{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA493827\" and tax_phylum = \"Foraminifera\"", "rows": [[1748148, "PRJNA493827_P_NODE_53162_length_487_cov_1.908213_g50971_i0", "PRJNA493827", "53162", "487", "1.908213", "9.29299731", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "161", "3.389999999999999e-47", "", "NR", "ETO03324.1", "46433", "g50971", "i0", "58.3", "0.856262833675565", "139", "55", "83.8", "2", "20", "427", "33", "171", "ETO03324.1 40S ribosomal protein S15 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "417", "161", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [5577875, "PRJNA493827_P_NODE_96145_length_349_cov_3.481884_g93947_i0", "PRJNA493827", "96145", "349", "3.481884", "12.15177516", "Allogromia sp.", "39594", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "279", "1.39e-70", "", "NTclustered", "gi|4837605|emb|AJ132371.1|", "39594", "g93947", "i0", "81.503", "13.9856733524355", "346", "58", "98", "6", "1", "343", "641", "983", "Allogromia sp. mRNA for actin 2", "blastn", "4881", "279", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, null, "Allogromia", "Allogromia sp."], [8125619, "PRJNA493827_P_NODE_27647_length_718_cov_2.204651_g25657_i0", "PRJNA493827", "27647", "718", "2.204651", "15.82939418", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "183", "1.9599999999999999e-54", "", "NR", "ETO03070.1", "46433", "g25657", "i0", "80.7", "1.36629526462396", "109", "21", "45.5", "0", "716", "390", "78", "186", "ETO03070.1 hypothetical protein RFI_34341 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "981", "183", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [8127254, "PRJNA493827_P_NODE_90507_length_361_cov_1.069444_g88309_i0", "PRJNA493827", "90507", "361", "1.069444", "3.86069284", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "159", "6.319999999999999e-47", "", "NR", "ETO03070.1", "46433", "g88309", "i0", "80.6", "1.62049861495845", "98", "19", "81.4", "0", "1", "294", "90", "187", "ETO03070.1 hypothetical protein RFI_34341 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "585", "159", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [11950679, "PRJNA493827_P_NODE_216610_length_244_cov_1.204678_g214412_i0", "PRJNA493827", "216610", "244", "1.204678", "2.93941432", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "90.5", "1.28e-20", "", "NR", "ETO28954.1", "46433", "g214412", "i0", "55.1", "5.92622950819672", "78", "34", "94.7", "1", "243", "13", "59", "136", "ETO28954.1 hypothetical protein RFI_08171 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "1446", "90.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [19598813, "PRJNA493827_P_NODE_39596_length_580_cov_4.715976_g37418_i0", "PRJNA493827", "39596", "580", "4.715976", "27.3526608", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "177", "3.71e-50", "", "NR", "ETO09453.1", "46433", "g37418", "i0", "66.4", "1.42758620689655", "137", "43", "70.9", "2", "5", "415", "189", "322", "ETO09453.1 hypothetical protein RFI_27925 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "828", "177", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [24057256, "PRJNA493827_P_NODE_218079_length_244_cov_0.900585_g215881_i0", "PRJNA493827", "218079", "244", "0.900585", "2.1974274", "Foraminifera sp. chocolate silver saccamminid", "1415197", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "162", "7.28e-48", "", "NR", "AJD73542.1", "1415197", "g215881", "i0", "97.5", "0.995901639344262", "81", "2", "99.6", "0", "1", "243", "67", "147", "AJD73542.1 actin, partial [Foraminifera sp. chocolate silver saccamminid]", "diamond", "243", "162", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, null, null, "Foraminifera sp. chocolate silver saccamminid"], [24695397, "PRJNA493827_P_NODE_100060_length_342_cov_2.104089_g97862_i0", "PRJNA493827", "100060", "342", "2.104089", "7.19598438", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "201", "1.83e-63", "", "NR", "ETO03070.1", "46433", "g97862", "i0", "84.1", "2.97368421052632", "113", "18", "99.1", "0", "341", "3", "71", "183", "ETO03070.1 hypothetical protein RFI_34341 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "1017", "201", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [26696863, "PRJNA493827_P_NODE_226501_length_242_cov_1.260355_g224303_i0", "PRJNA493827", "226501", "242", "1.260355", "3.0500591", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "119", "1.18e-29", "", "NR", "ETO34191.1", "46433", "g224303", "i0", "67.5", "8.78925619834711", "77", "25", "95.5", "0", "241", "11", "281", "357", "ETO34191.1 hypothetical protein RFI_02902 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "2127", "119", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [27298087, "PRJNA493827_P_NODE_215683_length_244_cov_2.286550_g213485_i0", "PRJNA493827", "215683", "244", "2.28655", "5.579182", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "45.1", "0.00572", "", "NR", "ETO01289.1", "46433", "g213485", "i0", "36.5", "0.774590163934426", "63", "38", "77.5", "1", "2", "190", "275", "335", "ETO01289.1 hypothetical protein RFI_36155 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "189", "45.