{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA565584\", tax_kingdom = \"Pseudomonadati\" and tax_phylum = \"Spirochaetota\"", "rows": [[1831491, "PRJNA565584_P_NODE_196182_length_245_cov_0.895349_g195030_i0", "PRJNA565584", "196182", "245", "0.895349", "2.19360505", "Gracilinema caldarium", "215591", "Bacteria", "Bacteria", "97.1", "3e-21", "", "NR", "WP_013969729.1", "215591", "g195030", "i0", "55.6", "4.93469387755102", "81", "36", "99.2", "0", "243", "1", "870", "950", "WP_013969729.1 ligand-binding sensor domain-containing diguanylate cyclase [Gracilinema caldarium]", "diamond", "1209", "97.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Breznakiellaceae", "Gracilinema", "Gracilinema caldarium"], [5658388, "PRJNA565584_P_NODE_119445_length_282_cov_1.473684_g118293_i0", "PRJNA565584", "119445", "282", "1.473684", "4.15578888", "Leptospira mgodei", "3235172", "Bacteria", "Bacteria", "516", "7.67e-142", "", "NTclustered", "gi|2777195838|gb|CP162139.1|", "3235172", "g118293", "i0", "99.645", "1", "282", "1", "100", "0", "1", "282", "1824465", "1824184", "Leptospira mgodei strain WS4.C2 chromosome 1, complete sequence", "blastn", "282", "516", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Leptospira", "Leptospira mgodei"], [5661668, "PRJNA565584_P_NODE_92485_length_310_cov_2.746835_g91333_i0", "PRJNA565584", "92485", "310", "2.746835", "8.5151885", "Treponema sp. Marseille-Q4132", "2766701", "Bacteria", "Bacteria", "464", "3.14e-126", "", "NTclustered", "gi|1897717435|gb|CP060591.1|", "2766701", "g91333", "i0", "92.605", "3.10322580645161", "311", "21", "99", "1", "2", "310", "2464696", "2465006", "Treponema sp. Marseille-Q4132 chromosome", "blastn", "962", "464", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q4132"], [10062584, "PRJNA565584_P_NODE_146528_length_264_cov_2.204188_g145376_i0", "PRJNA565584", "146528", "264", "2.204188", "5.81905632", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "466", "7.27e-127", "", "NTclustered", "gi|719625061|gb|CP009227.1|", "1539298", "g145376", "i0", "98.485", "12.9734848484848", "264", "4", "100", "0", "1", "264", "1125897", "1125634", "Treponema sp. OMZ 838, complete genome", "blastn", "3425", "466", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. OMZ 838"], [10759308, "PRJNA565584_P_NODE_135489_length_272_cov_1.185930_g134337_i0", "PRJNA565584", "135489", "272", "1.18593", "3.2257296", "Leptospira cinconiae", "3235173", "Bacteria", "Bacteria", "497", "2.67e-136", "", "NTclustered", "gi|2777192084|gb|CP162137.1|", "3235173", "g134337", "i0", "99.632", "1", "272", "1", "100", "0", "1", "272", "1335280", "1335009", "Leptospira cinconiae strain WS58.C1 chromosome 1, complete sequence", "blastn", "272", "497", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Leptospira", "Leptospira cinconiae"], [16437169, "PRJNA565584_P_NODE_196493_length_245_cov_0.895349_g195341_i0", "PRJNA565584", "196493", "245", "0.895349", "2.19360505", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "85.1", "2.74e-17", "", "NR", "MBX7059936.1", "2604146", "g195341", "i0", "50", "1.98367346938776", "78", "36", "91.8", "1", "244", "20", "272", "349", "MBX7059936.1 catalase family protein [Leptospirales bacterium]", "diamond", "486", "85.9", "0.990686845168801", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", null, null, "Leptospirales bacterium"], [17132364, "PRJNA565584_P_NODE_123494_length_279_cov_2.733010_g122342_i0", "PRJNA565584", "123494", "279", "2.73301", "7.6250979", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "433", "7.85e-117", "", "NTclustered", "gi|2034589463|gb|CP050497.1|", "69710", "g122342", "i0", "94.624", "5", "279", "15", "100", "0", "1", "279", "1181273", "1181551", "Treponema