{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA315399\", tax_clade = \"PVC group\" and tax_phylum = \"Chlamydiota\"", "rows": [[1660485, "PRJNA315399_S_NODE_90342_length_183_cov_4.239726_g90141_i0", "PRJNA315399", "90342", "183", "4.239726", "7.75869858", "Parachlamydia acanthamoebae", "83552", "Bacteria", "Bacteria", "274", "3.06e-69", "", "NTclustered", "gi|336478352|emb|FR872580.1|", "765952", "g90141", "i0", "99.338", "0.825136612021858", "151", "1", "83", "0", "33", "183", "519948", "520098", "Parachlamydia acanthamoebae UV-7, complete genome", "blastn", "151", "274", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Parachlamydia", "Parachlamydia acanthamoebae"], [8034457, "PRJNA315399_P_NODE_109767_length_197_cov_10.593750_g109319_i0", "PRJNA315399", "109767", "197", "10.59375", "20.8696875", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "244", "2.62e-60", "", "NTclustered", "gi|1869331976|gb|CP058704.1|", "2052176", "g109319", "i0", "91.279", "23.0812182741117", "172", "10", "87", "2", "10", "181", "1332991", "1333157", "Parachlamydiaceae bacterium isolate SSA5 chromosome", "blastn", "4547", "244", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [11864270, "PRJNA315399_S_NODE_72610_length_194_cov_3.738854_g72409_i0", "PRJNA315399", "72610", "194", "3.738854", "7.25337676", "Parachlamydia acanthamoebae", "83552", "Bacteria", "Bacteria", "351", "1.47e-92", "", "NTclustered", "gi|336478352|emb|FR872580.1|", "765952", "g72409", "i0", "100", "0.979381443298969", "190", "0", "98", "0", "5", "194", "3025778", "3025589", "Parachlamydia acanthamoebae UV-7, complete genome", "blastn", "190", "351", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Parachlamydia", "Parachlamydia acanthamoebae"], [15685297, "PRJNA315399_P_NODE_340573_length_172_cov_3.496296_g340125_i0", "PRJNA315399", "340573", "172", "3.496296", "6.01362912", "Neochlamydia hartmannellae", "112235", "Bacteria", "Bacteria", "278", "2.19e-70", "", "NTclustered", "gi|219857449|ref|NR_025037.1|", "112235", "g340125", "i0", "95.48", "104.546511627907", "177", "2", "99", "4", "2", "172", "478", "654", "Neochlamydia hartmannellae strain A1Hsp 16S ribosomal RNA, partial sequence", "blastn", "17982", "278", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Neochlamydia", "Neochlamydia hartmannellae"], [19508221, "PRJNA315399_P_NODE_272536_length_180_cov_4.377622_g272088_i0", "PRJNA315399", "272536", "180", "4.377622", "7.8797196", "Parachlamydiales bacterium", "2052178", "Bacteria", "Bacteria", "67.6", "5.45e-7", "", "NTclustered", "gi|2874253890|emb|OY970065.1|", "2052178", "g272088", "i0", "84.848", "0.366666666666667", "66", "10", "37", "0", "110", "175", "204426", "204361", "MAG: Parachlamydiales bacterium isolate MFD09286.bin.c.6 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "66", "67.6", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", null, null, "Parachlamydiales bacterium"], [25291929, "PRJNA315399_P_NODE_281760_length_179_cov_15.619718_g281312_i0", "PRJNA315399", "281760", "179", "15.619718", "27.95929522", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "76.8", "9e-10", "", "NTclustered", "gi|971146634|emb|LN879502.1|", "389348", "g281312", "i0", "97.727", "3.40782122905028", "44", "1", "25", "0", "106", "149", "456248", "456291", "Protochlamydia naegleriophila genome assembly PNK1, chromosome : cPNK", "blastn", "610", "76.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Candidatus Protochlamydia", "Candidatus Protochlamydia naegleriophila"], [26599235, "PRJNA315399_P_NODE_188141_length_185_cov_11.094595_g187693_i0", "PRJNA315399", "188141", "185", "11.094595", "20.52500075", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "60.1", "1.29e-8", "", "NR", "MBA3603023.1", "2052176", "g187693", "i0", "40", "1.54054054054054", "95", "17", "89.2", "1", "5", "169", "207", "301", "MBA3603023.1 adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "285", "60.1", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [26725841, "PRJNA315399_P_NODE_384001_length_163_cov_6.619048_g383553_i0", "PRJNA315399", "384001", "163", "6.619048", "10.78904824", "Parachlamydia sp.", "2052048", "Bacteria", "Bacteria", "55.8", "1.97e-7", "", "NR", "PJD96155.1", "2052048", "g383553", "i0", "60.9", "1.17791411042945", "64", "7", "84.7", "1", "11", "148", "32", "95", "PJD96155.1 MAG: hypothetical protein CK425_07070 [Parachlamydia sp.]", "diamond", "192", "55.