{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA549880\" and tax_phylum = \"Chordata\"", "rows": [[511716, "PRJNA549880_P_NODE_10061_length_255_cov_1.252747_g9968_i0", "PRJNA549880", "10061", "255", "1.252747", "3.19450485", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "472", "1.5e-128", "", "NTclustered", "gi|2775691830|ref|NM_001431812.1|", "10116", "g9968", "i0", "100", "84.3019607843137", "255", "0", "100", "0", "1", "255", "1408", "1662", "Rattus norvegicus LSM family member 14B (Lsm14b), transcript variant 1, mRNA", "blastn", "21497", "472", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511728, "PRJNA549880_P_NODE_11021_length_250_cov_0.870056_g10928_i0", "PRJNA549880", "11021", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "457", "4.1099999999999985e-124", "", "NTclustered", "gi|2678950990|ref|XM_063261777.1|", "10116", "g10928", "i0", "99.6", "86.076", "250", "1", "100", "0", "1", "250", "11263", "11512", "PREDICTED: Rattus norvegicus calmin (Clmn), transcript variant X7, mRNA", "blastn", "21519", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511729, "PRJNA549880_P_NODE_11061_length_250_cov_0.870056_g10968_i0", "PRJNA549880", "11061", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|157817289|ref|NM_001106622.1|", "10116", "g10968", "i0", "100", "32.096", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "308", "557", "Rattus norvegicus TAP binding protein-like (Tapbpl), mRNA", "blastn", "8024", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511730, "PRJNA549880_P_NODE_11081_length_250_cov_0.870056_g10988_i0", "PRJNA549880", "11081", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|2678879585|ref|XM_039087543.2|", "10116", "g10988", "i0", "100", "31.624", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "2144", "1895", "PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "7906", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511732, "PRJNA549880_P_NODE_11181_length_250_cov_0.870056_g11088_i0", "PRJNA549880", "11181", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "457", "4.1099999999999985e-124", "", "NTclustered", "gi|298881585|emb|FQ220001.1|", "10116", "g11088", "i0", "99.6", "60.108", "250", "1", "100", "0", "1", "250", "867", "1116", "Rattus norvegicus TL0ADA44YI23 mRNA sequence", "blastn", "15027", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511733, "PRJNA549880_P_NODE_11201_length_250_cov_0.870056_g11108_i0", "PRJNA549880", "11201", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|2777372270|ref|NM_001431960.1|", "10116", "g11108", "i0", "100", "98.684", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "1984", "1735", "Rattus norvegicus DENN domain containing 5B (Dennd5b), transcript variant 1, mRNA", "blastn", "24671", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511734, "PRJNA549880_P_NODE_11221_length_250_cov_0.870056_g11128_i0", "PRJNA549880", "11221", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|2678976372|ref|XM_008773429.4|", "10116", "g11128", "i0", "100", "80.18", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "2193", "1944", "PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing, X-linked 2 (Armcx2), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "20045", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511739, "PRJNA549880_P_NODE_11581_length_249_cov_0.875000_g11488_i0", "PRJNA549880", "11581", "249", "0.875", "2.17875", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "446", "8.849999999999999e-121", "", "NTclustered", "gi|2678898578|ref|XM_063274098.1|", "10116", "g11488", "i0", "98.81", "79.2971887550201", "252", "0", "100", "1", "1", "249", "766", "515", "PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase 2 (Parp2), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "19745", "446", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511741, "PRJNA549880_P_NODE_11721_length_249_cov_0.875000_g11628_i0", "PRJNA549880", "11721", "249", "0.875", "2.17875", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "460", "3.16e-125", "", "NTclustered", "gi|2678919569|ref|XM_039102698.2|", "10116", "g11628", "i0", "100", "31.9839357429719", "249", "0", "100", "0", "1", "249", "2275", "2027", "PREDICTED: Rattus norvegicus acidic nuclear phosphoprotein 32 family member E (Anp32e), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "7964", "460", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511762, "PRJNA549880_P_NODE_12921_length_246_cov_0.890173_g12828_i0", "PRJNA549880", "12921", "246", "0.890173", "2.18982558", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "455", "1.4500000000000002e-123", "", "NTclustered", "gi|2711571114|ref|NM_182843.2|", "10116", "g12828", "i0", "100", "21.2764227642276", "246", "0", "100", "0", "1", "246", "2865", "3110", "Rattus norvegicus acyl-CoA binding domain containing 3 (Acbd3), mRNA", "blastn", "5234", "455", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511767, "PRJNA549880_P_NODE_13221_length_246_cov_0.890173_g13128_i0", "PRJNA549880", "13221", "246", "0.890173", "2.18982558", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "435", "1.8900000000000003e-117", "", "NTclustered", "gi|2678929065|ref|XM_008761991.4|", "10116", "g13128", "i0", "98.394", "36.650406504065", "249", "1", "100", "2", "1", "246", "2100", "1852", "PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 43, member 3 (Slc43a3), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "9016", "435", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511778, "PRJNA549880_P_NODE_13921_length_244_cov_0.900585_g13828_i0", "PRJNA549880", "13921", "244", "0.900585", "2.1974274", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "281", "2.58e-71", "", "NTclustered", "gi|2264604247|ref|NM_001409008.1|", "10116", "g13828", "i0", "98.742", "10.8811475409836", "159", "1", "65", "1", "86", "244", "5998", "5841", "Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 1 (Adprhl1), transcript variant 2, mRNA", "blastn", "2655", "281", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511781, "PRJNA549880_P_NODE_14261_length_244_cov_0.900585_g14168_i0", "PRJNA549880", "14261", "244", "0.900585", "2.1974274", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "451", "1.86e-122", "", "NTclustered", "gi|226192806|gb|AC116220.6|", "10116", "g14168", "i0", "100", "85.1106557377049", "244", "0", "100", "0", "1", "244", "108039", "107796", "Rattus norvegicus CH230-256P17 (Children's Hospital Oakland Research Institute Rat (BN/SsNHsd/MCW) BAC library) complete