{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA407368\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[1081776, "PRJNA407368_S_NODE_6501_length_208_cov_90.810056_g6399_i0", "PRJNA407368", "6501", "208", "90.810056", "188.88491648", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "285", "1.6499999999999998e-72", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g6399", "i0", "91.388", "161.423076923077", "209", "16", "100", "2", "1", "208", "816059", "816266", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "33576", "285", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [2965918, "PRJNA407368_S_NODE_8243_length_177_cov_1384.527027_g8141_i0", "PRJNA407368", "8243", "177", "1384.527027", "2450.61283779", "uncultured Bdellovibrio sp.", "239744", "Bacteria", "Bacteria", "224", "2.99e-54", "", "NTclustered", "gi|389546679|gb|JQ401607.1|", "239744", "g8141", "i0", "91.463", "104.423728813559", "164", "12", "92", "2", "15", "177", "128", "290", "Uncultured Bdellovibrio sp. clone CNY_01758 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "18483", "224", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "uncultured Bdellovibrio sp."], [10009760, "PRJNA407368_S_NODE_2008_length_436_cov_87.294840_g1908_i0", "PRJNA407368", "2008", "436", "87.29484", "380.6055024", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "411", "6.029999999999999e-110", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g1908", "i0", "87.123", "114.988532110092", "365", "43", "98", "3", "8", "369", "783584", "783221", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "50135", "411", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [10619082, "PRJNA407368_S_NODE_7089_length_196_cov_142.455090_g6987_i0", "PRJNA407368", "7089", "196", "142.45509", "279.2119764", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "296", "7.089999999999998e-76", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g6987", "i0", "93.878", "226.887755102041", "196", "12", "100", "0", "1", "196", "3448050", "3447855", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "44470", "296", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [10619106, "PRJNA407368_S_NODE_849_length_704_cov_612.428148_g781_i0", "PRJNA407368", "849", "704", "612.428148", "4311.49416192", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "959", "0", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g781", "i0", "91.465", "190.663352272727", "703", "52", "99", "5", "10", "704", "3446739", "3447441", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "134227", "959", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [13168904, "PRJNA407368_S_NODE_6451_length_209_cov_688.033333_g6349_i0", "PRJNA407368", "6451", "209", "688.033333", "1437.98966597", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "257", "3.6200000000000005e-64", "", "NTclustered", "gi|1950812799|gb|CP066681.1|", "349221", "g6349", "i0", "89.372", "176.684210526316", "207", "18", "98", "4", "5", "209", "659793", "659589", "Micavibrio aeruginosavorus isolate NC_groundwater_70_Ag_B-0.1um_54_66 chromosome", "blastn", "36927", "257", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [16384122, "PRJNA407368_S_NODE_6633_length_205_cov_364.948864_g6531_i0", "PRJNA407368", "6633", "205", "364.948864", "748.1451712", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "318", "1.6e-82", "", "NTclustered", "gi|2524301767|gb|OR186335.1|", "28201", "g6531", "i0", "95.477", "97.9219512195122", "199", "9", "97", "0", "7", "205", "242", "440", "Bdellovibrio sp. strain YBD-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "20074", "320", "0.99375", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [16384131, "PRJNA407368_S_NODE_7273_length_193_cov_83.329268_g7171_i0", "PRJNA407368", "7273", "193", "83.329268", "160.82548724", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "302", "1.5e-77", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g7171", "i0", "94.819", "343.098445595855", "193", "10", "100", "0", "1", "193", "817491", "817683", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "66218", "302", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [16992663, "PRJNA407368_S_NODE_6454_length_209_cov_183.161111_g6352_i0", "PRJNA407368", "6454", "209", "183.161111", "382.80672199", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "326", "9.78e-85", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g6352", "i0", "95.567", "175.162679425837", "203", "9", "97", "0", "7", "209", "611135", "610933", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "36609", "326", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [16992675, "PRJNA407368_S_NODE_7154_length_195_cov_130.162651_g7052_i0", "PRJNA407368", "7154", "195", "130.162651", "253.81716945", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "331", "1.93e-86", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g7052", "i0", "97.436", "196.487179487179", "195", "4", "100", "1", "1", "195", "3447692", "3447885", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "38315", "331", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [22758636, "PRJNA407368_S_NODE_3038_length_340_cov_71.688103_g2936_i0", "PRJNA407368", "3038", "340", "71.688103", "243.7395502", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "411", "4.5999999999999997e-110", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g2936", "i0", "88.922", "148.479411764706", "334", "35", "98", "2", "8", "340", "783584", "783252", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "50483", "411", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [24641556, "PRJNA407368_S_NODE_6500_length_208_cov_139.005587_g6398_i0", "PRJNA407368", "6500", "208", "139.005587", "289.13162096", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "324", "3.5e-84", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g6398", "i0", "94.737", "187.346153846154", "209", "9", "100", "2", "1", "208", "816266", "816059", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "38968", "324", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [25307835, "PRJNA407368_S_NODE_3040_length_340_cov_54.437299_g2938_i0", "PRJNA407368", "3040", "340", "54.437299", "185.0868166", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "438", "2.109999999999999e-118", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g2938", "i0", "90.419", "146.7", "334", "30", "98", "2", "8", "340", "783584", "783252", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "49878", "438", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [27391692, "PRJNA407368_S_NODE_5503_length_232_cov_13.270936_g5401_i0", "PRJNA407368", "5503", "232", "13.270936", "30.78857152", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "124", "4.929999999999999e-31", "", "NR", "MCB0392645.1", "2053517", "g5401", "i0", "79.7", "0.956896551724138", "74", "15", "95.7", "0", "224", "3", "476", "549", "MCB0392645.1 cytochrome c biogenesis protein CcsA [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "222", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29285823, "PRJNA407368_S_NODE_9169_length_166_cov_2.452555_g9067_i0", "PRJNA407368", "9169", "166", "2.452555", "4.0712413", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "59.3", "4.78e-9", "", "NR", "MFM6930298.1", "28201", "g9067", "i0", "48.1", "0.975903614457831", "54", "28", "97.6", "0", "165", "4", "109", "162", "MFM6930298.1 MarR family winged helix-turn-helix transcriptional regulator [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "162", "59.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [32604666, "PRJNA407368_S_NODE_1780_length_468_cov_4.457859_g1683_i0", "PRJNA407368", "1780", "468", "4.457859", "20.86278012", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "70.9", "6.84e-11", "", "NR", "MBK7960150.1", "2053517", "g1683", "i0", "38.2", "0.83974358974359", "131", "73", "79.5", "4", "82", "453", "813", "942", "MBK7960150.1 DUF2341 domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "393", "70.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 16, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA407368", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA407368", "label": "PRJNA407368", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 13, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 3, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA407368", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 187.3281549778767}