{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1073712\" and tax_phylum = \"Chordata\"", "rows": [[187602, "PRJNA1073712_P_NODE_2921_length_398_cov_1.243077_g2838_i0", "PRJNA1073712", "2921", "398", "1.243077", "4.94744646", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "625", "1.7899999999999995e-174", "", "NTclustered", "gi|14269443|gb|AF378830.1|AF378830", "10090", "g2838", "i0", "100", "79.9497487437186", "338", "0", "85", "0", "61", "398", "710", "373", "Mus musculus cytochrome c oxidase subunit II (Cox2) mRNA, complete cds; mitochondrial gene for mitochondrial product", "blastn", "31820", "625", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [1462135, "PRJNA1073712_P_NODE_16742_length_241_cov_0.916667_g16659_i0", "PRJNA1073712", "16742", "241", "0.916667", "2.20916747", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "446", "8.519999999999999e-121", "", "NTclustered", "gi|46931419|gb|AC110564.7|", "10090", "g16659", "i0", "100", "8.24066390041494", "241", "0", "100", "0", "1", "241", "28188", "27948", "Mus musculus chromosome 12, clone RP23-292A16, complete sequence", "blastn", "1986", "446", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [2738153, "PRJNA1073712_P_NODE_14583_length_245_cov_0.895349_g14500_i0", "PRJNA1073712", "14583", "245", "0.895349", "2.19360505", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "307", "4.2700000000000006e-79", "", "NTclustered", "gi|68163722|gb|AC130669.17|", "10090", "g14500", "i0", "97.753", "0.726530612244898", "178", "4", "73", "0", "1", "178", "177514", "177691", "Mus musculus chromosome 15, clone RP24-84O5, complete sequence", "blastn", "178", "307", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [3566759, "PRJNA1073712_P_NODE_14063_length_246_cov_0.890173_g13980_i0", "PRJNA1073712", "14063", "246", "0.890173", "2.18982558", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "350", "7.04e-92", "", "NTclustered", "gi|45551804|gb|AY553638.1|", "10090", "g13980", "i0", "100", "76.8048780487805", "189", "0", "77", "0", "3", "191", "1538", "1726", "Mus musculus strain BALB/c metadherin mRNA, complete cds", "blastn", "18894", "350", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4013977, "PRJNA1073712_P_NODE_11884_length_250_cov_0.870056_g11801_i0", "PRJNA1073712", "11884", "250", "0.870056", "2.17514", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "460", "3.17e-125", "", "NTclustered", "gi|2678918321|ref|XM_039102261.2|", "10116", "g11801", "i0", "100", "73.16", "249", "0", "99", "0", "1", "249", "1480", "1728", "PREDICTED: Rattus norvegicus nocturnin (Noct), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "18290", "460", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4014017, "PRJNA1073712_P_NODE_14804_length_245_cov_0.889535_g14721_i0", "PRJNA1073712", "14804", "245", "0.889535", "2.17936075", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "305", "1.54e-78", "", "NTclustered", "gi|354791051|gb|JN955552.1|", "10090", "g14721", "i0", "99.405", "4.11428571428571", "168", "1", "69", "0", "3", "170", "26471", "26304", "Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele Slc46a1:tm1e(KOMP)Ucd; transgenic", "blastn", "1008", "305", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4014029, "PRJNA1073712_P_NODE_15924_length_243_cov_0.905882_g15841_i0", "PRJNA1073712", "15924", "243", "0.905882", "2.20129326", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "357", "4.1399999999999997e-94", "", "NTclustered", "gi|25189044|gb|AC122347.4|", "10090", "g15841", "i0", "97.608", "1.7201646090535", "209", "3", "85", "2", "1", "207", "163419", "163211", "Mus musculus BAC clone RP23-368O1 from chromosome 5, complete sequence", "blastn", "418", "357", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4844218, "PRJNA1073712_P_NODE_12204_length_249_cov_0.875000_g12121_i0", "PRJNA1073712", "12204", "249", "0.875", "2.17875", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "460", "3.16e-125", "", "NTclustered", "gi|26328702|dbj|AK032936.1|", "10090", "g12121", "i0", "100", "99.8875502008032", "249", "0", "100", "0", "1", "249", "1066", "818", "Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720476C15 product:hypothetical Tetratricopeptide repeat (TPR) structure containing protein, full insert sequence", "blastn", "24872", "460", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5290345, "PRJNA1073712_P_NODE_11185_length_251_cov_0.865169_g11102_i0", "PRJNA1073712", "11185", "251", "0.865169", "2.17157419", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "324", "4.37e-84", "", "NTclustered", "gi|56404138|gb|AC107734.13|", "10090", "g11102", "i0", "96.923", "0.776892430278884", "195", "3", "76", "2", "60", "251", "17344", "17150", "Mus musculus chromosome 7, clone RP23-399E4, complete sequence", "blastn", "195", "324", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5290355, "PRJNA1073712_P_NODE_12025_length_250_cov_0.870056_g11942_i0", "PRJNA1073712", "12025", "250", "0.870056", "2.17514", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "326", "1.21e-84", "", "NTclustered", "gi|34366485|emb|AL672186.7|", "10090", "g11942", "i0", "96.923", "0.78", "195", "5", "78", "1", "1", "194", "137576", "137382", "Mouse DNA sequence from clone RP23-42G2 on chromosome X, complete sequence", "blastn", "195", "326", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5290371, "PRJNA1073712_P_NODE_13025_length_248_cov_0.880000_g12942_i0", "PRJNA1073712", "13025", "248", "0.88", "2.1824", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "459", "1.13e-124", "", "NTclustered", "gi|354783137|gb|JN947638.1|", "10090", "g12942", "i0", "100", "6", "248", "0", "100", "0", "1", "248", "1679", "1926", "Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele Apip:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic", "blastn", "1488", "459", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5290408, "PRJNA1073712_P_NODE_16065_length_242_cov_0.911243_g15982_i0", "PRJNA1073712", "16065", "242", "0.911243", "2.20520806", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "174", "4.46e-39", "", "NTclustered", "gi|109734556|gb|BC117954.1|", "10090", "g15982", "i0", "97.115", "42.9545454545455", "104", "2", "43", "1", "139", "241", "466", "363", "Mus