{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1126198\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[2832115, "PRJNA1126198_P_NODE_333523_length_258_cov_1.675676_g332802_i0", "PRJNA1126198", "333523", "258", "1.675676", "4.32324408", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "344", "3.46e-90", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g332802", "i0", "90.734", "207.197674418605", "259", "23", "100", "1", "1", "258", "3446176", "3446434", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "53457", "344", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [4108584, "PRJNA1126198_P_NODE_386564_length_250_cov_0.881356_g385843_i0", "PRJNA1126198", "386564", "250", "0.881356", "2.20339", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "92.4", "6.77e-20", "", "NR", "WP_407676976.1", "28202", "g385843", "i0", "100", "3.864", "46", "0", "55.2", "0", "139", "2", "1", "46", "WP_407676976.1 methionine adenosyltransferase [Peredibacter starrii]", "diamond", "966", "92.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [6659122, "PRJNA1126198_P_NODE_248046_length_278_cov_2.629268_g247325_i0", "PRJNA1126198", "248046", "278", "2.629268", "7.30936504", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "381", "2.869999999999999e-101", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g247325", "i0", "91.667", "86.7158273381295", "276", "22", "99", "1", "1", "276", "3446707", "3446981", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "24107", "381", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [16858924, "PRJNA1126198_P_NODE_439234_length_245_cov_0.901163_g438513_i0", "PRJNA1126198", "439234", "245", "0.901163", "2.20784935", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "231", "2.65e-56", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g438513", "i0", "84.17", "87.8367346938775", "259", "19", "97", "9", "1", "238", "3251898", "3251641", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "21520", "231", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [21432388, "PRJNA1126198_P_NODE_442677_length_244_cov_1.812865_g441956_i0", "PRJNA1126198", "442677", "244", "1.812865", "4.4233906", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "446", "8.639999999999999e-121", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g441956", "i0", "99.59", "236.635245901639", "244", "1", "100", "0", "1", "244", "511286", "511529", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "57739", "446", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [21957944, "PRJNA1126198_P_NODE_173798_length_302_cov_2.860262_g173078_i0", "PRJNA1126198", "173798", "302", "2.860262", "8.63799124", "Bdellovibrio reynosensis", "2835041", "Bacteria", "Bacteria", "460", "3.94e-125", "", "NTclustered", "gi|2216477995|gb|CP093442.1|", "2835041", "g173078", "i0", "94.098", "217.228476821192", "305", "14", "100", "4", "1", "302", "950548", "950245", "Bdellovibrio reynosensis strain LBG001 chromosome, complete genome", "blastn", "65603", "460", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio reynosensis"], [23982610, "PRJNA1126198_P_NODE_329099_length_259_cov_1.661290_g328378_i0", "PRJNA1126198", "329099", "259", "1.66129", "4.3027411", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "217", "7.9e-52", "", "NTclustered", "gi|2800920897|gb|CP168968.1|", "959", "g328378", "i0", "81.992", "165.362934362934", "261", "42", "99", "4", "2", "259", "778137", "777879", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd5 chromosome, complete genome", "blastn", "42829", "219", "0.990867579908676", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [25256543, "PRJNA1126198_P_NODE_17920_length_506_cov_1.898383_g17230_i0", "PRJNA1126198", "17920", "506", "1.898383", "9.60581798", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "658", "0", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g17230", "i0", "90.335", "200.719367588933", "507", "41", "99", "8", "1", "504", "748374", "748875", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "101564", "664", "0.990963855421687", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [26658533, "PRJNA1126198_P_NODE_370341_length_252_cov_0.865922_g369620_i0", "PRJNA1126198", "370341", "252", "0.865922", "2.18212344", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "144", "3.88e-40", "", "NR", "MBC7465365.1", "28201", "g369620", "i0", "77.1", "0.988095238095238", "83", "19", "98.8", "0", "251", "3", "187", "269", "MBC7465365.1 hypothetical protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "249", "144", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [26912011, "PRJNA1126198_P_NODE_430382_length_246_cov_0.867052_g429661_i0", "PRJNA1126198", "430382", "246", "0.867052", "2.13294792", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "74.7", "3.12e-15", "", "NR", "HMN67913.1", "2053517", "g429661", "i0", "60.3", "0.707317073170732", "58", "23", "70.7", "0", "73", "246", "16", "73", "HMN67913.1 DNA-processing protein DprA [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "174", "74.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27070237, "PRJNA1126198_P_NODE_293722_length_267_cov_1.587629_g293001_i0", "PRJNA1126198", "293722", "267", "1.587629", "4.23896943", "Bacteriovorax sp.", "2608087", "Bacteria", "Bacteria", "152", "2.0999999999999996e-41", "", "NR", "MBC7711885.1", "2608087", "g293001", "i0", "78.4", "1.97752808988764", "88", "19", "98.9", "0", "1", "264", "94", "181", "MBC7711885.1 bifunctional metallophosphatase/5'-nucleotidase [Bacteriovorax sp.]", "diamond", "528", "152", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax sp."], [27544271, "PRJNA1126198_P_NODE_354184_length_254_cov_1.359116_g353463_i0", "PRJNA1126198", "354184", "254", "1.359116", "3.45215464", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "110", "6.29e-26", "", "NR", "MBX3022343.1", "2053517", "g353463", "i0", "61.7", "0.956692913385827", "81", "31", "95.7", "0", "10", "252", "393", "473", "MBX3022343.1 penicillin acylase family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "243", "110", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27891407, "PRJNA1126198_P_NODE_460525_length_243_cov_0.905882_g459804_i0", "PRJNA1126198", "460525", "243", "0.905882", "2.20129326", "Pseudobdellovibrio sp.", "2862747", "Bacteria", "Bacteria", "52.8", "1.8e-6", "", "NR", "MEQ1722613.1", "2862747", "g459804", "i0", "65.9", "0.54320987654321", "44", "15", "54.3", "0", "109", "240", "1", "44", "MEQ1722613.