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Parachlamydia", "Parachlamydia sp."], [26853120, "PRJNA315399_P_NODE_143381_length_189_cov_14.973684_g142933_i0", "PRJNA315399", "143381", "189", "14.973684", "28.30026276", "Chlamydiales bacterium", "2047757", "Bacteria", "Bacteria", "78.2", "2.89e-15", "", "NR", "MFI5343496.1", "2047757", "g142933", "i0", "72.7", "2.58730158730159", "55", "10", "87.3", "1", "175", "11", "110", "159", "MFI5343496.1 NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein [Chlamydiales bacterium]", "diamond", "489", "78.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", null, null, "Chlamydiales bacterium"], [27123175, "PRJNA315399_S_NODE_93802_length_181_cov_6.784722_g93601_i0", "PRJNA315399", "93802", "181", "6.784722", "12.28034682", "Parachlamydiaceae", "92713", "Bacteria", "Bacteria", "80.1", "2.76e-16", "", "NR", "WP_068469355.1", "1414722", "g93601", "i0", "71.2", "2.53591160220994", "52", "13", "82.9", "1", "14", "163", "53", "104", "WP_068469355.1 ABC transporter permease [Candidatus Protochlamydia phocaeensis]", "diamond", "459", "80.9", "0.990111248454882", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Candidatus Protochlamydia", "Candidatus Protochlamydia phocaeensis"], [27422309, "PRJNA315399_S_NODE_107823_length_175_cov_2.681159_g107622_i0", "PRJNA315399", "107823", "175", "2.681159", "4.69202825", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "67", "3.34e-13", "", "NR", "EPJ32944.1", "1112244", "g107622", "i0", "88.2", "0.582857142857143", "34", "4", "58.3", "0", "108", "7", "1", "34", "EPJ32944.1 hypothetical protein CP061683_1555, partial [Chlamydia psittaci 06-1683]", "diamond", "102", "67", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27611575, "PRJNA315399_P_NODE_155164_length_188_cov_5.344371_g154716_i0", "PRJNA315399", "155164", "188", "5.344371", "10.04741748", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "40", "0.0156", "", "NR", "EPJ33451.1", "1112244", "g154716", "i0", "100", "0.335106382978723", "21", "0", "33.5", "0", "168", "106", "1", "21", "EPJ33451.1 hypothetical protein CP061683_2024 [Chlamydia psittaci 06-1683]", "diamond", "63", "40", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [27706633, "PRJNA315399_P_NODE_487344_length_152_cov_4.965217_g486896_i0", "PRJNA315399", "487344", "152", "4.965217", "7.54712984", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "56.2", "1.81e-7", "", "NR", "QLH35150.1", "2052176", "g486896", "i0", "65.9", "1.61842105263158", "41", "14", "80.9", "0", "136", "14", "171", "211", "QLH35150.1 MAG: AI-2E family transporter [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "246", "56.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [28022154, "PRJNA315399_P_NODE_503065_length_151_cov_2.570175_g502617_i0", "PRJNA315399", "503065", "151", "2.570175", "3.88096425", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "58.2", "3.01e-8", "", "NR", "QLH36502.1", "2052176", "g502617", "i0", "63.4", "0.814569536423841", "41", "15", "81.5", "0", "17", "139", "3", "43", "QLH36502.1 MAG: hypothetical protein HWD61_10505 [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "123", "58.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [28116608, "PRJNA315399_P_NODE_484005_length_152_cov_11.226087_g483557_i0", "PRJNA315399", "484005", "152", "11.226087", "17.06365224", "Chlamydia psittaci 1", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "44.3", "2.41e-4", "", "NR", "EPP37648.1", "1238236", "g483557", "i0", "85.7", "0.414473684210526", "21", "3", "41.4", "0", "25", "87", "1", "21", "EPP37648.1 hypothetical protein CP10743SC13_1376, partial [Chlamydia psittaci 10_743_SC13]", "diamond", "63", "44.