{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA577580\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[2413517, "PRJNA577580_P_NODE_10182_length_287_cov_2.271028_g10104_i0", "PRJNA577580", "10182", "287", "2.271028", "6.51785036", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "274", "5.199999999999998e-69", "", "NTclustered", "gi|2663425168|dbj|AP029173.1|", "3113893", "g10104", "i0", "84.848", "98.5714285714286", "297", "18", "94", "8", "1", "270", "756516", "756220", "Bdellovibrio sp. CKG001 DNA, complete genome", "blastn", "28290", "274", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. CKG001"], [6241736, "PRJNA577580_P_NODE_5665_length_376_cov_2.983498_g5587_i0", "PRJNA577580", "5665", "376", "2.983498", "11.21795248", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "540", "6.27e-149", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g5587", "i0", "93.681", "167.808510638298", "364", "17", "95", "4", "18", "376", "964", "602", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "63096", "540", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [15866701, "PRJNA577580_P_NODE_2733_length_546_cov_2.604651_g2655_i0", "PRJNA577580", "2733", "546", "2.604651", "14.22139446", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "588", "3.31e-163", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g2655", "i0", "87.054", "347.558608058608", "533", "54", "95", "11", "25", "545", "3447552", "3447023", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "189767", "588", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [26699623, "PRJNA577580_P_NODE_5961_length_367_cov_3.163265_g5883_i0", "PRJNA577580", "5961", "367", "3.163265", "11.60918255", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "82", "2.71e-16", "", "NR", "MCO5113132.1", "2026715", "g5883", "i0", "43.7", "0.97275204359673", "119", "61", "97.3", "2", "363", "7", "46", "158", "MCO5113132.1 glutaredoxin 2 [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "357", "82", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28248060, "PRJNA577580_P_NODE_17146_length_227_cov_2.025974_g17068_i0", "PRJNA577580", "17146", "227", "2.025974", "4.59896098", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "84", "9.21e-17", "", "NR", "MBL7542369.1", "2026715", "g17068", "i0", "54.9", "0.9383259911894268", "71", "30", "91.2", "1", "3", "209", "159", "229", "MBL7542369.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "213", "84", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28324750, "PRJNA577580_P_NODE_1806_length_677_cov_3.286424_g1731_i0", "PRJNA577580", "1806", "677", "3.286424", "22.24909048", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "179", "8.99e-53", "", "NR", "MCB9027028.1", "2026715", "g1731", "i0", "45.1", "6.95716395864106", "224", "93", "98.4", "6", "7", "672", "29", "224", "MCB9027028.1 carbonic anhydrase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "4710", "180", "0.994444444444444", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28595737, "PRJNA577580_P_NODE_8907_length_304_cov_3.186147_g8829_i0", "PRJNA577580", "8907", "304", "3.186147", "9.68588688", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "124", "3.8800000000000005e-33", "", "NR", "MBK8204574.1", "2053517", "g8829", "i0", "60", "2.96052631578947", "100", "38", "98.7", "1", "300", "1", "1", "98", "MBK8204574.1 carbonic anhydrase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "900", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29353443, "PRJNA577580_P_NODE_10069_length_289_cov_0.935185_g9991_i0", "PRJNA577580", "10069", "289", "0.935185", "2.70268465", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "44.3", "0.00754", "", "NR", "MEW6056281.1", "3034175", "g9991", "i0", "34.3", "0.726643598615917", "70", "45", "72.7", "1", "8", "217", "56", "124", "MEW6056281.1 TraR/DksA C4-type zinc finger protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "210", "44.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [29953313, "PRJNA577580_P_NODE_71_length_2093_cov_10.037129_g56_i0", "PRJNA577580", "71", "2093", "10.037129", "210.07710997", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "205", "5.309999999999999e-52", "", "NR", "MCH2533348.1", "2053517", "g56", "i0", "35", "1.54801720019111", "383", "222", "54.2", "15", "2089", "956", "347", "707", "MCH2533348.1 putative Ig domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "3240", "205", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30269492, "PRJNA577580_P_NODE_11192_length_275_cov_1.544554_g11114_i0", "PRJNA577580", "11192", "275", "1.544554", "4.2475235", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "43.9", "0.0216", "", "NR", "HLG19372.1", "3034175", "g11114", "i0", "44.4", "0.589090909090909", "54", "22", "58.9", "1", "81", "242", "749", "794", "HLG19372.1 S8 family serine peptidase [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "162", "43.