{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJNA1000943\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[999280, "PRJNA1000943_P_NODE_9001_length_277_cov_1.911765_g8863_i0", "PRJNA1000943", "9001", "277", "1.911765", "5.29558905", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "178", "4.029999999999999e-40", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g8863", "i0", "78.767", "20.2093862815884", "292", "43", "100", "10", "1", "277", "1637", "1350", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "5598", "178", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [2695297, "PRJNA1000943_P_NODE_12963_length_248_cov_0.891429_g12825_i0", "PRJNA1000943", "12963", "248", "0.891429", "2.21074392", "Pseudobacteriovorax", "1769746", "Bacteria", "Bacteria", "121", "7.1e-30", "", "NR", "NRA68712.1", "2020859", "g12825", "i0", "73.8", "6.7258064516129", "80", "21", "96.8", "0", "247", "8", "148", "227", "NRA68712.1 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolyzing) large subunit [Pseudobacteriovorax sp.]", "diamond", "1668", "122", "0.991803278688525", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Pseudobacteriovoracaceae", "Pseudobacteriovorax", "Pseudobacteriovorax sp."], [6102402, "PRJNA1000943_P_NODE_5565_length_340_cov_1.632959_g5427_i0", "PRJNA1000943", "5565", "340", "1.632959", "5.5520606", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "316", "1.0299999999999999e-81", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g5427", "i0", "84.164", "306.002941176471", "341", "39", "98", "12", "1", "333", "783093", "783426", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "104041", "316", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [7376733, "PRJNA1000943_P_NODE_4066_length_389_cov_1.547468_g3929_i0", "PRJNA1000943", "4066", "389", "1.547468", "6.01965052", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "503", "8.54e-138", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g3929", "i0", "89.899", "194.52442159383", "396", "33", "100", "4", "1", "389", "784587", "784192", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "75670", "508", "0.990157480314961", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [11623737, "PRJNA1000943_P_NODE_350_length_1137_cov_5.222744_g288_i0", "PRJNA1000943", "350", "1137", "5.222744", "59.38259928", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154", "3386277", "Bacteria", "Bacteria", "1956", "0", "", "NTclustered", "gi|2872995934|gb|CP176530.1|", "3386277", "g288", "i0", "97.715", "178.018469656992", "1138", "24", "100", "2", "1", "1137", "699588", "700724", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154 chromosome, complete genome", "blastn", "202407", "1956", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154"], [15027081, "PRJNA1000943_P_NODE_12572_length_249_cov_0.886364_g12434_i0", "PRJNA1000943", "12572", "249", "0.886364", "2.20704636", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "276", "1.2299999999999999e-69", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g12434", "i0", "86.853", "290.78313253012", "251", "28", "99", "5", "1", "248", "426", "178", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "72405", "276", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [18850918, "PRJNA1000943_P_NODE_10275_length_261_cov_1.851064_g10137_i0", "PRJNA1000943", "10275", "261", "1.851064", "4.83127704", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "392", "1.2299999999999999e-104", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g10137", "i0", "93.87", "397.563218390805", "261", "14", "99", "2", "1", "260", "1662088", "1661829", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "103764", "392", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [18850944, "PRJNA1000943_P_NODE_2275_length_506_cov_12.577367_g2138_i0", "PRJNA1000943", "2275", "506", "12.577367", "63.64147702", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "846", "0", "", "NTclustered", "gi|425858678|gb|CP002930.1|", "1069642", "g2138", "i0", "96.838", "127.025691699605", "506", "16", "100", "0", "1", "506", "842408", "842913", "Bdellovibrio bacteriovorus str. Tiberius, complete