sequence", "blastn", "20767", "451", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511802, "PRJNA549880_P_NODE_15681_length_241_cov_0.916667_g15588_i0", "PRJNA549880", "15681", "241", "0.916667", "2.20916747", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "440", "3.959999999999999e-119", "", "NTclustered", "gi|222427681|gb|AC124867.4|", "10116", "g15588", "i0", "99.585", "8.99170124481328", "241", "1", "100", "0", "1", "241", "189972", "190212", "Rattus norvegicus CH230-5L12 (Children's Hospital Oakland Research Institute Rat (BN/SsNHsd/MCW) BAC library) complete sequence", "blastn", "2167", "440", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511839, "PRJNA549880_P_NODE_3421_length_399_cov_1.417178_g3328_i0", "PRJNA549880", "3421", "399", "1.417178", "5.65454022", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "737", "0", "", "NTclustered", "gi|2678869266|ref|XM_006227762.4|", "10116", "g3328", "i0", "100", "59.0451127819549", "399", "0", "100", "0", "1", "399", "75", "473", "PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L36 (Mrpl36), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "23559", "737", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511842, "PRJNA549880_P_NODE_3541_length_393_cov_4.781250_g3448_i0", "PRJNA549880", "3541", "393", "4.78125", "18.7903125", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "726", "0", "", "NTclustered", "gi|298891886|emb|FQ217805.1|", "10116", "g3448", "i0", "100", "86.6717557251908", "393", "0", "100", "0", "1", "393", "410", "18", "Rattus norvegicus TL0ACA17YF06 mRNA sequence", "blastn", "34062", "726", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511870, "PRJNA549880_P_NODE_5061_length_342_cov_1.092937_g4968_i0", "PRJNA549880", "5061", "342", "1.092937", "3.73784454", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "627", "4.22e-175", "", "NTclustered", "gi|2199215541|ref|NM_001401757.1|", "10116", "g4968", "i0", "99.708", "95.4093567251462", "342", "1", "100", "0", "1", "342", "527", "186", "Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein (Itprip), mRNA", "blastn", "32630", "627", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511873, "PRJNA549880_P_NODE_5321_length_336_cov_1.171103_g5228_i0", "PRJNA549880", "5321", "336", "1.171103", "3.93490608", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "621", "1.9299999999999997e-173", "", "NTclustered", "gi|51859469|gb|BC081842.1|", "10116", "g5228", "i0", "100", "99.0922619047619", "336", "0", "100", "0", "1", "336", "523", "188", "Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:93610 IMAGE:7105924), complete cds", "blastn", "33295", "621", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511874, "PRJNA549880_P_NODE_5361_length_335_cov_1.175573_g5268_i0", "PRJNA549880", "5361", "335", "1.175573", "3.93816955", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "617", "2.48e-172", "", "NTclustered", "gi|197246115|gb|BC169047.1|", "10116", "g5268", "i0", "100", "59.5462686567164", "334", "0", "99", "0", "1", "334", "1477", "1810", "Rattus norvegicus PTEN induced putative kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189438 IMAGE:7190543), complete cds", "blastn", "19948", "617", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511896, "PRJNA549880_P_NODE_6261_length_315_cov_1.289256_g6168_i0", "PRJNA549880", "6261", "315", "1.289256", "4.0611564", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "582", "8.459999999999998e-162", "", "NTclustered", "gi|2717371716|ref|NM_001429245.1|", "10116", "g6168", "i0", "100", "103.828571428571", "315", "0", "100", "0", "1", "315", "1267", "1581", "Rattus norvegicus enolase 1 (Eno1), transcript variant 9, mRNA", "blastn", "32706", "582", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511898, "PRJNA549880_P_NODE_6301_length_314_cov_2.452282_g6208_i0", "PRJNA549880", "6301", "314", "2.452282", "7.70016548", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "580", "3.0299999999999992e-161", "", "NTclustered", "gi|298891341|emb|FQ227326.1|", "10116", "g6208", "i0", "100", "27.671974522293", "314", "0", "100", "0", "1", "314", "635", "948", "Rattus norvegicus TL0AEA13YM04 mRNA sequence", "blastn", "8689", "580", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511929, "PRJNA549880_P_NODE_7981_length_285_cov_0.919811_g7888_i0", "PRJNA549880", "7981", "285", "0.919811", "2.62146135", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "521", "1.6699999999999996e-143", "", "NTclustered", "gi|1937369344|ref|NM_012946.2|", "10116", "g7888", "i0", "99.649", "40.7859649122807", "285", "1", "100", "0", "1", "285", "510", "226", "Rattus norvegicus SPARC like 1 (Sparcl1), mRNA", "blastn", "11624", "521", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511931, "PRJNA549880_P_NODE_8081_length_283_cov_1.833333_g7988_i0", "PRJNA549880", "8081", "283", "1.833333", "5.18833239", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "521", "1.6599999999999996e-143", "", "NTclustered", "gi|40538741|ref|NM_023093.1|", "10116", "g7988", "i0", "100", "90.8975265017668", "282", "0", "99", "0", "1", "282", "1523", "1804", "Rattus norvegicus ATP synthase F1 subunit alpha (Atp5f1a), mRNA; nuclear gene for mitochondrial product", "blastn", "25724", "521", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [511963, "PRJNA549880_P_NODE_9801_length_259_cov_0.913978_g9708_i0", "PRJNA549880", "9801", "259", "0.913978", "2.36720302", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "473", "4.25e-129", "", "NTclustered", "gi|158186671|ref|NM_012986.1|", "10116", "g9708", "i0", "99.614", "97.0849420849421", "259", "1", "100", "0", "1", "259", "465", "723", "Rattus norvegicus NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase (Nedd4), mRNA", "blastn", "25145", "473", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1119597, "PRJNA549880_P_NODE_6361_length_313_cov_1.558333_g6268_i0", "PRJNA549880", "6361", "313", "1.558333", "4.87758229", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "573", "5.049999999999998e-159", "", "NTclustered", "gi|2678877029|ref|XM_006245753.5|", "10116", "g6268", "i0", "99.681", "99.2555910543131", "313", "1", "100", "0", "1", "313", "501", "813", "PREDICTED: Rattus norvegicus calcium regulated heat stable protein 1 (Carhsp1), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "31067", "573", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787227, "PRJNA549880_P_NODE_10602_length_251_cov_0.865169_g10509_i0", "PRJNA549880", "10602", "251", "0.865169", "2.17157419", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "453", "5.34e-123", "", "NTclustered", "gi|298904418|emb|FQ221868.1|", "10116", "g10509", "i0", "100", "97.3784860557769", "245", "0", "98", "0", "7", "251", "1360", "1116", "Rattus