{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA414036\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[1082842, "PRJNA414036_P_NODE_25521_length_299_cov_6.500000_g23787_i0", "PRJNA414036", "25521", "299", "6.5", "19.435", "Micavibrio", "213485", "Bacteria", "Bacteria", "191", "5.65e-44", "", "NTclustered", "gi|469926873|gb|CP003538.1|", "349215", "g23787", "i0", "81.435", "30.0869565217391", "237", "40", "79", "4", "6", "240", "463852", "463618", "Micavibrio aeruginosavorus EPB, complete genome", "blastn", "8996", "191", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [1082987, "PRJNA414036_P_NODE_67401_length_190_cov_7.296774_g65662_i0", "PRJNA414036", "67401", "190", "7.296774", "13.8638706", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "187", "4.29e-43", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g65662", "i0", "100", "96.9526315789474", "101", "0", "88", "0", "10", "110", "1660365", "1660465", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "18421", "187", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [4910908, "PRJNA414036_P_NODE_29344_length_277_cov_11.231405_g27609_i0", "PRJNA414036", "29344", "277", "11.231405", "31.11099185", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "302", "2.29e-77", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g27609", "i0", "98.817", "183.909747292419", "169", "2", "84", "0", "101", "269", "816490", "816322", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "50943", "302", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [6186020, "PRJNA414036_P_NODE_58465_length_222_cov_32.085561_g56726_i0", "PRJNA414036", "58465", "222", "32.085561", "71.22994542", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "379", "7.949999999999998e-101", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g56726", "i0", "99.519", "308.846846846847", "208", "1", "94", "0", "7", "214", "816529", "816322", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "68564", "379", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [7460848, "PRJNA414036_P_NODE_40806_length_231_cov_5.897959_g39067_i0", "PRJNA414036", "40806", "231", "5.897959", "13.62428529", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "122", "1.55e-23", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g39067", "i0", "92.857", "5.74025974025974", "84", "6", "65", "0", "139", "222", "1661747", "1661830", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "1326", "122", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [7460922, "PRJNA414036_P_NODE_68506_length_187_cov_5.111842_g66767_i0", "PRJNA414036", "68506", "187", "5.111842", "9.55914454", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "117", "5.600000000000001e-22", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g66767", "i0", "93.59", "2.0855614973262", "78", "5", "42", "0", "101", "178", "945130", "945207", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "390", "117", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [8072104, "PRJNA414036_P_NODE_65427_length_196_cov_27.409938_g63688_i0", "PRJNA414036", "65427", "196", "27.409938", "53.72347848", "Bdellovibrio sp. NC01", "2220073", "Bacteria", "Bacteria", "292", "9.18e-75", "", "NTclustered", "gi|1700686220|gb|CP030034.1|", "2220073", "g63688", "i0", "96.591", "78.3163265306122", "176", "6", "90", "0", "10", "185", "861324", "861499", "Bdellovibrio sp. NC01 chromosome, complete genome", "blastn", "15350", "292", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [8735695, "PRJNA414036_P_NODE_12287_length_408_cov_10.865952_g10682_i0", "PRJNA414036", "12287", "408", "10.865952", "44.33308416", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "252", "3.6e-62", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g10682", "i0", "88.208", "37.3039215686275", "212", "24", "69", "1", "94", "305", "750244", "750454", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "15220", "252", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [10010925, "PRJNA414036_P_NODE_15068_length_380_cov_11.055072_g13387_i0", "PRJNA414036", "15068", "380", "11.055072", "42.0092736", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "241", "7.2e-59", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g13387", "i0", "88.208", "101.802631578947", "212", "11", "71", "6", "79", "277", "750244", "750454", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "38685", "241", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [11897664, "PRJNA414036_P_NODE_67510_length_190_cov_2.703226_g65771_i0", "PRJNA414036", "67510", "190", "2.703226", "5.1361294", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "178", "2.58e-40", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g65771", "i0", "86.792", "5.82105