musculus DAZ interacting protein 3, zinc finger, mRNA (cDNA clone MGC:144138 IMAGE:40098143), complete cds", "blastn", "10395", "174", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5290419, "PRJNA1073712_P_NODE_16965_length_241_cov_0.916667_g16882_i0", "PRJNA1073712", "16965", "241", "0.916667", "2.20916747", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "259", "1.19e-64", "", "NTclustered", "gi|38564405|gb|AC129336.4|", "10090", "g16882", "i0", "94.152", "1.00829875518672", "171", "8", "87", "2", "42", "211", "169239", "169408", "Mus musculus BAC clone RP23-113I7 from chromosome 10, complete sequence", "blastn", "243", "259", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [6565513, "PRJNA1073712_P_NODE_11226_length_251_cov_0.865169_g11143_i0", "PRJNA1073712", "11226", "251", "0.865169", "2.17157419", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "464", "2.47e-126", "", "NTclustered", "gi|74225281|dbj|AK152892.1|", "10090", "g11143", "i0", "100", "79.3545816733068", "251", "0", "100", "0", "1", "251", "1536", "1786", "Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830089I05 product:cathepsin D, full insert sequence", "blastn", "19918", "464", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [6565532, "PRJNA1073712_P_NODE_13306_length_247_cov_0.885057_g13223_i0", "PRJNA1073712", "13306", "247", "0.885057", "2.18609079", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "340", "4.25e-89", "", "NTclustered", "gi|38153901|gb|AC116138.21|", "10090", "g13223", "i0", "98.454", "0.785425101214575", "194", "1", "78", "2", "54", "245", "31060", "31253", "Mus musculus chromosome 10, clone RP23-123D17, complete sequence", "blastn", "194", "340", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7393991, "PRJNA1073712_P_NODE_8706_length_275_cov_0.821782_g8623_i0", "PRJNA1073712", "8706", "275", "0.821782", "2.2599005", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "357", "4.78e-94", "", "NTclustered", "gi|846388176|dbj|LC062059.1|", "10090", "g8623", "i0", "99.49", "71.2727272727273", "196", "1", "71", "0", "77", "272", "2385", "2190", "Mus musculus mitochondrion DNA, including Cytb, tRNA-Tyr, tRNA-Pro, tRNA-Phe, 12S rRNA genes and D-loop, complete sequence, sequence_id: (14446..634)_12", "blastn", "19600", "357", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7840213, "PRJNA1073712_P_NODE_15687_length_243_cov_0.905882_g15604_i0", "PRJNA1073712", "15687", "243", "0.905882", "2.20129326", "Pteropus vampyrus", "132908", "Chordata", "Chordata", "58.4", "4.71e-4", "", "NTclustered", "gi|1995999043|ref|XM_039853650.1|", "132908", "g15604", "i0", "97.059", "0.263374485596708", "34", "1", "14", "0", "176", "209", "3347", "3380", "PREDICTED: Pteropus giganteus hyaluronan synthase 2 (HAS2), mRNA", "blastn", "64", "58.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Chiroptera", "Pteropodidae", "Pteropus", "Pteropus vampyrus"], [7840277, "PRJNA1073712_P_NODE_8247_length_280_cov_0.946860_g8164_i0", "PRJNA1073712", "8247", "280", "0.94686", "2.651208", "Xenopus tropicalis", "8364", "Chordata", "Chordata", "172", "1.8999999999999995e-38", "", "NTclustered", "gi|50253597|gb|AC148966.2|", "8364", "g8164", "i0", "83.42", "1.37857142857143", "193", "24", "69", "5", "16", "208", "86776", "86960", "X. tropicalis BAC clone ISB1-137N19 containing gene for DLL3, complete sequence", "blastn", "386", "172", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Amphibia", "Anura", "Pipidae", "Xenopus", "Xenopus tropicalis"], [7840286, "PRJNA1073712_P_NODE_9567_length_266_cov_1.585492_g9484_i0", "PRJNA1073712", "9567", "266", "1.585492", "4.21740872", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "492", "1.2099999999999999e-134", "", "NTclustered", "gi|74186107|dbj|AK157843.1|", "10090", "g9484", "i0", "100", "31.3233082706767", "266", "0", "100", "0", "1", "266", "1783", "2048", "Mus musculus erythroblast cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K0C0021G18 product:SAR1a gene homolog 1 (S. cerevisiae), full insert sequence", "blastn", "8332", "492", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7840287, "PRJNA1073712_P_NODE_9727_length_265_cov_0.833333_g9644_i0", "PRJNA1073712", "9727", "265", "0.833333", "2.20833245", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "363", "9.849999999999999e-96", "", "NTclustered", "gi|55991508|gb|BC086653.1|", "10090", "g9644", "i0", "98.537", "13.7962264150943", "205", "3", "77", "0", "2", "206", "5352", "5556", "Mus musculus lupus brain antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:113752 IMAGE:30536238), complete cds", "blastn", "3656", "363", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [8669397, "PRJNA1073712_P_NODE_4167_length_352_cov_2.161290_g4084_i0", "PRJNA1073712", "4167", "352", "2.16129", "7.6077408", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "651", "0", "", "NTclustered", "gi|846387786|dbj|LC061991.1|", "10090", "g4084", "i0", "100", "100", "352", "0", "100", "0", "1", "352", "1245", "894", "Mus musculus mitochondrion DNA, including ATP6, COX3, tRNA-Gly, ND3, tRNA-Arg, ND4L, ND4 genes, complete sequence, sequence_id: (8070..10988)_18", "blastn", "35200", "651", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [9115219, "PRJNA1073712_P_NODE_15248_length_244_cov_0.900585_g15165_i0", "PRJNA1073712", "15248", "244", "0.900585", "2.1974274", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "329", "9.08e-86", "", "NTclustered", "gi|2551953376|ref|NG_204053.1|", "10090", "g15165", "i0", "98.919", "4.51229508196721", "185", "1", "75", "1", "1", "184", "646", "462", "Mus musculus STARR-seq mESC enhancer starr_01013 (LOC131295633) on chromosome 1", "blastn", "1101", "329", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [9115287, "PRJNA1073712_P_NODE_8668_length_275_cov_1.346535_g8585_i0", "PRJNA1073712", "8668", "275", "1.346535", "3.70297125", "Cinclus cinclus", "127875", "Chordata", "Chordata", "52.8", "0.025", "", "NTclustered", "gi|2661066406|ref|XM_062492527.1|", "127875", "g8585", "i0", "100", "0.101818181818182", "28", "0", "10", "0", "153", "180", "633", "606", "PREDICTED: Cinclus cinclus RecQ like helicase 4 (RECQL4), mRNA", "blastn", "28", "52.