{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA562549\", tax_phylum = \"Bdellovibrionota\" and tax_superkingdom = \"Bacteria\"", "rows": [[545758, "PRJNA562549_P_NODE_33141_length_208_cov_0.884354_g32908_i0", "PRJNA562549", "33141", "208", "0.884354", "1.83945632", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "89.7", "2.47e-21", "", "NR", "MCB0369061.1", "2053517", "g32908", "i0", "93.5", "2.625", "46", "3", "66.3", "0", "208", "71", "55", "100", "MCB0369061.1 GTP-binding protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "546", "89.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [4373080, "PRJNA562549_P_NODE_1324_length_925_cov_2.854167_g1235_i0", "PRJNA562549", "1324", "925", "2.854167", "26.40104475", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "427", "8.489999999999999e-148", "", "NR", "MCB0368864.1", "2053517", "g1235", "i0", "68.8", "0.998918918918919", "308", "88", "99.9", "3", "925", "2", "5", "304", "MCB0368864.1 C1 family peptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "924", "427", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [19672147, "PRJNA562549_P_NODE_16496_length_284_cov_2.206278_g16263_i0", "PRJNA562549", "16496", "284", "2.206278", "6.26582952", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "102", "1.84e-26", "", "NR", "MCB0371283.1", "2053517", "g16263", "i0", "76.3", "0.623239436619718", "59", "14", "62.3", "0", "96", "272", "3", "61", "MCB0371283.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "177", "102", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [23498188, "PRJNA562549_P_NODE_34939_length_205_cov_0.902778_g34706_i0", "PRJNA562549", "34939", "205", "0.902778", "1.8506949", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "99.8", "9.45e-26", "", "NR", "MCB0368925.1", "2053517", "g34706", "i0", "83.3", "0.790243902439024", "54", "9", "79", "0", "164", "3", "1", "54", "MCB0368925.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "162", "99.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [24772121, "PRJNA562549_P_NODE_5960_length_472_cov_2.846715_g5727_i0", "PRJNA562549", "5960", "472", "2.846715", "13.4364948", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "265", "2.2599999999999997e-88", "", "NR", "MCB0369647.1", "2053517", "g5727", "i0", "78.3", "1.99576271186441", "157", "34", "99.8", "0", "471", "1", "9", "165", "MCB0369647.1 uL30 family ribosomal protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "942", "265", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [26604102, "PRJNA562549_P_NODE_32481_length_209_cov_1.337838_g32248_i0", "PRJNA562549", "32481", "209", "1.337838", "2.79608142", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "88.2", "1.28e-20", "", "NR", "MCB0370983.1", "2053517", "g32248", "i0", "74.5", "1.46411483253589", "51", "13", "73.2", "0", "155", "3", "1", "51", "MCB0370983.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "306", "88.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27300459, "PRJNA562549_P_NODE_33763_length_207_cov_0.890411_g33530_i0", "PRJNA562549", "33763", "207", "0.890411", "1.84315077", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "48.5", "3.25e-5", "", "NR", "MCB0368048.1", "2053517", "g33530", "i0", "60", "0.507246376811594", "35", "14", "50.7", "0", "106", "2", "9", "43", "MCB0368048.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "105", "48.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27711437, "PRJNA562549_P_NODE_37884_length_192_cov_2.183206_g37651_i0", "PRJNA562549", "37884", "192", "2.183206", "4.19175552", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "120", "4.11e-33", "", "NR", "MCB0369869.1", "2053517", "g37651", "i0", "95.2", "1.96875", "63", "3", "98.4", "0", "190", "2", "1", "63", "MCB0369869.1 uL15 family ribosomal protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "378", "120", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27742818, "PRJNA562549_P_NODE_21384_length_252_cov_2.026178_g21151_i0", "PRJNA562549", "21384", "252", "2.026178", "5.10596856", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "130", "1.35e-36", "", "NR", "MCB0368309.1", "2053517", "g21151", "i0", "81.6", "0.904761904761905", "76", "14", "90.5", "0", "228", "1", "1", "76", "MCB0368309.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "228", "130", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27931963, "PRJNA562549_P_NODE_14865_length_298_cov_2.586498_g14632_i0", "PRJNA562549", "14865", "298", "2.586498", "7.70776404", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "163", "3.0099999999999996e-47", "", "NR", "MCB0369725.1", "2053517", "g14632", "i0", "87.5", "0.885906040268456", "88", "11", "88.6", "0", "34", "297", "8", "95", "MCB0369725.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "264", "163", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27963538, "PRJNA562549_P_NODE_22905_length_244_cov_2.945355_g22672_i0", "PRJNA562549", "22905", "244", "2.945355", "7.1866662", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "124", "5.26e-34", "", "NR", "MBP9675022.1", "2081706", "g22672", "i0", "96.7", "0.75", "61", "2", "75", "0", "1", "183", "66", "126", "MBP9675022.1 EF-hand domain-containing protein [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "183", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [28879089, "PRJNA562549_P_NODE_29788_length_216_cov_1.780645_g29555_i0", "PRJNA562549", "29788", "216", "1.780645", "3.8461932", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "47.8", "7.26e-5", "", "NR", "MCB0369525.1", "2053517", "g29555", "i0", "52.9", "0.472222222222222", "34", "16", "47.2", "0", "6", "107", "40", "73", "MCB0369525.