vincentii strain OMZ 806 chromosome, complete genome", "blastn", "1395", "433", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [17712392, "PRJNA565584_P_NODE_196574_length_245_cov_0.895349_g195422_i0", "PRJNA565584", "196574", "245", "0.895349", "2.19360505", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "147", "9.86e-31", "", "NTclustered", "gi|2265141765|gb|CP051199.1|", "2563664", "g195422", "i0", "98.78", "40.9836734693878", "82", "1", "61", "0", "61", "142", "1330157", "1330238", "Treponema sp. OMZ 788 chromosome, complete genome", "blastn", "10041", "147", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. OMZ 788"], [19682248, "PRJNA565584_P_NODE_183196_length_248_cov_0.880000_g182044_i0", "PRJNA565584", "183196", "248", "0.88", "2.1824", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "453", "5.2600000000000005e-123", "", "NTclustered", "gi|2265115921|gb|CP051153.1|", "69710", "g182044", "i0", "99.597", "5", "248", "1", "100", "0", "1", "248", "2423206", "2423453", "Treponema vincentii strain OMZ 862 chromosome, complete genome", "blastn", "1240", "453", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [26636229, "PRJNA565584_P_NODE_75921_length_341_cov_1.149254_g74770_i0", "PRJNA565584", "75921", "341", "1.149254", "3.91895614", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "44.7", "0.0238", "", "NR", "GHV25216.1", "2053615", "g74770", "i0", "31.8", "0.967741935483871", "110", "68", "90.6", "1", "322", "14", "263", "372", "GHV25216.1 hypothetical protein FACS189498_3240 [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "330", "44.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [26667561, "PRJNA565584_P_NODE_126261_length_278_cov_1.209756_g125109_i0", "PRJNA565584", "126261", "278", "1.209756", "3.36312168", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "144", "1.2999999999999998e-38", "", "NR", "GHV24167.1", "2053615", "g125109", "i0", "77.8", "1.94244604316547", "90", "20", "97.1", "0", "3", "272", "385", "474", "GHV24167.1 capsular polysaccharide biosynthesis protein [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "540", "144", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [26903388, "PRJNA565584_P_NODE_195941_length_245_cov_0.895349_g194789_i0", "PRJNA565584", "195941", "245", "0.895349", "2.19360505", "Pleomorphochaeta", "1920504", "Bacteria", "Bacteria", "103", "1.3399999999999999e-25", "", "NR", "MDC7244240.1", "1920505", "g194789", "i0", "62.2", "5.84081632653061", "82", "30", "99.2", "1", "3", "245", "90", "171", "MDC7244240.1 phosphoribosyltransferase [Pleomorphochaeta sp.]", "diamond", "1431", "103", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Sphaerochaetaceae", "Pleomorphochaeta", "Pleomorphochaeta sp."], [27205501, "PRJNA565584_P_NODE_135562_length_272_cov_1.160804_g134410_i0", "PRJNA565584", "135562", "272", "1.160804", "3.15738688", "Spirochaetaceae bacterium", "1898206", "Bacteria", "Bacteria", "102", "3.25e-23", "", "NR", "MDA3852253.1", "1898206", "g134410", "i0", "60.5", "2.93382352941176", "86", "31", "94.9", "2", "13", "270", "73", "155", "MDA3852253.1 asparagine--tRNA ligase [Spirochaetaceae bacterium]", "diamond", "798", "102", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Spirochaetaceae", null, "Spirochaetaceae bacterium"], [27458724, "PRJNA565584_P_NODE_124043_length_279_cov_1.495146_g122891_i0", "PRJNA565584", "124043", "279", "1.495146", "4.17145734", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "51.2", "5.79e-5", "", "NR", "MBS7294236.1", "166", "g122891", "i0", "34.2", "0.817204301075269", "76", "48", "79.6", "2", "230", "9", "351", "426", "MBS7294236.1 hypothetical protein [Treponema sp.]", "diamond", "228", "51.