{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA575566\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[4964869, "PRJNA575566_P_NODE_28224_length_203_cov_0.901408_g28027_i0", "PRJNA575566", "28224", "203", "0.901408", "1.82985824", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "239", "1.27e-58", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g28027", "i0", "88.776", "7.63054187192118", "196", "20", "96", "2", "1", "195", "4045413", "4045607", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "1549", "239", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [9488398, "PRJNA575566_P_NODE_20748_length_230_cov_1.136095_g20551_i0", "PRJNA575566", "20748", "230", "1.136095", "2.6130185", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "150", "3.6e-45", "", "NR", "WP_413939772.1", "3394362", "g20551", "i0", "100", "0.991304347826087", "76", "0", "99.1", "0", "229", "2", "5", "80", "WP_413939772.1 RNA recognition motif domain-containing protein [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "228", "150", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [10764440, "PRJNA575566_P_NODE_29869_length_201_cov_0.914286_g29672_i0", "PRJNA575566", "29869", "201", "0.914286", "1.83771486", "Bdellovibrio sp. KM01", "2748865", "Bacteria", "Bacteria", "195", "2.74e-45", "", "NTclustered", "gi|1880307726|gb|CP058348.1|", "2748865", "g29672", "i0", "84.158", "2.00995024875622", "202", "30", "100", "2", "1", "201", "341709", "341909", "Bdellovibrio sp. KM01 chromosome, complete genome", "blastn", "404", "195", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. KM01"], [12039213, "PRJNA575566_P_NODE_25970_length_207_cov_0.876712_g25773_i0", "PRJNA575566", "25970", "207", "0.876712", "1.81479384", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "131", "4.85e-34", "", "NR", "WP_413938877.1", "3394362", "g25773", "i0", "100", "0.985507246376812", "68", "0", "98.6", "0", "206", "3", "3", "70", "WP_413938877.1 microtubule-binding protein [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "204", "131", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [12615648, "PRJNA575566_P_NODE_15590_length_267_cov_1.242718_g15393_i0", "PRJNA575566", "15590", "267", "1.242718", "3.31805706", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "287", "6.15e-73", "", "NTclustered", "gi|1700693790|gb|CP030082.1|", "2231053", "g15393", "i0", "87.251", "35.8801498127341", "251", "32", "94", "0", "16", "266", "806388", "806638", "Bdellovibrio sp. ZAP7 chromosome, complete genome", "blastn", "9580", "289", "0.993079584775087", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. ZAP7"], [13890665, "PRJNA575566_P_NODE_12651_length_295_cov_1.581197_g12454_i0", "PRJNA575566", "12651", "295", "1.581197", "4.66453115", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "479", "1.0599999999999996e-130", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g12454", "i0", "95.946", "44.0203389830508", "296", "11", "100", "1", "1", "295", "3504713", "3504418", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "12986", "479", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [19686640, "PRJNA575566_P_NODE_26496_length_206_cov_0.882759_g26299_i0", "PRJNA575566", "26496", "206", "0.882759", "1.81848354", "Bdellovibrio sp. HCB185ZH", "3394235", "Bacteria", "Bacteria", "298", "2.09e-76", "", "NTclustered", "gi|2895513970|gb|CP178624.1|", "3394235", "g26299", "i0", "92.718", "14.2766990291262", "206", "15", "100", "0", "1", "206", "1199597", "1199802", "Bdellovibrio sp. HCB185ZH chromosome, complete genome", "blastn", "2941", "298", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB185ZH"], [20263235, "PRJNA575566_P_NODE_24696_length_208_cov_1.292517_g24499_i0", "PRJNA575566", "24696", "208", "1.292517", "2.68843536", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "124", "1.22e-33", "", "NR", "WP_413941498.1", "3394362", "g24499", "i0", "95.5", "0.951923076923077", "66", "3", "95.2", "0", "198", "1", "1", "66", "WP_413941498.1 MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "198", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [23512284, "PRJNA575566_P_NODE_14539_length_276_cov_1.190698_g14342_i0", "PRJNA575566", "14539", "276", "1.190698", "3.28632648", "Bdellovibrio