norvegicus TL0ADA30YL16 mRNA sequence", "blastn", "24442", "453", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787229, "PRJNA549880_P_NODE_10662_length_251_cov_0.865169_g10569_i0", "PRJNA549880", "10662", "251", "0.865169", "2.17157419", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "453", "5.34e-123", "", "NTclustered", "gi|2678936284|ref|XM_063285605.1|", "10116", "g10569", "i0", "99.203", "13.4581673306773", "251", "2", "100", "0", "1", "251", "6036", "5786", "PREDICTED: Rattus norvegicus calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 (Cacna2d1), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "3378", "453", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787230, "PRJNA549880_P_NODE_10722_length_251_cov_0.865169_g10629_i0", "PRJNA549880", "10722", "251", "0.865169", "2.17157419", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "464", "2.47e-126", "", "NTclustered", "gi|37589625|gb|BC059161.1|", "10116", "g10629", "i0", "100", "78.1752988047809", "251", "0", "100", "0", "1", "251", "766", "1016", "Rattus norvegicus tudor and KH domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:72982 IMAGE:6887770), complete cds", "blastn", "19622", "464", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787232, "PRJNA549880_P_NODE_10802_length_251_cov_0.808989_g10709_i0", "PRJNA549880", "10802", "251", "0.808989", "2.03056239", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "448", "2.48e-121", "", "NTclustered", "gi|237681070|ref|NM_001160228.1|", "10116", "g10709", "i0", "98.805", "3.86852589641434", "251", "3", "100", "0", "1", "251", "3977", "4227", "Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 19 (Adam19), mRNA", "blastn", "971", "448", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787233, "PRJNA549880_P_NODE_10822_length_250_cov_1.706215_g10729_i0", "PRJNA549880", "10822", "250", "1.706215", "4.2655375", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "446", "8.89e-121", "", "NTclustered", "gi|157821328|ref|NM_001107784.1|", "10116", "g10729", "i0", "98.8", "5.392", "250", "3", "100", "0", "1", "250", "3095", "3344", "Rattus norvegicus RNA polymerase III subunit F (Polr3f), mRNA", "blastn", "1348", "446", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787236, "PRJNA549880_P_NODE_10982_length_250_cov_0.870056_g10889_i0", "PRJNA549880", "10982", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|29171072|gb|AY160770.1|", "10116", "g10889", "i0", "100", "98.432", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "2352", "2103", "Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C (Ip3kc) mRNA, complete cds", "blastn", "24608", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787240, "PRJNA549880_P_NODE_11102_length_250_cov_0.870056_g11009_i0", "PRJNA549880", "11102", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|2678936248|ref|XM_063285589.1|", "10116", "g11009", "i0", "100", "27.888", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "1842", "2091", "PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial membrane protein 1 (Emp1), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "6972", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787243, "PRJNA549880_P_NODE_11242_length_250_cov_0.870056_g11149_i0", "PRJNA549880", "11242", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|31455631|gb|AC096310.9|", "10116", "g11149", "i0", "100", "4.012", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "66375", "66126", "Rattus norvegicus 1 BAC CH230-121B19 (Children's Hospital Oakland Research Institute) complete sequence", "blastn", "1003", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787249, "PRJNA549880_P_NODE_11722_length_249_cov_0.875000_g11629_i0", "PRJNA549880", "11722", "249", "0.875", "2.17875", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "407", "4.1799999999999994e-109", "", "NTclustered", "gi|21489984|ref|NM_145084.1|", "10116", "g11629", "i0", "100", "92.1847389558233", "220", "0", "88", "0", "30", "249", "1855", "1636", "Rattus norvegicus retinol saturase (Retsat), mRNA", "blastn", "22954", "407", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787251, "PRJNA549880_P_NODE_11862_length_248_cov_1.211429_g11769_i0", "PRJNA549880", "11862", "248", "1.211429", "3.00434392", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "453", "5.2600000000000005e-123", "", "NTclustered", "gi|54633339|ref|NM_001006602.1|", "10116", "g11769", "i0", "99.597", "24.0483870967742", "248", "1", "100", "0", "1", "248", "1987", "2234", "Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class S (Pigs), mRNA", "blastn", "5964", "453", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787254, "PRJNA549880_P_NODE_1202_length_641_cov_1.545775_g1112_i0", "PRJNA549880", "1202", "641", "1.545775", "9.90841775", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "1179", "0", "", "NTclustered", "gi|281427179|ref|NM_001170467.1|", "10116", "g1112", "i0", "100", "94.9266770670827", "638", "0", "99", "0", "4", "641", "28", "665", "Rattus norvegicus cell death-inducing DFFA-like effector a (Cidea), mRNA", "blastn", "60848", "1179", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787262, "PRJNA549880_P_NODE_12422_length_247_cov_0.885057_g12329_i0", "PRJNA549880", "12422", "247", "0.885057", "2.18609079", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "457", "4.05e-124", "", "NTclustered", "gi|2678956220|ref|XM_063263088.1|", "10116", "g12329", "i0", "100", "11", "247", "0", "100", "0", "1", "247", "3982", "4228", "PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 2 (Rbms2), transcript variant X14, mRNA", "blastn", "2717", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787266, "PRJNA549880_P_NODE_12622_length_247_cov_0.885057_g12529_i0", "PRJNA549880", "12622", "247", "0.885057", "2.18609079", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "451", "1.88e-122", "", "NTclustered", "gi|16758689|ref|NM_053835.1|", "10116", "g12529", "i0", "99.595", "99.6518218623482", "247", "1", "100", "0", "1", "247", "420", "174", "Rattus norvegicus clathrin, light chain B (Cltb), mRNA", "blastn", "24614", "451", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787268, "PRJNA549880_P_NODE_12662_length_247_cov_0.885057_g12569_i0", "PRJNA549880", "12662", "247", "0.885057", "2.18609079", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "444", "3.15e-120", "", "NTclustered", "gi|1958748732|ref|XM_008760857.3|", "10116", "g12569", "i0", "99.19", "29.8502024291498", "247", "1", "100", "1", "1", "247", "3150", "3395", "PREDICTED: Rattus norvegicus cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha (Pkia), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "7373", "444", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787277, "PRJNA549880_P_NODE_13022_length_246_cov_0.890173_g12929_i0", "PRJNA549880", "13022", "246", "0.890173", "2.18982558", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "444", "3.14e-120", "", "NTclustered", "gi|49615119|gb|AC113720.6|", "10116", "g12929", "i0", "99.187", "3.98780487804878", "246", "2", "100", "0", "1", "246", "217306", "217061", "Rattus norvegicus 1 BAC CH230-117B1 (Children's Hospital Oakland Research Institute) complete sequence", "blastn", "981", "444", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787280, "PRJNA549880_P_NODE_13102_length_246_cov_0.890173_g13009_i0", "PRJNA549880", "13102", "246", "0.890173", "2.18982558", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "453", "5.2100000000000006e-123", "", "NTclustered", "gi|298906534|emb|FQ222101.1|", "10116", "g13009", "i0", "100", "69.9349593495935", "245", "0", "99", "0", "1", "245", "1577", "1333", "Rattus norvegicus TL0ADA29YB11 mRNA sequence", "blastn", "17204", "453", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787291, "PRJNA549880_P_NODE_13582_length_245_cov_0.895349_g13489_i0", "PRJNA549880", "13582", "245", "0.895349", "2.19360505", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "448", "2.41e-121", "", "NTclustered", "gi|298889597|emb|FQ217492.1|", "10116", "g13489", "i0", "99.592", "21.5795918367347", "245", "1", "100", "0", "1", "245", "2547", "2791", "Rattus norvegicus TL0ACA25YB19 mRNA sequence", "blastn", "5287", "448", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787298, "PRJNA549880_P_NODE_13902_length_244_cov_0.900585_g13809_i0", "PRJNA549880", "13902", "244", "0.900585", "2.1974274", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "335", "1.9499999999999992e-87", "", "NTclustered", "gi|2708437839|ref|NM_001106077.4|", "10116", "g13809", "i0", "100", "1.46311475409836", "181", "0", "74", "0", "64", "244", "8210", "8030", "Rattus norvegicus MAU2 sister chromatid cohesion factor (Mau2), transcript variant 1, mRNA", "blastn", "357", "335", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787312, "PRJNA549880_P_NODE_14602_length_243_cov_0.905882_g14509_i0", "PRJNA549880", "14602", "243", "0.905882", "2.20129326", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "449", "6.65e-122", "", "NTclustered", "gi|47271551|gb|AC003067.59|", "10090", "g14509", "i0", "100", "24.3786008230453", "243", "0", "100", "0", "1", "243", "203514", "203272", "Mus musculus Chromosome 16 BAC Clone tbx3 Syntenic To Homo sapiens 22q11.2 DGCR Region, complete sequence", "blastn", "5924", "449", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [1787372, "PRJNA549880_P_NODE_3082_length_417_cov_1.584302_g2989_i0", "PRJNA549880", "3082", "417", "1.584302", "6.60653934", "Rattus rattus", "10117", "Chordata", "Chordata", "721", "0", "", "NTclustered", "gi|1820981485|ref|XM_032900747.1|", "10117", "g2989", "i0", "97.847", "22.2613908872902", "418", "8", "100", "1", "1", "417", "4304", "3887", "PREDICTED: Rattus rattus fem-1 homolog A (Fem1a), mRNA", "blastn", "9283", "721", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus rattus"], [1787378, "PRJNA549880_P_NODE_3322_length_404_cov_0.924471_g3229_i0", "PRJNA549880", "3322", "404", "0.924471", "3.73486284", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "736", "0", "", "NTclustered", "gi|2700936687|ref|NM_172222.3|", "10116", "g3229", "i0", "99.505", "42.3242574257426", "404", "2", "100", "0", "1", "404", "2586", "2183", "Rattus norvegicus complement C2 (C2), transcript variant 1, mRNA", "blastn", "17099", "736", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787405, "PRJNA549880_P_NODE_4582_length_355_cov_1.092199_g4489_i0", "PRJNA549880", "4582", "355", "1.092199", "3.87730645", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "656", "0", "", "NTclustered", "gi|2678943592|ref|XM_006239125.5|", "10116", "g4489", "i0", "100", "99.9718309859155", "355", "0", "100", "0", "1", "355", "285", "639", "PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial fission regulator 1-like (Mtfr1l), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "35490", "656", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787407, "PRJNA549880_P_NODE_5002_length_343_cov_1.377778_g4909_i0", "PRJNA549880", "5002", "343", "1.377778", "4.72577854", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "628", "1.1799999999999997e-175", "", "NTclustered", "gi|2678962506|ref|XM_063264709.1|", "10116", "g4909", "i0", "99.708", "25.0320699708455", "343", "1", "100", "0", "1", "343", "5155", "4813", "PREDICTED: Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 2 (Kank2), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "8586", "628", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787416, "PRJNA549880_P_NODE_5602_length_329_cov_36.332031_g5509_i0", "PRJNA549880", "5602", "329", "36.332031", "119.53238199", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "606", "5.269999999999998e-169", "", "NTclustered", "gi|228014974|gb|FJ919767.1|", "10116", "g5509", "i0", "100", "99.5440729483283", "328", "0", "99", "0", "1", "328", "9470", "9797", "Rattus norvegicus strain WK/Kyoto mitochondrion, complete genome", "blastn", "32750", "606", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787425, "PRJNA549880_P_NODE_5962_length_321_cov_3.008065_g5869_i0", "PRJNA549880", "5962", "321", "3.008065", "9.65588865", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "592", "1.44e-164", "", "NTclustered", "gi|298885116|emb|FQ230116.1|", "10116", "g5869", "i0", "100", "94.5140186915888", "320", "0", "99", "0", "2", "321", "816", "497", "Rattus norvegicus TL0ADA45YJ12 mRNA sequence", "blastn", "30339", "592", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787426, "PRJNA549880_P_NODE_5982_length_321_cov_1.241935_g5889_i0", "PRJNA549880", "5982", "321", "1.241935", "3.98661135", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "593", "3.9899999999999986e-165", "", "NTclustered", "gi|298891236|emb|FQ214951.1|", "10116", "g5889", "i0", "100", "96.803738317757", "321", "0", "100", "0", "1", "321", "15", "335", "Rattus norvegicus TL0ACA50YG03 mRNA