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [27616589, "PRJNA565584_P_NODE_200104_length_244_cov_0.900585_g198952_i0", "PRJNA565584", "200104", "244", "0.900585", "2.1974274", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "73.6", "4.68e-13", "", "NR", "MCL2478242.1", "166", "g198952", "i0", "44", "0.922131147540984", "75", "42", "92.2", "0", "239", "15", "180", "254", "MCL2478242.1 hypothetical protein [Treponema sp.]", "diamond", "225", "73.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [27679958, "PRJNA565584_P_NODE_195384_length_245_cov_0.895349_g194232_i0", "PRJNA565584", "195384", "245", "0.895349", "2.19360505", "Spirochaetota bacterium", "2202144", "Bacteria", "Bacteria", "60.8", "1.52e-8", "", "NR", "MDH5680916.1", "2202144", "g194232", "i0", "55.3", "0.575510204081633", "47", "21", "57.6", "0", "3", "143", "48", "94", "MDH5680916.1 phosphoglucosamine mutase [Spirochaetota bacterium]", "diamond", "141", "60.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetota bacterium"], [27756729, "PRJNA565584_P_NODE_53404_length_407_cov_1.383234_g52253_i0", "PRJNA565584", "53404", "407", "1.383234", "5.62976238", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "60.8", "9.77e-8", "", "NR", "MBU45438.1", "1898206", "g52253", "i0", "39.3", "3.90663390663391", "89", "46", "60.4", "4", "4", "249", "289", "376", "MBU45438.1 NADP-dependent succinic semialdehyde dehydrogenase [Spirochaetaceae bacterium]", "diamond", "1590", "60.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Spirochaetaceae", null, "Spirochaetaceae bacterium"], [27837356, "PRJNA565584_P_NODE_208664_length_242_cov_0.911243_g207512_i0", "PRJNA565584", "208664", "242", "0.911243", "2.20520806", "Treponema phagedenis", "162", "Bacteria", "Bacteria", "122", "3.02e-31", "", "NR", "WP_024753216.1", "162", "g207512", "i0", "73.4", "0.979338842975207", "79", "20", "96.7", "1", "6", "239", "296", "374", "WP_024753216.1 alanine racemase [Treponema phagedenis]", "diamond", "237", "122", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema phagedenis"], [28121764, "PRJNA565584_P_NODE_97525_length_303_cov_0.995652_g96373_i0", "PRJNA565584", "97525", "303", "0.995652", "3.01682556", "Spirochaetales bacterium", "2026792", "Bacteria", "Bacteria", "108", "2.99e-25", "", "NR", "MBT3272796.1", "2026792", "g96373", "i0", "53", "10.1683168316832", "100", "44", "96", "2", "301", "11", "317", "416", "MBT3272796.1 CotH kinase family protein [Spirochaetales bacterium]", "diamond", "3081", "108", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", null, null, "Spirochaetales bacterium"], [28293111, "PRJNA565584_P_NODE_39606_length_477_cov_1.363861_g38455_i0", "PRJNA565584", "39606", "477", "1.363861", "6.50561697", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "50.8", "2.92e-4", "", "NR", "MDR0554012.1", "166", "g38455", "i0", "29.4", "3.57861635220126", "136", "82", "81.8", "3", "466", "77", "13", "140", "MDR0554012.1 rhomboid family intramembrane serine protease [Treponema sp.]", "diamond", "1707", "51.2", "0.9921875", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [28532291, "PRJNA565584_P_NODE_190947_length_246_cov_0.890173_g189795_i0", "PRJNA565584", "190947", "246", "0.890173", "2.18982558", "Leptospiraceae bacterium", "2026757", "Bacteria", "Bacteria", "61.2", "1.11e-8", "", "NR", "MBK8398112.1", "2026757", "g189795", "i0", "40.2", "2.80487804878049", "82", "45", "100", "2", "246", "1", "171", "248", "MBK8398112.1 alpha/beta fold hydrolase [Leptospiraceae bacterium]", "diamond", "690", "61.