{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA558770\", tax_kingdom = \"Pseudomonadati\" and tax_phylum = \"Nitrospirota\"", "rows": [[1815184, "PRJNA558770_P_NODE_219402_length_234_cov_3.110553_g217397_i0", "PRJNA558770", "219402", "234", "3.110553", "7.27869402", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "84.2", "7.43e-12", "", "NTclustered", "gi|2194432121|gb|CP092081.1|", "70125", "g217397", "i0", "92.982", "19.1538461538462", "57", "4", "24", "0", "160", "216", "3728487", "3728543", "MAG: Nitrospira sp. isolate UBC2 chromosome", "blastn", "4482", "84.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [3089696, "PRJNA558770_P_NODE_180503_length_234_cov_4.623116_g178498_i0", "PRJNA558770", "180503", "234", "4.623116", "10.81809144", "Nitrospira sp. KM1", "1936990", "Bacteria", "Bacteria", "69.4", "2.08e-7", "", "NTclustered", "gi|1808878785|dbj|AP022671.1|", "1936990", "g178498", "i0", "89.286", "0.239316239316239", "56", "5", "24", "1", "166", "220", "1603609", "1603664", "Nitrospira sp. KM1 DNA, complete genome", "blastn", "56", "69.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp. KM1"], [10743526, "PRJNA558770_P_NODE_209389_length_234_cov_3.437186_g207384_i0", "PRJNA558770", "209389", "234", "3.437186", "8.04301524", "Candidatus Nitrospira neomarina", "3020899", "Bacteria", "Bacteria", "63.9", "9.68e-6", "", "NTclustered", "gi|2582130041|gb|CP116968.1|", "3020899", "g207384", "i0", "90.196", "0.405982905982906", "51", "2", "21", "3", "164", "213", "4222962", "4223010", "Candidatus Nitrospira neomarina strain DK chromosome, complete genome", "blastn", "95", "63.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Candidatus Nitrospira neomarina"], [10743676, "PRJNA558770_P_NODE_216929_length_234_cov_3.185930_g214924_i0", "PRJNA558770", "216929", "234", "3.18593", "7.4550762", "Dissulfurispira thermophila", "2715679", "Bacteria", "Bacteria", "67.6", "7.48e-7", "", "NTclustered", "gi|1901208073|dbj|AP022873.1|", "2715679", "g214924", "i0", "87.719", "0.683760683760684", "57", "7", "24", "0", "4", "60", "732197", "732141", "Dissulfurispira thermophila T55J DNA, complete genome", "blastn", "160", "67.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Thermodesulfovibrionia", "Thermodesulfovibrionales", "Dissulfurispiraceae", "Dissulfurispira", "Dissulfurispira thermophila"], [12019534, "PRJNA558770_P_NODE_280730_length_234_cov_1.723618_g278725_i0", "PRJNA558770", "280730", "234", "1.723618", "4.03326612", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "128", "3.38e-25", "", "NTclustered", "gi|2290915413|gb|CP060502.1|", "70125", "g278725", "i0", "97.333", "1.28205128205128", "75", "2", "64", "0", "1", "75", "201046", "201120", "MAG: Nitrospira sp. isolate NSFW plasmid pNSFW1, complete sequence", "blastn", "300", "128", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [13293934, "PRJNA558770_P_NODE_243791_length_234_cov_2.447236_g241786_i0", "PRJNA558770", "243791", "234", "2.447236", "5.72653224", "Candidatus Nitrospira inopinata", "1715989", "Bacteria", "Bacteria", "54.7", "0.006", "", "NTclustered", "gi|952974062|emb|LN885086.1|", "1715989", "g241786", "i0", "96.875", "0.136752136752137", "32", "1", "14", "0", "187", "218", "1439484", "1439453", "Nitrospira sp. ENR4 genome assembly NiCh1, chromosome : 1", "blastn", "32", "54.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Candidatus Nitrospira inopinata"], [19666875, "PRJNA558770_P_NODE_275656_length_234_cov_1.804020_g273651_i0", "PRJNA558770", "275656", "234", "1.80402", "4.2214068", "Candidatus Nitrospira kreftii", "2652173", "Bacteria", "Bacteria", "73.1", "1.61e-8", "", "NTclustered", "gi|1884724763|gb|CP047423.1|", "2652173", "g273651", "i0", "93.75", "0.205128205128205", "48", "3", "21", "0", "160", "207", "3845399", "3845446", "Candidatus Nitrospira kreftii isolate comreactor17 chromosome, complete genome", "blastn", "48", "73.