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [28495703, "PRJNA315399_P_NODE_363007_length_166_cov_11.325581_g362559_i0", "PRJNA315399", "363007", "166", "11.325581", "18.80046446", "Chlamydiia bacterium", "2052156", "Bacteria", "Bacteria", "47", "4.23e-4", "", "NR", "MCB1113590.1", "2052156", "g362559", "i0", "73.9", "0.41566265060241", "23", "6", "41.6", "0", "10", "78", "265", "287", "MCB1113590.1 hypothetical protein [Chlamydiia bacterium]", "diamond", "69", "47", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", null, null, null, "Chlamydiia bacterium"], [28765531, "PRJNA315399_P_NODE_502407_length_151_cov_2.868421_g501959_i0", "PRJNA315399", "502407", "151", "2.868421", "4.33131571", "Parachlamydiaceae", "92713", "Bacteria", "Bacteria", "79.3", "9.57e-16", "", "NR", "WP_039385231.1", "1478174", "g501959", "i0", "87", "7.27152317880795", "46", "6", "91.4", "0", "140", "3", "43", "88", "WP_039385231.1 DNA polymerase III subunit beta [Neochlamydia sp. TUME1]", "diamond", "1098", "79.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Neochlamydia", "Neochlamydia sp. TUME1"], [28811035, "PRJNA315399_S_NODE_47888_length_217_cov_4.744444_g47687_i0", "PRJNA315399", "47888", "217", "4.744444", "10.29544348", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "60.1", "2.75e-10", "", "NR", "EPP28211.1", "1112246", "g47687", "i0", "66.7", "0.580645161290323", "42", "14", "58.1", "0", "48", "173", "1", "42", "EPP28211.1 hypothetical protein CP082626L3_1479, partial [Chlamydia psittaci 08-2626_L3]", "diamond", "126", "60.1", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29063997, "PRJNA315399_P_NODE_136688_length_190_cov_17.320261_g136240_i0", "PRJNA315399", "136688", "190", "17.320261", "32.9084959", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "49.7", "2.53e-6", "", "NR", "EPP28211.1", "1112246", "g136240", "i0", "88.5", "0.410526315789474", "26", "3", "41.1", "0", "105", "182", "1", "26", "EPP28211.1 hypothetical protein CP082626L3_1479, partial [Chlamydia psittaci 08-2626_L3]", "diamond", "78", "49.7", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29222002, "PRJNA315399_P_NODE_483689_length_152_cov_14.721739_g483241_i0", "PRJNA315399", "483689", "152", "14.721739", "22.37704328", "Chlamydia trachomatis", "813", "Bacteria", "Bacteria", "47.8", "4.27e-5", "", "NR", "CRH67830.1", "813", "g483241", "i0", "95.8", "0.473684210526316", "24", "1", "47.4", "0", "147", "76", "90", "113", "CRH67830.1 Uncharacterised protein [Chlamydia trachomatis]", "diamond", "72", "47.8", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia trachomatis"], [29379694, "PRJNA315399_S_NODE_49089_length_216_cov_1.798883_g48888_i0", "PRJNA315399", "49089", "216", "1.798883", "3.88558728", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "77.4", "5.52e-17", "", "NR", "EPJ33213.1", "1112244", "g48888", "i0", "91.7", "0.666666666666667", "48", "4", "66.7", "0", "159", "16", "1", "48", "EPJ33213.1 hypothetical protein CP061683_2350, partial [Chlamydia psittaci 06-1683]", "diamond", "144", "77.4", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29474093, "PRJNA315399_P_NODE_506010_length_150_cov_10.274336_g505562_i0", "PRJNA315399", "506010", "150", "10.274336", "15.411504", "Chlamydiales bacterium", "2047757", "Bacteria", "Bacteria", "78.6", "2.08e-15", "", "NR", "MBN9377108.1", "2047757", "g505562", "i0", "74.4", "0.86", "43", "11", "86", "0", "144", "16", "259", "301", "MBN9377108.1 rhomboid family intramembrane serine protease [Chlamydiales bacterium]", "diamond", "129", "78.6", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", null, null, "Chlamydiales bacterium"], [29695057, "PRJNA315399_P_NODE_59290_length_227_cov_5.431579_g58842_i0", "PRJNA315399", "59290", "227", "5.431579", "12.32968433", "Chlamydia psittaci 84-8471/1", "1112230", "Bacteria", "Bacteria", "44.3", "8.42e-4", "", "NR", "EPP39159.1", "1112230", "g58842", "i0", "100", "0.237885462555066", "18", "0", "23.8", "0", "200", "147", "2", "19", "EPP39159.1 hypothetical protein CP8484711_2760 [Chlamydia psittaci 84-8471/1]", "diamond", "54", "44.