sequence", "blastn", "31074", "593", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787431, "PRJNA549880_P_NODE_6122_length_318_cov_1.257143_g6029_i0", "PRJNA549880", "6122", "318", "1.257143", "3.99771474", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "588", "1.84e-163", "", "NTclustered", "gi|58865715|ref|NM_001012072.1|", "10116", "g6029", "i0", "100", "18.3238993710692", "318", "0", "100", "0", "1", "318", "1135", "1452", "Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3C (Ppp1r3c), mRNA", "blastn", "5827", "588", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787439, "PRJNA549880_P_NODE_6322_length_314_cov_1.178423_g6229_i0", "PRJNA549880", "6322", "314", "1.178423", "3.70024822", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "560", "3.95e-155", "", "NTclustered", "gi|1937370069|ref|NM_012925.2|", "10116", "g6229", "i0", "99.673", "41.7738853503185", "306", "1", "97", "0", "1", "306", "306", "1", "Rattus norvegicus CD59b molecule (Cd59b), mRNA", "blastn", "13117", "560", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787440, "PRJNA549880_P_NODE_6422_length_312_cov_1.288703_g6329_i0", "PRJNA549880", "6422", "312", "1.288703", "4.02075336", "Rattus rattus", "10117", "Chordata", "Chordata", "521", "1.8499999999999998e-143", "", "NTclustered", "gi|1820945476|ref|XM_032915287.1|", "10117", "g6329", "i0", "97.106", "6.71474358974359", "311", "6", "99", "3", "2", "310", "2878", "3187", "PREDICTED: Rattus rattus regulator of G protein signaling 5 (Rgs5), mRNA", "blastn", "2095", "521", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus rattus"], [1787456, "PRJNA549880_P_NODE_7142_length_298_cov_1.253333_g7049_i0", "PRJNA549880", "7142", "298", "1.253333", "3.73493234", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "529", "1.0499999999999996e-145", "", "NTclustered", "gi|2678907220|ref|XM_039095822.2|", "10116", "g7049", "i0", "98.658", "98.6308724832215", "298", "4", "100", "0", "1", "298", "8438", "8735", "PREDICTED: Rattus norvegicus nebulette (Nebl), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "29392", "529", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787457, "PRJNA549880_P_NODE_7162_length_298_cov_0.982222_g7069_i0", "PRJNA549880", "7162", "298", "0.982222", "2.92702156", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "551", "2.239999999999999e-152", "", "NTclustered", "gi|461496458|ref|NM_001110490.2|", "10116", "g7069", "i0", "100", "20.9865771812081", "298", "0", "100", "0", "1", "298", "1012", "1309", "Rattus norvegicus LIM domain binding 3 (Ldb3), transcript variant 5, mRNA", "blastn", "6254", "551", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787472, "PRJNA549880_P_NODE_7862_length_286_cov_1.446009_g7769_i0", "PRJNA549880", "7862", "286", "1.446009", "4.13558574", "Rattus rattus", "10117", "Chordata", "Chordata", "483", "7.909999999999998e-132", "", "NTclustered", "gi|1820945476|ref|XM_032915287.1|", "10117", "g7769", "i0", "97.203", "9.16783216783217", "286", "6", "99", "1", "3", "286", "2738", "2453", "PREDICTED: Rattus rattus regulator of G protein signaling 5 (Rgs5), mRNA", "blastn", "2622", "483", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus rattus"], [1787482, "PRJNA549880_P_NODE_842_length_760_cov_2.171761_g761_i0", "PRJNA549880", "842", "760", "2.171761", "16.5053836", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "1351", "0", "", "NTclustered", "gi|1937370099|ref|NM_013220.2|", "10116", "g761", "i0", "100", "30.8986842105263", "731", "0", "100", "0", "1", "731", "808", "1538", "Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 1 (Ankrd1), mRNA", "blastn", "23483", "1351", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787486, "PRJNA549880_P_NODE_8602_length_277_cov_1.132353_g8509_i0", "PRJNA549880", "8602", "277", "1.132353", "3.13661781", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "512", "9.73e-141", "", "NTclustered", "gi|56461|emb|X68312.1|", "10116", "g8509", "i0", "100", "96.8519855595668", "277", "0", "100", "0", "1", "277", "987", "711", "R.norvegicus mRNA for Ig rearranged mu-chain C region, exons 2-4", "blastn", "26828", "512", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787494, "PRJNA549880_P_NODE_8962_length_271_cov_1.555556_g8869_i0", "PRJNA549880", "8962", "271", "1.555556", "4.21555676", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "501", "2.05e-137", "", "NTclustered", "gi|2678926698|ref|XM_063282948.1|", "10116", "g8869", "i0", "100", "48.4981549815498", "271", "0", "100", "0", "1", "271", "746", "1016", "PREDICTED: Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 4B (Chmp4b), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "13143", "501", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787499, "PRJNA549880_P_NODE_9402_length_265_cov_1.015625_g9309_i0", "PRJNA549880", "9402", "265", "1.015625", "2.69140625", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "484", "2.0199999999999998e-132", "", "NTclustered", "gi|31542411|ref|NM_130411.2|", "10116", "g9309", "i0", "99.623", "99.5698113207547", "265", "1", "100", "0", "1", "265", "797", "533", "Rattus norvegicus coronin 1A (Coro1a), mRNA", "blastn", "26386", "484", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1787506, "PRJNA549880_P_NODE_9702_length_260_cov_1.577540_g9609_i0", "PRJNA549880", "9702", "260", "1.57754", "4.101604", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "481", "2.55e-131", "", "NTclustered", "gi|241982901|gb|AC136178.3|", "10116", "g9609", "i0", "100", "40.7076923076923", "260", "0", "100", "0", "1", "260", "134307", "134566", "Rattus norvegicus CH230-435P16 (Children's Hospital Oakland Research Institute Rat (BN/SsNHsd/MCW) BAC library) complete sequence", "blastn", "10584", "481", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [2395023, "PRJNA549880_P_NODE_14122_length_244_cov_0.900585_g14029_i0", "PRJNA549880", "14122", "244", "0.900585", "2.1974274", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "451", "1.86e-122", "", "NTclustered", "gi|2678970056|ref|XM_039083272.2|", "10116", "g14029", "i0", "100", "102.479508196721", "244", "0", "100", "0", "1", "244", "2223", "1980", "PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 30 (Tex30), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "25005", "451", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [2395044, "PRJNA549880_P_NODE_1942_length_516_cov_2.623025_g1849_i0", "PRJNA549880", "1942", "516", "2.623025", "13.534809", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "948", "0", "", "NTclustered", "gi|399124794|ref|NM_031975.2|", "10116", "g1849", "i0", "99.806", "46.8139534883721", "516", "1", "100", "0", "1", "516", "517", "1032", "Rattus norvegicus parathymosin (Ptms), mRNA", "blastn", "24156", "948", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [2395055, "PRJNA549880_P_NODE_3842_length_381_cov_2.126623_g3749_i0", "PRJNA549880", "3842", "381", "2.126623", "8.10243363", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "654", "0", "", "NTclustered", "gi|846387786|dbj|LC061991.1|", "10090", "g3749", "i0", "100", "102.099737532808", "354", "0", "100", "0", "1", "354", "1313", "960", "Mus musculus mitochondrion DNA, including ATP6, COX3, tRNA-Gly, ND3, tRNA-Arg, ND4L, ND4 genes, complete sequence, sequence_id: (8070..10988)_18", "blastn", "38900", "654", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [2395110, "PRJNA549880_P_NODE_8422_length_279_cov_1.300971_g8329_i0", "PRJNA549880", "8422", "279", "1.300971", "3.62970909", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "510", "3.5299999999999996e-140", "", "NTclustered", "gi|2678975138|ref|XM_063279839.1|", "10116", "g8329", "i0", "99.642", "99.9498207885305", "279", "1", "100", "0", "1", "279", "3700", "3978", "PREDICTED: Rattus norvegicus filamin A (Flna), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "27886", "510", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062698, "PRJNA549880_P_NODE_10563_length_251_cov_0.865169_g10470_i0", "PRJNA549880", "10563", "251", "0.865169", "2.17157419", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "459", "1.1499999999999996e-124", "", "NTclustered", "gi|2678888592|ref|XM_039089608.2|", "10116", "g10470", "i0", "99.602", "99.5776892430279", "251", "1", "100", "0", "1", "251", "344", "94", "PREDICTED: Rattus norvegicus paxillin (Pxn), transcript variant X6, mRNA", "blastn", "24994", "459", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062709, "PRJNA549880_P_NODE_11223_length_250_cov_0.870056_g11130_i0", "PRJNA549880", "11223", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "8.83e-126", "", "NTclustered", "gi|2658368301|ref|NM_001427438.1|", "10116", "g11130", "i0", "100", "23.9", "250", "0", "100", "0", "1", "250", "13471", "13720", "Rattus norvegicus heparan sulfate proteoglycan 2 (Hspg2), mRNA", "blastn", "5975", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062714, "PRJNA549880_P_NODE_11603_length_249_cov_0.875000_g11510_i0", "PRJNA549880", "11603", "249", "0.875", "2.17875", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "460", "3.16e-125", "", "NTclustered", "gi|298900811|emb|FQ212514.1|", "10116", "g11510", "i0", "100", "71.3935742971887", "249", "0", "100", "0", "1", "249", "226", "474", "Rattus norvegicus TL0AAA52YO09 mRNA sequence", "blastn", "17777", "460", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062724, "PRJNA549880_P_NODE_12403_length_247_cov_0.885057_g12310_i0", "PRJNA549880", "12403", "247", "0.885057", "2.18609079", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "457", "4.05e-124", "", "NTclustered", "gi|2678876283|ref|XM_008767930.3|", "10116", "g12310", "i0", "100", "50.5951417004049", "247", "0", "100", "0", "1", "247", "5024", "4778", "PREDICTED: Rattus norvegicus A-kinase anchoring protein 1 (Akap1), transcript variant X3, mRNA", "blastn", "12497", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062726, "PRJNA549880_P_NODE_12523_length_247_cov_0.885057_g12430_i0", "PRJNA549880", "12523", "247", "0.885057", "2.18609079", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "457", "4.05e-124", "", "NTclustered", "gi|2184285313|ref|NM_001400798.1|", "10116", "g12430", "i0", "100", "15.8502024291498", "247", "0", "100", "0", "1", "247", "2681", "2927", "Rattus norvegicus thioredoxin-related transmembrane protein 3 (Tmx3), mRNA", "blastn", "3915", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062731, "PRJNA549880_P_NODE_12743_length_247_cov_0.885057_g12650_i0", "PRJNA549880", "12743", "247", "0.885057", "2.18609079", "Mus caroli", "10089", "Chordata", "Chordata", "252", "2.05e-62", "", "NTclustered", "gi|1679842556|ref|XM_021161443.2|", "10089", "g12650", "i0", "88.182", "9.79757085020243", "220", "14", "85", "7", "39", "247", "1371", "1153", "PREDICTED: Mus caroli TNF receptor superfamily member 4 (Tnfrsf4), mRNA", "blastn", "2420", "252", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus caroli"], [3062739, "PRJNA549880_P_NODE_13083_length_246_cov_0.890173_g12990_i0", "PRJNA549880", "13083", "246", "0.890173", "2.18982558", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "449", "6.74e-122", "", "NTclustered", "gi|298910813|emb|FQ228985.1|", "10116", "g12990", "i0", "99.593", "30.3983739837398", "246", "1", "100", "0", "1", "246", "73", "318", "Rattus norvegicus TL0ADA4YP03 mRNA sequence", "blastn", "7478", "449", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062750, "PRJNA549880_P_NODE_13623_length_245_cov_0.895349_g13530_i0", "PRJNA549880", "13623", "245", "0.895349", "2.19360505", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "453", "5.1900000000000006e-123", "", "NTclustered", "gi|395863614|gb|JN831161.1|", "10116", "g13530", "i0", "100", "99.1795918367347", "245", "0", "100", "0", "1", "245", "1519", "1275", "Rattus norvegicus diphosphoinositol polyphosphate phosphohydolase isoform 2b mRNA, partial cds", "blastn", "24299", "453", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062754, "PRJNA549880_P_NODE_14143_length_244_cov_0.900585_g14050_i0", "PRJNA549880", "14143", "244", "0.900585", "2.1974274", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "451", "1.86e-122", "", "NTclustered", "gi|2191823059|ref|NM_001401364.1|", "10116", "g14050", "i0", "100", "26.594262295082", "244", "0", "100", "0", "1", "244", "9750", "9993", "Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 (Ptpn14), mRNA", "blastn", "6489", "451", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062777, "PRJNA549880_P_NODE_15223_length_242_cov_0.911243_g15130_i0", "PRJNA549880", "15223", "242", "0.911243", "2.20520806", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "448", "2.3799999999999995e-121", "", "NTclustered", "gi|2416560072|ref|NM_001415143.1|", "10116", "g15130", "i0", "100", "64.1735537190083", "242", "0", "100", "0", "1", "242", "2458", "2217", "Rattus norvegicus PHD finger protein 2 (Phf2), mRNA", "blastn", "15530", "448", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062780, "PRJNA549880_P_NODE_15443_length_241_cov_0.916667_g15350_i0", "PRJNA549880", "15443", "241", "0.916667", "2.20916747", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "446", "8.519999999999999e-121", "", "NTclustered", "gi|2678868570|ref|XM_063267252.1|", "10116", "g15350", "i0", "100", "76.4066390041494", "241", "0", "100", "0", "1", "241", "3798", "4038", "PREDICTED: Rattus norvegicus stromal interaction molecule 1 (Stim1), transcript variant X6, mRNA", "blastn", "18414", "446", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062781, "PRJNA549880_P_NODE_15463_length_241_cov_0.916667_g15370_i0", "PRJNA549880", "15463", "241", "0.916667", "2.20916747", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "440", "3.959999999999999e-119", "", "NTclustered", "gi|2717371371|ref|NM_001429247.1|", "10116", "g15370", "i0", "99.585", "2.58091286307054", "241", "1", "100", "0", "1", "241", "7222", "7462", "Rattus norvegicus thrombospondin type 1 domain containing 4 (Thsd4), transcript variant 1, mRNA", "blastn", "622", "440", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062785, "PRJNA549880_P_NODE_15723_length_241_cov_0.916667_g15630_i0", "PRJNA549880", "15723", "241", "0.916667", "2.20916747", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "446", "8.519999999999999e-121", "", "NTclustered", "gi|25045296|emb|AL772282.9|", "10090", "g15630", "i0", "100", "1.17842323651452", "241", "0", "100", "0", "1", "241", "49391", "49151", "Mouse DNA sequence from clone RP23-328F3 on chromosome 2, complete sequence", "blastn", "284", "446", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [3062797, "PRJNA549880_P_NODE_1983_length_510_cov_1.622426_g1890_i0", "PRJNA549880", "1983", "510", "1.622426", "8.2743726", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "942", "0", "", "NTclustered", "gi|298903640|emb|FQ212651.1|", "10116", "g1890", "i0", "100", "99.4921568627451", "510", "0", "100", "0", "1", "510", "25", "534", "Rattus norvegicus TL0AAA52YB12 mRNA sequence", "blastn", "50741", "942", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062834, "PRJNA549880_P_NODE_3643_length_389_cov_2.556962_g3550_i0", "PRJNA549880", "3643", "389", "2.556962", "9.94658218", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "719", "0", "", "NTclustered", "gi|298905983|emb|FQ214112.1|", "10116", "g3550", "i0", "100", "86.5784061696658", "389", "0", "100", "0", "1", "389", "16", "404", "Rattus norvegicus TL0AAA43YN07 mRNA sequence", "blastn", "33679", "719", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062837, "PRJNA549880_P_NODE_383_length_1055_cov_2.164969_g326_i0", "PRJNA549880", "383", "1055", "2.164969", "22.84042295", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "1943", "0", "", "NTclustered", "gi|2770131065|ref|NM_001431376.1|", "10116", "g326", "i0", "99.905", "99.2559241706161", "1055", "1", "100", "0", "1", "1055", "1692", "638", "Rattus norvegicus clusterin (Clu), transcript variant 10, mRNA", "blastn", "104715", "1943", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062879, "PRJNA549880_P_NODE_603_length_881_cov_1.068069_g532_i0", "PRJNA549880", "603", "881", "1.068069", "9.40968789", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "1616", "0", "", "NTclustered", "gi|54400717|ref|NM_001005908.1|", "10116", "g532", "i0", "99.773", "96.7866061293984", "881", "2", "100", "0", "1", "881", "913", "33", "Rattus norvegicus growth hormone inducible transmembrane protein (Ghitm), mRNA", "blastn", "85269", "1616", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062885, "PRJNA549880_P_NODE_6283_length_315_cov_0.954545_g6190_i0", "PRJNA549880", "6283", "315", "0.954545", "3.00681675", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "582", "8.459999999999998e-162", "", "NTclustered", "gi|38512113|gb|BC061782.1|", "10116", "g6190", "i0", "100", "102.492063492063", "315", "0", "100", "0", "1", "315", "1118", "1432", "Rattus norvegicus four and a half LIM domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:72291 IMAGE:5623247), complete cds", "blastn", "32285", "582", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062894, "PRJNA549880_P_NODE_6923_length_302_cov_1.192140_g6830_i0", "PRJNA549880", "6923", "302", "1.19214", "3.6002628", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "553", "6.32e-153", "", "NTclustered", "gi|2678909889|ref|XM_006254999.5|", "10116", "g6830", "i0", "99.669", "98.9238410596027", "302", "1", "100", "0", "1", "302", "455", "154", "PREDICTED: Rattus norvegicus carnosine dipeptidase 2 (Cndp2), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "29875", "553", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062916, "PRJNA549880_P_NODE_8083_length_283_cov_1.833333_g7990_i0", "PRJNA549880", "8083", "283", "1.833333", "5.18833239", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "523", "4.5999999999999983e-144", "", "NTclustered", "gi|298910880|emb|FQ229052.1|", "10116", "g7990", "i0", "100", "91.1413427561837", "283", "0", "100", "0", "1", "283", "1285", "1567", "Rattus norvegicus TL0ADA4YC01 mRNA sequence", "blastn", "25793", "523", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062917, "PRJNA549880_P_NODE_8123_length_283_cov_1.119048_g8030_i0", "PRJNA549880", "8123", "283", "1.119048", "3.16690584", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "518", "2.14e-142", "", "NTclustered", "gi|298892053|emb|FQ220899.1|", "10116", "g8030", "i0", "99.647", "97.0035335689046", "283", "1", "100", "0", "1", "283", "308", "26", "Rattus norvegicus TL0ADA41YE12 mRNA sequence", "blastn", "27452", "518", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062928, "PRJNA549880_P_NODE_8763_length_274_cov_1.532338_g8670_i0", "PRJNA549880", "8763", "274", "1.532338", "4.19860612", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "507", "4.47e-139", "", "NTclustered", "gi|30523392|gb|AY277279.1|", "10116", "g8670", "i0", "100", "94.4233576642336", "274", "0", "100", "0", "1", "274", "2228", "1955", "Rattus norvegicus histidine-rich calcium binding protein (Hrc) mRNA, complete cds", "blastn", "25872", "507", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3062933, "PRJNA549880_P_NODE_8963_length_271_cov_1.555556_g8870_i0", "PRJNA549880", "8963", "271", "1.555556", "4.21555676", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "496", "9.55e-136", "", "NTclustered", "gi|47575867|ref|NM_031771.2|", "10116", "g8870", "i0", "99.631", "8.7380073800738", "271", "1", "100", "0", "1", "271", "2774", "3044", "Rattus norvegicus thrombomodulin (Thbd), mRNA", "blastn", "2368", "496", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3670860, "PRJNA549880_P_NODE_10103_length_254_cov_1.569061_g10010_i0", "PRJNA549880", "10103", "254", "1.569061", "3.98541494", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "470", "5.37e-128", "", "NTclustered", "gi|298901241|emb|FQ218649.1|", "10116", "g10010", "i0", "100", "20.4763779527559", "254", "0", "100", "0", "1", "254", "1148", "895", "Rattus