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Candidatus Nitrospira kreftii"], [26712891, "PRJNA558770_P_NODE_366201_length_232_cov_2.269036_g364196_i0", "PRJNA558770", "366201", "232", "2.269036", "5.26416352", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "45.1", "0.00472", "", "NR", "MCC2641341.1", "70125", "g364196", "i0", "34.3", "3.71120689655172", "70", "23", "90.5", "1", "212", "3", "235", "281", "MCC2641341.1 hypothetical protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "861", "45.4", "0.993392070484582", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [26983941, "PRJNA558770_P_NODE_225322_length_234_cov_2.939698_g223317_i0", "PRJNA558770", "225322", "234", "2.939698", "6.87889332", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "53.9", "3.85e-6", "", "NR", "MDR4470746.1", "70125", "g223317", "i0", "80", "0.961538461538462", "25", "5", "32.1", "0", "1", "75", "208", "232", "MDR4470746.1 AIPR family protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "225", "53.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [27205071, "PRJNA558770_P_NODE_139582_length_234_cov_7.226131_g137577_i0", "PRJNA558770", "139582", "234", "7.226131", "16.90914654", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "78.2", "5.81e-16", "", "NR", "HEY7128955.1", "70125", "g137577", "i0", "56.6", "2.93589743589744", "76", "32", "97.4", "1", "232", "5", "60", "134", "HEY7128955.1 UpxY family transcription antiterminator [Nitrospira sp.]", "diamond", "687", "78.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [27584410, "PRJNA558770_P_NODE_326904_length_233_cov_7.025253_g324899_i0", "PRJNA558770", "326904", "233", "7.025253", "16.36883949", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "47.4", "7.53e-4", "", "NR", "MDD5433987.1", "70125", "g324899", "i0", "63.3", "0.386266094420601", "30", "11", "38.6", "0", "4", "93", "198", "227", "MDD5433987.1 terminase family protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "90", "47.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [27661781, "PRJNA558770_P_NODE_138924_length_234_cov_7.281407_g136919_i0", "PRJNA558770", "138924", "234", "7.281407", "17.03849238", "Nitrospira", "1234", "Bacteria", "Bacteria", "59.7", "1.26e-8", "", "NR", "HRI37561.1", "70125", "g136919", "i0", "100", "1.28205128205128", "25", "0", "32.1", "0", "233", "159", "118", "142", "HRI37561.1 NapC/NirT family cytochrome c [Nitrospira sp.]", "diamond", "300", "59.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [27774058, "PRJNA558770_P_NODE_345484_length_233_cov_2.378788_g343479_i0", "PRJNA558770", "345484", "233", "2.378788", "5.54257604", "Nitrospirota bacterium", "2026887", "Bacteria", "Bacteria", "45.8", "7.86e-4", "", "NR", "MEK6745226.1", "2026887", "g343479", "i0", "68", "0.630901287553648", "25", "8", "32.2", "0", "158", "232", "83", "107", "MEK6745226.1 endonuclease domain-containing protein [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "147", "45.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [27868448, "PRJNA558770_P_NODE_207765_length_234_cov_3.492462_g205760_i0", "PRJNA558770", "207765", "234", "3.492462", "8.17236108", "Nitrospirota bacterium", "2026887", "Bacteria", "Bacteria", "43.5", "0.0183", "", "NR", "MBI5747053.1", "2026887", "g205760", "i0", "91.7", "0.307692307692308", "24", "2", "30.8", "0", "75", "4", "426", "449", "MBI5747053.1 thioredoxin domain-containing protein [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "72", "43.