{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1158727\", tax_kingdom = \"Pseudomonadati\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[6684381, "PRJNA1158727_P_NODE_81226_length_336_cov_1.171103_g73765_i0", "PRJNA1158727", "81226", "336", "1.171103", "3.93490608", "Cyanobacteriota/Melainabacteria group", "1798711", "Bacteria", "Bacteria", "206", "8.29e-63", "", "NR", "WP_015470630.1", "453816", "g73765", "i0", "91", "114.982142857143", "111", "10", "99.1", "0", "2", "334", "18", "128", "WP_015470630.1 elongation factor Tu [Pseudobdellovibrio exovorus]", "diamond", "38634", "206", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [10508155, "PRJNA1158727_P_NODE_162949_length_241_cov_0.916667_g155487_i0", "PRJNA1158727", "162949", "241", "0.916667", "2.20916747", "Bdellovibrio sp. HCB-162", "3394234", "Bacteria", "Bacteria", "261", "3.31e-65", "", "NTclustered", "gi|2898207634|gb|CP178861.1|", "3394234", "g155487", "i0", "86.555", "9.40663900414938", "238", "30", "98", "2", "5", "241", "1840023", "1840259", "Bdellovibrio sp. HCB-162 chromosome, complete genome", "blastn", "2267", "261", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB-162"], [13060259, "PRJNA1158727_P_NODE_84491_length_327_cov_1.452756_g77030_i0", "PRJNA1158727", "84491", "327", "1.452756", "4.75051212", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "425", "1.57e-114", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g77030", "i0", "90.214", "177.562691131498", "327", "30", "99", "2", "1", "326", "666173", "666498", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "58063", "425", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [21980769, "PRJNA1158727_P_NODE_140898_length_249_cov_0.875000_g133436_i0", "PRJNA1158727", "140898", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "368", "1.97e-97", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g133436", "i0", "93.548", "136.429718875502", "248", "15", "99", "1", "3", "249", "3447954", "3447707", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "33971", "368", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [25263768, "PRJNA1158727_P_NODE_130720_length_255_cov_1.692308_g123259_i0", "PRJNA1158727", "130720", "255", "1.692308", "4.3153854", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "138", "2.06e-36", "", "NR", "MBX3021147.1", "2053517", "g123259", "i0", "73.8", "0.988235294117647", "84", "22", "98.8", "0", "1", "252", "66", "149", "MBX3021147.1 UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "252", "138", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27134766, "PRJNA1158727_P_NODE_139162_length_250_cov_0.870056_g131700_i0", "PRJNA1158727", "139162", "250", "0.870056", "2.17514", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "142", "1.87e-38", "", "NR", "MCO5142763.1", "2599941", "g131700", "i0", "75.9", "0.996", "83", "20", "99.6", "0", "249", "1", "187", "269", "MCO5142763.1 flagellar hook protein FlgE [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "249", "142", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [27672341, "PRJNA1158727_P_NODE_112024_length_277_cov_1.245098_g104563_i0", "PRJNA1158727", "112024", "277", "1.245098", "3.44892146", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "85.1", "2.78e-17", "", "NR", "PZP56002.1", "349221", "g104563", "i0", "56.5", "0.747292418772563", "69", "30", "74.7", "0", "69", "275", "1", "69", "PZP56002.1 MAG: endolytic transglycosylase MltG [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "207", "85.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [27735636, "PRJNA1158727_P_NODE_158764_length_242_cov_1.822485_g151302_i0", "PRJNA1158727", "158764", "242", "1.822485", "4.4104137", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "119", "1.67e-30", "", "NR", "MBY0316991.1", "2053517", "g151302", "i0", "93", "0.706611570247934", "57", "4", "70.7", "0", "242", "72", "283", "339", "MBY0316991.1 site-specific integrase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "171", "119", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27830018, "PRJNA1158727_P_NODE_143784_length_248_cov_0.880000_g136322_i0", "PRJNA1158727", "143784", "248", "0.88", "2.1824", "Micavibrio sp.", "2024841", "Bacteria", "Bacteria", "124", "1.7399999999999999e-31", "", "NR", "HEY8190593.1", "2024841", "g136322", "i0", "80.5", "0.931451612903226", "77", "15", "93.1", "0", "247", "17", "144", "220", "HEY8190593.1 type II and III secretion system protein family protein [Micavibrio sp.]", "diamond", "231", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio sp."], [27849231, "PRJNA1158727_P_NODE_154944_length_244_cov_0.900585_g147482_i0", "PRJNA1158727", "154944", "244", "0.900585", "2.1974274", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "52.4", "6.66e-6", "", "NR", "QQG35199.1", "349221", "g147482", "i0", "43.9", "2.05327868852459", "57", "32", "70.1", "0", "70", "240", "15", "71", "QQG35199.1 