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Passeriformes", "Cinclidae", "Cinclus", "Cinclus cinclus"], [10390832, "PRJNA1073712_P_NODE_12189_length_249_cov_0.875000_g12106_i0", "PRJNA1073712", "12189", "249", "0.875", "2.17875", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "344", "3.32e-90", "", "NTclustered", "gi|23337016|gb|BC037461.1|", "10090", "g12106", "i0", "99.471", "41.6465863453815", "189", "1", "76", "0", "1", "189", "2724", "2912", "Mus musculus Rab40c, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:4192196), with apparent retained intron", "blastn", "10370", "344", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [10390841, "PRJNA1073712_P_NODE_13289_length_247_cov_0.885057_g13206_i0", "PRJNA1073712", "13289", "247", "0.885057", "2.18609079", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "331", "2.5600000000000002e-86", "", "NTclustered", "gi|88319892|emb|CT025561.11|", "10090", "g13206", "i0", "97.917", "0.777327935222672", "192", "3", "78", "1", "1", "192", "186361", "186551", "Mouse DNA sequence from clone RP23-308G10 on chromosome 9, complete sequence", "blastn", "192", "331", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [10390889, "PRJNA1073712_P_NODE_17009_length_241_cov_0.916667_g16926_i0", "PRJNA1073712", "17009", "241", "0.916667", "2.20916747", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "440", "3.959999999999999e-119", "", "NTclustered", "gi|2678898975|ref|XM_063274223.1|", "10116", "g16926", "i0", "99.585", "99.9875518672199", "241", "1", "100", "0", "1", "241", "2244", "2004", "PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 219 (Zfp219), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "24097", "440", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [12494983, "PRJNA1073712_P_NODE_15510_length_243_cov_1.000000_g15427_i0", "PRJNA1073712", "15510", "243", "1", "2.43", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "291", "4.26e-74", "", "NTclustered", "gi|756142290|gb|KP260515.1|", "10090", "g15427", "i0", "97.11", "71.1934156378601", "173", "3", "70", "1", "67", "237", "13287", "13115", "Mus musculus strain ME mitochondrion, complete genome", "blastn", "17300", "291", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [12941303, "PRJNA1073712_P_NODE_11711_length_250_cov_0.870056_g11628_i0", "PRJNA1073712", "11711", "250", "0.870056", "2.17514", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "311", "3.38e-80", "", "NTclustered", "gi|77920853|gb|AC162520.7|", "10090", "g11628", "i0", "96.791", "0.748", "187", "4", "74", "2", "66", "250", "81851", "81665", "Mus musculus chromosome 5, clone RP24-118C7, complete sequence", "blastn", "187", "311", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [12941328, "PRJNA1073712_P_NODE_14111_length_246_cov_0.890173_g14028_i0", "PRJNA1073712", "14111", "246", "0.890173", "2.18982558", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "274", "4.36e-69", "", "NTclustered", "gi|21844703|gb|AC114817.3|", "10090", "g14028", "i0", "100", "8.63008130081301", "148", "0", "60", "0", "99", "246", "156310", "156163", "Mus musculus BAC clone RP23-28O15 from 14, complete sequence", "blastn", "2123", "274", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [12941361, "PRJNA1073712_P_NODE_16631_length_241_cov_0.916667_g16548_i0", "PRJNA1073712", "16631", "241", "0.916667", "2.20916747", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "316", "6.97e-82", "", "NTclustered", "gi|21425260|emb|AL731728.10|", "10090", "g16548", "i0", "97.312", "1.44813278008299", "186", "5", "77", "0", "56", "241", "31649", "31464", "Mouse DNA sequence from clone RP24-531N10 on chromosome 11, complete sequence", "blastn", "349", "316", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [14216248, "PRJNA1073712_P_NODE_13432_length_247_cov_0.885057_g13349_i0", "PRJNA1073712", "13432", "247", "0.885057", "2.18609079", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "457", "4.05e-124", "", "NTclustered", "gi|41351589|gb|AC115743.10|", "10090", "g13349", "i0", "100", "5", "247", "0", "100", "0", "1", "247", "160472", "160718", "Mus musculus chromosome 5, clone RP23-477P24, complete sequence", "blastn", "1235", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [15490167, "PRJNA1073712_P_NODE_13893_length_246_cov_0.890173_g13810_i0", "PRJNA1073712", "13893", "246", "0.890173", "2.18982558", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "303", "5.56e-78", "", "NTclustered", "gi|46408806|emb|CR354442.5|", "10090", "g13810", "i0", "97.207", "25.0487804878049", "179", "5", "73", "0", "1", "179", "104295", "104473", "Mouse DNA sequence from clone RP24-562O19 on chromosome 2, complete sequence", "blastn", "6162", "303", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [15490176, "PRJNA1073712_P_NODE_14573_length_245_cov_0.895349_g14490_i0", "PRJNA1073712", "14573", "245", "0.895349", "2.19360505", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "335", "1.9599999999999992e-87", "", "NTclustered", "gi|21955611|emb|AL731843.14|", "10090", "g14490", "i0", "98.429", "3.11836734693878", "191", "1", "77", "1", "1", "189", "161607", "161797", "Mouse DNA sequence from clone RP23-300F6 on chromosome X, complete sequence", "blastn", "764", "335", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [15490180, "PRJNA1073712_P_NODE_14813_length_245_cov_0.872093_g14730_i0", "PRJNA1073712", "14813", "245", "0.872093", "2.13662785", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "289", "1.55e-73", "", "NTclustered", "gi|354793693|gb|JN958194.1|", "10090", "g14730", "i0", "96.571", "2.14285714285714", "175", "5", "71", "1", "71", "244", "22923", "22749", "Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Plekha5:tm1(KOMP)Ucd; transgenic", "blastn", "525", "289", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [15490259, "PRJNA1073712_P_NODE_9053_length_271_cov_1.373737_g8970_i0", "PRJNA1073712", "9053", "271", "1.373737", "3.72282727", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "429", "9.83e-116", "", "NTclustered", "gi|74039309|gb|AC159631.2|", "10090", "g8970", "i0", "99.574", "1.73431734317343", "235", "1", "87", "0", "37", "271", "14511", "14745", "Mus musculus BAC clone RP24-177F21 from chromosome 12, complete sequence", "blastn", "470", "429", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [16318658, "PRJNA1073712_P_NODE_12373_length_249_cov_0.875000_g12290_i0", "PRJNA1073712", "12373", "249", "0.875", "2.17875", "Marmota", "9992", "Chordata", "Chordata", "52.8", "0.023", "", "NTclustered", "gi|2556768865|ref|XM_046429220.2|", "9995", "g12290", "i0", "100", "0.562248995983936", "28", "0", "11", "0", "121", "148", "37", "64", "PREDICTED: Marmota monax transcription factor 20 (Tcf20), transcript variant X5, mRNA", "blastn", "140", "52.