norvegicus TL0ABA50YK19 mRNA sequence", "blastn", "5201", "470", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3670875, "PRJNA549880_P_NODE_1183_length_645_cov_3.199301_g1093_i0", "PRJNA549880", "1183", "645", "3.199301", "20.63549145", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "1192", "0", "", "NTclustered", "gi|846387676|dbj|LC061971.1|", "10090", "g1093", "i0", "100", "100", "645", "0", "100", "0", "1", "645", "1734", "1090", "Mus musculus mitochondrion DNA, including COX1, tRNA-Ser, tRNA-Asp, COX2, tRNA-Lys, ATP8, ATP6 genes, complete sequence, sequence_id: (5951..8605)_20", "blastn", "64500", "1192", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [3670906, "PRJNA549880_P_NODE_15503_length_241_cov_0.916667_g15410_i0", "PRJNA549880", "15503", "241", "0.916667", "2.20916747", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "446", "8.519999999999999e-121", "", "NTclustered", "gi|2678905629|ref|XM_039095285.2|", "10116", "g15410", "i0", "100", "93.9668049792531", "241", "0", "100", "0", "1", "241", "1706", "1466", "PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, interleukin 3 regulated (Nfil3), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "22646", "446", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3670946, "PRJNA549880_P_NODE_5743_length_326_cov_4.134387_g5650_i0", "PRJNA549880", "5743", "326", "4.134387", "13.47810162", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "603", "6.749999999999998e-168", "", "NTclustered", "gi|298891957|emb|FQ220803.1|", "10116", "g5650", "i0", "100", "97.9110429447853", "326", "0", "100", "0", "1", "326", "139", "464", "Rattus norvegicus TL0ADA41YJ24 mRNA sequence", "blastn", "31919", "603", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3670949, "PRJNA549880_P_NODE_5863_length_324_cov_0.940239_g5770_i0", "PRJNA549880", "5863", "324", "0.940239", "3.04637436", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "593", "4.0299999999999986e-165", "", "NTclustered", "gi|726454|gb|U11038.1|RNU11038", "10116", "g5770", "i0", "99.691", "16.7901234567901", "324", "1", "100", "0", "1", "324", "2556", "2879", "Rattus norvegicus lysyl oxidase mRNA, complete cds and multiple polyadenylation sites", "blastn", "5440", "593", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3670976, "PRJNA549880_P_NODE_7283_length_295_cov_2.909910_g7190_i0", "PRJNA549880", "7283", "295", "2.90991", "8.5842345", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "496", "1.05e-135", "", "NTclustered", "gi|846388176|dbj|LC062059.1|", "10090", "g7190", "i0", "100", "90.8474576271186", "268", "0", "91", "0", "12", "279", "2357", "2090", "Mus musculus mitochondrion DNA, including Cytb, tRNA-Tyr, tRNA-Pro, tRNA-Phe, 12S rRNA genes and D-loop, complete sequence, sequence_id: (14446..634)_12", "blastn", "26800", "496", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4338792, "PRJNA549880_P_NODE_10004_length_256_cov_1.103825_g9911_i0", "PRJNA549880", "10004", "256", "1.103825", "2.825792", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "462", "9.07e-126", "", "NTclustered", "gi|1937370051|ref|NM_053356.2|", "10116", "g9911", "i0", "99.219", "81.0390625", "256", "2", "100", "0", "1", "256", "297", "42", "Rattus norvegicus collagen type I alpha 2 chain (Col1a2), mRNA", "blastn", "20746", "462", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4338796, "PRJNA549880_P_NODE_10124_length_254_cov_1.276243_g10031_i0", "PRJNA549880", "10124", "254", "1.276243", "3.24165722", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "470", "5.37e-128", "", "NTclustered", "gi|55741543|ref|NM_001006970.1|", "10116", "g10031", "i0", "100", "99.5708661417323", "254", "0", "100", "0", "1", "254", "506", "253", "Rattus norvegicus ubiquinol cytochrome c reductase core protein 2 (Uqcrc2), mRNA; nuclear gene for mitochondrial product", "blastn", "25291", "470", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4338804, "PRJNA549880_P_NODE_10584_length_251_cov_0.865169_g10491_i0", "PRJNA549880", "10584", "251", "0.865169", "2.17157419", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "464", "2.47e-126", "", "NTclustered", "gi|1368833252|gb|MG963111.1|", "10116", "g10491", "i0", "100", "100.067729083665", "251", "0", "100", "0", "1", "251", "606", "356", "Rattus norvegicus MHC class Ib, RT1-Uav1 precursor (RT1-Uav1) mRNA, complete cds", "blastn", "25117", "464", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4338806, "PRJNA549880_P_NODE_10684_length_251_cov_0.865169_g10591_i0", "PRJNA549880", "10684", "251", "0.865169", "2.17157419", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "424", "4.18e-114", "", "NTclustered", "gi|49615115|gb|AC118414.9|", "10116", "g10591", "i0", "99.571", "26.0836653386454", "233", "0", "93", "1", "1", "233", "198904", "199135", "Rattus norvegicus 3 BAC CH230-223K21 (Children's Hospital Oakland Research Institute) complete sequence", "blastn", "6547", "424", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4338814, "PRJNA549880_P_NODE_11164_length_250_cov_0.870056_g11071_i0", "PRJNA549880", "11164", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "436", "5.349999999999999e-118", "", "NTclustered", "gi|2416560048|ref|NM_001415135.1|", "10116", "g11071", "i0", "100", "94.272", "236", "0", "94", "0", "1", "236", "4001", "3766", "Rattus norvegicus semaphorin 5B (Sema5b), mRNA", "blastn", "23568", "436", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 734, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA549880", "p1": "Chordata"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "PRJNA549880", "label": "PRJNA549880", "count": 734, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 728, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 6, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 734, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Opisthokonta", "label": "Opisthokonta", "count": 734, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata&tax_clade=Opisthokonta", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Metazoa", "label": "Metazoa", "count": 734, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata&tax_kingdom=Metazoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Chordata", "label": "Chordata", "count": 734, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": "4338814", "next_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA549880&tax_phylum=Chordata&_next=4338814", "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 186.16426600056002}