{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1245487\", tax_phylum = \"Bdellovibrionota\" and tax_superkingdom = \"Bacteria\"", "rows": [[2901844, "PRJNA1245487_P_NODE_11483_length_346_cov_3.333333_g11145_i0", "PRJNA1245487", "11483", "346", "3.333333", "11.53333218", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "374", "6.149999999999998e-99", "", "NTclustered", "gi|2800920897|gb|CP168968.1|", "959", "g11145", "i0", "86.246", "159.884393063584", "349", "43", "100", "4", "1", "346", "777822", "778168", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd5 chromosome, complete genome", "blastn", "55320", "374", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [4879362, "PRJNA1245487_P_NODE_14944_length_293_cov_1.309091_g14606_i0", "PRJNA1245487", "14944", "293", "1.309091", "3.83563663", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "361", "3.97e-95", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g14606", "i0", "89.236", "156.645051194539", "288", "31", "98", "0", "1", "288", "22", "309", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "45897", "361", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [6728955, "PRJNA1245487_P_NODE_21606_length_243_cov_1.835294_g21268_i0", "PRJNA1245487", "21606", "243", "1.835294", "4.45976442", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "318", "1.96e-82", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g21268", "i0", "90.833", "198.378600823045", "240", "19", "98", "3", "5", "243", "3250924", "3250687", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "48206", "318", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [8004445, "PRJNA1245487_P_NODE_22387_length_237_cov_2.847561_g22049_i0", "PRJNA1245487", "22387", "237", "2.847561", "6.74871957", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "353", "5.209999999999998e-93", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g22049", "i0", "93.671", "100.459915611814", "237", "13", "99", "2", "2", "237", "3447077", "3447312", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "23809", "353", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [9979375, "PRJNA1245487_P_NODE_17048_length_270_cov_2.543147_g16710_i0", "PRJNA1245487", "17048", "270", "2.543147", "6.8664969", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "302", "2.23e-77", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g16710", "i0", "86.94", "321.17037037037", "268", "35", "99", "0", "3", "270", "752902", "753169", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "86716", "302", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [11254848, "PRJNA1245487_P_NODE_7249_length_458_cov_2.729870_g6913_i0", "PRJNA1245487", "7249", "458", "2.72987", "12.5028046", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "466", "1.3399999999999997e-126", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g6913", "i0", "85.217", "173.294759825328", "460", "60", "99", "8", "1", "456", "1660363", "1660818", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "79369", "466", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [12530018, "PRJNA1245487_P_NODE_20990_length_246_cov_0.901734_g20652_i0", "PRJNA1245487", "20990", "246", "0.901734", "2.21826564", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "339", "1.5199999999999998e-88", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g20652", "i0", "91.77", "82.0934959349593", "243", "20", "99", "0", "4", "246", "750724", "750482", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "20195", "339", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [15654153, "PRJNA1245487_P_NODE_22533_length_235_cov_2.395062_g22195_i0", "PRJNA1245487", "22533", "235", "2.395062", "5.6283957", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "435", "1.79e-117", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g22195", "i0", "100", "171.208510638298", "235", "0", "100", "0", "1", "235", "1293208", "1293442", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "40234", "435", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [16353646, "PRJNA1245487_P_NODE_11613_length_344_cov_1.918819_g11275_i0", "PRJNA1245487", "11613", "344", "1.918819", "6.60073736", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "231", "3.89e-56", "", "NTclustered", "gi|1700693790|gb|CP030082.1|", "2231053", "g11275", "i0", "81.695", "85.421511627907", "295", "38", "95", "16", "59", "344", "1964146", "1963859", "Bdellovibrio sp. ZAP7 chromosome, complete genome", "blastn", "29385", "231", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. ZAP7"], [16928292, "PRJNA1245487_P_NODE_17234_length_268_cov_4.374359_g16896_i0", "PRJNA1245487", "17234", "268", "4.374359", "11.72328212", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "418", "2.1e-112", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g16896", "i0", "94.776", "95.3134328358209", "268", "14", "100", "0", "1", "268", "3446952", "3446685", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "25544", "418", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [17629143, "PRJNA1245487_P_NODE_19994_length_249_cov_3.232955_g19656_i0", "PRJNA1245487", "19994", "249", "3.232955", "8.05005795", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "422", "1.49e-113", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g19656", "i0", "97.189", "89.9397590361446", "249", "7", "100", "0", "1", "249", "1724", "1476", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "22395", "422", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [21453158, "PRJNA1245487_P_NODE_17897_length_263_cov_1.642105_g17559_i0", "PRJNA1245487", "17897", "263", "1.642105", "4.31873615", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "268", "2.1899999999999998e-67", "", "NTclustered", "gi|2663425168|dbj|AP029173.1|", "3113893", "g17559", "i0", "85.547", "277.984790874525", "256", "37", "97", "0", "7", "262", "757309", "757564", "Bdellovibrio sp. CKG001 DNA, complete genome", "blastn", "73110", "268", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. CKG001"], [22728103, "PRJNA1245487_P_NODE_12538_length_328_cov_1.568627_g12200_i0", "PRJNA1245487", "12538", "328", "1.568627", "5.14509656", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "331", "3.54e-86", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g12200", "i0", "89.734", "292.121951219512", "263", "21", "79", "5", "69", "328", "2950172", "2950431", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "95816", "331", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [23303530, "PRJNA1245487_P_NODE_22499_length_235_cov_3.425926_g22161_i0", "PRJNA1245487", "22499", "235", "3.425926", "8.0509261", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "294", "3.17e-75", "", "NTclustered", "gi|2893356065|emb|OZ220488.1|", "2053517", "g22161", "i0", "89.407", "151.289361702128", "236", "21", "99", "4", "3", "235", "729045", "729279", "MAG: Bdellovibrionales bacterium isolate 0d1acec5-ee6a-42a0-9e8e-8bc2840f726d genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "35553", "294", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [25277632, "PRJNA1245487_P_NODE_6120_length_504_cov_2.394432_g5784_i0", "PRJNA1245487", "6120", "504", "2.394432", "12.06793728", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "787", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g5784", "i0", "94.841", "144.960317460317", "504", "26", "100", "0", "1", "504", "510936", "511439", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "73060", "787", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [30073445, "PRJNA1245487_P_NODE_17792_length_264_cov_1.460733_g17454_i0", "PRJNA1245487", "17792", "264", "1.460733", "3.85633512", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "88.6", "8.15e-20", "", "NR", "HEY1079254.1", "28201", "g17454", "i0", "65", "1.31818181818182", "60", "21", "68.2", "0", "181", "2", "10", "69", "HEY1079254.1 lipocalin family protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "348", "88.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [32760229, "PRJNA1245487_P_NODE_13340_length_315_cov_1.429752_g13002_i0", "PRJNA1245487", "13340", "315", "1.429752", "4.5037188", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "51.2", "8.51e-5", "", "NR", "MFN8790750.1", "2053517", "g13002", "i0", "34.2", "0.723809523809524", "76", "47", "69.5", "2", "225", "7", "182", "257", "MFN8790750.1 site-specific integrase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "228", "51.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 17, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 and \"tax_superkingdom\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1245487", "p1": "Bdellovibrionota", "p2": "Bacteria"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "PRJNA1245487", "label": "PRJNA1245487", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 2, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1245487&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 367.9879660194274}