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Sciuridae", "Marmota", "Marmota monax"], [16318694, "PRJNA1073712_P_NODE_17393_length_217_cov_6.736111_g17310_i0", "PRJNA1073712", "17393", "217", "6.736111", "14.61736087", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "228", "2.969999999999999e-55", "", "NTclustered", "gi|20338812|emb|AL645571.18|", "10090", "g17310", "i0", "100", "100.322580645161", "123", "0", "100", "0", "95", "217", "169793", "169671", "Mouse DNA sequence from clone RP23-39H1 on chromosome 11, complete sequence", "blastn", "21770", "228", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [16764466, "PRJNA1073712_P_NODE_11754_length_250_cov_0.870056_g11671_i0", "PRJNA1073712", "11754", "250", "0.870056", "2.17514", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "407", "4.1899999999999994e-109", "", "NTclustered", "gi|344925855|ref|NM_011221.3|", "10090", "g11671", "i0", "99.552", "14.46", "223", "1", "89", "0", "26", "248", "4521", "4299", "Mus musculus purine rich element binding protein B (Purb), mRNA", "blastn", "3615", "407", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [16764469, "PRJNA1073712_P_NODE_12174_length_249_cov_0.875000_g12091_i0", "PRJNA1073712", "12174", "249", "0.875", "2.17875", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "315", "2.6e-81", "", "NTclustered", "gi|14529735|emb|AL136998.36|", "10090", "g12091", "i0", "98.864", "1.4136546184739", "176", "2", "71", "0", "73", "248", "25018", "25193", "Mouse DNA sequence from clone RP21-509E24 on chromosome X, complete sequence", "blastn", "352", "315", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [16764541, "PRJNA1073712_P_NODE_4514_length_343_cov_1.940741_g4431_i0", "PRJNA1073712", "4514", "343", "1.940741", "6.65674163", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "202", "1.47e-60", "", "NR", "NP_001091127.1", "8355", "g4431", "i0", "86", "22.932944606414", "114", "16", "99.7", "0", "2", "343", "29", "142", "NP_001091127.1 uncharacterized protein LOC100036877 [Xenopus laevis]", "diamond", "7866", "204", "0.990196078431373", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Amphibia", "Anura", "Pipidae", "Xenopus", "Xenopus laevis"], [16764564, "PRJNA1073712_P_NODE_6794_length_298_cov_1.848889_g6711_i0", "PRJNA1073712", "6794", "298", "1.848889", "5.50968922", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "429", "1.1e-115", "", "NTclustered", "gi|92446090|gb|BC055952.1|", "10090", "g6711", "i0", "99.163", "75.010067114094", "239", "1", "80", "1", "61", "298", "2519", "2281", "Mus musculus cDNA clone IMAGE:4484770, **** WARNING: chimeric clone ****", "blastn", "22353", "429", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [16764580, "PRJNA1073712_P_NODE_8674_length_275_cov_1.326733_g8591_i0", "PRJNA1073712", "8674", "275", "1.326733", "3.64851575", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "405", "1.68e-108", "", "NTclustered", "gi|38154213|gb|AC123930.4|", "10090", "g8591", "i0", "99.55", "0.807272727272727", "222", "1", "81", "0", "54", "275", "18787", "18566", "Mus musculus BAC clone RP24-478K24 from chromosome 19, complete sequence", "blastn", "222", "405", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [17593905, "PRJNA1073712_P_NODE_10454_length_257_cov_1.673913_g10371_i0", "PRJNA1073712", "10454", "257", "1.673913", "4.30195641", "Felidae", "9681", "Chordata", "Chordata", "58.4", "5.02e-4", "", "NTclustered", "gi|2079033507|ref|XR_006204611.1|", "9689", "g10371", "i0", "94.595", "2.92996108949416", "37", "2", "14", "0", "211", "247", "328", "364", "PREDICTED: Panthera leo uncharacterized LOC122223980 (LOC122223980), transcript variant X2, ncRNA", "blastn", "753", "58.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Felidae", "Panthera", "Panthera leo"], [17593973, "PRJNA1073712_P_NODE_3954_length_359_cov_1.884615_g3871_i0", "PRJNA1073712", "3954", "359", "1.884615", "6.76576785", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "568", "2.7299999999999993e-157", "", "NTclustered", "gi|846387586|dbj|LC061956.1|", "10090", "g3871", "i0", "100", "85.5153203342618", "307", "0", "86", "0", "53", "359", "2121", "1815", "Mus musculus mitochondrion DNA, including COX1, tRNA-Ser, tRNA-Asp, COX2, tRNA-Lys, ATP8, ATP6 genes, complete sequence, sequence_id: (5951..8605)_5", "blastn", "30700", "568", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [18039227, "PRJNA1073712_P_NODE_12715_length_248_cov_0.880000_g12632_i0", "PRJNA1073712", "12715", "248", "0.88", "2.1824", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "340", "4.27e-89", "", "NTclustered", "gi|48926717|gb|AC121499.9|", "10090", "g12632", "i0", "99.465", "0.754032258064516", "187", "1", "75", "0", "3", "189", "60949", "60763", "Mus musculus chromosome 9, clone RP23-269E5, complete sequence", "blastn", "187", "340", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [18039336, "PRJNA1073712_P_NODE_9575_length_266_cov_1.497409_g9492_i0", "PRJNA1073712", "9575", "266", "1.497409", "3.98310794", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "492", "1.2099999999999999e-134", "", "NTclustered", "gi|33147420|gb|AC122482.4|", "10090", "g9492", "i0", "100", "1", "266", "0", "100", "0", "1", "266", "11854", "11589", "Mus musculus BAC clone RP24-361E14 from chromosome 1, complete