{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1240805\", tax_clade = \"Opisthokonta\" and tax_phylum = \"Rotifera\"", "rows": [[16352952, "PRJNA1240805_P_NODE_4153_length_225_cov_5.448864_g4104_i0", "PRJNA1240805", "4153", "225", "5.448864", "12.259944", "Brachionidae", "10193", "Rotifera", "other_Eukaryota", "342", "1.0599999999999999e-89", "", "NTclustered", "gi|2177087|gb|U49911.1|BPU49911", "10195", "g4104", "i0", "97.044", "90.2044444444444", "203", "6", "90", "0", "1", "203", "1640", "1438", "Brachionus plicatilis 18S rRNA gene, complete sequence", "blastn", "20296", "342", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus plicatilis"], [16352953, "PRJNA1240805_P_NODE_4173_length_224_cov_14.291429_g4124_i0", "PRJNA1240805", "4173", "224", "14.291429", "32.01280096", "Eurotatoria", "2816136", "Rotifera", "other_Eukaryota", "76.3", "4.47e-14", "", "NR", "CAF1338083.1", "249248", "g4124", "i0", "82.9", "10.9821428571429", "41", "7", "54.9", "0", "190", "68", "18", "58", "CAF1338083.1 unnamed protein product, partial [Adineta ricciae]", "diamond", "2460", "76.3", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Adinetida", "Adinetidae", "Adineta", "Adineta ricciae"], [19475462, "PRJNA1240805_P_NODE_2276_length_315_cov_17.575188_g2227_i0", "PRJNA1240805", "2276", "315", "17.575188", "55.3618422", "Platyias quadricornis", "360688", "Rotifera", "other_Eukaryota", "309", "1.58e-79", "", "NTclustered", "gi|308156994|gb|GQ890459.1|", "360688", "g2227", "i0", "86.254", "41.4793650793651", "291", "33", "92", "3", "1", "291", "633", "350", "Platyias quadricornis isolate DNA197 large subunit ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "13066", "309", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Platyias", "Platyias quadricornis"], [19475487, "PRJNA1240805_P_NODE_4176_length_224_cov_8.657143_g4127_i0", "PRJNA1240805", "4176", "224", "8.657143", "19.39200032", "Proales similis", "360698", "Rotifera", "other_Eukaryota", "189", "1.4499999999999999e-43", "", "NTclustered", "gi|1859640894|gb|MN970216.1|", "360698", "g4127", "i0", "94.309", "6.07142857142857", "123", "7", "55", "0", "47", "169", "12362", "12484", "Proales similis mitochondrion, complete genome", "blastn", "1360", "189", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Proalidae", "Proales", "Proales similis"], [20176675, "PRJNA1240805_P_NODE_2076_length_334_cov_34.764912_g2027_i0", "PRJNA1240805", "2076", "334", "34.764912", "116.11480608", "Lecane", "96445", "Rotifera", "other_Eukaryota", "420", "7.49e-113", "", "NTclustered", "gi|61200802|gb|AY829083.1|", "96446", "g2027", "i0", "91.586", "53.9311377245509", "309", "18", "91", "6", "11", "313", "2091", "1785", "Lecane bulla 28S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "18013", "420", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Lecanidae", "Lecane", "Lecane bulla"], [24575779, "PRJNA1240805_P_NODE_5560_length_193_cov_6.312500_g5511_i0", "PRJNA1240805", "5560", "193", "6.3125", "12.183125", "Brachionus rubens", "392764", "Rotifera", "other_Eukaryota", "147", "7.419999999999999e-31", "", "NTclustered", "gi|1802791198|gb|MN256531.1|", "392764", "g5511", "i0", "82.738", "35.6735751295337", "168", "25", "87", "3", "22", "189", "11235", "11398", "Brachionus rubens chromosome I mitochondrion, complete sequence", "blastn", "6885", "147", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus rubens"], [26724954, "PRJNA1240805_P_NODE_3161_length_262_cov_4.004695_g3112_i0", "PRJNA1240805", "3161", "262", "4.004695", "10.4923009", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "85.9", "1.93e-18", "", "NR", "CAF0897745.1", "104777", "g3112", "i0", "83.3", "0.618320610687023", "54", "9", "61.8", "0", "23", "184", "155", "208", "CAF0897745.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "162", "85.9", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [27484360, "PRJNA1240805_P_NODE_4563_length_214_cov_8.490909_g4514_i0", "PRJNA1240805", "4563", "214", "8.490909", "18.17054526", "Didymodactylos carnosus", "1234261", "Rotifera", "other_Eukaryota", "83.6", "9.79e-17", "", "NR", "CAF1125919.1", "1234261", "g4514", "i0", "68.4", "7.09345794392523", "57", "18", "79.9", "0", "41", "211", "38", "94", "CAF1125919.1 unnamed protein product, partial [Didymodactylos carnosus]", "diamond", "1518", "83.