{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1028258\", tax_clade = \"Sar\" and tax_phylum = \"Foraminifera\"", "rows": [[5268032, "PRJNA1028258_P_NODE_61905_length_324_cov_2.494118_g61342_i0", "PRJNA1028258", "61905", "324", "2.494118", "8.08094232", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "199", "4.26e-63", "", "NR", "ETO03070.1", "46433", "g61342", "i0", "89.7", "1.98148148148148", "107", "11", "99.1", "0", "324", "4", "46", "152", "ETO03070.1 hypothetical protein RFI_34341 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "642", "199", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [5268616, "PRJNA1028258_P_NODE_91085_length_270_cov_1.412935_g90522_i0", "PRJNA1028258", "91085", "270", "1.412935", "3.8149245", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "119", "8.489999999999998e-32", "", "NR", "ETO01004.1", "46433", "g90522", "i0", "62.2", "1", "90", "30", "96.7", "2", "269", "9", "86", "174", "ETO01004.1 Protein kinase domain containing protein [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "270", "119", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [18015061, "PRJNA1028258_P_NODE_117595_length_246_cov_1.497175_g117032_i0", "PRJNA1028258", "117595", "246", "1.497175", "3.6830505", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "53.5", "5.82e-6", "", "NR", "ETO08753.1", "46433", "g117032", "i0", "31.9", "0.878048780487805", "72", "49", "87.8", "0", "10", "225", "24", "95", "ETO08753.1 hypothetical protein RFI_28635 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "216", "53.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [18017593, "PRJNA1028258_P_NODE_87515_length_275_cov_4.966019_g86952_i0", "PRJNA1028258", "87515", "275", "4.966019", "13.65655225", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "169", "3.1e-51", "", "NR", "ETO03070.1", "46433", "g86952", "i0", "87.9", "1.98545454545455", "91", "11", "99.3", "0", "273", "1", "62", "152", "ETO03070.1 hypothetical protein RFI_34341 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "546", "169", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [20132052, "PRJNA1028258_P_NODE_47296_length_368_cov_2.244147_g46733_i0", "PRJNA1028258", "47296", "368", "2.244147", "8.25846096", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "124", "3.719999999999999e-31", "", "NR", "ETO09453.1", "46433", "g46733", "i0", "67", "1.52445652173913", "94", "30", "76.6", "1", "1", "282", "230", "322", "ETO09453.1 hypothetical protein RFI_27925 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "561", "124", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [20566482, "PRJNA1028258_P_NODE_65637_length_316_cov_1.149798_g65074_i0", "PRJNA1028258", "65637", "316", "1.149798", "3.63336168", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "186", "7.95e-58", "", "NR", "ETO03070.1", "46433", "g65074", "i0", "83.8", "1.99367088607595", "105", "17", "99.7", "0", "1", "315", "75", "179", "ETO03070.1 hypothetical protein RFI_34341 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "630", "186", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [24389982, "PRJNA1028258_P_NODE_159380_length_229_cov_0.887500_g158817_i0", "PRJNA1028258", "159380", "229", "0.8875", "2.032375", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "74.7", "1.55e-13", "", "NR", "ETO25313.1", "46433", "g158817", "i0", "51.3", "0.995633187772926", "76", "32", "99.6", "2", "1", "228", "284", "354", "ETO25313.1 hypothetical protein RFI_11821 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "228", "74.7", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [27603994, "PRJNA1028258_P_NODE_172884_length_226_cov_0.904459_g172321_i0", "PRJNA1028258", "172884", "226", "0.904459", "2.04407734", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "52.4", "9.8199999999999992e-06", "", "NR", "ETO14278.1", "46433", "g172321", "i0", "47.2", "0.70353982300885", "53", "25", "66.4", "2", "3", "152", "207", "259", "ETO14278.1 actin [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "159", "52.4", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [27667065, "PRJNA1028258_P_NODE_122504_length_242_cov_1.549133_g121941_i0", "PRJNA1028258", "122504", "242", "1.549133", "3.74890186", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "122", "2.91e-33", "", "NR", "ETO01528.1", "46433", "g121941", "i0", "71.3", "1.98347107438017", "80", "23", "99.2", "0", "3", "242", "42", "121", "ETO01528.1 ABC transporter family protein, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "480", "122", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [27824914, "PRJNA1028258_P_NODE_145224_length_232_cov_0.871166_g144661_i0", "PRJNA1028258", "145224", "232", "0.871166", "2.02110512", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "132", "6.05e-34", "", "NR", "ETO28442.1", "46433", "g144661", "i0", "81.8", "0.995689655172414", "77", "14", "99.6", "0", "232", "2", "590", "666", "ETO28442.1 hypothetical protein RFI_08694, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "231", "132", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [27887790, "PRJNA1028258_P_NODE_104225_length_257_cov_1.510638_g103662_i0", "PRJNA1028258", "104225", "257", "1.510638", "3.88233966", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "80.1", "3.46e-16", "", "NR", "ETO15830.1", "46433", "g103662", "i0", "52.4", "1.96108949416342", "84", "32", "98.1", "2", "2", "253", "125", "200", "ETO15830.1 ubiquitin domain-containing protein [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "504", "80.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [28361456, "PRJNA1028258_P_NODE_78886_length_290_cov_1.819005_g78323_i0", "PRJNA1028258", "78886", "290", "1.819005", "5.2751145", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "46.6", "0.00286", "", "NR", "ETO14349.1", "46433", "g78323", "i0", "65.6", "0.331034482758621", "32", "11", "33.1", "0", "194", "289", "46", "77", "ETO14349.1 GTP-binding protein 1 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "96", "46.