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [27899950, "PRJNA558770_P_NODE_111065_length_234_cov_10.427136_g109060_i0", "PRJNA558770", "111065", "234", "10.427136", "24.39949824", "Nitrospiraceae bacterium", "2026770", "Bacteria", "Bacteria", "42.4", "0.0315", "", "NR", "MER3422197.1", "2026770", "g109060", "i0", "68", "0.320512820512821", "25", "8", "32.1", "0", "1", "75", "54", "78", "MER3422197.1 hypothetical protein [Nitrospiraceae bacterium]", "diamond", "75", "42.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", null, "Nitrospiraceae bacterium"], [28026540, "PRJNA558770_P_NODE_147645_length_234_cov_6.587940_g145640_i0", "PRJNA558770", "147645", "234", "6.58794", "15.4157796", "Nitrospirota bacterium", "2026887", "Bacteria", "Bacteria", "55.1", "2.84e-7", "", "NR", "MEK7267320.1", "2026887", "g145640", "i0", "100", "1.23076923076923", "24", "0", "30.8", "0", "161", "232", "29", "52", "MEK7267320.1 tetratricopeptide repeat protein [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "288", "55.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [28026589, "PRJNA558770_P_NODE_291325_length_234_cov_1.537688_g289320_i0", "PRJNA558770", "291325", "234", "1.537688", "3.59818992", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "56.6", "4.15e-7", "", "NR", "MDF2755773.1", "70125", "g289320", "i0", "48.7", "1", "78", "30", "87.2", "1", "31", "234", "1", "78", "MDF2755773.1 hypothetical protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "234", "56.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [28626532, "PRJNA558770_P_NODE_153187_length_234_cov_6.201005_g151182_i0", "PRJNA558770", "153187", "234", "6.201005", "14.5103517", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "56.2", "5.37e-7", "", "NR", "HMS85978.1", "70125", "g151182", "i0", "41.6", "1.14102564102564", "89", "40", "98.7", "1", "3", "233", "190", "278", "HMS85978.1 NAD(P)-dependent alcohol dehydrogenase [Nitrospira sp.]", "diamond", "267", "56.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [28658067, "PRJNA558770_P_NODE_240667_length_234_cov_2.522613_g238662_i0", "PRJNA558770", "240667", "234", "2.522613", "5.90291442", "Nitrospira sp. BLG_1", "3395883", "Bacteria", "Bacteria", "48.5", "3.03e-4", "", "NR", "WP_413937057.1", "3395883", "g238662", "i0", "40.3", "0.858974358974359", "67", "30", "85.9", "1", "231", "31", "244", "300", "WP_413937057.1 hypothetical protein [Nitrospira sp. BLG_1]", "diamond", "201", "48.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp. BLG_1"], [28784079, "PRJNA558770_P_NODE_287047_length_234_cov_1.623116_g285042_i0", "PRJNA558770", "287047", "234", "1.623116", "3.79809144", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "49.7", "2.43e-5", "", "NR", "HEX5550720.1", "70125", "g285042", "i0", "92", "0.641025641025641", "25", "2", "32.1", "0", "234", "160", "12", "36", "HEX5550720.1 DUF5666 domain-containing protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "150", "49.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [28942332, "PRJNA558770_P_NODE_189368_length_234_cov_4.211055_g187363_i0", "PRJNA558770", "189368", "234", "4.211055", "9.8538687", "Nitrospirae bacterium RBG_13_41_22", "1801704", "Bacteria", "Bacteria", "59.7", "3.48e-8", "", "NR", "OGW43582.1", "1801704", "g187363", "i0", "53.2", "0.794871794871795", "62", "10", "79.5", "1", "187", "2", "1", "43", "OGW43582.1 MAG: hypothetical protein A2Y66_02255 [Nitrospirae bacterium RBG_13_41_22]", "diamond", "186", "59.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirae bacterium RBG_13_41_22"], [29019604, "PRJNA558770_P_NODE_243448_length_234_cov_2.457286_g241443_i0", "PRJNA558770", "243448", "234", "2.457286", "5.75004924", "Nitrospira", "1234", "Bacteria", "Bacteria", "46.6", "0.0011", "", "NR", "HET8721443.1", "70125", "g241443", "i0", "100", "2.46153846153846", "24", "0", "30.8", "0", "73", "2", "36", "59", "HET8721443.1 type II secretion system protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "576", "46.