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "102", "47.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29005893, "PRJNA562549_P_NODE_16168_length_287_cov_1.477876_g15935_i0", "PRJNA562549", "16168", "287", "1.477876", "4.24150412", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "180", "4.4199999999999985e-56", "", "NR", "MCB0370084.1", "2053517", "g15935", "i0", "94.7", "1.98606271777003", "95", "5", "99.3", "0", "1", "285", "10", "104", "MCB0370084.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "570", "180", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29037324, "PRJNA562549_P_NODE_33268_length_208_cov_0.884354_g33035_i0", "PRJNA562549", "33268", "208", "0.884354", "1.83945632", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "85.5", "4.75e-20", "", "NR", "MCB0371261.1", "2053517", "g33035", "i0", "71.4", "1.80288461538462", "56", "16", "80.8", "0", "41", "208", "1", "56", "MCB0371261.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "375", "85.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29352929, "PRJNA562549_P_NODE_25989_length_230_cov_3.313609_g25756_i0", "PRJNA562549", "25989", "230", "3.313609", "7.6213007", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "153", "9.26e-43", "", "NR", "MCB0368368.1", "2053517", "g25756", "i0", "97.3", "0.978260869565217", "75", "2", "97.8", "0", "6", "230", "270", "344", "MCB0368368.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "225", "153", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29384455, "PRJNA562549_P_NODE_19569_length_263_cov_1.138614_g19336_i0", "PRJNA562549", "19569", "263", "1.138614", "2.99455482", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "133", "2.5899999999999996e-37", "", "NR", "MCB0371036.1", "2053517", "g19336", "i0", "95.8", "0.809885931558935", "71", "3", "81", "0", "2", "214", "107", "177", "MCB0371036.1 HAD-IC family P-type ATPase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "213", "133", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29510532, "PRJNA562549_P_NODE_10590_length_353_cov_1.349315_g10357_i0", "PRJNA562549", "10590", "353", "1.349315", "4.76308195", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "54.7", "1.65e-6", "", "NR", "MCB0369157.1", "2053517", "g10357", "i0", "65.8", "0.322946175637394", "38", "13", "32.3", "0", "350", "237", "100", "137", "MCB0369157.1 RICIN domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "114", "54.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29668197, "PRJNA562549_P_NODE_17710_length_275_cov_1.158879_g17477_i0", "PRJNA562549", "17710", "275", "1.158879", "3.18691725", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "56.6", "2.4e-8", "", "NR", "MCB0368701.1", "2053517", "g17477", "i0", "73.2", "0.447272727272727", "41", "11", "44.7", "0", "120", "242", "2", "42", "MCB0368701.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "123", "56.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30774391, "PRJNA562549_P_NODE_16014_length_288_cov_1.955947_g15781_i0", "PRJNA562549", "16014", "288", "1.955947", "5.63312736", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "171", "2.33e-49", "", "NR", "MCB0368368.1", "2053517", "g15781", "i0", "86.3", "0.989583333333333", "95", "13", "99", "0", "287", "3", "116", "210", "MCB0368368.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "285", "171", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31374857, "PRJNA562549_P_NODE_16756_length_282_cov_1.176471_g16523_i0", "PRJNA562549", "16756", "282", "1.176471", "3.31764822", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "75.5", "1.02e-13", "", "NR", "MCB0368270.1", "2053517", "g16523", "i0", "42.2", "0.882978723404255", "83", "48", "88.3", "0", "7", "255", "15", "97", "MCB0368270.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "249", "75.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31817451, "PRJNA562549_P_NODE_34057_length_206_cov_1.793103_g33824_i0", "PRJNA562549", "34057", "206", "1.793103", "3.69379218", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "64.3", "3.96e-10", "", "NR", "MCB0369784.1", "2053517", "g33824", "i0", "74.4", "0.567961165048544", "39", "10", "56.8", "0", "204", "88", "224", "262", "MCB0369784.1 insulinase family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "117", "64.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32102303, "PRJNA562549_P_NODE_30498_length_214_cov_1.307190_g30265_i0", "PRJNA562549", "30498", "214", "1.30719", "2.7973866", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.00204", "", "NR", "MCB0370383.1", "2053517", "g30265", "i0", "66.7", "0.378504672897196", "27", "9", "37.9", "0", "192", "112", "20", "46", "MCB0370383.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "81", "43.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 and \"tax_superkingdom\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA562549", "p1": "Bdellovibrionota", "p2": "Bacteria"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "PRJNA562549", "label": "PRJNA562549", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA562549&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 369.5415710000134}