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [29758464, "PRJNA315399_S_NODE_148091_length_161_cov_5.000000_g147890_i0", "PRJNA315399", "148091", "161", "5", "8.05", "Chlamydia psittaci 1", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "79.3", "2.47e-16", "", "NR", "EPP36802.1", "1238236", "g147890", "i0", "100", "0.68944099378882", "37", "0", "68.9", "0", "3", "113", "3", "39", "EPP36802.1 hypothetical protein CP10743SC13_1855 [Chlamydia psittaci 10_743_SC13]", "diamond", "111", "79.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [30042798, "PRJNA315399_S_NODE_181531_length_153_cov_5.198276_g181330_i0", "PRJNA315399", "181531", "153", "5.198276", "7.95336228", "Chlamydiales bacterium", "2047757", "Bacteria", "Bacteria", "59.7", "1.16e-8", "", "NR", "MCH9626811.1", "2047757", "g181330", "i0", "60", "2.62745098039216", "45", "18", "88.2", "0", "141", "7", "244", "288", "MCH9626811.1 hypothetical protein [Chlamydiales bacterium]", "diamond", "402", "59.7", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", null, null, "Chlamydiales bacterium"], [30074301, "PRJNA315399_S_NODE_56712_length_207_cov_10.482353_g56511_i0", "PRJNA315399", "56712", "207", "10.482353", "21.69847071", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "74.3", "2.84e-14", "", "NR", "MBA3603120.1", "2052176", "g56511", "i0", "62.3", "0.768115942028985", "53", "20", "76.8", "0", "49", "207", "75", "127", "MBA3603120.1 MBL fold metallo-hydrolase [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "159", "74.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [30232414, "PRJNA315399_S_NODE_158772_length_158_cov_8.685950_g158571_i0", "PRJNA315399", "158772", "158", "8.68595", "13.723801", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "58.2", "4.41e-9", "", "NR", "EPP30060.1", "1112246", "g158571", "i0", "82", "0.949367088607595", "50", "7", "91.1", "1", "13", "156", "51", "100", "EPP30060.1 putative membrane protein, partial [Chlamydia psittaci 08-2626_L3]", "diamond", "150", "58.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [30281851, "PRJNA315399_S_NODE_169952_length_156_cov_2.008403_g169751_i0", "PRJNA315399", "169952", "156", "2.008403", "3.13310868", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "89.4", "3.21e-19", "", "NR", "OJV11532.1", "1895743", "g169751", "i0", "79.2", "2.76923076923077", "48", "10", "92.3", "0", "156", "13", "245", "292", "OJV11532.1 MAG: hypothetical protein BGO14_11295 [Chlamydiales bacterium 38-26]", "diamond", "432", "89.4", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", null, null, "Chlamydiales bacterium 38-26"], [30327700, "PRJNA315399_P_NODE_495472_length_151_cov_9.149123_g495024_i0", "PRJNA315399", "495472", "151", "9.149123", "13.81517573", "Parachlamydiaceae bacterium", "2052176", "Bacteria", "Bacteria", "57", "9.46e-8", "", "NR", "MDP1880756.1", "2052176", "g495024", "i0", "59.5", "0.834437086092715", "42", "17", "83.4", "0", "18", "143", "266", "307", "MDP1880756.1 phenylalanine--tRNA ligase subunit beta [Parachlamydiaceae bacterium]", "diamond", "126", "57", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", null, "Parachlamydiaceae bacterium"], [30674581, "PRJNA315399_P_NODE_111233_length_197_cov_3.818750_g110785_i0", "PRJNA315399", "111233", "197", "3.81875", "7.5229375", "Rhabdochlamydiaceae bacterium", "2047756", "Bacteria", "Bacteria", "43.1", "0.00354", "", "NR", "MBY0528732.1", "2047756", "g110785", "i0", "65.6", "0.487309644670051", "32", "11", "48.7", "0", "11", "106", "1", "32", "MBY0528732.1 preprotein translocase subunit SecG [Rhabdochlamydiaceae bacterium]", "diamond", "96", "43.1", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Candidatus