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29051036, "PRJNA558770_P_NODE_152768_length_234_cov_6.226131_g150763_i0", "PRJNA558770", "152768", "234", "6.226131", "14.56914654", "Nitrospira", "1234", "Bacteria", "Bacteria", "49.7", "1.2e-5", "", "NR", "MBL8072229.1", "70125", "g150763", "i0", "96", "6.08974358974359", "25", "1", "32.1", "0", "160", "234", "15", "39", "MBL8072229.1 hypothetical protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "1425", "49.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29051044, "PRJNA558770_P_NODE_195708_length_234_cov_3.949749_g193703_i0", "PRJNA558770", "195708", "234", "3.949749", "9.24241266", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "50.1", "8.8e-5", "", "NR", "MEW6585562.1", "2026887", "g193703", "i0", "91.7", "3.69230769230769", "24", "2", "30.8", "0", "4", "75", "110", "133", "MEW6585562.1 FMN-binding glutamate synthase family protein [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "864", "50.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [29131698, "PRJNA558770_P_NODE_204949_length_234_cov_3.597990_g202944_i0", "PRJNA558770", "204949", "234", "3.59799", "8.4192966", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "48.5", "2.34e-4", "", "NR", "HEX6531620.1", "70125", "g202944", "i0", "87.5", "0.307692307692308", "24", "3", "30.8", "0", "74", "3", "18", "41", "HEX6531620.1 ATP phosphoribosyltransferase [Nitrospira sp.]", "diamond", "72", "48.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29289341, "PRJNA558770_P_NODE_249389_length_234_cov_2.321608_g247384_i0", "PRJNA558770", "249389", "234", "2.321608", "5.43256272", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "53.1", "6.89e-6", "", "NR", "HAN92282.1", "70125", "g247384", "i0", "100", "0.307692307692308", "24", "0", "30.8", "0", "161", "232", "265", "288", "HAN92282.1 hypothetical protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "72", "53.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29352689, "PRJNA558770_P_NODE_257209_length_234_cov_2.155779_g255204_i0", "PRJNA558770", "257209", "234", "2.155779", "5.04452286", "Nitrospira cf. moscoviensis SBR1", "96242", "Bacteria", "Bacteria", "76.3", "2.15e-14", "", "NR", "WP_087475171.1", "96242", "g255204", "i0", "56.5", "1.08974358974359", "85", "29", "98.7", "1", "232", "2", "177", "261", "WP_087475171.1 hypothetical protein [Nitrospira cf. moscoviensis SBR1015]", "diamond", "255", "76.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira cf. moscoviensis SBR1015"], [29461009, "PRJNA558770_P_NODE_104530_length_234_cov_11.512563_g102525_i0", "PRJNA558770", "104530", "234", "11.512563", "26.93939742", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "45.8", "0.00244", "", "NR", "MCA9474179.1", "70125", "g102525", "i0", "78.3", "2.08974358974359", "23", "5", "29.5", "0", "76", "8", "192", "214", "MCA9474179.1 site-specific DNA-methyltransferase [Nitrospira sp.]", "diamond", "489", "46.2", "0.991341991341991", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29510315, "PRJNA558770_P_NODE_257190_length_234_cov_2.155779_g255185_i0", "PRJNA558770", "257190", "234", "2.155779", "5.04452286", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.0248", "", "NR", "HNA26129.1", "70125", "g255185", "i0", "79.2", "1.84615384615385", "24", "5", "30.8", "0", "162", "233", "1498", "1521", "HNA26129.1 cadherin-like domain-containing protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "432", "43.