sequence", "blastn", "266", "492", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [18867765, "PRJNA1073712_P_NODE_1775_length_472_cov_1.536341_g1692_i0", "PRJNA1073712", "1775", "472", "1.536341", "7.25152952", "Carnivora", "33554", "Chordata", "Chordata", "93.5", "2.7e-14", "", "NTclustered", "gi|1886020089|ref|XM_027573121.2|", "9704", "g1692", "i0", "77.564", "0.661016949152542", "156", "34", "33", "1", "317", "472", "1475", "1321", "PREDICTED: Zalophus californianus homeobox A5 (HOXA5), mRNA", "blastn", "312", "93.5", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Otariidae", "Zalophus", "Zalophus californianus"], [19313254, "PRJNA1073712_P_NODE_11196_length_251_cov_0.865169_g11113_i0", "PRJNA1073712", "11196", "251", "0.865169", "2.17157419", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "464", "2.47e-126", "", "NTclustered", "gi|21410548|gb|BC031131.1|", "10090", "g11113", "i0", "100", "10.7410358565737", "251", "0", "100", "0", "1", "251", "2349", "2099", "Mus musculus ladinin, mRNA (cDNA clone MGC:37195 IMAGE:4954891), complete cds", "blastn", "2696", "464", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [20142591, "PRJNA1073712_P_NODE_4336_length_348_cov_1.701818_g4253_i0", "PRJNA1073712", "4336", "348", "1.701818", "5.92232664", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "643", "4.279999999999998e-180", "", "NTclustered", "gi|12832042|dbj|AK002219.1|", "10090", "g4253", "i0", "100", "73.1235632183908", "348", "0", "100", "0", "1", "348", "1226", "879", "Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610005C19 product:glutathione peroxidase 3, full insert sequence", "blastn", "25447", "643", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [20588617, "PRJNA1073712_P_NODE_17317_length_228_cov_2.270968_g17234_i0", "PRJNA1073712", "17317", "228", "2.270968", "5.17780704", "Scyliorhinus canicula", "7830", "Chordata", "Chordata", "52.8", "0.02", "", "NTclustered", "gi|1952533211|ref|XM_038791845.1|", "7830", "g17234", "i0", "100", "0.245614035087719", "28", "0", "12", "0", "177", "204", "720", "693", "PREDICTED: Scyliorhinus canicula dynein light chain 2, cytoplasmic-like (LOC119963156), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "56", "52.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Chondrichthyes", "Carcharhiniformes", "Scyliorhinidae", "Scyliorhinus", "Scyliorhinus canicula"], [21864344, "PRJNA1073712_P_NODE_10438_length_257_cov_2.358696_g10355_i0", "PRJNA1073712", "10438", "257", "2.358696", "6.06184872", "Galeopterus variegatus", "482537", "Chordata", "Chordata", "97.1", "1.06e-15", "", "NTclustered", "gi|667298074|ref|XM_008581936.1|", "482537", "g10355", "i0", "79.72", "1.66147859922179", "143", "22", "55", "5", "37", "177", "351", "488", "PREDICTED: Galeopterus variegatus histone H3.1-like (LOC103598027), mRNA", "blastn", "427", "97.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Dermoptera", "Cynocephalidae", "Galeopterus", "Galeopterus variegatus"], [21864355, "PRJNA1073712_P_NODE_1178_length_555_cov_1.251037_g1095_i0", "PRJNA1073712", "1178", "555", "1.251037", "6.94325535", "Pteronotus mesoamericanus", "1884717", "Chordata", "Chordata", "91.6", "1.16e-13", "", "NTclustered", "gi|2466567928|ref|XM_054563935.1|", "1884717", "g1095", "i0", "83.505", "0.863063063063063", "97", "16", "17", "0", "3", "99", "799", "895", "PREDICTED: Pteronotus mesoamericanus homeobox A4 (HOXA4), mRNA", "blastn", "479", "91.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Chiroptera", "Mormoopidae", "Pteronotus", "Pteronotus mesoamericanus"], [23139891, "PRJNA1073712_P_NODE_13499_length_247_cov_0.885057_g13416_i0", "PRJNA1073712", "13499", "247", "0.885057", "2.18609079", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "305", "1.55e-78", "", "NTclustered", "gi|32469571|gb|AC102145.3|", "10090", "g13416", "i0", "100", "2.08906882591093", "165", "0", "67", "0", "83", "247", "64435", "64271", "Mus musculus chromosome 6, clone RP23-302K3, complete sequence", "blastn", "516", "305", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [23139902, "PRJNA1073712_P_NODE_14219_length_246_cov_0.884393_g14136_i0", "PRJNA1073712", "14219", "246", "0.884393", "2.17560678", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "339", "1.5199999999999998e-88", "", "NTclustered", "gi|31746716|gb|AC125540.4|", "10090", "g14136", "i0", "98.947", "3.27235772357724", "190", "1", "77", "1", "58", "246", "101941", "101752", "Mus musculus BAC clone RP23-229O18 from chromosome 15, complete sequence", "blastn", "805", "339", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [23139907, "PRJNA1073712_P_NODE_14399_length_245_cov_0.895349_g14316_i0", "PRJNA1073712", "14399", "245", "0.895349", "2.19360505", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "409", "1.1399999999999998e-109", "", "NTclustered", "gi|62123192|gb|AC154801.2|", "10090", "g14316", "i0", "97.89", "1.93469387755102", "237", "3", "96", "2", "11", "245", "28361", "28597", "Mus musculus BAC clone RP24-500P8 from chromosome 16, complete sequence", "blastn", "474", "409", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [23968645, "PRJNA1073712_P_NODE_8139_length_281_cov_1.177885_g8056_i0", "PRJNA1073712", "8139", "281", "1.177885", "3.30985685", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "375", "1.3499999999999995e-99", "", "NTclustered", "gi|21727344|emb|AL627314.6|", "10090", "g8056", "i0", "98.14", "102.466192170819", "215", "4", "100", "0", "1", "215", "31807", "32021", "Mouse DNA sequence from clone RP23-354H24 on chromosome 4, complete sequence", "blastn", "28793", "375", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [24413464, "PRJNA1073712_P_NODE_12400_length_249_cov_0.875000_g12317_i0", "PRJNA1073712", "12400", "249", "0.875", "2.17875", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "348", "2.57e-91", "", "NTclustered", "gi|50540826|gb|AC116774.9|", "10090", "g12317", "i0", "100", "0.755020080321285", "188", "0", "76", "0", "3", "190", "49882", "50069", "Mus musculus chromosome 3, clone RP24-361N19, complete sequence", "blastn", "188", "348", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [24413533, "PRJNA1073712_P_NODE_1840_length_464_cov_2.813299_g1757_i0", "PRJNA1073712", "1840", "464", "2.813299", "13.05370736", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "852", "0", "", "NTclustered", "gi|2321481628|pdb|7QGG|t", "10116", "g1757", "i0", "99.784", "94.2780172413793", "464", "1", "100", "0", "1", "464", "750", "1213", "Chain