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", null, "Leptospiraceae bacterium"], [28595485, "PRJNA565584_P_NODE_27687_length_586_cov_2.157895_g26546_i0", "PRJNA565584", "27687", "586", "2.157895", "12.6452647", "Spirochaetales bacterium", "2026792", "Bacteria", "Bacteria", "63.5", "2.14e-8", "", "NR", "MBN2874962.1", "2026792", "g26546", "i0", "57.4", "0.486348122866894", "47", "20", "24.1", "0", "393", "533", "181", "227", "MBN2874962.1 CAP domain-containing protein [Spirochaetales bacterium]", "diamond", "285", "63.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", null, null, "Spirochaetales bacterium"], [28595499, "PRJNA565584_P_NODE_49907_length_421_cov_1.767241_g48756_i0", "PRJNA565584", "49907", "421", "1.767241", "7.44008461", "Spirochaetota bacterium", "2202144", "Bacteria", "Bacteria", "65.9", "4.23e-10", "", "NR", "HSA14422.1", "2202144", "g48756", "i0", "32.1", "1.94536817102138", "137", "85", "97.6", "3", "412", "2", "41", "169", "HSA14422.1 hypothetical protein [Spirochaetota bacterium]", "diamond", "819", "65.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetota bacterium"], [28627080, "PRJNA565584_P_NODE_197587_length_245_cov_0.895349_g196435_i0", "PRJNA565584", "197587", "245", "0.895349", "2.19360505", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "67.8", "5.71e-11", "", "NR", "GHV80811.1", "2053615", "g196435", "i0", "47.3", "1.91020408163265", "74", "37", "90.6", "1", "238", "17", "410", "481", "GHV80811.1 hypothetical protein AGMMS49944_26020 [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "468", "67.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [28690167, "PRJNA565584_P_NODE_142467_length_267_cov_1.587629_g141315_i0", "PRJNA565584", "142467", "267", "1.587629", "4.23896943", "Candidatus Ornithospirochaeta stercorigallinarum", "2840898", "Bacteria", "Bacteria", "123", "1.9e-31", "", "NR", "HIS14517.1", "2840898", "g141315", "i0", "97.1", "0.764044943820225", "68", "2", "76.4", "0", "3", "206", "305", "372", "HIS14517.1 patatin-like phospholipase family protein [Candidatus Ornithospirochaeta stercorigallinarum]", "diamond", "204", "123", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Spirochaetaceae", "Candidatus Ornithospirochaeta", "Candidatus Ornithospirochaeta stercorigallinarum"], [28766788, "PRJNA565584_P_NODE_7607_length_1230_cov_4.222126_g6902_i0", "PRJNA565584", "7607", "1230", "4.222126", "51.9321498", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "84", "3.13e-14", "", "NR", "MDR2632347.1", "166", "g6902", "i0", "27.5", "1.84634146341463", "193", "116", "43.2", "5", "1186", "656", "80", "264", "MDR2632347.1 CAP domain-containing protein [Treponema sp.]", "diamond", "2271", "84.3", "0.99644128113879", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [28910788, "PRJNA565584_P_NODE_60708_length_381_cov_1.996753_g59557_i0", "PRJNA565584", "60708", "381", "1.996753", "7.60762893", "Leptospiraceae bacterium", "2026757", "Bacteria", "Bacteria", "57", "4.22e-8", "", "NR", "MCB1177358.1", "2026757", "g59557", "i0", "49.1", "0.417322834645669", "53", "26", "40.9", "1", "163", "8", "1", "53", "MCB1177358.1 hypothetical protein [Leptospiraceae bacterium]", "diamond", "159", "57", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", null, "Leptospiraceae bacterium"], [28942888, "PRJNA565584_P_NODE_204528_length_243_cov_0.905882_g203376_i0", "PRJNA565584", "204528", "243", "0.905882", "2.20129326", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "126", "1.08e-31", "", "NR", "HUI71271.1", "2053615", "g203376", "i0", "66.3", "1.97530864197531", "80", "27", "98.8", "0", "1", "240", "88", "167", "HUI71271.1 hypothetical protein [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "480", "126", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [29069013, "PRJNA565584_P_NODE_143288_length_266_cov_3.373057_g142136_i0", "PRJNA565584", "143288", "266", "3.373057", "8.97233162", "Spirochaetae bacterium HGW-Spirochaetae-3", "2013835", "Bacteria", "Bacteria", "45.1", "0.00745", "", "NR", "PKL23071.1", "2013835", "g142136", "i0", "35.3", "0.958646616541353", "85", "48", "95.9", "1", "256", "2", "27", "104", "PKL23071.1 MAG: hypothetical protein CVV47_16305 [Spirochaetae bacterium HGW-Spirochaetae-3]", "diamond", "255", "45.