16.86996296", "Saccamoeba sp. W187G", "1215626", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "636", "7.059999999999998e-178", "", "NTclustered", "gi|399764209|gb|JQ271720.1|", "1215626", "g87235", "i0", "100", "81.2761627906977", "344", "0", "100", "0", "1", "344", "380", "37", "Saccamoeba sp. W187G 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "27959", "636", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba sp. W187G"], [13425318, "PRJNA690592_S_NODE_210751_length_242_cov_2.485207_g209737_i0", "PRJNA690592", "210751", "242", "2.485207", "6.01420094", "Amoeba leningradensis", "160820", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "219", "2.0299999999999993e-52", "", "NTclustered", "gi|17897590|emb|AJ314605.1|", "160820", "g209737", "i0", "83.133", "37.9214876033058", "249", "33", "100", "9", "1", "242", "1363", "1609", "Amoeba leningradensis partial 16S rRNA gene, strain CCAP 1503/6", "blastn", "9177", "219", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba leningradensis"], [13425563, "PRJNA690592_S_NODE_40351_length_482_cov_33.630807_g39337_i0", "PRJNA690592", "40351", "482", "33.630807", "162.10048974", "Rhizamoeba saxonica", "200886", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "154", "1.2499999999999998e-32", "", "NTclustered", "gi|300078497|gb|GU001159.1|", "200886", "g39337", "i0", "82.011", "42.2406639004149", "189", "27", "38", "7", "298", "482", "4309", "4124", "Rhizamoeba saxonica 18S ribosomal RNA gene, partial sequence; internal transcribed spacer 1, 5.8S ribosomal RNA gene, and internal transcribed spacer 2, complete sequence; and 28S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "20360", "154", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Leptomyxida", "Flabellulidae", "Rhizamoeba", "Rhizamoeba saxonica"], [18523633, "PRJNA690592_S_NODE_29155_length_559_cov_2.314815_g28156_i0", "PRJNA690592", "29155", "559", "2.314815", "12.93981585", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "621", "3.3499999999999986e-173", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g28156", "i0", "87.64", "40.0232558139535", "534", "66", "96", "0", "24", "557", "576", "43", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "22373", "621", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [21073976, "PRJNA690592_S_NODE_2117_length_1606_cov_8.810176_g1821_i0", "PRJNA690592", "2117", "1606", "8.810176", "141.49142656", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "769", "2.4e-276", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g1821", "i0", "81.2", "2.57036114570361", "463", "81", "85.4", "1", "1572", "202", "1", "463", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "4128", "769", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [21074036, "PRJNA690592_S_NODE_220757_length_217_cov_5.875000_g219743_i0", "PRJNA690592", "220757", "217", "5.875", "12.74875", "Nolandella sp. ATCC PRA-27", "498006", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "318", "1.71e-82", "", "NTclustered", "gi|167859744|gb|EU273453.1|", "498006", "g219743", "i0", "93.119", "105.751152073733", "218", "13", "100", "2", "1", "217", "352", "136", "Nolandella sp. ATCC PRA-27 clone 2 actin gene, partial cds", "blastn", "22948", "318", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Nolandella", "Nolandella sp. ATCC PRA-27"], [21581160, "PRJNA690592_S_NODE_145617_length_280_cov_2.594203_g144603_i0", "PRJNA690592", "145617", "280", "2.594203", "7.2637684", "Saccamoeba", "136463", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "291", "5.02e-74", "", "NTclustered", "gi|399764206|gb|JQ271717.1|", "1215623", "g144603", "i0", "98.193", "34.0107142857143", "166", "3", "59", "0", "115", "280", "1808", "1643", "Saccamoeba sp. DP7 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "9523", "291", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba sp. DP7"], [22348143, "PRJNA690592_S_NODE_11898_length_843_cov_3.467532_g11095_i0", "PRJNA690592", "11898", "843", "3.467532", "29.23129476", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "423", "2.439999999999999e-145", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g11095", "i0", "78.2", "0.9644128113879", "271", "56", "96.1", "2", "841", "32", "122", "390", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "813", "423", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [22349342, "PRJNA690592_S_NODE_79698_length_359_cov_3.290210_g78684_i0", "PRJNA690592", "79698", "359", "3.29021", "11.8118539", "Saccamoeba sp. W187G", "1215626", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "658", "0", "", "NTclustered", "gi|399764209|gb|JQ271720.1|", "1215626", "g78684", "i0", "99.721", "73.3983286908078", "359", "1", "100", "0", "1", "359", "949", "591", "Saccamoeba sp. W187G 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "26350", "658", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba sp. W187G"], [24130964, "PRJNA690592_S_NODE_47459_length_449_cov_4.095745_g46445_i0", "PRJNA690592", "47459", "449", "4.095745", "18.38989505", "Saccamoeba", "136463", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "821", "0", "", "NTclustered", "gi|399764206|gb|JQ271717.1|", "1215623", "g46445", "i0", "99.776", "96.0178173719376", "447", "1", "99", "0", "3", "449", "1201", "1647", "Saccamoeba sp. DP7 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "43112", "821", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba sp. DP7"], [24897867, "PRJNA690592_S_NODE_26220_length_588_cov_3.308738_g25228_i0", "PRJNA690592", "26220", "588", "3.308738", "19.45537944", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "555", "3.6299999999999997e-153", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g25228", "i0", "83.871", "4.14625850340136", "589", "87", "99", "7", "4", "588", "753", "1337", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "2438", "555", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [28345716, "PRJNA690592_S_NODE_173866_length_259_cov_1.241935_g172852_i0", "PRJNA690592", "173866", "259", "1.241935", "3.21661165", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "117", "1.61e-30", "", "NR", "ABD46545.1", "5778", "g172852", "i0", "72.7", "0.891891891891892", "77", "21", "89.2", "0", "28", "258", "116", "192", "ABD46545.1 aldehyde dehydrogenase, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "231", "117", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [28377163, "PRJNA690592_S_NODE_11066_length_869_cov_4.407035_g10282_i0", "PRJNA690592", "11066", "869", "4.407035", "38.29713415", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "191", "2.03e-57", "", "NR", "ABD72565.1", "5778", "g10282", "i0", "65", "0.472957422324511", "137", "48", "47.3", "0", "729", "319", "1", "137", "ABD72565.1 chitinase-like protein cluster B, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "411", "191", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [28472218, "PRJNA690592_S_NODE_23806_length_615_cov_2.872694_g22818_i0", "PRJNA690592", "23806", "615", "2.872694", "17.6670681", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "163", "6.789999999999998e-48", "", "NR", "ABD72565.1", "5778", "g22818", "i0", "56.1", "0.678048780487805", "139", "59", "67.8", "1", "139", "555", "1", "137", "ABD72565.1 chitinase-like protein cluster B, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "417", "163", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [29103707, "PRJNA690592_S_NODE_214788_length_241_cov_1.226190_g213774_i0", "PRJNA690592", "214788", "241", "1.22619", "2.9551179", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "47.8", "5.48e-4", "", "NR", "AKN09692.1", "5775", "g213774", "i0", "32.9", "0.983402489626556", "79", "51", "95.9", "1", "6", "236", "149", "227", "AKN09692.1 Tom40 [Amoeba proteus]", "diamond", "237", "47.8", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [29135362, "PRJNA690592_S_NODE_194849_length_248_cov_0.880000_g193835_i0", "PRJNA690592", "194849", "248", "0.88", "2.1824", "Arcella hemisphaerica", "497998", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "120", "1.71e-31", "", "NR", "ADM22175.1", "497998", "g193835", "i0", "74.6", "0.858870967741935", "71", "18", "85.9", "0", "35", "247", "154", "224", "ADM22175.1 actin, partial [Arcella hemisphaerica]", "diamond", "213", "120", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Arcellinida", "Arcellidae", "Arcella", "Arcella hemisphaerica"], [29956043, "PRJNA690592_S_NODE_105811_length_320_cov_1.870445_g104797_i0", "PRJNA690592", "105811", "320", "1.870445", "5.985424", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "117", "1.48e-28", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g104797", "i0", "89.1", "1.2375", "64", "7", "60", "0", "5", "196", "401", "464", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "396", "117", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [32169150, "PRJNA690592_S_NODE_194338_length_248_cov_1.320000_g193324_i0", "PRJNA690592", "194338", "248", "1.32", "3.2736", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "114", "2.6e-27", "", "NR", "AKN09691.1", "5775", "g193324", "i0", "59.3", "1.97177419354839", "81", "32", "98", "1", "5", "247", "594", "673", "AKN09691.1 Tom70 [Amoeba proteus]", "diamond", "489", "114", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 24, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA690592", "p1": "Tubulinea"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "PRJNA690592", "label": "PRJNA690592", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 13, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 11, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Amoebozoa", "label": "Amoebozoa", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea&tax_clade=Amoebozoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Tubulinea", "label": "Tubulinea", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA690592", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 181.8297520003398}