t, RNA (4803-MER)", "blastn", "43745", "852", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [25242475, "PRJNA1073712_P_NODE_1880_length_462_cov_1.136247_g1797_i0", "PRJNA1073712", "1880", "462", "1.136247", "5.24946114", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "854", "0", "", "NTclustered", "gi|354795652|gb|JN960153.1|", "10090", "g1797", "i0", "100", "98.4545454545455", "462", "0", "100", "0", "1", "462", "10773", "10312", "Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Apoc1:tm1(KOMP)Ucd; transgenic", "blastn", "45486", "854", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [26900847, "PRJNA1073712_P_NODE_5621_length_319_cov_1.341463_g5538_i0", "PRJNA1073712", "5621", "319", "1.341463", "4.27926697", "Mammalia", "40674", "Chordata", "Chordata", "73.2", "1.04e-12", "", "NR", "XP_007530638.1", "9365", "g5538", "i0", "65.5", "7.03448275862069", "58", "20", "54.5", "0", "176", "3", "1", "58", "XP_007530638.1 olfactory receptor 10K1 [Erinaceus europaeus]", "diamond", "2244", "73.2", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Eulipotyphla", "Erinaceidae", "Erinaceus", "Erinaceus europaeus"], [26995389, "PRJNA1073712_P_NODE_5802_length_316_cov_0.950617_g5719_i0", "PRJNA1073712", "5802", "316", "0.950617", "3.00394972", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "115", "9.13e-28", "", "NR", "XP_025919739.1", "308060", "g5719", "i0", "54.8", "9.87341772151899", "104", "47", "98.7", "0", "5", "316", "195", "298", "XP_025919739.1 ammonium transporter Rh type A [Apteryx rowi]", "diamond", "3120", "116", "0.991379310344828", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Apterygiformes", "Apterygidae", "Apteryx", "Apteryx rowi"], [27185209, "PRJNA1073712_P_NODE_862_length_630_cov_1.294434_g779_i0", "PRJNA1073712", "862", "630", "1.294434", "8.1549342", "Mammalia", "40674", "Chordata", "Chordata", "54.7", "6.43e-5", "", "NR", "EMP34551.1", "8469", "g779", "i0", "71.4", "6", "42", "12", "20", "0", "2", "127", "197", "238", "EMP34551.1 Protein FAM78B [Chelonia mydas]", "diamond", "3780", "55.1", "0.992740471869329", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", null, "Testudines", "Cheloniidae", "Chelonia", "Chelonia mydas"], [27383564, "PRJNA1073712_P_NODE_14143_length_246_cov_0.890173_g14060_i0", "PRJNA1073712", "14143", "246", "0.890173", "2.18982558", "Oryctolagus cuniculus", "9986", "Chordata", "Chordata", "51.6", "2.95e-5", "", "NR", "XP_002713428.3", "9986", "g14060", "i0", "46.8", "2.36585365853659", "47", "20", "51.2", "1", "245", "120", "2146", "2192", "XP_002713428.3 stabilin-1 [Oryctolagus cuniculus]", "diamond", "582", "51.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Lagomorpha", "Leporidae", "Oryctolagus", "Oryctolagus cuniculus"], [27888560, "PRJNA1073712_P_NODE_1625_length_490_cov_0.944844_g1542_i0", "PRJNA1073712", "1625", "490", "0.944844", "4.6297356", "Fukomys damarensis", "885580", "Chordata", "Chordata", "65.5", "5.25e-9", "", "NR", "KFO18957.1", "885580", "g1542", "i0", "63.6", "0.336734693877551", "55", "20", "33.7", "0", "345", "181", "1", "55", "KFO18957.1 BarH-like 2 homeobox protein [Fukomys damarensis]", "diamond", "165", "65.5", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Bathyergidae", "Fukomys", "Fukomys damarensis"], [28425561, "PRJNA1073712_P_NODE_9166_length_270_cov_1.172589_g9083_i0", "PRJNA1073712", "9166", "270", "1.172589", "3.1659903", "Fukomys damarensis", "885580", "Chordata", "Chordata", "66.2", "2.69e-10", "", "NR", "XP_010626660.2", "885580", "g9083", "i0", "44.4", "0.9", "81", "45", "90", "0", "264", "22", "47", "127", "XP_010626660.2 homeobox protein Hox-A5 [Fukomys damarensis]", "diamond", "243", "66.2", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Bathyergidae", "Fukomys", "Fukomys damarensis"], [28457128, "PRJNA1073712_P_NODE_10926_length_252_cov_2.581006_g10843_i0", "PRJNA1073712", "10926", "252", "2.581006", "6.50413512", "Felis catus", "9685", "Chordata", "Chordata", "61.2", "1.28e-8", "", "NR", "XP_023095022.1", "9685", "g10843", "i0", "64.3", "0.5", "42", "15", "50", "0", "52", "177", "24", "65", "XP_023095022.1 hepatocyte cell adhesion molecule isoform X1 [Felis catus]", "diamond", "126", "61.2", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Felidae", "Felis", "Felis catus"], [28457130, "PRJNA1073712_P_NODE_7286_length_290_cov_2.235023_g7203_i0", "PRJNA1073712", "7286", "290", "2.235023", "6.4815667", "Fukomys damarensis", "885580", "Chordata", "Chordata", "52", "3.48e-5", "", "NR", "XP_010626660.2", "885580", "g7203", "i0", "45.6", "0.589655172413793", "57", "31", "59", "0", "173", "3", "47", "103", "XP_010626660.2 homeobox protein Hox-A5 [Fukomys damarensis]", "diamond", "171", "52", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Bathyergidae", "Fukomys", "Fukomys damarensis"], [28583472, "PRJNA1073712_P_NODE_16287_length_242_cov_0.911243_g16204_i0", "PRJNA1073712", "16287", "242", "0.911243", "2.20520806", "Protopterus annectens", "7888", "Chordata", "Chordata", "73.6", "1.09e-14", "", "NR", "XP_043924616.1", "7888", "g16204", "i0", "43.4", "1.92148760330579", "76", "43", "94.2", "0", "232", "5", "27", "102", "XP_043924616.1 macrophage migration inhibitory factor-like [Protopterus annectens]", "diamond", "465", "73.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", null, "Ceratodontiformes", "Protopteridae", "Protopterus", "Protopterus annectens"], [28701251, "PRJNA1073712_P_NODE_4747_length_338_cov_1.237736_g4664_i0", "PRJNA1073712", "4747", "338", "1.237736", "4.18354768", "Mammalia", "40674", "Chordata", "Chordata", "79.7", "3.41e-16", "", "NR", "AAA18780.1", "10090", "g4664", "i0", "75", "36.6390532544379", "48", "12", "42.6", "0", "3", "146", "52", "99", "AAA18780.1 GDF7, partial [Mus musculus]", "diamond", "12384", "79.7", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [28772657, "PRJNA1073712_P_NODE_4867_length_335_cov_2.629771_g4784_i0", "PRJNA1073712", "4867", "335", "2.629771", "8.80973285", "Erinaceus europaeus", "9365", "Chordata", "Chordata", "53.1", "2.5e-5", "", "NR", "XP_060053346.1", "9365", "g4784", "i0", "65.7", "1.7910447761194", "35", "12", "31.3", "0", "106", "2", "808", "842", "XP_060053346.1 vascular endothelial growth factor receptor 3 isoform X1 [Erinaceus europaeus]", "diamond", "600", "53.