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29604815, "PRJNA558770_P_NODE_213830_length_234_cov_3.286432_g211825_i0", "PRJNA558770", "213830", "234", "3.286432", "7.69025088", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "48.1", "4.07e-4", "", "NR", "HEU4503971.1", "70125", "g211825", "i0", "87.5", "0.923076923076923", "24", "3", "30.8", "0", "73", "2", "139", "162", "HEU4503971.1 ATP-binding protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "216", "48.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29604819, "PRJNA558770_P_NODE_218150_length_234_cov_3.145729_g216145_i0", "PRJNA558770", "218150", "234", "3.145729", "7.36100586", "Nitrospirae bacterium RBG_19FT_COMBO_58_9", "1801711", "Bacteria", "Bacteria", "51.2", "3.32e-5", "", "NR", "OGW52113.1", "1801711", "g216145", "i0", "96", "0.641025641025641", "25", "1", "32.1", "0", "75", "1", "114", "138", "OGW52113.1 MAG: arsenical-resistance protein [Nitrospirae bacterium RBG_19FT_COMBO_58_9]", "diamond", "150", "51.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirae bacterium RBG_19FT_COMBO_58_9"], [29921116, "PRJNA558770_P_NODE_185551_length_234_cov_4.381910_g183546_i0", "PRJNA558770", "185551", "234", "4.38191", "10.2536694", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "43.9", "0.00537", "", "NR", "HKY71939.1", "70125", "g183546", "i0", "91.3", "0.294871794871795", "23", "2", "29.5", "0", "3", "71", "115", "137", "HKY71939.1 response regulator transcription factor [Nitrospira sp.]", "diamond", "69", "43.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [29935162, "PRJNA558770_P_NODE_289011_length_234_cov_1.587940_g287006_i0", "PRJNA558770", "289011", "234", "1.58794", "3.7157796", "Nitrospira", "1234", "Bacteria", "Bacteria", "52.4", "1.27e-5", "", "NR", "WP_053378527.1", "42253", "g287006", "i0", "100", "3.38461538461538", "24", "0", "30.8", "0", "232", "161", "82", "105", "WP_053378527.1 adenosylhomocysteinase [Nitrospira moscoviensis]", "diamond", "792", "52.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira moscoviensis"], [30173615, "PRJNA558770_P_NODE_219432_length_234_cov_3.110553_g217427_i0", "PRJNA558770", "219432", "234", "3.110553", "7.27869402", "Nitrospiraceae bacterium", "2026770", "Bacteria", "Bacteria", "60.5", "1.82e-8", "", "NR", "HEY6973266.1", "2026770", "g217427", "i0", "100", "3.20512820512821", "25", "0", "32.1", "0", "2", "76", "401", "425", "HEY6973266.1 radical SAM protein [Nitrospiraceae bacterium]", "diamond", "750", "60.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", null, "Nitrospiraceae bacterium"], [31184458, "PRJNA558770_P_NODE_227315_length_234_cov_2.884422_g225310_i0", "PRJNA558770", "227315", "234", "2.884422", "6.74954748", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "55.8", "7.53e-7", "", "NR", "MFO0707286.1", "70125", "g225310", "i0", "100", "0.320512820512821", "25", "0", "32.1", "0", "233", "159", "59", "83", "MFO0707286.1 phosphopentomutase [Nitrospira sp.]", "diamond", "75", "55.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [31247927, "PRJNA558770_P_NODE_129675_length_234_cov_8.140704_g127670_i0", "PRJNA558770", "129675", "234", "8.140704", "19.04924736", "Candidatus Nitrospira nitrificans", "1742973", "Bacteria", "Bacteria", "77.8", "4.57e-15", "", "NR", "CUS32748.1", "1742973", "g127670", "i0", "61", "0.987179487179487", "77", "30", "98.7", "0", "4", "234", "175", "251", "CUS32748.1 Putative Phage integrase (fragment) [Candidatus Nitrospira nitrificans]", "diamond", "231", "77.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Candidatus Nitrospira nitrificans"], [31262079, "PRJNA558770_P_NODE_241195_length_234_cov_2.512563_g239190_i0", "PRJNA558770", "241195", "234", "2.512563", "5.87939742", "Nitrospira", "1234", "Bacteria", "Bacteria", "55.1", "1.43e-6", "", "NR", "HEU5202413.1", "70125", "g239190", "i0", "100", "22.7692307692308", "24", "0", "30.8", "0", "2", "73", "173", "196", "HEU5202413.1 hypothetical protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "5328", "55.