{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJEB83101\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[12895495, "PRJEB83101_P_NODE_42371_length_290_cov_1.331797_g42066_i0", "PRJEB83101", "42371", "290", "1.331797", "3.8622113", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "162", "8.74e-44", "", "NR", "MFN8846768.1", "2053517", "g42066", "i0", "83.3", "0.993103448275862", "96", "16", "99.3", "0", "290", "3", "834", "929", "MFN8846768.1 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "288", "162", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [23095044, "PRJEB83101_P_NODE_82319_length_244_cov_0.912281_g82014_i0", "PRJEB83101", "82319", "244", "0.912281", "2.22596564", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "401", "1.8999999999999998e-107", "", "NTclustered", "gi|469926873|gb|CP003538.1|", "349215", "g82014", "i0", "96.311", "13.8975409836066", "244", "9", "100", "0", "1", "244", "375146", "375389", "Micavibrio aeruginosavorus EPB, complete genome", "blastn", "3391", "401", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [26710097, "PRJEB83101_P_NODE_89541_length_231_cov_2.278481_g89236_i0", "PRJEB83101", "89541", "231", "2.278481", "5.26329111", "Micavibrio", "213485", "Bacteria", "Bacteria", "105", "2.45e-26", "", "NR", "WP_015468097.1", "349221", "g89236", "i0", "82.5", "2.22077922077922", "57", "10", "74", "0", "171", "1", "1", "57", "WP_015468097.1 helix-turn-helix domain-containing protein [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "513", "105", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [26868952, "PRJEB83101_P_NODE_59421_length_261_cov_1.393617_g59116_i0", "PRJEB83101", "59421", "261", "1.393617", "3.63734037", "Bdellovibrionota", "3018035", "Bacteria", "Bacteria", "142", "6.1399999999999995e-37", "", "NR", "MBC7467272.1", "28201", "g59116", "i0", "83.9", "16", "87", "14", "100", "0", "261", "1", "918", "1004", "MBC7467272.1 efflux RND transporter permease subunit [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "4176", "142", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [27729680, "PRJEB83101_P_NODE_45104_length_285_cov_1.127358_g44799_i0", "PRJEB83101", "45104", "285", "1.127358", "3.2129703", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "63.5", "2.97e-9", "", "NR", "PZP55814.1", "349221", "g44799", "i0", "47.3", "1.17894736842105", "112", "41", "98.9", "4", "282", "1", "122", "233", "PZP55814.1 MAG: hybrid sensor histidine kinase/response regulator, partial [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "336", "63.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [28100715, "PRJEB83101_P_NODE_75605_length_247_cov_1.793103_g75300_i0", "PRJEB83101", "75605", "247", "1.793103", "4.42896441", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "145", "9.27e-40", "", "NR", "HVK61701.1", "2053517", "g75300", "i0", "90.2", "1.9919028340081", "82", "8", "99.6", "0", "1", "246", "303", "384", "HVK61701.1 acetyl-CoA C-acyltransferase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "492", "145", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29276311, "PRJEB83101_P_NODE_60749_length_259_cov_1.317204_g60444_i0", "PRJEB83101", "60749", "259", "1.317204", "3.41155836", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "53.1", "3.95e-7", "", "NR", "MBT7670529.1", "2053517", "g60444", "i0", "60.5", "1.47104247104247", "43", "15", "47.5", "1", "137", "259", "5", "47", "MBT7670529.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "381", "53.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30090046, "PRJEB83101_P_NODE_84572_length_243_cov_0.917647_g84267_i0", "PRJEB83101", "84572", "243", "0.917647", "2.22988221", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "150", "1.1199999999999999e-40", "", "NR", "MEN0057597.1", "28201", "g84267", "i0", "83.8", "1.97530864197531", "80", "13", "98.8", "0", "3", "242", "119", "198", "MEN0057597.1 DEAD/DEAH box helicase [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "480", "151", "0.993377483443709", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [30097406, "PRJEB83101_P_NODE_62772_length_256_cov_1.327869_g62467_i0", "PRJEB83101", "62772", "256", "1.327869", "3.39934464", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "107", "3.3100000000000004e-26", "", "NR", "PZP56867.1", "349221", "g62467", "i0", "65.4", "0.94921875", "81", "28", "94.9", "0", "251", "9", "5", "85", "PZP56867.1 MAG: hypothetical protein DI586_02315 [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "243", "107", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [30406479, "PRJEB83101_P_NODE_50713_length_275_cov_1.262376_g50408_i0", "PRJEB83101", "50713", "275", "1.262376", "3.471534", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "88.2", "4.31e-18", "", "NR", "MCM2281808.1", "2026715", "g50408", "i0", "51.3", "4.37454545454545", "78", "38", "85.1", "0", "275", "42", "279", "356", "MCM2281808.1 O-antigen ligase family protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "1203", "88.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [31202907, "PRJEB83101_P_NODE_64155_length_254_cov_1.342541_g63850_i0", "PRJEB83101", "64155", "254", "1.342541", "3.41005414", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "57.8", "2.02e-7", "", "NR", "MBS1969502.1", "2053517", "g63850", "i0", "42.2", "0.980314960629921", "83", "40", "94.5", "5", "253", "14", "220", "297", "MBS1969502.1 porin [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "249", "57.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31519808, "PRJEB83101_P_NODE_52916_length_271_cov_1.575758_g52611_i0", "PRJEB83101", "52916", "271", "1.575758", "4.27030418", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "173", "5.5e-51", "", "NR", "MBX3023203.1", "2053517", "g52611", "i0", "88.8", "0.985239852398524", "89", "10", "98.5", "0", "268", "2", "70", "158", "MBX3023203.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "267", "173", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31962465, "PRJEB83101_P_NODE_64538_length_253_cov_1.788889_g64233_i0", "PRJEB83101", "64538", "253", "1.788889", "4.52588917", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "135", "3.1899999999999997e-37", "", "NR", "HEY8280076.1", "3034175", "g64233", "i0", "79.8", "0.99604743083004", "84", "17", "99.6", "0", "252", "1", "107", "190", "HEY8280076.1 carboxylating nicotinate-nucleotide diphosphorylase [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "252", "135", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [32057394, "PRJEB83101_P_NODE_60758_length_259_cov_1.306452_g60453_i0", "PRJEB83101", "60758", "259", "1.306452", "3.38371068", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "162", "3.92e-44", "", "NR", "MES2767986.1", "3034175", "g60453", "i0", "91.8", "0.984555984555985", "85", "7", "98.5", "0", "3", "257", "329", "413", "MES2767986.1 3'-5' exonuclease [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "255", "162", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [32279129, "PRJEB83101_P_NODE_79579_length_245_cov_1.523256_g79274_i0", "PRJEB83101", "79579", "245", "1.523256", "3.7319772", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "136", "5.1e-37", "", "NR", "HMN68335.1", "2053517", "g79274", "i0", "86.4", "0.991836734693878", "81", "11", "99.2", "0", "2", "244", "96", "176", "HMN68335.1 peptidylprolyl isomerase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "243", "136", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32847021, "PRJEB83101_P_NODE_77780_length_246_cov_1.427746_g77475_i0", "PRJEB83101", "77780", "246", "1.427746", "3.51225516", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "159", "1.5e-45", "", "NR", "MCK6594806.1", "2081706", "g77475", "i0", "96.3", "1", "82", "3", "100", "0", "246", "1", "64", "145", "MCK6594806.1 alanine racemase [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "246", "159", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 16, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJEB83101", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJEB83101", "label": "PRJEB83101", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 1, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB83101", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 161.06694500194862}