{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1204310\" and tax_phylum = \"Tubulinea\"", "rows": [[2320354, "PRJNA1204310_P_NODE_36682_length_308_cov_0.995745_g36385_i0", "PRJNA1204310", "36682", "308", "0.995745", "3.0668946", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "564", "2.99e-156", "", "NTclustered", "gi|399764264|gb|JQ271775.1|", "1215986", "g36385", "i0", "99.675", "49.2402597402597", "308", "1", "100", "0", "1", "308", "575", "268", "Tubulinea group 02 sp. 1HFKJ 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "15166", "569", "0.991212653778559", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", null, null, null, null, "Tubulinea group 02 sp. 1HFKJ"], [4156355, "PRJNA1204310_P_NODE_43324_length_281_cov_4.538462_g43027_i0", "PRJNA1204310", "43324", "281", "4.538462", "12.75307822", "Glaeseria mira", "242547", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "335", "2.3e-87", "", "NTclustered", "gi|33946352|gb|AY294155.1|", "242547", "g43027", "i0", "88.489", "91.1138790035587", "278", "31", "99", "1", "1", "277", "296", "19", "Glaeseria mira actin mRNA, partial cds", "blastn", "25603", "335", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Glaeseria", "Glaeseria mira"], [4156774, "PRJNA1204310_P_NODE_644_length_1623_cov_62.105806_g562_i0", "PRJNA1204310", "644", "1623", "62.105806", "1007.97723138", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "769", "2.9100000000000003e-276", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g562", "i0", "81.2", "2.54343807763401", "463", "81", "84.5", "1", "39", "1409", "1", "463", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "4128", "769", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [5431756, "PRJNA1204310_P_NODE_1005_length_1408_cov_3.402996_g886_i0", "PRJNA1204310", "1005", "1408", "3.402996", "47.91418368", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "1557", "0", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g886", "i0", "87.15", "27.1732954545455", "1393", "153", "97", "16", "14", "1384", "1", "1389", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "38260", "1557", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [5432241, "PRJNA1204310_P_NODE_29085_length_344_cov_2.140221_g28788_i0", "PRJNA1204310", "29085", "344", "2.140221", "7.36236024", "Saccamoeba sp. W187G", "1215626", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "636", "7.059999999999998e-178", "", "NTclustered", "gi|399764209|gb|JQ271720.1|", "1215626", "g28788", "i0", "100", "83.1482558139535", "344", "0", "100", "0", "1", "344", "1083", "740", "Saccamoeba sp. W187G 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "28603", "636", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba sp. W187G"], [6707350, "PRJNA1204310_P_NODE_51246_length_253_cov_0.866667_g50949_i0", "PRJNA1204310", "51246", "253", "0.866667", "2.19266751", "Copromyxa sp. PKD 2011", "1215977", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "468", "1.92e-127", "", "NTclustered", "gi|399764167|gb|JQ271678.1|", "1215977", "g50949", "i0", "100", "26.6837944664032", "253", "0", "100", "0", "1", "253", "1655", "1403", "Copromyxa sp. PKD 2011 strain ZEB1 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "6751", "468", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa sp. PKD 2011"], [9256823, "PRJNA1204310_P_NODE_21628_length_391_cov_1.116352_g21331_i0", "PRJNA1204310", "21628", "391", "1.116352", "4.36493632", "Copromyxa laresi", "1789826", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "640", "6.27e-179", "", "NTclustered", "gi|1042160931|dbj|LC102272.1|", "1789826", "g21331", "i0", "96.164", "99.3222506393862", "391", "15", "100", "0", "1", "391", "57", "447", "Copromyxa sp. MK-2016 gene for actin, partial cds, strain: ZEB1_cl1", "blastn", "38835", "640", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa laresi"], [11807400, "PRJNA1204310_P_NODE_19230_length_411_cov_1.153846_g18933_i0", "PRJNA1204310", "19230", "411", "1.153846", "4.74230706", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "229", "9.18e-72", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g18933", "i0", "81.6", "0.992700729927007", "136", "25", "99.3", "0", "410", "3", "131", "266", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "408", "229", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [11807610, "PRJNA1204310_P_NODE_27890_length_351_cov_0.888489_g27593_i0", "PRJNA1204310", "27890", "351", "0.888489", "3.11859639", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "201", "4.24e-62", "", "NR", "AFX84537.1", "5775", "g27593", "i0", "82.1", "1", "117", "21", "100", "0", "351", "1", "106", "222", "AFX84537.1 alpha tubulin, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "351", "201", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [12523606, "PRJNA1204310_P_NODE_14070_length_472_cov_6.263158_g13773_i0", "PRJNA1204310", "14070", "472", "6.263158", "29.56210576", "Saccamoeba", "136463", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "872", "0", "", "NTclustered", "gi|399764206|gb|JQ271717.1|", "1215623", "g13773", "i0", "100", "95.2733050847458", "472", "0", "100", "0", "1", "472", "1652", "1181", "Saccamoeba sp. DP7 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "44969", "872", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Saccamoeba", "Saccamoeba sp. DP7"], [13083065, "PRJNA1204310_P_NODE_45951_length_272_cov_1.175879_g45654_i0", "PRJNA1204310", "45951", "272", "1.175879", "3.19839088", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "160", "6.08e-48", "", "NR", "AAW58116.1", "5775", "g45654", "i0", "81.1", "0.992647058823529", "90", "17", "99.3", "0", "272", "3", "59", "148", "AAW58116.1 