{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA527965\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[1772095, "PRJNA527965_S_NODE_5182_length_164_cov_6.170543_g5099_i0", "PRJNA527965", "5182", "164", "6.170543", "10.11969052", "Bdellovibrio sp. NC01", "2220073", "Bacteria", "Bacteria", "254", "3.5e-63", "", "NTclustered", "gi|1700686220|gb|CP030034.1|", "2220073", "g5099", "i0", "94.512", "116.426829268293", "164", "9", "100", "0", "1", "164", "860522", "860359", "Bdellovibrio sp. NC01 chromosome, complete genome", "blastn", "19094", "254", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [2389861, "PRJNA527965_S_NODE_6262_length_150_cov_2.182609_g6179_i0", "PRJNA527965", "6262", "150", "2.182609", "3.2739135", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "78.7", "2.02e-10", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g6179", "i0", "87.143", "37.3466666666667", "70", "7", "45", "2", "1", "68", "2948778", "2948847", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "5602", "78.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [3665549, "PRJNA527965_S_NODE_1123_length_352_cov_6.006309_g1040_i0", "PRJNA527965", "1123", "352", "6.006309", "21.14220768", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "453", "7.810000000000001e-123", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g1040", "i0", "90.085", "120.204545454545", "353", "29", "100", "3", "1", "352", "512675", "512328", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "42312", "453", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [3665562, "PRJNA527965_S_NODE_2263_length_257_cov_5.265766_g2180_i0", "PRJNA527965", "2263", "257", "5.265766", "13.53301862", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "315", "2.7e-81", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g2180", "i0", "90.083", "182.280155642023", "242", "24", "94", "0", "2", "243", "10", "251", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "46846", "315", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [6874535, "PRJNA527965_S_NODE_3066_length_217_cov_34.032967_g2983_i0", "PRJNA527965", "3066", "217", "34.032967", "73.85153839", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "291", "3.729999999999999e-74", "", "NTclustered", "gi|1950812799|gb|CP066681.1|", "349221", "g2983", "i0", "90.826", "186.889400921659", "218", "19", "100", "1", "1", "217", "659588", "659805", "Micavibrio aeruginosavorus isolate NC_groundwater_70_Ag_B-0.1um_54_66 chromosome", "blastn", "40555", "291", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [10042810, "PRJNA527965_S_NODE_1568_length_309_cov_10.777372_g1485_i0", "PRJNA527965", "1568", "309", "10.777372", "33.30207948", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "549", "8.389999999999996e-152", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g1485", "i0", "98.706", "121.724919093851", "309", "4", "100", "0", "1", "309", "813646", "813338", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "37613", "549", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [13250699, "PRJNA527965_S_NODE_1471_length_316_cov_6.014235_g1388_i0", "PRJNA527965", "1471", "316", "6.014235", "19.0049826", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154", "3386277", "Bacteria", "Bacteria", "436", "6.9899999999999996e-118", "", "NTclustered", "gi|2872995934|gb|CP176530.1|", "3386277", "g1388", "i0", "93.793", "278.642405063291", "290", "18", "92", "0", "12", "301", "698887", "699176", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154 chromosome, complete genome", "blastn", "88051", "436", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154"], [13250787, "PRJNA527965_S_NODE_6031_length_152_cov_230.059829_g5948_i0", "PRJNA527965", "6031", "152", "230.059829", "349.69094008", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "202", "1.1699999999999998e-47", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g5948", "i0", "90.789", "195.348684210526", "152", "13", "100", "1", "1", "152", "815424", "815274", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "29693", "202", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [13250800, "PRJNA527965_S_NODE_891_length_383_cov_15.612069_g808_i0", "PRJNA527965", "891", "383", "15.612069", "59.79422427", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "470", "8.509999999999999e-128", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g808", "i0", "89.474", "278.671018276762", "380", "28", "98", "12", "8", "383", "815231", "815602", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "106731", "470", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [13868102, "PRJNA527965_S_NODE_2131_length_265_cov_4.330435_g2048_i0", "PRJNA527965", "2131", "265", "4.330435", "11.47565275", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "340", "4.62e-89", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g2048", "i0", "89.85", "137.483018867925", "266", "25", "100", "2", "1", "265", "665996", "665732", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "36433", "340", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [15799481, "PRJNA527965_S_NODE_153_length_739_cov_13.767045_g55_i1", "PRJNA527965", "153", "739", "13.767045", "101.73846255", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "1188", "0", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g55", "i1", "95.924", "203.105548037889", "736", "25", "99", "3", "4", "739", "666711", "665981", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "150095", "1188", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [16417081, "PRJNA527965_S_NODE_533_length_468_cov_4.055427_g451_i0", "PRJNA527965", "533", "468", "4.055427", "18.97939836", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "774", "0", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g451", "i0", "97.363", "85.8782051282051", "455", "12", "97", "0", "14", "468", "816443", "816897", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "40191", "774", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [19622853, "PRJNA527965_S_NODE_1316_length_331_cov_7.668919_g1233_i0", "PRJNA527965", "1316", "331", "7.668919", "25.38412189", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "446", "1.22e-120", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g1233", "i0", "91.667", "3.35347432024169", "324", "24", "98", "3", "9", "331", "2982634", "2982955", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "1110", "446", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [20240796, "PRJNA527965_S_NODE_416_length_507_cov_58.010593_g335_i0", "PRJNA527965", "416", "507", "58.010593", "294.11370651", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "556", "8.62e-154", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g335", "i0", "86.64", "150.264299802761", "509", "60", "99", "8", "3", "507", "1660853", "1660349", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "76184", "556", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [21516315, "PRJNA527965_S_NODE_637_length_440_cov_3.807407_g555_i0", "PRJNA527965", "637", "440", "3.807407", "16.7525908", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "710", "0", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g555", "i0", "96.296", "85.7431818181818", "432", "16", "98", "0", "1", "432", "816897", "816466", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "37727", "710", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [24066241, "PRJNA527965_S_NODE_5099_length_166_cov_1.603053_g5016_i0", "PRJNA527965", "5099", "166", "1.603053", "2.66106798", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "211", "2.17e-50", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g5016", "i0", "89.759", "55.1626506024096", "166", "15", "99", "2", "1", "165", "335", "499", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "9157", "211", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 16, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA527965", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA527965", "label": "PRJNA527965", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA527965", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 318.2799280000381}