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [28771955, "PRJNA1028258_P_NODE_40407_length_398_cov_1.294833_g39844_i0", "PRJNA1028258", "40407", "398", "1.294833", "5.15343534", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "147", "7.19e-42", "", "NR", "ETO03070.1", "46433", "g39844", "i0", "62.5", "2.51758793969849", "112", "42", "84.4", "0", "2", "337", "75", "186", "ETO03070.1 hypothetical protein RFI_34341 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "1002", "147", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [28803315, "PRJNA1028258_P_NODE_159328_length_229_cov_0.887500_g158765_i0", "PRJNA1028258", "159328", "229", "0.8875", "2.032375", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "47", "9.96e-4", "", "NR", "ETO22018.1", "46433", "g158765", "i0", "34.7", "0.982532751091703", "75", "48", "96.9", "1", "1", "222", "109", "183", "ETO22018.1 ubiquitin specific protease 47 isoform 1 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "225", "47", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [29877241, "PRJNA1028258_P_NODE_173551_length_226_cov_0.904459_g172988_i0", "PRJNA1028258", "173551", "226", "0.904459", "2.04407734", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "67", "8.17e-11", "", "NR", "ETO14536.1", "46433", "g172988", "i0", "41.9", "0.982300884955752", "74", "43", "98.2", "0", "3", "224", "208", "281", "ETO14536.1 hypothetical protein RFI_22832, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "222", "67", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [30446015, "PRJNA1028258_P_NODE_94593_length_266_cov_1.578680_g94030_i0", "PRJNA1028258", "94593", "266", "1.57868", "4.1992888", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "134", "2.57e-34", "", "NR", "ETO10243.1", "46433", "g94030", "i0", "76.1", "1.98496240601504", "88", "21", "99.2", "0", "1", "264", "134", "221", "ETO10243.1 hypothetical protein RFI_27134, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "528", "134", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [30509002, "PRJNA1028258_P_NODE_174873_length_225_cov_1.153846_g174310_i0", "PRJNA1028258", "174873", "225", "1.153846", "2.5961535", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "80.1", "4.08e-16", "", "NR", "ETO23606.1", "46433", "g174310", "i0", "56.5", "0.92", "69", "30", "92", "0", "207", "1", "102", "170", "ETO23606.1 hypothetical protein RFI_13572 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "207", "80.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [30627323, "PRJNA1028258_P_NODE_158353_length_229_cov_0.887500_g157790_i0", "PRJNA1028258", "158353", "229", "0.8875", "2.032375", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "92.8", "1.09e-21", "", "NR", "ETO33553.1", "46433", "g157790", "i0", "58.4", "8.29257641921397", "77", "28", "95.6", "1", "221", "3", "85", "161", "ETO33553.1 2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "1899", "92.8", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [30919894, "PRJNA1028258_P_NODE_118734_length_245_cov_1.613636_g118171_i0", "PRJNA1028258", "118734", "245", "1.613636", "3.9534082", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "47.8", "6.4899999999999e-4", "", "NR", "ETO28959.1", "46433", "g118171", "i0", "32.8", "0.820408163265306", "67", "20", "82", "2", "243", "43", "503", "544", "ETO28959.1 hypothetical protein RFI_08166 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "201", "47.8", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [31386083, "PRJNA1028258_P_NODE_124116_length_241_cov_1.238372_g123553_i0", "PRJNA1028258", "124116", "241", "1.238372", "2.98447652", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "57", "1.71e-7", "", "NR", "ETO18606.1", "46433", "g123553", "i0", "35.6", "3.89626556016598", "73", "47", "90.9", "0", "20", "238", "80", "152", "ETO18606.1 platelet glycoprotein 4 [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "939", "57", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [31702233, "PRJNA1028258_P_NODE_150657_length_231_cov_0.876543_g150094_i0", "PRJNA1028258", "150657", "231", "0.876543", "2.02481433", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "71.2", "2.45e-12", "", "NR", "ETO30045.1", "46433", "g150094", "i0", "47.4", "6.98701298701299", "76", "38", "96.1", "2", "227", "6", "252", "327", "ETO30045.1 deoxyribonuclease-2-alpha [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "1614", "71.6", "0.994413407821229", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [31773326, "PRJNA1028258_P_NODE_159297_length_229_cov_0.887500_g158734_i0", "PRJNA1028258", "159297", "229", "0.8875", "2.032375", "Reticulomyxa filosa", "46433", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "57", "3e-7", "", "NR", "ETO13186.1", "46433", "g158734", "i0", "38.7", "1.96506550218341", "75", "45", "96.9", "1", "228", "7", "944", "1018", "ETO13186.1 component of scar regulatory complex, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "450", "57", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"], [32303689, "PRJNA1028258_P_NODE_164639_length_228_cov_0.893082_g164076_i0", "PRJNA1028258", "164639", "228", "0.893082", "2.03622696", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "76.3", "8.12e-15", "", "NR", "ETO18786.1", "46433", "g164076", "i0", "42.1", "2", "76", "44", "100", "0", "228", "1", "42", "117", "ETO18786.1 hypothetical protein RFI_18461, partial [Reticulomyxa filosa]", "diamond", "456", "76.3", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Foraminifera", null, null, "Reticulomyxidae", "Reticulomyxa", "Reticulomyxa filosa"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 23, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_clade\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1028258", "p1": "Sar", "p2": "Foraminifera"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "PRJNA1028258", "label": "PRJNA1028258", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "Sar", "label": "Sar", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_phylum=Foraminifera", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar&tax_phylum=Foraminifera", "results": [{"value": "Foraminifera", "label": "Foraminifera", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1028258&tax_clade=Sar", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 309.5557800043025}