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Philodinida", "Philodinidae", "Didymodactylos", "Didymodactylos carnosus"], [27547497, "PRJNA1240805_P_NODE_1824_length_359_cov_4.209677_g1775_i0", "PRJNA1240805", "1824", "359", "4.209677", "15.11274043", "Brachionus plicatilis", "10195", "Rotifera", "other_Eukaryota", "55.5", "1.14e-7", "", "NR", "RNA00457.1", "10195", "g1775", "i0", "75", "0.902506963788301", "36", "9", "30.1", "0", "22", "129", "15", "50", "RNA00457.1 NAD(P)H:quinone type IV, partial [Brachionus plicatilis]", "diamond", "324", "55.5", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus plicatilis"], [27579033, "PRJNA1240805_P_NODE_3124_length_264_cov_5.920930_g3075_i0", "PRJNA1240805", "3124", "264", "5.92093", "15.6312552", "Brachionus plicatilis", "10195", "Rotifera", "other_Eukaryota", "116", "2.75e-31", "", "NR", "RNA29896.1", "10195", "g3075", "i0", "82.3", "0.704545454545455", "62", "11", "70.5", "0", "24", "209", "76", "137", "RNA29896.1 40S ribosomal S12 [Brachionus plicatilis]", "diamond", "186", "116", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus plicatilis"], [27894723, "PRJNA1240805_P_NODE_6505_length_179_cov_11.761538_g6456_i0", "PRJNA1240805", "6505", "179", "11.761538", "21.05315302", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "84.7", "2.41e-17", "", "NR", "CAF0763792.1", "104777", "g6456", "i0", "76", "0.837988826815642", "50", "12", "83.8", "0", "24", "173", "399", "448", "CAF0763792.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "150", "84.7", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [27989628, "PRJNA1240805_P_NODE_6045_length_186_cov_2.233577_g5996_i0", "PRJNA1240805", "6045", "186", "2.233577", "4.15445322", "Brachionus plicatilis", "10195", "Rotifera", "other_Eukaryota", "72.4", "5.48e-15", "", "NR", "RNA40478.1", "10195", "g5996", "i0", "92.3", "0.629032258064516", "39", "3", "62.9", "0", "2", "118", "36", "74", "RNA40478.1 60S ribosomal L38 [Brachionus plicatilis]", "diamond", "117", "72.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus plicatilis"], [28178739, "PRJNA1240805_P_NODE_6666_length_177_cov_5.312500_g6617_i0", "PRJNA1240805", "6666", "177", "5.3125", "9.403125", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "81.3", "4.01e-16", "", "NR", "CAF0825505.1", "104777", "g6617", "i0", "72.5", "0.864406779661017", "51", "14", "86.4", "0", "24", "176", "877", "927", "CAF0825505.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "153", "81.3", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [28652644, "PRJNA1240805_P_NODE_4607_length_213_cov_6.402439_g4558_i0", "PRJNA1240805", "4607", "213", "6.402439", "13.63719507", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "72.4", "8.75e-13", "", "NR", "CAF0734485.1", "104777", "g4558", "i0", "48.3", "0.845070422535211", "60", "31", "84.5", "0", "191", "12", "424", "483", "CAF0734485.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "180", "72.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [30439405, "PRJNA1240805_P_NODE_6733_length_176_cov_9.921260_g6684_i0", "PRJNA1240805", "6733", "176", "9.92126", "17.4614176", "Brachionus", "10194", "Rotifera", "other_Eukaryota", "77", "8.17e-15", "", "NR", "RNA02595.1", "10195", "g6684", "i0", "69.2", "1.75568181818182", "52", "16", "88.6", "0", "157", "2", "65", "116", "RNA02595.1 elongation factor 1-gamma, partial [Brachionus plicatilis]", "diamond", "309", "77.4", "0.994832041343669", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus plicatilis"], [30452966, "PRJNA1240805_P_NODE_4453_length_217_cov_2.386905_g4404_i0", "PRJNA1240805", "4453", "217", "2.386905", "5.17958385", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "71.6", "2.9e-13", "", "NR", "CAF0870909.1", "104777", "g4404", "i0", "88.6", "0.483870967741935", "35", "4", "48.4", "0", "197", "93", "169", "203", "CAF0870909.