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrio sp.]", "diamond", "132", "52.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp."], [28112465, "PRJNA1126198_P_NODE_488825_length_229_cov_2.673077_g488104_i0", "PRJNA1126198", "488825", "229", "2.673077", "6.12134633", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "84", "9.64e-18", "", "NR", "MEW6058194.1", "3034175", "g488104", "i0", "80.8", "1.37554585152838", "52", "10", "68.1", "0", "1", "156", "173", "224", "MEW6058194.1 ABC transporter ATP-binding protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "315", "84", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [28144357, "PRJNA1126198_P_NODE_440565_length_245_cov_0.877907_g439844_i0", "PRJNA1126198", "440565", "245", "0.877907", "2.15087215", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "44.3", "0.0111", "", "NR", "PWU19774.1", "28201", "g439844", "i0", "55.9", "0.416326530612245", "34", "15", "41.6", "0", "3", "104", "16", "49", "PWU19774.1 MAG: hypothetical protein C5B49_05200 [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "102", "44.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [28175541, "PRJNA1126198_P_NODE_468826_length_242_cov_0.923077_g468105_i0", "PRJNA1126198", "468826", "242", "0.923077", "2.23384634", "Bdellovibrio sp. HAGR", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "54.3", "2.38e-6", "", "NR", "BFD69049.1", "3113895", "g468105", "i0", "40.3", "0.954545454545455", "77", "46", "95.5", "0", "235", "5", "113", "189", "BFD69049.1 hypothetical protein HAGR004_40710 [Bdellovibrio sp. HAGR004]", "diamond", "231", "54.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [28428384, "PRJNA1126198_P_NODE_444226_length_244_cov_1.409357_g443505_i0", "PRJNA1126198", "444226", "244", "1.409357", "3.43883108", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "82", "1.42e-16", "", "NR", "MEK6772611.1", "3034175", "g443505", "i0", "76.5", "0.627049180327869", "51", "12", "62.7", "0", "90", "242", "1", "51", "MEK6772611.1 hypothetical protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "153", "82", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [28586377, "PRJNA1126198_P_NODE_372927_length_251_cov_1.741573_g372206_i0", "PRJNA1126198", "372927", "251", "1.741573", "4.37134823", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "116", "1.52e-29", "", "NR", "MEK6774396.1", "3034175", "g372206", "i0", "68.7", "0.99203187250996006", "83", "26", "99.2", "0", "3", "251", "95", "177", "MEK6774396.1 hypothetical protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "249", "116", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [29344028, "PRJNA1126198_P_NODE_379989_length_251_cov_0.865169_g379268_i0", "PRJNA1126198", "379989", "251", "0.865169", "2.17157419", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "53.9", "3.88e-6", "", "NR", "HMN68375.1", "2053517", "g379268", "i0", "81.3", "0.382470119521912", "32", "6", "38.2", "0", "65", "160", "246", "277", "HMN68375.1 flagellin [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "96", "53.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30702152, "PRJNA1126198_P_NODE_421714_length_246_cov_1.803468_g420993_i0", "PRJNA1126198", "421714", "246", "1.803468", "4.43653128", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "110", "3.29e-26", "", "NR", "HEY8279479.1", "3034175", "g420993", "i0", "68", "0.914634146341463", "75", "24", "91.5", "0", "21", "245", "8", "82", "HEY8279479.1 long-chain fatty acid--CoA ligase [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "225", "110", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [30702158, "PRJNA1126198_P_NODE_446254_length_244_cov_0.912281_g445533_i0", "PRJNA1126198", "446254", "244", "0.912281", "2.22596564", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "107", "3.62e-27", "", "NR", "MEK6772640.1", "3034175", "g445533", "i0", "87.9", "0.713114754098361", "58", "7", "71.3", "0", "175", "2", "1", "58", "MEK6772640.1 nitroreductase family protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "174", "107", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [31639533, "PRJNA1126198_P_NODE_379076_length_251_cov_0.870787_g378355_i0", "PRJNA1126198", "379076", "251", "0.870787", "2.18567537", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "139", "1.6199999999999996e-40", "", "NR", "WP_321393711.1", "28202", "g378355", "i0", "86.5", "2.65338645418327", "74", "10", "88.4", "0", "3", "224", "50", "123", "WP_321393711.1 TraR/DksA family transcriptional regulator [Peredibacter starrii]", "diamond", "666", "140", "0.992857142857143", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [32156852, "PRJNA1126198_P_NODE_217198_length_287_cov_1.457944_g216477_i0", "PRJNA1126198", "217198", "287", "1.457944", "4.18429928", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "99", "2.94e-22", "", "NR", "MEK6773955.1", "3034175", "g216477", "i0", "76.7", "0.627177700348432", "60", "14", "62.7", "0", "2", "181", "297", "356", "MEK6773955.1 branched-chain amino acid aminotransferase [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "180", "99", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [32568269, "PRJNA1126198_P_NODE_339699_length_257_cov_1.331522_g338978_i0", "PRJNA1126198", "339699", "257", "1.331522", "3.42201154", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "139", "3.72e-36", "", "NR", "MBY0315255.1", "2053517", "g338978", "i0", "77.6", "0.992217898832685", "85", "19", "99.2", "0", "256", "2", "6942", "7026", "MBY0315255.1 choice-of-anchor D domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "255", "139", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 24, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1126198", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA1126198", "label": "PRJNA1126198", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1126198", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 267.8653069961001}