genome", "blastn", "64275", "852", "0.992957746478873", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [20125763, "PRJNA1000943_P_NODE_1256_length_673_cov_2.016667_g1125_i0", "PRJNA1000943", "1256", "673", "2.016667", "13.57216891", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "845", "0", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g1125", "i0", "89.365", "148.364041604755", "677", "64", "100", "8", "1", "673", "1661033", "1660361", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "99849", "845", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [20125811, "PRJNA1000943_P_NODE_956_length_760_cov_7.478894_g830_i0", "PRJNA1000943", "956", "760", "7.478894", "56.8395944", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "1315", "0", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g830", "i0", "97.898", "127.067105263158", "761", "15", "100", "1", "1", "760", "749548", "748788", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "96571", "1315", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [20546245, "PRJNA1000943_P_NODE_12317_length_250_cov_0.881356_g12179_i0", "PRJNA1000943", "12317", "250", "0.881356", "2.20339", "Bdellovibrio sp. 28-41-41", "1970323", "Bacteria", "Bacteria", "171", "1.64e-53", "", "NR", "OYZ13569.1", "1970323", "g12179", "i0", "98.8", "0.996", "83", "1", "99.6", "0", "1", "249", "2", "84", "OYZ13569.1 MAG: thioredoxin [Bdellovibrio sp. 28-41-41]", "diamond", "249", "171", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. 28-41-41"], [24371070, "PRJNA1000943_P_NODE_6620_length_316_cov_1.283951_g6482_i0", "PRJNA1000943", "6620", "316", "1.283951", "4.05728516", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "254", "7.560000000000001e-63", "", "NTclustered", "gi|2893356065|emb|OZ220488.1|", "2053517", "g6482", "i0", "87.111", "153.509493670886", "225", "27", "71", "2", "81", "304", "730038", "730261", "MAG: Bdellovibrionales bacterium isolate 0d1acec5-ee6a-42a0-9e8e-8bc2840f726d genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "48509", "254", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29213576, "PRJNA1000943_P_NODE_13869_length_246_cov_0.901734_g13731_i0", "PRJNA1000943", "13869", "246", "0.901734", "2.21826564", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "107", "4.63e-26", "", "NR", "WP_061834069.1", "959", "g13731", "i0", "67.1", "2.89024390243902", "79", "26", "96.3", "0", "10", "246", "1", "79", "WP_061834069.1 SDR family oxidoreductase [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "711", "107", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [30413790, "PRJNA1000943_P_NODE_11793_length_251_cov_0.876404_g11655_i0", "PRJNA1000943", "11793", "251", "0.876404", "2.19977404", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "70.9", "2.12e-12", "", "NR", "MCC6137820.1", "2026715", "g11655", "i0", "97", "0.394422310756972", "33", "1", "39.4", "0", "250", "152", "230", "262", "MCC6137820.1 DUF1338 domain-containing protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "99", "70.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [31038343, "PRJNA1000943_P_NODE_4095_length_388_cov_0.946032_g3958_i0", "PRJNA1000943", "4095", "388", "0.946032", "3.67060416", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "111", "1.99e-28", "", "NR", "MFA4994930.1", "2053517", "g3958", "i0", "49.6", "15.0927835051546", "113", "54", "85.1", "3", "337", "8", "5", "117", "MFA4994930.1 single-stranded DNA-binding protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "5856", "112", "0.991071428571429", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31298229, "PRJNA1000943_P_NODE_12975_length_248_cov_0.891429_g12837_i0", "PRJNA1000943", "12975", "248", "0.891429", "2.21074392", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "58.2", "1.46e-7", "", "NR", "MBT7608812.1", "2081706", "g12837", "i0", "45.6", "1.28225806451613", "57", "31", "69", "0", "197", "27", "676", "732", "MBT7608812.1 penicillin acylase family protein [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "318", "58.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [32847060, "PRJNA1000943_P_NODE_6960_length_309_cov_2.644068_g6822_i0", "PRJNA1000943", "6960", "309", "2.644068", "8.17017012", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "51.6", "4.04e-5", "", "NR", "MCO4753379.1", "2081706", "g6822", "i0", "34.4", "0.902912621359223", "93", "50", "83.5", "3", "5", "262", "72", "160", "MCO4753379.1 glutathione S-transferase [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "279", "51.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 17, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJNA1000943", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA1000943", "label": "PRJNA1000943", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 10, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1000943", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 266.3299170017126}