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [31325230, "PRJNA558770_P_NODE_248595_length_234_cov_2.341709_g246590_i0", "PRJNA558770", "248595", "234", "2.341709", "5.47959906", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "42.4", "0.041", "", "NR", "HMZ57071.1", "70125", "g246590", "i0", "86.4", "2.76923076923077", "22", "3", "28.2", "0", "75", "10", "99", "120", "HMZ57071.1 transposase [Nitrospira sp.]", "diamond", "648", "42.7", "0.992974238875878", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [31342916, "PRJNA558770_P_NODE_236316_length_234_cov_2.633166_g234311_i0", "PRJNA558770", "236316", "234", "2.633166", "6.16160844", "Nitrospirota bacterium", "2026887", "Bacteria", "Bacteria", "55.8", "4.57e-7", "", "NR", "MBU6433821.1", "2026887", "g234311", "i0", "95.8", "2.76923076923077", "24", "1", "30.8", "0", "74", "3", "144", "167", "MBU6433821.1 formylglycine-generating enzyme family protein [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "648", "55.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [31374626, "PRJNA558770_P_NODE_185596_length_234_cov_4.376884_g183591_i0", "PRJNA558770", "185596", "234", "4.376884", "10.24190856", "Nitrospiraceae bacterium", "2026770", "Bacteria", "Bacteria", "73.2", "9.38e-15", "", "NR", "HXT66619.1", "2026770", "g183591", "i0", "51.3", "0.974358974358974", "76", "34", "97.4", "1", "230", "3", "14", "86", "HXT66619.1 hypothetical protein [Nitrospiraceae bacterium]", "diamond", "228", "73.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", null, "Nitrospiraceae bacterium"], [31515335, "PRJNA558770_P_NODE_268176_length_234_cov_1.939698_g266171_i0", "PRJNA558770", "268176", "234", "1.939698", "4.53889332", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "45.8", "0.00248", "", "NR", "HNP42514.1", "70125", "g266171", "i0", "95.5", "0.871794871794872", "22", "1", "28.2", "0", "229", "164", "260", "281", "HNP42514.1 DUF2184 domain-containing protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "204", "45.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [31627452, "PRJNA558770_P_NODE_212216_length_234_cov_3.336683_g210211_i0", "PRJNA558770", "212216", "234", "3.336683", "7.80783822", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "55.1", "8.97e-7", "", "NR", "HKT36541.1", "70125", "g210211", "i0", "100", "4.30769230769231", "24", "0", "30.8", "0", "3", "74", "163", "186", "HKT36541.1 lytic transglycosylase domain-containing protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "1008", "55.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [31722327, "PRJNA558770_P_NODE_189117_length_234_cov_4.221106_g187112_i0", "PRJNA558770", "189117", "234", "4.221106", "9.87738804", "Nitrospirota bacterium", "2026887", "Bacteria", "Bacteria", "54.3", "2.5e-6", "", "NR", "TAL08314.1", "2026887", "g187112", "i0", "35.5", "1.93589743589744", "76", "25", "97.4", "1", "3", "230", "116", "167", "TAL08314.1 MAG: hypothetical protein EPO02_13230, partial [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "453", "54.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [32052825, "PRJNA558770_P_NODE_203758_length_234_cov_3.643216_g201753_i0", "PRJNA558770", "203758", "234", "3.643216", "8.52512544", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "52.8", "9.62e-6", "", "NR", "MDF2756353.1", "70125", "g201753", "i0", "92", "0.641025641025641", "25", "2", "32.1", "0", "1", "75", "39", "63", "MDF2756353.1 treT [Nitrospira sp.]", "diamond", "150", "52.