sp. HCB185ZH", "3394235", "Bacteria", "Bacteria", "377", "3.69e-100", "", "NTclustered", "gi|2895513970|gb|CP178624.1|", "3394235", "g14342", "i0", "91.636", "43.6775362318841", "275", "20", "99", "2", "4", "276", "2779033", "2779306", "Bdellovibrio sp. HCB185ZH chromosome, complete genome", "blastn", "12055", "377", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB185ZH"], [25363121, "PRJNA575566_P_NODE_27860_length_204_cov_0.895105_g27663_i0", "PRJNA575566", "27860", "204", "0.895105", "1.8260142", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "241", "3.54e-59", "", "NTclustered", "gi|1880307726|gb|CP058348.1|", "2748865", "g27663", "i0", "89.894", "10.2549019607843", "188", "17", "92", "2", "1", "187", "799524", "799710", "Bdellovibrio sp. KM01 chromosome, complete genome", "blastn", "2092", "241", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. KM01"], [26889934, "PRJNA575566_P_NODE_24281_length_209_cov_0.864865_g24084_i0", "PRJNA575566", "24281", "209", "0.864865", "1.80756785", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "118", "3.32e-29", "", "NR", "WP_413939334.1", "3394362", "g24084", "i0", "95.7", "0.990430622009569", "69", "3", "99", "0", "207", "1", "432", "500", "WP_413939334.1 methyl-accepting chemotaxis protein [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "207", "118", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [27205712, "PRJNA575566_P_NODE_27762_length_204_cov_0.895105_g27565_i0", "PRJNA575566", "27762", "204", "0.895105", "1.8260142", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "127", "1.2e-34", "", "NR", "WP_413941452.1", "3394362", "g27565", "i0", "85.1", "0.985294117647059", "67", "10", "98.5", "0", "2", "202", "33", "99", "WP_413941452.1 3D domain-containing protein [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "201", "127", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [28279477, "PRJNA575566_P_NODE_28386_length_203_cov_0.901408_g28189_i0", "PRJNA575566", "28386", "203", "0.901408", "1.82985824", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "131", "3.76e-34", "", "NR", "WP_413939910.1", "3394362", "g28189", "i0", "98.4", "0.916256157635468", "62", "1", "91.6", "0", "201", "16", "464", "525", "WP_413939910.1 hypothetical protein [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "186", "131", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [29164021, "PRJNA575566_P_NODE_27949_length_204_cov_0.895105_g27752_i0", "PRJNA575566", "27949", "204", "0.895105", "1.8260142", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "132", "3.59e-35", "", "NR", "WP_413939332.1", "3394362", "g27752", "i0", "100", "0.985294117647059", "67", "0", "98.5", "0", "202", "2", "305", "371", "WP_413939332.1 cell division protein FtsA [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "201", "132", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [32387454, "PRJNA575566_P_NODE_25959_length_207_cov_0.876712_g25762_i0", "PRJNA575566", "25959", "207", "0.876712", "1.81479384", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "129", "1.14e-33", "", "NR", "WP_413941783.1", "3394362", "g25762", "i0", "87", "1", "69", "9", "100", "0", "207", "1", "249", "317", "WP_413941783.1 NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "207", "129", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"], [32482529, "PRJNA575566_P_NODE_29159_length_202_cov_0.907801_g28962_i0", "PRJNA575566", "29159", "202", "0.907801", "1.83375802", "Bdellovibrio sp. HCB2-146", "3394362", "Bacteria", "Bacteria", "141", "3.29e-39", "", "NR", "WP_413940981.1", "3394362", "g28962", "i0", "100", "0.98019801980198", "66", "0", "98", "0", "200", "3", "67", "132", "WP_413940981.1 tryptophan--tRNA ligase [Bdellovibrio sp. HCB2-146]", "diamond", "198", "141", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB2-146"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 16, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA575566", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA575566", "label": "PRJNA575566", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 9, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA575566", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 372.39453499933006}