263157895", "159", "21", "84", "0", "27", "185", "3446858", "3446700", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "1106", "178", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [12561631, "PRJNA414036_P_NODE_40990_length_231_cov_5.535714_g39251_i0", "PRJNA414036", "40990", "231", "5.535714", "12.78749934", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "122", "1.55e-23", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g39251", "i0", "100", "138.761904761905", "66", "0", "58", "0", "157", "222", "1662149", "1662214", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "32054", "122", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [16996113, "PRJNA414036_P_NODE_1674_length_658_cov_400.528090_g1327_i0", "PRJNA414036", "1674", "658", "400.52809", "2635.4748322", "Halobacteriovorax sp. BALOs_7", "2109558", "Bacteria", "Bacteria", "156", "4.85e-33", "", "NTclustered", "gi|1486380477|gb|CP027772.1|", "2109558", "g1327", "i0", "82.258", "100.969604863222", "186", "28", "28", "5", "161", "344", "250102", "250284", "Halobacteriovorax sp. BALOs_7 chromosome, complete genome", "blastn", "66438", "156", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax sp. BALOs_7"], [18270277, "PRJNA414036_P_NODE_1675_length_658_cov_393.850722_g1328_i0", "PRJNA414036", "1675", "658", "393.850722", "2591.53775076", "Halobacteriovorax sp. BALOs_7", "2109558", "Bacteria", "Bacteria", "156", "4.85e-33", "", "NTclustered", "gi|1486380477|gb|CP027772.1|", "2109558", "g1328", "i0", "82.258", "94.1884498480243", "186", "28", "28", "5", "315", "498", "250284", "250102", "Halobacteriovorax sp. BALOs_7 chromosome, complete genome", "blastn", "61976", "156", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax sp. BALOs_7"], [22759895, "PRJNA414036_P_NODE_36098_length_246_cov_9.924171_g34362_i0", "PRJNA414036", "36098", "246", "9.924171", "24.41346066", "Micavibrio", "213485", "Bacteria", "Bacteria", "121", "6.01e-23", "", "NTclustered", "gi|469926873|gb|CP003538.1|", "349215", "g34362", "i0", "95.946", "87.3455284552846", "74", "3", "30", "0", "10", "83", "464682", "464755", "Micavibrio aeruginosavorus EPB, complete genome", "blastn", "21487", "121", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [29128448, "PRJNA414036_P_NODE_67709_length_189_cov_18.272727_g65970_i0", "PRJNA414036", "67709", "189", "18.272727", "34.53545403", "Micavibrio sp.", "2024841", "Bacteria", "Bacteria", "41.2", "0.0133", "", "NR", "MDB5491878.1", "2024841", "g65970", "i0", "67.7", "0.492063492063492", "31", "10", "49.2", "0", "2", "94", "53", "83", "MDB5491878.1 uncharacterized protein [Micavibrio sp.]", "diamond", "93", "41.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio sp."], [29191452, "PRJNA414036_P_NODE_47709_length_231_cov_2.653061_g45970_i0", "PRJNA414036", "47709", "231", "2.653061", "6.12857091", "Bacteriovorax antarcticus", "3088717", "Bacteria", "Bacteria", "50.8", "4.22e-5", "", "NR", "WP_323574562.1", "3088717", "g45970", "i0", "95.5", "0.285714285714286", "22", "1", "28.6", "0", "9", "74", "213", "234", "WP_323574562.1 homogentisate 1,2-dioxygenase [Bacteriovorax antarcticus]", "diamond", "66", "50.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax antarcticus"], [30580856, "PRJNA414036_P_NODE_45893_length_231_cov_3.061224_g44154_i0", "PRJNA414036", "45893", "231", "3.061224", "7.07142744", "Oligoflexus sp.", "1971216", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.0237", "", "NR", "MBC7659921.1", "1971216", "g44154", "i0", "85.7", "0.272727272727273", "21", "3", "27.3", "0", "160", "222", "38", "58", "MBC7659921.1 trypsin-like serine protease [Oligoflexus sp.]", "diamond", "63", "43.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Oligoflexaceae", "Oligoflexus", "Oligoflexus sp."], [32305506, "PRJNA414036_P_NODE_42199_length_231_cov_4.418367_g40460_i0", "PRJNA414036", "42199", "231", "4.418367", "10.20642777", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "45.1", "0.00182", "", "NR", "MBC7531827.1", "1971216", "g40460", "i0", "86.4", "1.14285714285714", "22", "3", "28.6", "0", "157", "222", "44", "65", "MBC7531827.1 hypothetical protein [Oligoflexus sp.]", "diamond", "264", "45.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Oligoflexaceae", "Oligoflexus", "Oligoflexus sp."]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 18, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA414036", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA414036", "label": "PRJNA414036", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 14, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 4, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA414036", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 207.0135539979674}