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [27329877, "PRJNA493827_P_NODE_61483_length_448_cov_1.341333_g59286_i0", "PRJNA493827", "61483", "448", "1.341333", "6.00917184", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "84.7", "2.55e-16", "", "NR", "ETO03605.1", "46433", "g59286", "i0", "36.8", "1.78125", "133", "81", "87.1", "1", "53", "442", "30", "162", "ETO03605.1 hypothetical protein RFI_33797, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "798", "84.7", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [28118909, "PRJNA493827_P_NODE_116585_length_316_cov_2.312757_g114387_i0", "PRJNA493827", "116585", "316", "2.312757", "7.30831212", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "126", "3.1499999999999993e-34", "", "NR", "ETO11964.1", "46433", "g114387", "i0", "92.6", "2.58227848101266", "68", "5", "64.6", "0", "315", "112", "126", "193", "ETO11964.1 glycoprotein FP21 precursor [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "816", "126", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [28781992, "PRJNA493827_P_NODE_43307_length_550_cov_3.262055_g41121_i0", "PRJNA493827", "43307", "550", "3.262055", "17.9413025", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "106", "7.22e-23", "", "NR", "ETO08110.1", "46433", "g41121", "i0", "40.1", "1.70181818181818", "157", "81", "80.2", "4", "542", "102", "458", "611", "ETO08110.1 hypothetical protein RFI_29276 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "936", "106", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [29050564, "PRJNA493827_P_NODE_98988_length_344_cov_2.011070_g96790_i0", "PRJNA493827", "98988", "344", "2.01107", "6.9180808", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "51.6", "4.03e-5", "", "NR", "ETO26716.1", "46433", "g96790", "i0", "33.7", "1.88372093023256", "101", "59", "81.1", "3", "294", "16", "82", "182", "ETO26716.1 hypothetical protein RFI_10417 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "648", "52", "0.992307692307692", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [29224456, "PRJNA493827_P_NODE_213169_length_245_cov_0.895349_g210971_i0", "PRJNA493827", "213169", "245", "0.895349", "2.19360505", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "90.1", "5.91e-20", "", "NR", "ETO36577.1", "46433", "g210971", "i0", "47.4", "1.86122448979592", "76", "40", "93.1", "0", "230", "3", "69", "144", "ETO36577.1 NADPH oxidase [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "456", "90.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [29287182, "PRJNA493827_P_NODE_157649_length_273_cov_1.170000_g155451_i0", "PRJNA493827", "157649", "273", "1.17", "3.1941", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "56.6", "6.86e-7", "", "NR", "ETO35694.1", "46433", "g155451", "i0", "37.3", "0.912087912087912", "83", "51", "90.1", "1", "272", "27", "281", "363", "ETO35694.1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2-like protein [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "249", "56.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [30202936, "PRJNA493827_P_NODE_212912_length_245_cov_0.895349_g210714_i0", "PRJNA493827", "212912", "245", "0.895349", "2.19360505", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "106", "1.13e-26", "", "NR", "ETO11361.1", "46433", "g210714", "i0", "62.2", "1.00408163265306", "82", "30", "99.2", "1", "1", "243", "42", "123", "ETO11361.1 trans-2,3-enoyl-CoA reductase [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "246", "106", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [31530721, "PRJNA493827_P_NODE_156696_length_274_cov_1.034826_g154498_i0", "PRJNA493827", "156696", "274", "1.034826", "2.83542324", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "48.9", "1.28e-4", "", "NR", "ETO31674.1", "46433", "g154498", "i0", "37.5", "4.63138686131387", "88", "48", "94.2", "3", "13", "270", "29", "111", "ETO31674.1 kinesin-ii motor protein [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "1269", "48.9", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [32005106, "PRJNA493827_P_NODE_217658_length_244_cov_0.900585_g215460_i0", "PRJNA493827", "217658", "244", "0.900585", "2.1974274", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "76.6", "3.44e-14", "", "NR", "ETO06363.1", "46433", "g215460", "i0", "42.1", "0.934426229508197", "76", "44", "93.4", "0", "15", "242", "150", "225", "ETO06363.1 hypothetical protein RFI_31032 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "228", "76.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [32511651, "PRJNA493827_P_NODE_58019_length_463_cov_1.569231_g55823_i0", "PRJNA493827", "58019", "463", "1.569231", "7.26553953", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "194", "2.7099999999999992e-55", "", "NR", "ETO26066.1", "46433", "g55823", "i0", "62.7", "0.991360691144708", "153", "56", "98.5", "1", "457", "2", "273", "425", "ETO26066.1 SET domain containing protein [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "459", "194", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [32652797, "PRJNA493827_P_NODE_103780_length_336_cov_1.372624_g101582_i0", "PRJNA493827", "103780", "336", "1.372624", "4.61201664", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "43.9", "0.0408", "", "NR", "ETO36149.1", "46433", "g101582", "i0", "32.3", "1.00892857142857", "65", "40", "58", "1", "271", "77", "524", "584", "ETO36149.1 hypothetical protein RFI_00914, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "339", "44.3", "0.99097065462754", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 21, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA493827", "p1": "Foraminifera"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "PRJNA493827", "label": "PRJNA493827", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Foraminifera", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 20, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 1, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "Sar", "label": "Sar", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera&tax_clade=Sar", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "Foraminifera", "label": "Foraminifera", "count": 21, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493827", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 333.2070750002458}