peroxiredoxin, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "270", "160", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [15631713, "PRJNA1204310_P_NODE_2113_length_1080_cov_2.420060_g1925_i0", "PRJNA1204310", "2113", "1080", "2.42006", "26.136648", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "563", "1.74e-199", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g1925", "i0", "79.2", "0.961111111111111", "346", "70", "96.1", "1", "1080", "43", "47", "390", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "1038", "563", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [18180207, "PRJNA1204310_P_NODE_11855_length_511_cov_1.958904_g11558_i0", "PRJNA1204310", "11855", "511", "1.958904", "10.00999944", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "364", "5.6599999999999985e-96", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g11558", "i0", "80.04", "1.09784735812133", "496", "95", "97", "4", "1", "494", "494", "1", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "561", "364", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [22005515, "PRJNA1204310_P_NODE_1578_length_1212_cov_12.890255_g1415_i0", "PRJNA1204310", "1578", "1212", "12.890255", "156.2298906", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "619", "1.61e-220", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g1415", "i0", "77.6", "0.97029702970297", "392", "85", "96.8", "2", "1204", "32", "1", "390", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "1176", "619", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [22006303, "PRJNA1204310_P_NODE_50918_length_253_cov_0.866667_g50621_i0", "PRJNA1204310", "50918", "253", "0.866667", "2.19266751", "Chaos carolinense", "160823", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "142", "2.2199999999999996e-41", "", "NR", "AFX73058.1", "160823", "g50621", "i0", "85.7", "0.99604743083004", "84", "12", "99.6", "0", "2", "253", "69", "152", "AFX73058.1 14-3-3 protein, partial [Chaos carolinense]", "diamond", "252", "142", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Chaos", "Chaos carolinense"], [23281961, "PRJNA1204310_P_NODE_7699_length_624_cov_2.573503_g7413_i0", "PRJNA1204310", "7699", "624", "2.573503", "16.05865872", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "342", "4.38e-116", "", "NR", "AFX84537.1", "5775", "g7413", "i0", "80.7", "0.995192307692308", "207", "40", "99.5", "0", "623", "3", "47", "253", "AFX84537.1 alpha tubulin, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "621", "342", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [28209427, "PRJNA1204310_P_NODE_2866_length_955_cov_1.833333_g2648_i0", "PRJNA1204310", "2866", "955", "1.833333", "17.50833015", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "498", "4.17e-173", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g2648", "i0", "74", "1.01465968586387", "323", "79", "99.9", "1", "954", "1", "130", "452", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "969", "498", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [28999328, "PRJNA1204310_P_NODE_52188_length_252_cov_0.871508_g51891_i0", "PRJNA1204310", "52188", "252", "0.871508", "2.19620016", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "119", "4.75e-29", "", "NR", "AKN09691.1", "5775", "g51891", "i0", "67.5", "0.988095238095238", "83", "27", "98.8", "0", "2", "250", "694", "776", "AKN09691.1 Tom70 [Amoeba proteus]", "diamond", "249", "119", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [30262455, "PRJNA1204310_P_NODE_45872_length_272_cov_1.537688_g45575_i0", "PRJNA1204310", "45872", "272", "1.537688", "4.18251136", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "97.1", "4.34e-22", "", "NR", "AKN09689.1", "5775", "g45575", "i0", "58.8", "0.9375", "85", "32", "91.5", "3", "15", "263", "95", "178", "AKN09689.1 Tom20 [Amoeba proteus]", "diamond", "255", "97.1", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [31336422, "PRJNA1204310_P_NODE_42836_length_283_cov_1.485714_g42539_i0", "PRJNA1204310", "42836", "283", "1.485714", "4.20457062", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "145", "3.5999999999999995e-38", "", "NR", "AKN09691.1", "5775", "g42539", "i0", "69.1", "0.996466431095406", "94", "29", "99.6", "0", "282", "1", "588", "681", "AKN09691.1 Tom70 [Amoeba proteus]", "diamond", "282", "145", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [32064047, "PRJNA1204310_P_NODE_7998_length_613_cov_2.655556_g7712_i0", "PRJNA1204310", "7998", "613", "2.655556", "16.27855828", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "147", "6.21e-40", "", "NR", "AAY87037.1", "5778", "g7712", "i0", "44.5", "0.978792822185971", "200", "102", "94.9", "5", "583", "2", "37", "233", "AAY87037.1 CmfA-like protein, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "600", "147", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [32809499, "PRJNA1204310_P_NODE_41460_length_288_cov_1.204651_g41163_i0", "PRJNA1204310", "41460", "288", "1.204651", "3.46939488", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "63.2", "4.2e-9", "", "NR", "AKN09691.1", "5775", "g41163", "i0", "41.5", "1.77083333333333", "82", "48", "85.4", "0", "269", "24", "37", "118", "AKN09691.1 Tom70 [Amoeba proteus]", "diamond", "510", "63.2", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1204310", "p1": "Tubulinea"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "PRJNA1204310", "label": "PRJNA1204310", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 14, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 8, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Amoebozoa", "label": "Amoebozoa", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea&tax_clade=Amoebozoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Tubulinea", "label": "Tubulinea", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1204310", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 192.88964799852693}