{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA561212\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[10749715, "PRJNA561212_P_NODE_21429_length_251_cov_0.876404_g21218_i0", "PRJNA561212", "21429", "251", "0.876404", "2.19977404", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "298", "2.65e-76", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g21218", "i0", "89.451", "541.629482071713", "237", "24", "94", "1", "10", "245", "610539", "610303", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "135949", "298", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [18397445, "PRJNA561212_P_NODE_7035_length_415_cov_1.251462_g6824_i0", "PRJNA561212", "7035", "415", "1.251462", "5.1935673", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "182", "2.4499999999999998e-54", "", "NR", "MCB0368864.1", "2053517", "g6824", "i0", "65.2", "0.975903614457831", "135", "42", "97.6", "2", "1", "405", "64", "193", "MCB0368864.1 C1 family peptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "405", "182", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [22222365, "PRJNA561212_P_NODE_14578_length_293_cov_3.522727_g14367_i0", "PRJNA561212", "14578", "293", "3.522727", "10.32159011", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "420", "6.469999999999998e-113", "", "NTclustered", "gi|1950812799|gb|CP066681.1|", "349221", "g14367", "i0", "94.505", "263.184300341297", "273", "13", "93", "2", "14", "285", "658548", "658277", "Micavibrio aeruginosavorus isolate NC_groundwater_70_Ag_B-0.1um_54_66 chromosome", "blastn", "77113", "420", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [22807829, "PRJNA561212_P_NODE_14458_length_294_cov_4.108597_g14247_i0", "PRJNA561212", "14458", "294", "4.108597", "12.07927518", "Halobacteriovorax", "1652133", "Bacteria", "Bacteria", "510", "3.74e-140", "", "NTclustered", "gi|1249980216|gb|CP017414.1|", "97084", "g14247", "i0", "100", "308.676870748299", "276", "0", "94", "0", "10", "285", "235265", "234990", "Halobacteriovorax marinus strain BE01 chromosome, complete genome", "blastn", "90751", "510", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax marinus"], [26635837, "PRJNA561212_P_NODE_11921_length_321_cov_1.774194_g11710_i0", "PRJNA561212", "11921", "321", "1.774194", "5.69516274", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "90.1", "2.26e-18", "", "NR", "MEZ4704431.1", "3034175", "g11710", "i0", "52.5", "1.82242990654206", "99", "38", "92.5", "3", "306", "10", "694", "783", "MEZ4704431.1 hypothetical protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "585", "90.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [26649665, "PRJNA561212_P_NODE_23581_length_246_cov_1.676301_g23370_i0", "PRJNA561212", "23581", "246", "1.676301", "4.12370046", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "55.1", "1.77e-6", "", "NR", "MBL7689555.1", "2026715", "g23370", "i0", "52.8", "2.15853658536585", "53", "24", "64.6", "1", "236", "78", "1277", "1328", "MBL7689555.1 putative Ig domain-containing protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "531", "55.5", "0.992792792792793", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [27173728, "PRJNA561212_P_NODE_26082_length_242_cov_0.881657_g25871_i0", "PRJNA561212", "26082", "242", "0.881657", "2.13360994", "Pigmentibacter ruber", "2683196", "Bacteria", "Bacteria", "65.1", "3.57e-10", "", "NR", "BFD32711.1", "2683196", "g25871", "i0", "43.7", "0.880165289256198", "71", "34", "80.6", "1", "204", "10", "55", "125", "BFD32711.1 hypothetical protein GTC16762_23290 [Pigmentibacter ruber]", "diamond", "213", "65.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Pigmentibacter", "Pigmentibacter ruber"], [27237079, "PRJNA561212_P_NODE_17923_length_268_cov_2.297436_g17712_i0", "PRJNA561212", "17923", "268", "2.297436", "6.15712848", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "79.3", "6.65e-15", "", "NR", "MCC7442433.1", "2053517", "g17712", "i0", "54.5", "0.861940298507463", "77", "33", "85.1", "2", "257", "30", "675", "750", "MCC7442433.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "231", "79.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27584572, "PRJNA561212_P_NODE_24344_length_245_cov_0.906977_g24133_i0", "PRJNA561212", "24344", "245", "0.906977", "2.22209365", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "81.6", "2.42e-17", "", "NR", "MCB0371231.1", "2053517", "g24133", "i0", "81.6", "0.6", "49", "9", "60", "0", "48", "194", "112", "160", "MCB0371231.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "147", "81.