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Eulipotyphla", "Erinaceidae", "Erinaceus", "Erinaceus europaeus"], [29174910, "PRJNA1073712_P_NODE_12409_length_249_cov_0.875000_g12326_i0", "PRJNA1073712", "12409", "249", "0.875", "2.17875", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "122", "2.03e-32", "", "NR", "XP_043918615.1", "7888", "g12326", "i0", "73", "21.6626506024096", "74", "20", "89.2", "0", "226", "5", "64", "137", "XP_043918615.1 coiled-coil domain-containing protein 25 isoform X1 [Protopterus annectens]", "diamond", "5394", "122", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", null, "Ceratodontiformes", "Protopteridae", "Protopterus", "Protopterus annectens"], [29490334, "PRJNA1073712_P_NODE_7510_length_288_cov_1.316279_g7427_i0", "PRJNA1073712", "7510", "288", "1.316279", "3.79088352", "Mammalia", "40674", "Chordata", "Chordata", "66.6", "2.6200000000000003e-10", "", "NR", "XP_004717019.1", "9371", "g7427", "i0", "85.7", "18.9583333333333", "35", "5", "36.5", "0", "106", "2", "1217", "1251", "XP_004717019.1 adenomatous polyposis coli protein 2 isoform X4 [Echinops telfairi]", "diamond", "5460", "66.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", null, "Tenrecidae", "Echinops", "Echinops telfairi"], [29647943, "PRJNA1073712_P_NODE_7790_length_285_cov_1.018868_g7707_i0", "PRJNA1073712", "7790", "285", "1.018868", "2.9037738", "Mammalia", "40674", "Chordata", "Chordata", "79.3", "8.56e-15", "", "NR", "XP_044635622.2", "9793", "g7707", "i0", "58.7", "4.64210526315789", "63", "26", "66.3", "0", "285", "97", "597", "659", "XP_044635622.2 transcription factor SOX-1 [Equus asinus]", "diamond", "1323", "80.1", "0.990012484394507", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Perissodactyla", "Equidae", "Equus", "Equus asinus"], [29972604, "PRJNA1073712_P_NODE_8391_length_278_cov_1.497561_g8308_i0", "PRJNA1073712", "8391", "278", "1.497561", "4.16321958", "Pristiophorus japonicus", "55135", "Chordata", "Chordata", "52", "3.19e-5", "", "NR", "XP_070756643.1", "55135", "g8308", "i0", "55.3", "1.89928057553957", "38", "17", "41", "0", "2", "115", "694", "731", "XP_070756643.1 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4-like isoform X1 [Pristiophorus japonicus]", "diamond", "528", "52", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Chondrichthyes", null, "Pristiophoridae", "Pristiophorus", "Pristiophorus japonicus"], [30035863, "PRJNA1073712_P_NODE_1211_length_549_cov_1.260504_g1128_i0", "PRJNA1073712", "1211", "549", "1.260504", "6.92016696", "Orcinus orca", "9733", "Chordata", "Chordata", "51.6", "6.22e-4", "", "NR", "XP_049569077.1", "9733", "g1128", "i0", "56.4", "0.601092896174863", "55", "23", "30.1", "1", "154", "318", "1222", "1275", "XP_049569077.1 liprin-alpha-4 isoform X1 [Orcinus orca]", "diamond", "330", "51.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Delphinidae", "Orcinus", "Orcinus orca"], [30058755, "PRJNA1073712_P_NODE_11451_length_251_cov_0.865169_g11368_i0", "PRJNA1073712", "11451", "251", "0.865169", "2.17157419", "Saccopteryx", "59481", "Chordata", "Chordata", "58.9", "7.8e-8", "", "NR", "XP_066093304.1", "59482", "g11368", "i0", "45.3", "12.5856573705179", "75", "40", "89.6", "1", "3", "227", "58", "131", "XP_066093304.1 ankyrin repeat and SOCS box protein 10 isoform X4 [Saccopteryx bilineata]", "diamond", "3159", "58.9", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Chiroptera", "Emballonuridae", "Saccopteryx", "Saccopteryx bilineata"], [30098862, "PRJNA1073712_P_NODE_6892_length_297_cov_1.267857_g6809_i0", "PRJNA1073712", "6892", "297", "1.267857", "3.76553529", "Orycteropus afer afer", "1230840", "Chordata", "Chordata", "48.9", "4.9e-4", "", "NR", "XP_007940468.1", "1230840", "g6809", "i0", "56.1", "0.828282828282828", "41", "18", "41.4", "0", "10", "132", "92", "132", "XP_007940468.1 PR domain zinc finger protein 13 [Orycteropus afer afer]", "diamond", "246", "48.9", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Tubulidentata", "Orycteropodidae", "Orycteropus", "Orycteropus afer"], [30248729, "PRJNA1073712_P_NODE_2712_length_407_cov_2.002994_g2629_i0", "PRJNA1073712", "2712", "407", "2.002994", "8.15218558", "Mammalia", "40674", "Chordata", "Chordata", "55.1", "9.25e-6", "", "NR", "XP_047565711.1", "9657", "g2629", "i0", "59.3", "1.20884520884521", "54", "21", "39.1", "1", "250", "92", "73", "126", "XP_047565711.1 LOW QUALITY PROTEIN: calcyclin-binding protein-like [Lutra lutra]", "diamond", "492", "55.5", "0.992792792792793", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Mustelidae", "Lutra", "Lutra lutra"], [30438301, "PRJNA1073712_P_NODE_6093_length_310_cov_1.801688_g6010_i0", "PRJNA1073712", "6093", "310", "1.801688", "5.5852328", "Chordata", "7711", "Chordata", "Chordata", "102", "5.36e-23", "", "NR", "XP_067886915.1", "7792", "g6010", "i0", "61.7", "87.6387096774194", "81", "31", "78.4", "0", "67", "309", "310", "390", "XP_067886915.1 growth/differentiation factor 6-A [Heterodontus francisci]", "diamond", "27168", "103", "0.990291262135922", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Chondrichthyes", "Heterodontiformes", "Heterodontidae", "Heterodontus", "Heterodontus francisci"], [30920678, "PRJNA1073712_P_NODE_2514_length_418_cov_1.800000_g2431_i0", "PRJNA1073712", "2514", "418", "1.8", "7.524", "Fukomys damarensis", "885580", "Chordata", "Chordata", "70.1", "6.2e-11", "", "NR", "XP_010638550.1", "885580", "g2431", "i0", "49.3", "4.49282296650718", "75", "37", "53.1", "1", "407", "186", "158", "232", "XP_010638550.1 mitochondria-eating protein isoform X12 [Fukomys damarensis]", "diamond", "1878", "70.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Bathyergidae", "Fukomys", "Fukomys damarensis"], [31006773, "PRJNA1073712_P_NODE_13674_length_246_cov_2.121387_g13591_i0", "PRJNA1073712", "13674", "246", "2.121387", "5.21861202", "Aves", "8782", "Chordata", "Chordata", "93.6", "3.28e-20", "", "NR", "KAK2520218.1", "8932", "g13591", "i0", "64.2", "20.7439024390244", "81", "29", "98.8", "0", "244", "2", "217", "297", "KAK2520218.1 Mab21l2 [Columba livia]", "diamond", "5103", "93.