MAG: PH domain-containing protein [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "501", "52.8", "0.992424242424242", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [27893073, "PRJNA1158727_P_NODE_152445_length_245_cov_0.895349_g144983_i0", "PRJNA1158727", "152445", "245", "0.895349", "2.19360505", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "139", "7.99e-40", "", "NR", "HEY8278050.1", "3034175", "g144983", "i0", "79", "0.991836734693878", "81", "17", "99.2", "0", "244", "2", "15", "95", "HEY8278050.1 hypothetical protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "243", "139", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [28177122, "PRJNA1158727_P_NODE_159606_length_242_cov_0.911243_g152144_i0", "PRJNA1158727", "159606", "242", "0.911243", "2.20520806", "Oligoflexus sp.", "1971216", "Bacteria", "Bacteria", "97.4", "2.08e-22", "", "NR", "MBC7530104.1", "1971216", "g152144", "i0", "100", "2.4297520661157", "49", "0", "60.7", "0", "151", "5", "1", "49", "MBC7530104.1 ParA family protein [Oligoflexus sp.]", "diamond", "588", "97.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Oligoflexaceae", "Oligoflexus", "Oligoflexus sp."], [30028266, "PRJNA1158727_P_NODE_160231_length_242_cov_0.911243_g152769_i0", "PRJNA1158727", "160231", "242", "0.911243", "2.20520806", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "46.6", "0.00153", "", "NR", "MBT4792039.1", "2026745", "g152769", "i0", "31.3", "1.90909090909091", "80", "53", "99.2", "2", "240", "1", "57", "134", "MBT4792039.1 hypothetical protein [Halobacteriovoraceae bacterium]", "diamond", "462", "47", "0.991489361702128", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", null, "Halobacteriovoraceae bacterium"], [30293526, "PRJNA1158727_P_NODE_156672_length_243_cov_0.905882_g149210_i0", "PRJNA1158727", "156672", "243", "0.905882", "2.20129326", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "85.9", "2.44e-17", "", "NR", "HMN67242.1", "2053517", "g149210", "i0", "57", "3.90123456790123", "79", "33", "97.5", "1", "239", "3", "397", "474", "HMN67242.1 choice-of-anchor D domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "948", "85.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30703778, "PRJNA1158727_P_NODE_136294_length_251_cov_0.865169_g128832_i0", "PRJNA1158727", "136294", "251", "0.865169", "2.17157419", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "113", "1.88e-28", "", "NR", "MFN8791414.1", "2053517", "g128832", "i0", "65.1", "1.9840637450199201", "83", "29", "99.2", "0", "250", "2", "28", "110", "MFN8791414.1 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "498", "113", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30956789, "PRJNA1158727_P_NODE_139094_length_250_cov_0.870056_g131632_i0", "PRJNA1158727", "139094", "250", "0.870056", "2.17514", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "120", "4.7699999999999996e-32", "", "NR", "HEY8280566.1", "3034175", "g131632", "i0", "70.7", "1.896", "82", "24", "98.4", "0", "248", "3", "103", "184", "HEY8280566.1 GGDEF domain-containing protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "474", "120", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [31208931, "PRJNA1158727_P_NODE_157655_length_243_cov_0.905882_g150193_i0", "PRJNA1158727", "157655", "243", "0.905882", "2.20129326", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "75.9", "3.99e-14", "", "NR", "MBI2234198.1", "349221", "g150193", "i0", "78.6", "0.518518518518518", "42", "9", "51.9", "0", "117", "242", "1", "42", "MBI2234198.1 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "126", "75.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [32177923, "PRJNA1158727_P_NODE_153298_length_244_cov_1.748538_g145836_i0", "PRJNA1158727", "153298", "244", "1.748538", "4.26643272", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "160", "1.1999999999999999e-43", "", "NR", "NUM58224.1", "2026715", "g145836", "i0", "92.5", "1.9672131147541", "80", "6", "98.4", "0", "242", "3", "138", "217", "NUM58224.1 acyl-CoA dehydrogenase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "480", "160", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 18, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_kingdom\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1158727", "p1": "Pseudomonadati", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA1158727", "label": "PRJNA1158727", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 3, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1158727&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 301.5139540002565}