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "105", "71.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [30610534, "PRJNA1240805_P_NODE_3173_length_262_cov_2.253521_g3124_i0", "PRJNA1240805", "3173", "262", "2.253521", "5.90422502", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "100", "1.15e-24", "", "NR", "CAF0865306.1", "104777", "g3124", "i0", "73.5", "1.55725190839695", "68", "18", "77.9", "0", "7", "210", "77", "144", "CAF0865306.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "408", "100", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [30926853, "PRJNA1240805_P_NODE_5694_length_191_cov_5.676056_g5645_i0", "PRJNA1240805", "5694", "191", "5.676056", "10.84126696", "Brachionus plicatilis", "10195", "Rotifera", "other_Eukaryota", "63.5", "5.25e-10", "", "NR", "RMZ93438.1", "10195", "g5645", "i0", "50.9", "0.832460732984293", "53", "26", "83.2", "0", "179", "21", "28", "80", "RMZ93438.1 hypothetical protein BpHYR1_011371 [Brachionus plicatilis]", "diamond", "159", "63.5", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus plicatilis"], [31021476, "PRJNA1240805_P_NODE_6755_length_176_cov_3.976378_g6706_i0", "PRJNA1240805", "6755", "176", "3.976378", "6.99842528", "Brachionus plicatilis", "10195", "Rotifera", "other_Eukaryota", "89.7", "1.41e-20", "", "NR", "RMZ95576.1", "10195", "g6706", "i0", "76.9", "8.59090909090909", "52", "12", "88.6", "0", "166", "11", "142", "193", "RMZ95576.1 40S ribosomal S7 [Brachionus plicatilis]", "diamond", "1512", "89.7", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus plicatilis"], [31337395, "PRJNA1240805_P_NODE_3736_length_239_cov_4.389474_g3687_i0", "PRJNA1240805", "3736", "239", "4.389474", "10.49084286", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "58.5", "5e-8", "", "NR", "CAF0785067.1", "104777", "g3687", "i0", "90", "0.376569037656904", "30", "3", "37.7", "0", "202", "113", "199", "228", "CAF0785067.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "90", "58.5", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [31432362, "PRJNA1240805_P_NODE_2876_length_278_cov_2.921397_g2827_i0", "PRJNA1240805", "2876", "278", "2.921397", "8.12148366", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "67.8", "8.7e-11", "", "NR", "CAF0745072.1", "104777", "g2827", "i0", "50", "0.690647482014389", "64", "32", "69.1", "0", "274", "83", "528", "591", "CAF0745072.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "192", "67.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"], [32001780, "PRJNA1240805_P_NODE_4718_length_210_cov_10.919255_g4669_i0", "PRJNA1240805", "4718", "210", "10.919255", "22.9304355", "Brachionus calyciflorus", "104777", "Rotifera", "other_Eukaryota", "85.1", "2.82e-17", "", "NR", "CAF0899337.1", "104777", "g4669", "i0", "68.6", "1.91428571428571", "70", "20", "97.1", "1", "206", "3", "22", "91", "CAF0899337.1 unnamed protein product [Brachionus calyciflorus]", "diamond", "402", "85.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Rotifera", "Eurotatoria", "Ploima", "Brachionidae", "Brachionus", "Brachionus calyciflorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_clade\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1240805", "p1": "Opisthokonta", "p2": "Rotifera"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera", "results": [{"value": "PRJNA1240805", "label": "PRJNA1240805", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 5, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera", "results": [{"value": "Opisthokonta", "label": "Opisthokonta", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_phylum=Rotifera", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera", "results": [{"value": "Metazoa", "label": "Metazoa", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera&tax_kingdom=Metazoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta&tax_phylum=Rotifera", "results": [{"value": "Rotifera", "label": "Rotifera", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1240805&tax_clade=Opisthokonta", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 406.09730799997124}