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [30364454, "PRJNA577580_P_NODE_7172_length_336_cov_1.669202_g7094_i0", "PRJNA577580", "7172", "336", "1.669202", "5.60851872", "Bdellovibrionia bacterium", "3034169", "Bacteria", "Bacteria", "84.7", "2.03e-16", "", "NR", "MEQ1878799.1", "3034169", "g7094", "i0", "43.8", "0.857142857142857", "96", "53", "85.7", "1", "6", "293", "135", "229", "MEQ1878799.1 serine hydrolase [Bdellovibrionia bacterium]", "diamond", "288", "84.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", null, null, null, "Bdellovibrionia bacterium"], [30756674, "PRJNA577580_P_NODE_13074_length_257_cov_1.277174_g12996_i0", "PRJNA577580", "13074", "257", "1.277174", "3.28233718", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "64.7", "3.94e-11", "", "NR", "MFM6928100.1", "28201", "g12996", "i0", "43.6", "5.36964980544747", "78", "40", "91.1", "2", "3", "236", "7", "80", "MFM6928100.1 thioredoxin [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "1380", "65.1", "0.993855606758833", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [30964471, "PRJNA577580_P_NODE_13234_length_255_cov_1.659341_g13156_i0", "PRJNA577580", "13234", "255", "1.659341", "4.23131955", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "130", "1.52e-36", "", "NR", "MCB0368223.1", "2053517", "g13156", "i0", "91.5", "0.835294117647059", "71", "6", "83.5", "0", "214", "2", "13", "83", "MCB0368223.1 cation transporting ATPase C-terminal domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "213", "130", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30996018, "PRJNA577580_P_NODE_294_length_1385_cov_3.806402_g262_i0", "PRJNA577580", "294", "1385", "3.806402", "52.7186677", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "108", "9.87e-21", "", "NR", "MCB0421895.1", "2053517", "g262", "i0", "31.4", "0.807942238267148", "373", "245", "79.1", "9", "266", "1360", "135", "504", "MCB0421895.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "1119", "108", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31628253, "PRJNA577580_P_NODE_16476_length_242_cov_0.923077_g16398_i0", "PRJNA577580", "16476", "242", "0.923077", "2.23384634", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "84.3", "8.39e-17", "", "NR", "MBL7554552.1", "2026715", "g16398", "i0", "78.8", "1.98347107438017", "80", "17", "99.2", "0", "2", "241", "723", "802", "MBL7554552.1 FHA domain-containing protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "480", "84.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [32102786, "PRJNA577580_P_NODE_7178_length_336_cov_1.273764_g7100_i0", "PRJNA577580", "7178", "336", "1.273764", "4.27984704", "Pseudobacteriovorax antillogorgiicola", "1513793", "Bacteria", "Bacteria", "177", "3.16e-51", "", "NR", "WP_132323897.1", "1513793", "g7100", "i0", "73.1", "0.964285714285714", "108", "29", "96.4", "0", "325", "2", "330", "437", "WP_132323897.1 glutathione-disulfide reductase [Pseudobacteriovorax antillogorgiicola]", "diamond", "324", "177", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Pseudobacteriovoracaceae", "Pseudobacteriovorax", "Pseudobacteriovorax antillogorgiicola"], [32671748, "PRJNA577580_P_NODE_15100_length_247_cov_0.896552_g15022_i0", "PRJNA577580", "15100", "247", "0.896552", "2.21448344", "Bdellovibrio sp. 28-41-41", "1970323", "Bacteria", "Bacteria", "151", "1.0499999999999999e-42", "", "NR", "OYZ24175.1", "1970323", "g15022", "i0", "93.9", "0.995951417004049", "82", "5", "99.6", "0", "1", "246", "89", "170", "OYZ24175.1 MAG: hypothetical protein B7Y39_01740 [Bdellovibrio sp. 28-41-41]", "diamond", "246", "151", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. 28-41-41"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 17, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA577580", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA577580", "label": "PRJNA577580", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 14, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 3, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA577580", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 316.5032830002019}