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [32242991, "PRJNA558770_P_NODE_223618_length_234_cov_2.989950_g221613_i0", "PRJNA558770", "223618", "234", "2.98995", "6.996483", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "44.3", "0.00917", "", "NR", "MCK6501267.1", "70125", "g221613", "i0", "79.2", "0.923076923076923", "24", "5", "30.8", "0", "73", "2", "276", "299", "MCK6501267.1 helicase RepA family protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "216", "44.7", "0.991051454138702", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [32306277, "PRJNA558770_P_NODE_280439_length_234_cov_1.728643_g278434_i0", "PRJNA558770", "280439", "234", "1.728643", "4.04502462", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.024", "", "NR", "MEW6545230.1", "2026887", "g278434", "i0", "83.3", "0.923076923076923", "24", "4", "30.8", "0", "160", "231", "254", "277", "MEW6545230.1 ACR3 family arsenite efflux transporter [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "216", "43.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [32765482, "PRJNA558770_P_NODE_345960_length_233_cov_2.242424_g343955_i0", "PRJNA558770", "345960", "233", "2.242424", "5.22484792", "Nitrospiraceae bacterium", "2026770", "Bacteria", "Bacteria", "52.8", "8.74e-6", "", "NR", "MBX9661038.1", "2026770", "g343955", "i0", "95.8", "0.309012875536481", "24", "1", "30.9", "0", "2", "73", "160", "183", "MBX9661038.1 LysR family transcriptional regulator [Nitrospiraceae bacterium]", "diamond", "72", "52.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", null, "Nitrospiraceae bacterium"], [32796817, "PRJNA558770_P_NODE_8540_length_612_cov_5.329289_g7069_i0", "PRJNA558770", "8540", "612", "5.329289", "32.61524868", "Nitrospirota bacterium", "2026887", "Bacteria", "Bacteria", "74.3", "1.39e-11", "", "NR", "MDH5426877.1", "2026887", "g7069", "i0", "48.5", "0.892156862745098", "66", "34", "32.4", "0", "232", "35", "6", "71", "MDH5426877.1 ATP-binding protein [Nitrospirota bacterium]", "diamond", "546", "74.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", null, null, null, null, "Nitrospirota bacterium"], [32891344, "PRJNA558770_P_NODE_213380_length_234_cov_3.301508_g211375_i0", "PRJNA558770", "213380", "234", "3.301508", "7.72552872", "Nitrospira sp.", "70125", "Bacteria", "Bacteria", "66.6", "1.13e-10", "", "NR", "HKY71524.1", "70125", "g211375", "i0", "48.1", "1.03846153846154", "81", "33", "92.3", "1", "217", "2", "41", "121", "HKY71524.1 dihydrolipoamide acetyltransferase family protein [Nitrospira sp.]", "diamond", "243", "66.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", "Nitrospira", "Nitrospira sp."], [32891356, "PRJNA558770_P_NODE_271020_length_234_cov_1.889447_g269015_i0", "PRJNA558770", "271020", "234", "1.889447", "4.42130598", "Nitrospiraceae bacterium", "2026770", "Bacteria", "Bacteria", "42", "0.0498", "", "NR", "HXX73830.1", "2026770", "g269015", "i0", "78.3", "0.294871794871795", "23", "5", "29.5", "0", "164", "232", "28", "50", "HXX73830.1 ATP-binding protein [Nitrospiraceae bacterium]", "diamond", "69", "42", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Nitrospirota", "Nitrospiria", "Nitrospirales", "Nitrospiraceae", null, "Nitrospiraceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 50, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_kingdom\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA558770", "p1": "Pseudomonadati", "p2": "Nitrospirota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota", "results": [{"value": "PRJNA558770", "label": "PRJNA558770", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 43, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Nitrospirota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Nitrospirota", "results": [{"value": "Nitrospirota", "label": "Nitrospirota", "count": 50, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 318.79613298224285}