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetae bacterium HGW-Spirochaetae-3"], [29082690, "PRJNA565584_P_NODE_70928_length_353_cov_1.100000_g69777_i0", "PRJNA565584", "70928", "353", "1.1", "3.883", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "54.3", "2.53e-6", "", "NR", "WP_272532658.1", "1513297", "g69777", "i0", "34.5", "1.47875354107649", "87", "55", "73.1", "2", "298", "41", "17", "102", "WP_272532658.1 hypothetical protein [Leptospira sp. GIMC2001]", "diamond", "522", "54.7", "0.992687385740402", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Leptospira", "Leptospira sp. GIMC2001"], [29384732, "PRJNA565584_P_NODE_186949_length_247_cov_0.885057_g185797_i0", "PRJNA565584", "186949", "247", "0.885057", "2.18609079", "Candidatus Treponema excrementipullorum", "2838768", "Bacteria", "Bacteria", "181", "2.6499999999999998e-52", "", "NR", "MBU3849231.1", "2838768", "g185797", "i0", "100", "0.983805668016194", "81", "0", "98.4", "0", "245", "3", "146", "226", "MBU3849231.1 asparagine synthase B [Candidatus Treponema excrementipullorum]", "diamond", "243", "181", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Candidatus Treponema excrementipullorum"], [29461126, "PRJNA565584_P_NODE_133290_length_273_cov_1.540000_g132138_i0", "PRJNA565584", "133290", "273", "1.54", "4.2042", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "80.1", "4.19e-16", "", "NR", "MDR3341879.1", "166", "g132138", "i0", "44.9", "3.68131868131868", "89", "49", "97.8", "0", "5", "271", "78", "166", "MDR3341879.1 CAP domain-containing protein [Treponema sp.]", "diamond", "1005", "80.5", "0.995031055900621", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [29573907, "PRJNA565584_P_NODE_50550_length_418_cov_2.234783_g49399_i0", "PRJNA565584", "50550", "418", "2.234783", "9.34139294", "Oceanispirochaeta crateris", "2518645", "Bacteria", "Bacteria", "71.2", "2.65e-11", "", "NR", "WP_149486566.1", "2518645", "g49399", "i0", "37.3", "1.01913875598086", "142", "76", "98.3", "4", "416", "6", "161", "294", "WP_149486566.1 glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing) [Oceanispirochaeta crateris]", "diamond", "426", "71.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Spirochaetaceae", "Oceanispirochaeta", "Oceanispirochaeta crateris"], [29618918, "PRJNA565584_P_NODE_124850_length_279_cov_1.116505_g123698_i0", "PRJNA565584", "124850", "279", "1.116505", "3.11504895", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "65.1", "7.84e-10", "", "NR", "MDR2951739.1", "166", "g123698", "i0", "37", "5.90322580645161", "92", "54", "98.9", "1", "4", "279", "368", "455", "MDR2951739.1 caspase family protein [Treponema sp.]", "diamond", "1647", "65.5", "0.993893129770992", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [29636896, "PRJNA565584_P_NODE_58730_length_388_cov_0.977778_g57579_i0", "PRJNA565584", "58730", "388", "0.977778", "3.79377864", "Sphaerochaetaceae bacterium", "2791017", "Bacteria", "Bacteria", "170", "1.9899999999999995e-47", "", "NR", "MFA7188483.1", "2791017", "g57579", "i0", "88.4", "0.734536082474227", "95", "11", "73.5", "0", "102", "386", "1", "95", "MFA7188483.1 hypothetical protein [Sphaerochaetaceae bacterium]", "diamond", "285", "170", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Sphaerochaetaceae", null, "Sphaerochaetaceae