Rhabdochlamydiaceae", null, "Rhabdochlamydiaceae bacterium"], [30755417, "PRJNA315399_P_NODE_371514_length_165_cov_4.312500_g371066_i0", "PRJNA315399", "371514", "165", "4.3125", "7.115625", "Chlamydiia", "204429", "Bacteria", "Bacteria", "70.5", "2.08e-12", "", "NR", "OJV11694.1", "1895743", "g371066", "i0", "61", "3.23636363636364", "59", "13", "89.1", "1", "151", "5", "403", "461", "OJV11694.1 MAG: type II secretion system protein GspE [Chlamydiales bacterium 38-26]", "diamond", "534", "70.5", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", null, null, "Chlamydiales bacterium 38-26"], [31008157, "PRJNA315399_P_NODE_421274_length_159_cov_4.901639_g420826_i0", "PRJNA315399", "421274", "159", "4.901639", "7.79360601", "Neochlamydia", "112987", "Bacteria", "Bacteria", "62", "1.88e-9", "", "NR", "WP_039384677.1", "1478174", "g420826", "i0", "61.7", "1.77358490566038", "47", "18", "88.7", "0", "13", "153", "160", "206", "WP_039384677.1 hypothetical protein [Neochlamydia sp. TUME1]", "diamond", "282", "62", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Neochlamydia", "Neochlamydia sp. TUME1"], [31229101, "PRJNA315399_P_NODE_492755_length_152_cov_2.339130_g492307_i0", "PRJNA315399", "492755", "152", "2.33913", "3.5554776", "Parachlamydiales", "1963360", "Bacteria", "Bacteria", "58.2", "7.95e-9", "", "NR", "MFS8564359.1", "2047756", "g492307", "i0", "71.4", "6.90789473684211", "35", "10", "69.1", "0", "2", "106", "28", "62", "MFS8564359.1 hypothetical protein [Rhabdochlamydiaceae bacterium]", "diamond", "1050", "58.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Candidatus Rhabdochlamydiaceae", null, "Rhabdochlamydiaceae bacterium"], [31306691, "PRJNA315399_P_NODE_417775_length_159_cov_11.360656_g417327_i0", "PRJNA315399", "417775", "159", "11.360656", "18.06344304", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "77.4", "2.88e-17", "", "NR", "EPP28937.1", "1112246", "g417327", "i0", "94.6", "0.69811320754717", "37", "2", "69.8", "0", "115", "5", "1", "37", "EPP28937.1 hypothetical protein CP082626L3_1649 [Chlamydia psittaci 08-2626_L3]", "diamond", "111", "77.4", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31306749, "PRJNA315399_S_NODE_21095_length_275_cov_7.004202_g20894_i0", "PRJNA315399", "21095", "275", "7.004202", "19.2615555", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "86.3", "2.35e-20", "", "NR", "EPJ32081.1", "1112244", "g20894", "i0", "100", "0.403636363636364", "37", "0", "40.4", "0", "258", "148", "1", "37", "EPJ32081.1 hypothetical protein CP061683_2145 [Chlamydia psittaci 06-1683]", "diamond", "111", "86.3", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31749489, "PRJNA315399_S_NODE_89497_length_184_cov_1.306122_g89296_i0", "PRJNA315399", "89497", "184", "1.306122", "2.40326448", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "67", "5.78e-13", "", "NR", "EPJ33662.1", "1112244", "g89296", "i0", "97", "0.53804347826087", "33", "1", "53.8", "0", "102", "4", "1", "33", "EPJ33662.1 putative membrane protein, partial [Chlamydia psittaci 06-1683]", "diamond", "99", "67", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [31780984, "PRJNA315399_P_NODE_165777_length_187_cov_5.426667_g165329_i0", "PRJNA315399", "165777", "187", "5.426667", "10.14786729", "Chlamydia ibidis", "1405396", "Bacteria", "Bacteria", "47", "7.88e-5", "", "NR", "EPP34989.1", "1405396", "g165329", "i0", "100", "0.737967914438503", "22", "0", "35.3", "0", "75", "10", "3", "24", "EPP34989.1 hypothetical protein CP10139811_1527, partial [Chlamydia ibidis]", "diamond", "138", "47", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia ibidis"], [32161111, "PRJNA315399_S_NODE_42158_length_225_cov_3.351064_g41957_i0", "PRJNA315399", "42158", "225", "3.351064", "7.539894", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "58.9", "1.09e-9", "", "NR", "EPP28212.1", "1112246", "g41957", "i0", "77.4", "0.413333333333333", "31", "7", "41.3", "0", "133", "225", "13", "43", "EPP28212.1 