{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA395690\", tax_kingdom = \"Pseudomonadati\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[411716, "PRJNA395690_P_NODE_34061_length_162_cov_1.831858_g33909_i0", "PRJNA395690", "34061", "162", "1.831858", "2.96760996", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "174", "2.76e-39", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g33909", "i0", "89.781", "6.75925925925926", "137", "13", "85", "1", "1", "137", "3251354", "3251489", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "1095", "174", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [3629899, "PRJNA395690_P_NODE_7803_length_289_cov_1.462500_g7651_i0", "PRJNA395690", "7803", "289", "1.4625", "4.226625", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "311", "4e-80", "", "NTclustered", "gi|469926873|gb|CP003538.1|", "349215", "g7651", "i0", "86.254", "327.166089965398", "291", "34", "99", "5", "2", "289", "464866", "464579", "Micavibrio aeruginosavorus EPB, complete genome", "blastn", "94551", "311", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [6789436, "PRJNA395690_P_NODE_2786_length_469_cov_1.635714_g2638_i0", "PRJNA395690", "2786", "469", "1.635714", "7.67149866", "Fluviispira sanaruensis", "2493639", "Bacteria", "Bacteria", "73.1", "3.5e-8", "", "NTclustered", "gi|1566193515|dbj|AP019368.1|", "2493639", "g2638", "i0", "83.544", "0.842217484008529", "79", "11", "16", "1", "143", "219", "398774", "398852", "Silvanigrellales bacterium RF1110005 DNA, complete genome", "blastn", "395", "73.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Fluviispira", "Fluviispira sanaruensis"], [10615512, "PRJNA395690_P_NODE_24069_length_177_cov_1.195312_g23917_i0", "PRJNA395690", "24069", "177", "1.195312", "2.11570224", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "180", "6.57e-41", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g23917", "i0", "92.126", "63.5762711864407", "127", "10", "72", "0", "47", "173", "3251793", "3251667", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "11253", "180", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [11890475, "PRJNA395690_P_NODE_24590_length_175_cov_3.412698_g24438_i0", "PRJNA395690", "24590", "175", "3.412698", "5.9722215", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "200", "4.979999999999999e-47", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g24438", "i0", "88.623", "255.497142857143", "167", "15", "94", "4", "4", "168", "3250794", "3250630", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "44712", "200", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [12557595, "PRJNA395690_P_NODE_11750_length_237_cov_1.771277_g11598_i0", "PRJNA395690", "11750", "237", "1.771277", "4.19792649", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "219", "1.9799999999999994e-52", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g11598", "i0", "83.333", "97.3164556962025", "258", "21", "100", "8", "1", "237", "749174", "749430", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "23064", "219", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [16989296, "PRJNA395690_P_NODE_7234_length_300_cov_1.406375_g7082_i0", "PRJNA395690", "7234", "300", "1.406375", "4.219125", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "263", "1.18e-65", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g7082", "i0", "85.714", "67.5166666666667", "252", "32", "84", "4", "12", "262", "666622", "666870", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "20255", "263", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [20205214, "PRJNA395690_P_NODE_30176_length_166_cov_0.871795_g30024_i0", "PRJNA395690", "30176", "166", "0.871795", "1.4471797", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "91.3", "7.44e-20", "", "NR", "MCB0371130.1", "2053517", "g30024", "i0", "83.3", "0.975903614457831", "54", "9", "97.6", "0", "164", "3", "168", "221", "MCB0371130.1 ATP-grasp domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "162", "91.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [22755884, "PRJNA395690_P_NODE_13858_length_218_cov_2.384615_g13706_i0", "PRJNA395690", "13858", "218", "2.384615", "5.1984607", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "198", "2.3399999999999998e-46", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g13706", "i0", "83.182", "85.6559633027523", "220", "33", "99", "4", "1", "217", "665951", "665733", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "18673", "198", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [28686217, "PRJNA395690_P_NODE_33767_length_163_cov_0.894737_g33615_i0", "PRJNA395690", "33767", "163", "0.894737", "1.45842131", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "91.7", "3.02e-21", "", "NR", "MES2526518.1", "3034175", "g33615", "i0", "77.8", "0.993865030674847", "54", "12", "99.4", "0", "1", "162", "157", "210", "MES2526518.1 hypothetical protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "162", "91.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [28970161, "PRJNA395690_P_NODE_27928_length_167_cov_2.355932_g27776_i0", "PRJNA395690", "27928", "167", "2.355932", "3.93440644", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "88.6", "6.61e-19", "", "NR", "MBX3021047.1", "2053517", "g27776", "i0", "72.7", "0.988023952095808", "55", "14", "97", "1", "2", "163", "358", "412", "MBX3021047.1 type IV pilus twitching motility protein PilT [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "165", "88.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29380587, "PRJNA395690_P_NODE_30029_length_166_cov_0.871795_g29877_i0", "PRJNA395690", "30029", "166", "0.871795", "1.4471797", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "47.8", "7.46e-5", "", "NR", "HVK62452.1", "2053517", "g29877", "i0", "80.6", "1.13855421686747", "31", "6", "56", "0", "164", "72", "106", "136", "HVK62452.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "189", "47.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30486140, "PRJNA395690_P_NODE_31453_length_165_cov_0.879310_g31301_i0", "PRJNA395690", "31453", "165", "0.87931", "1.4508615", "Halobacteriovoraceae bacterium", "2026745", "Bacteria", "Bacteria", "79.7", "1.17e-15", "", "NR", "MAZ48396.1", "2026745", "g31301", "i0", "71.7", "1.92727272727273", "53", "15", "96.4", "0", "161", "3", "704", "756", "MAZ48396.1 hypothetical protein [Halobacteriovoraceae bacterium]", "diamond", "318", "79.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", null, "Halobacteriovoraceae bacterium"], [30738782, "PRJNA395690_P_NODE_37274_length_152_cov_2.563107_g37121_i0", "PRJNA395690", "37274", "152", "2.563107", "3.89592264", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "69.3", "4.47e-12", "", "NR", "MFN8790112.1", "2053517", "g37121", "i0", "70", "1.95394736842105", "50", "15", "98.7", "0", "3", "152", "368", "417", "MFN8790112.1 type IV secretory system conjugative DNA transfer family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "297", "69.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31672310, "PRJNA395690_P_NODE_18097_length_191_cov_1.830986_g17945_i0", "PRJNA395690", "18097", "191", "1.830986", "3.49718326", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "61.2", "5.5e-9", "", "NR", "WP_061833089.1", "959", "g17945", "i0", "81.8", "2.56020942408377", "33", "6", "51.8", "0", "190", "92", "415", "447", "WP_061833089.1 sensor histidine kinase [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "489", "61.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 15, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_kingdom\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA395690", "p1": "Pseudomonadati", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA395690", "label": "PRJNA395690", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 8, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA395690&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 472.1536979996017}