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Columbiformes", "Columbidae", "Columba", "Columba livia"], [31015261, "PRJNA1073712_P_NODE_15415_length_243_cov_1.811765_g15332_i0", "PRJNA1073712", "15415", "243", "1.811765", "4.40258895", "Branchiostoma floridae", "7739", "Chordata", "Chordata", "53.1", "7.48e-6", "", "NR", "XP_035683361.1", "7739", "g15332", "i0", "44.4", "0.777777777777778", "63", "29", "77.8", "2", "191", "3", "112", "168", "XP_035683361.1 cysteine-rich motor neuron 1 protein-like [Branchiostoma floridae]", "diamond", "189", "53.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Leptocardii", "Amphioxiformes", "Branchiostomatidae", "Branchiostoma", "Branchiostoma floridae"], [31132868, "PRJNA1073712_P_NODE_8075_length_281_cov_1.759615_g7992_i0", "PRJNA1073712", "8075", "281", "1.759615", "4.94451815", "Carnivora", "33554", "Chordata", "Chordata", "100", "1.0300000000000001e-22", "", "NR", "VCW50085.1", "48420", "g7992", "i0", "60.9", "1.8576512455516", "87", "34", "92.9", "0", "280", "20", "41", "127", "VCW50085.1 unnamed protein product, partial [Gulo gulo]", "diamond", "522", "100", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Mustelidae", "Gulo", "Gulo gulo"], [31141264, "PRJNA1073712_P_NODE_1975_length_455_cov_2.329843_g1892_i0", "PRJNA1073712", "1975", "455", "2.329843", "10.60078565", "Myotis lucifugus", "59463", "Chordata", "Chordata", "94", "1.92e-19", "", "NR", "XP_023601374.1", "59463", "g1892", "i0", "48.5", "1.95824175824176", "99", "51", "65.3", "0", "387", "91", "275", "373", "XP_023601374.1 RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1 isoform X3 [Myotis lucifugus]", "diamond", "891", "94", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Chiroptera", "Vespertilionidae", "Myotis", "Myotis lucifugus"], [31576002, "PRJNA1073712_P_NODE_11116_length_251_cov_1.269663_g11033_i0", "PRJNA1073712", "11116", "251", "1.269663", "3.18685413", "Chordata", "7711", "Chordata", "Chordata", "90.1", "3.09e-19", "", "NR", "XP_030309550.1", "9244", "g11033", "i0", "63", "8.17529880478088", "81", "30", "96.8", "0", "6", "248", "259", "339", "XP_030309550.1 LOW QUALITY PROTEIN: ventral anterior homeobox 1 [Calypte anna]", "diamond", "2052", "90.5", "0.995580110497237", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Apodiformes", "Trochilidae", "Calypte", "Calypte anna"], [31584581, "PRJNA1073712_P_NODE_5656_length_318_cov_2.244898_g5573_i0", "PRJNA1073712", "5656", "318", "2.244898", "7.13877564", "Chinchilla lanigera", "34839", "Chordata", "Chordata", "67.8", "1.32e-10", "", "NR", "XP_005414808.1", "34839", "g5573", "i0", "60.4", "3.5", "53", "21", "50", "0", "221", "63", "26", "78", "XP_005414808.1 PREDICTED: solute carrier family 22 member 8 isoform X2 [Chinchilla lanigera]", "diamond", "1113", "67.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Chinchillidae", "Chinchilla", "Chinchilla lanigera"], [31702412, "PRJNA1073712_P_NODE_7337_length_290_cov_1.175115_g7254_i0", "PRJNA1073712", "7337", "290", "1.175115", "3.4078335", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "118", "1.22e-31", "", "NR", "AAN73350.1", "7740", "g7254", "i0", "64.3", "9.02068965517241", "84", "30", "86.9", "0", "252", "1", "1", "84", "AAN73350.1 ribosomal protein L17, partial [Branchiostoma lanceolatum]", "diamond", "2616", "118", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Leptocardii", "Amphioxiformes", "Branchiostomatidae", "Branchiostoma", "Branchiostoma lanceolatum"], [32153875, "PRJNA1073712_P_NODE_2058_length_448_cov_1.224000_g1975_i0", "PRJNA1073712", "2058", "448", "1.224", "5.48352", "Tupaia chinensis", "246437", "Chordata", "Chordata", "195", "9.32e-58", "", "NR", "XP_027623112.1", "246437", "g1975", "i0", "70.2", "1.91517857142857", "141", "42", "94.4", "0", "433", "11", "179", "319", "XP_027623112.1 LOW QUALITY PROTEIN: homeobox protein Hox-B3 [Tupaia chinensis]", "diamond", "858", "195", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Scandentia", "Tupaiidae", "Tupaia", "Tupaia chinensis"], [32682458, "PRJNA1073712_P_NODE_5660_length_318_cov_2.110204_g5577_i0", "PRJNA1073712", "5660", "318", "2.110204", "6.71044872", "Chordata", "7711", "Chordata", "Chordata", "163", "3.259999999999999e-47", "", "NR", "KAJ1119051.1", "8319", "g5577", "i0", "69.8", "41", "106", "32", "100", "0", "318", "1", "66", "171", "KAJ1119051.1 hypothetical protein NDU88_007237 [Pleurodeles waltl]", "diamond", "13038", "163", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Amphibia", "Caudata", "Salamandridae", "Pleurodeles", "Pleurodeles waltl"], [32848498, "PRJNA1073712_P_NODE_6100_length_310_cov_1.637131_g6017_i0", "PRJNA1073712", "6100", "310", "1.637131", "5.0751061", "Odocoileus virginianus", "9874", "Chordata", "Chordata", "58.2", "2.64e-7", "", "NR", "XP_070330315.1", "9874", "g6017", "i0", "45.5", "2.98064516129032", "77", "38", "70.6", "1", "230", "12", "145", "221", "XP_070330315.1 uncharacterized protein [Odocoileus virginianus]", "diamond", "924", "58.2", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Cervidae", "Odocoileus", "Odocoileus virginianus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 90, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1073712", "p1": "Chordata"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "PRJNA1073712", "label": "PRJNA1073712", "count": 90, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 58, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 32, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 90, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Opisthokonta", "label": "Opisthokonta", "count": 90, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata&tax_clade=Opisthokonta", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Metazoa", "label": "Metazoa", "count": 90, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata&tax_kingdom=Metazoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Chordata", "label": "Chordata", "count": 90, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1073712", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 205.13222100271378}