bacterium"], [29713637, "PRJNA565584_P_NODE_11650_length_980_cov_1.143330_g10690_i0", "PRJNA565584", "11650", "980", "1.14333", "11.204634", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "148", "1.17e-37", "", "NR", "WP_135766052.1", "2484901", "g10690", "i0", "30.1", "5.76428571428571", "322", "178", "86.6", "7", "867", "19", "29", "342", "WP_135766052.1 catalase family protein [Leptospira ilyithenensis]", "diamond", "5649", "148", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Leptospira", "Leptospira ilyithenensis"], [29731636, "PRJNA565584_P_NODE_132190_length_274_cov_1.328358_g131038_i0", "PRJNA565584", "132190", "274", "1.328358", "3.63970092", "Spirochaetes bacterium GWB1_59_5", "1802176", "Bacteria", "Bacteria", "58.9", "4.21e-8", "", "NR", "OHD18884.1", "1802176", "g131038", "i0", "42.5", "2.9014598540146", "87", "48", "93.1", "1", "259", "5", "66", "152", "OHD18884.1 MAG: hypothetical protein A2Y38_14560 [Spirochaetes bacterium GWB1_59_5]", "diamond", "795", "58.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetes bacterium GWB1_59_5"], [30079283, "PRJNA565584_P_NODE_39232_length_479_cov_2.985222_g38081_i0", "PRJNA565584", "39232", "479", "2.985222", "14.29921338", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "85.1", "1.31e-17", "", "NR", "MDH5656459.1", "2053615", "g38081", "i0", "68.5", "0.338204592901879", "54", "17", "33.8", "0", "317", "478", "19", "72", "MDH5656459.1 50S ribosomal protein L13 [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "162", "85.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [30142161, "PRJNA565584_P_NODE_145592_length_265_cov_1.598958_g144440_i0", "PRJNA565584", "145592", "265", "1.598958", "4.2372387", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "112", "1.88e-27", "", "NR", "HKJ85084.1", "2053615", "g144440", "i0", "56.8", "0.99622641509434", "88", "37", "99.6", "1", "265", "2", "213", "299", "HKJ85084.1 hypothetical protein [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "264", "112", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [30174164, "PRJNA565584_P_NODE_57852_length_391_cov_0.952830_g56701_i0", "PRJNA565584", "57852", "391", "0.95283", "3.7255653", "Turneriella parva", "29510", "Bacteria", "Bacteria", "232", "5.7899999999999996e-74", "", "NR", "WP_014802630.1", "29510", "g56701", "i0", "77.3", "2.9079283887468", "128", "29", "98.2", "0", "389", "6", "148", "275", "WP_014802630.1 hypothetical protein [Turneriella parva]", "diamond", "1137", "232", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Turneriella", "Turneriella parva"], [30314759, "PRJNA565584_P_NODE_28052_length_581_cov_1.921260_g26909_i0", "PRJNA565584", "28052", "581", "1.92126", "11.1625206", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "70.9", "4.18e-11", "", "NR", "MCL2480986.1", "1898206", "g26909", "i0", "34.9", "7.46127366609294", "106", "64", "54.7", "1", "1", "318", "115", "215", "MCL2480986.1 30S ribosomal protein S3 [Spirochaetaceae bacterium]", "diamond", "4335", "70.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Spirochaetaceae", null, "Spirochaetaceae bacterium"], [30900954, "PRJNA565584_P_NODE_154754_length_259_cov_1.650538_g153602_i0", "PRJNA565584", "154754", "259", "1.650538", "4.27489342", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "42.7", "0.04", "", "NR", "MDA8424982.1", "166", "g153602", "i0", "32.1", "0.972972972972973", "84", "55", "96.1", "2", "4", "252", "24", "106", "MDA8424982.1 hypothetical protein [Treponema sp.]", "diamond", "252", "42.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [30995802, "PRJNA565584_P_NODE_72514_length_349_cov_1.126812_g71363_i0", "PRJNA565584", "72514", "349", "1.126812", "3.93257388", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "51.2", "1.28e-4", "", "NR", "MCE9599478.1", "2053615", "g71363", "i0", "36.1", "0.713467048710602", "83", "48", "71.3", "1", "98", "346", "6", "83", "MCE9599478.1 aldo/keto reductase [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "249", "51.