hypothetical protein CP082626L3_1480 [Chlamydia psittaci 08-2626_L3]", "diamond", "93", "58.9", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [32192623, "PRJNA315399_S_NODE_57778_length_206_cov_8.431953_g57577_i0", "PRJNA315399", "57778", "206", "8.431953", "17.36982318", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "73.9", "9.4e-16", "", "NR", "EPP28212.1", "1112246", "g57577", "i0", "76.2", "0.611650485436893", "42", "10", "61.2", "0", "44", "169", "6", "47", "EPP28212.1 hypothetical protein CP082626L3_1480 [Chlamydia psittaci 08-2626_L3]", "diamond", "126", "73.9", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [32287740, "PRJNA315399_P_NODE_358579_length_167_cov_7.576923_g358131_i0", "PRJNA315399", "358579", "167", "7.576923", "12.65346141", "Chlamydiota bacterium", "2081524", "Bacteria", "Bacteria", "65.9", "8.41e-11", "", "NR", "NDD59539.1", "2081524", "g358131", "i0", "52.1", "0.862275449101796", "48", "23", "86.2", "0", "13", "156", "219", "266", "NDD59539.1 hypothetical protein [Chlamydiota bacterium]", "diamond", "144", "65.9", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", null, null, null, null, "Chlamydiota bacterium"], [32287747, "PRJNA315399_P_NODE_380679_length_164_cov_2.551181_g380231_i0", "PRJNA315399", "380679", "164", "2.551181", "4.18393684", "Chlamydia psittaci", "83554", "Bacteria", "Bacteria", "46.2", "8.12e-5", "", "NR", "EPJ31256.1", "1112244", "g380231", "i0", "78.8", "0.603658536585366", "33", "4", "54.9", "1", "57", "146", "17", "49", "EPJ31256.1 putative membrane protein, partial [Chlamydia psittaci 06-1683]", "diamond", "99", "46.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Chlamydiales", "Chlamydiaceae", "Chlamydia", "Chlamydia psittaci"], [32350900, "PRJNA315399_P_NODE_505879_length_150_cov_11.097345_g505431_i0", "PRJNA315399", "505879", "150", "11.097345", "16.6460175", "Parachlamydia sp.", "2052048", "Bacteria", "Bacteria", "68.2", "7.31e-12", "", "NR", "MCE2984110.1", "2052048", "g505431", "i0", "90.9", "0.66", "33", "3", "66", "0", "13", "111", "261", "293", "MCE2984110.1 phytoene/squalene synthase family protein [Parachlamydia sp.]", "diamond", "99", "68.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", "Chlamydiia", "Parachlamydiales", "Parachlamydiaceae", "Parachlamydia", "Parachlamydia sp."], [32698015, "PRJNA315399_S_NODE_106300_length_175_cov_12.130435_g106099_i0", "PRJNA315399", "106300", "175", "12.130435", "21.22826125", "Chlamydiae bacterium GWA2_5", "2081524", "Bacteria", "Bacteria", "78.2", "5.32e-17", "", "NR", "OGN52734.1", "1797595", "g106099", "i0", "85", "0.685714285714286", "40", "6", "68.6", "0", "134", "15", "1", "40", "OGN52734.1 MAG: 50S ribosomal protein L31 [Chlamydiae bacterium GWA2_50_15]", "diamond", "120", "78.2", "1", "Bacteria", "PVC group", "Pseudomonadati", "Chlamydiota", null, null, null, null, "Chlamydiae bacterium GWA2_50_15"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 43, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_clade\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA315399", "p1": "PVC group", "p2": "Chlamydiota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "PRJNA315399", "label": "PRJNA315399", "count": 43, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 37, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 6, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 43, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "PVC group", "label": "PVC group", "count": 43, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_phylum=Chlamydiota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 43, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group&tax_phylum=Chlamydiota", "results": [{"value": "Chlamydiota", "label": "Chlamydiota", "count": 43, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA315399&tax_clade=PVC+group", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 331.8741910006793}