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28405599, "PRJNA561212_P_NODE_6826_length_422_cov_0.787966_g6615_i0", "PRJNA561212", "6826", "422", "0.78796600000000006", "3.32521652", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "70.5", "5.33e-11", "", "NR", "MDB9786543.1", "2081706", "g6615", "i0", "32.5", "0.895734597156398", "126", "71", "88.9", "4", "382", "8", "74", "186", "MDB9786543.1 S8 family peptidase [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "378", "70.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [29605030, "PRJNA561212_P_NODE_22930_length_248_cov_0.891429_g22719_i0", "PRJNA561212", "22930", "248", "0.891429", "2.21074392", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "92.8", "9.51e-20", "", "NR", "MBT3983814.1", "2081706", "g22719", "i0", "59.2", "2.78225806451613", "76", "30", "91.9", "1", "239", "12", "334", "408", "MBT3983814.1 hypothetical protein [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "690", "92.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [29650413, "PRJNA561212_P_NODE_16970_length_275_cov_1.519802_g16759_i0", "PRJNA561212", "16970", "275", "1.519802", "4.1794555", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "73.2", "1.11e-12", "", "NR", "OFZ31872.1", "1797389", "g16759", "i0", "49.3", "2.38909090909091", "73", "36", "79.6", "1", "23", "241", "987", "1058", "OFZ31872.1 MAG: hypothetical protein A2622_11675 [Bdellovibrionales bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_40_29]", "diamond", "657", "73.9", "0.990527740189445", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_40_29"], [30078957, "PRJNA561212_P_NODE_25532_length_243_cov_0.917647_g25321_i0", "PRJNA561212", "25532", "243", "0.917647", "2.22988221", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "83.6", "1.19e-17", "", "NR", "MCB0369273.1", "2053517", "g25321", "i0", "75", "0.592592592592593", "48", "12", "59.3", "0", "57", "200", "35", "82", "MCB0369273.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "144", "83.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31248130, "PRJNA561212_P_NODE_12435_length_315_cov_1.789256_g12224_i0", "PRJNA561212", "12435", "315", "1.789256", "5.6361564", "Micavibrio sp.", "2024841", "Bacteria", "Bacteria", "57.4", "4.34e-7", "", "NR", "MBX2833619.1", "2024841", "g12224", "i0", "51.9", "1.16190476190476", "54", "25", "50.5", "1", "83", "241", "212", "265", "MBX2833619.1 carbonic anhydrase family protein [Micavibrio sp.]", "diamond", "366", "57.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio sp."], [32007367, "PRJNA561212_P_NODE_24818_length_244_cov_0.912281_g24607_i0", "PRJNA561212", "24818", "244", "0.912281", "2.22596564", "Bdellovibrionales bacterium RIFOXYD1_FULL_55_31", "1797404", "Bacteria", "Bacteria", "61.6", "8.64e-9", "", "NR", "OFZ83107.1", "1797404", "g24607", "i0", "51.5", "0.811475409836066", "66", "30", "81.1", "2", "37", "234", "1082", "1145", "OFZ83107.1 MAG: hypothetical protein A2603_05625 [Bdellovibrionales bacterium RIFOXYD1_FULL_55_31]", "diamond", "198", "61.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium RIFOXYD1_FULL_55_31"], [32306338, "PRJNA561212_P_NODE_22339_length_249_cov_0.886364_g22128_i0", "PRJNA561212", "22339", "249", "0.886364", "2.20704636", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "54.7", "2.48e-6", "", "NR", "MBU6154217.1", "2053517", "g22128", "i0", "46.1", "2.75903614457831", "76", "40", "91.6", "1", "11", "238", "808", "882", "MBU6154217.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "687", "54.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32324078, "PRJNA561212_P_NODE_17259_length_273_cov_1.475000_g17048_i0", "PRJNA561212", "17259", "273", "1.475", "4.02675", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "136", "1.5e-38", "", "NR", "MCB0369646.1", "2053517", "g17048", "i0", "90", "0.769230769230769", "70", "7", "76.9", "0", "9", "218", "29", "98", "MCB0369646.1 50S ribosomal protein L22 [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "210", "136", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32734399, "PRJNA561212_P_NODE_17760_length_270_cov_1.071066_g17549_i0", "PRJNA561212", "17760", "270", "1.071066", "2.8918782", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "86.3", "2.56e-17", "", "NR", "MEC7275530.1", "3034175", "g17549", "i0", "53.2", "0.877777777777778", "79", "35", "87.8", "2", "15", "251", "857", "933", "MEC7275530.1 choice-of-anchor D domain-containing protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "237", "86.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 18, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA561212", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA561212", "label": "PRJNA561212", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 3, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA561212", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 357.4254419945646}