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [31311598, "PRJNA565584_P_NODE_161355_length_255_cov_1.076923_g160203_i0", "PRJNA565584", "161355", "255", "1.076923", "2.74615365", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "68.6", "3.41e-11", "", "NR", "MCR5623533.1", "166", "g160203", "i0", "47.2", "0.847058823529412", "72", "38", "84.7", "0", "10", "225", "72", "143", "MCR5623533.1 hypothetical protein [Treponema sp.]", "diamond", "216", "68.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [31641593, "PRJNA565584_P_NODE_64936_length_368_cov_3.393220_g63785_i0", "PRJNA565584", "64936", "368", "3.39322", "12.4870496", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "67.8", "9.66e-11", "", "NR", "MBR4374040.1", "166", "g63785", "i0", "48.3", "0.978260869565217", "60", "31", "48.9", "0", "2", "181", "187", "246", "MBR4374040.1 CAP domain-containing protein [Treponema sp.]", "diamond", "360", "67.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [31785927, "PRJNA565584_P_NODE_142577_length_267_cov_1.561856_g141425_i0", "PRJNA565584", "142577", "267", "1.561856", "4.17015552", "Spirochaetae bacterium HGW-Spirochaetae-3", "2013835", "Bacteria", "Bacteria", "153", "5.07e-44", "", "NR", "PKL23227.1", "2013835", "g141425", "i0", "87.6", "1", "89", "11", "100", "0", "267", "1", "146", "234", "PKL23227.1 MAG: molybdopterin dehydrogenase [Spirochaetae bacterium HGW-Spirochaetae-3]", "diamond", "267", "153", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetae bacterium HGW-Spirochaetae-3"], [31894707, "PRJNA565584_P_NODE_156537_length_258_cov_1.432432_g155385_i0", "PRJNA565584", "156537", "258", "1.432432", "3.69567456", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "47.4", "0.00102", "", "NR", "MDR1252473.1", "166", "g155385", "i0", "59.5", "2.18604651162791", "37", "15", "43", "0", "14", "124", "131", "167", "MDR1252473.1 fibronectin type III domain-containing protein [Treponema sp.]", "diamond", "564", "47.8", "0.99163179916318", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [32052932, "PRJNA565584_P_NODE_204738_length_243_cov_0.905882_g203586_i0", "PRJNA565584", "204738", "243", "0.905882", "2.20129326", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "47", "7.87e-4", "", "NR", "MCI1208542.1", "166", "g203586", "i0", "43.4", "3.20987654320988", "53", "30", "65.4", "0", "7", "165", "143", "195", "MCI1208542.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit [Treponema sp.]", "diamond", "780", "47.4", "0.991561181434599", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [32070869, "PRJNA565584_P_NODE_172938_length_250_cov_0.870056_g171786_i0", "PRJNA565584", "172938", "250", "0.870056", "2.17514", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "118", "7.17e-29", "", "NR", "MEL3907153.1", "166", "g171786", "i0", "69.9", "0.996", "83", "25", "99.6", "0", "1", "249", "64", "146", "MEL3907153.1 methyl-accepting chemotaxis protein [Treponema sp.]", "diamond", "249", "118", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [32134212, "PRJNA565584_P_NODE_113858_length_286_cov_1.084507_g112706_i0", "PRJNA565584", "113858", "286", "1.084507", "3.10169002", "Spirochaetota bacterium", "2202144", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.0242", "", "NR", "MEM7181493.1", "2202144", "g112706", "i0", "32.4", "0.713286713286713", "68", "34", "58.7", "2", "285", "118", "88", "155", "MEM7181493.1 hypothetical protein [Spirochaetota bacterium]", "diamond", "204", "43.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetota bacterium"], [32197529, "PRJNA565584_P_NODE_185858_length_247_cov_1.132184_g184706_i0", "PRJNA565584", "185858", "247", "1.132184", "2.79649448", "Spirochaetales bacterium", "2026792", "Bacteria", "Bacteria", "104", "9.76e-25", "", "NR", "MBN1697184.1", "2026792", "g184706", "i0", "56.6", "10.9068825910931", "76", "33", "92.3", "0", "229", "2", "20", "95", "MBN1697184.1 paraslipin [Spirochaetales bacterium]", "diamond", "2694", "104", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", null, null, "Spirochaetales bacterium"], [32356011, "PRJNA565584_P_NODE_66239_length_365_cov_1.335616_g65088_i0", "PRJNA565584", "66239", "365", "1.335616", "4.8749984", "Brachyspira intermedia", "84377", "Bacteria", "Bacteria", "45.8", "0.0098", "", "NR", "WP_300741451.1", "84377", "g65088", "i0", "47.9", "0.764383561643836", "48", "24", "39.5", "1", "210", "353", "20", "66", "WP_300741451.1 ankyrin repeat domain-containing protein [Brachyspira intermedia]", "diamond", "279", "45.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Brachyspirales", "Brachyspiraceae", "Brachyspira", "Brachyspira intermedia"], [32419076, "PRJNA565584_P_NODE_220259_length_231_cov_2.689873_g219107_i0", "PRJNA565584", "220259", "231", "2.689873", "6.21360663", "Spirochaetota bacterium", "2202144", "Bacteria", "Bacteria", "124", "8.35e-33", "", "NR", "HPJ41256.1", "2202144", "g219107", "i0", "81.1", "0.961038961038961", "74", "14", "96.1", "0", "224", "3", "178", "251", "HPJ41256.1 hypothetical protein [Spirochaetota bacterium]", "diamond", "222", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetota bacterium"], [32450953, "PRJNA565584_P_NODE_96679_length_304_cov_1.666667_g95527_i0", "PRJNA565584", "96679", "304", "1.666667", "5.06666768", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "47.8", "1.97e-4", "", "NR", "MFO7729640.1", "2053615", "g95527", "i0", "92.9", "0.276315789473684", "28", "0", "27.6", "1", "86", "3", "8", "33", "MFO7729640.1 hypothetical protein [Spirochaetia bacterium]", "diamond", "84", "47.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [32765980, "PRJNA565584_P_NODE_214140_length_241_cov_0.916667_g212988_i0", "PRJNA565584", "214140", "241", "0.916667", "2.20916747", "Spirochaetota bacterium", "2202144", "Bacteria", "Bacteria", "42", "0.0296", "", "NR", "MCX7040941.1", "2202144", "g212988", "i0", "27.4", "0.908713692946058", "73", "53", "90.9", "0", "220", "2", "26", "98", "MCX7040941.1 type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin [Spirochaetota bacterium]", "diamond", "219", "42", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetota bacterium"], [32891935, "PRJNA565584_P_NODE_87500_length_318_cov_0.844898_g86348_i0", "PRJNA565584", "87500", "318", "0.844898", "2.68677564", "Leptospiraceae bacterium", "2026757", "Bacteria", "Bacteria", "52", "4.22e-5", "", "NR", "MBK8398971.1", "2026757", "g86348", "i0", "30.6", "2.83962264150943", "85", "54", "77.4", "2", "299", "54", "211", "293", "MBK8398971.1 hypothetical protein [Leptospiraceae bacterium]", "diamond", "903", "52", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", null, "Leptospiraceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 56, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_kingdom\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA565584", "p1": "Pseudomonadati", "p2": "Spirochaetota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "PRJNA565584", "label": "PRJNA565584", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 49, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Spirochaetota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Spirochaetota", "label": "Spirochaetota", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 560.5465589906089}