{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJEB75230\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[136058, "PRJEB75230_P_NODE_132821_length_249_cov_0.875000_g132639_i0", "PRJEB75230", "132821", "249", "0.875", "2.17875", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "97.1", "8.049999999999999e-23", "", "NR", "MCB9072629.1", "2026715", "g132639", "i0", "64.1", "3.10843373493976", "64", "23", "77.1", "0", "247", "56", "148", "211", "MCB9072629.1 succinate dehydrogenase cytochrome b subunit [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "774", "97.4", "0.996919917864476", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [4823981, "PRJEB75230_P_NODE_173984_length_242_cov_0.911243_g173802_i0", "PRJEB75230", "173984", "242", "0.911243", "2.20520806", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "115", "1.24e-30", "", "NR", "MES3037699.1", "3034175", "g173802", "i0", "65.4", "1.93388429752066", "78", "27", "96.7", "0", "8", "241", "56", "133", "MES3037699.1 potassium channel family protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "468", "115", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [27034167, "PRJEB75230_P_NODE_125362_length_250_cov_0.870056_g125180_i0", "PRJEB75230", "125362", "250", "0.870056", "2.17514", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "98.2", "2.25e-22", "", "NR", "MCB0379076.1", "2053517", "g125180", "i0", "58", "0.972", "81", "33", "97.2", "1", "7", "249", "87", "166", "MCB0379076.1 formimidoylglutamase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "243", "98.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27761099, "PRJEB75230_P_NODE_17644_length_397_cov_1.246914_g17462_i0", "PRJEB75230", "17644", "397", "1.246914", "4.95024858", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "67", "7.12e-10", "", "NR", "MBS1969835.1", "2053517", "g17462", "i0", "31.4", "1.05793450881612", "140", "80", "99.7", "3", "396", "1", "741", "872", "MBS1969835.1 endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "420", "67", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27981859, "PRJEB75230_P_NODE_150525_length_246_cov_0.890173_g150343_i0", "PRJEB75230", "150525", "246", "0.890173", "2.18982558", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "119", "2.3e-31", "", "NR", "MBA2405764.1", "2053517", "g150343", "i0", "71.3", "0.975609756097561", "80", "23", "97.6", "0", "243", "4", "118", "197", "MBA2405764.1 sulfite exporter TauE/SafE family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "240", "119", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28044882, "PRJEB75230_P_NODE_133045_length_249_cov_0.875000_g132863_i0", "PRJEB75230", "133045", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "45.4", "0.00358", "", "NR", "HEY8279653.1", "3034175", "g132863", "i0", "41.8", "0.662650602409639", "55", "30", "66.3", "2", "241", "77", "8", "60", "HEY8279653.1 hypothetical protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "165", "45.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [28076413, "PRJEB75230_P_NODE_142605_length_247_cov_0.885057_g142423_i0", "PRJEB75230", "142605", "247", "0.885057", "2.18609079", "Bacteriovoracaceae bacterium", "2081706", "Bacteria", "Bacteria", "125", "2.27e-32", "", "NR", "MBY0518024.1", "2081706", "g142423", "i0", "72", "1.9919028340081", "82", "23", "99.6", "0", "247", "2", "92", "173", "MBY0518024.1 flagellar biosynthesis protein FlhB [Bacteriovoracaceae bacterium]", "diamond", "492", "125", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", null, "Bacteriovoracaceae bacterium"], [28139948, "PRJEB75230_P_NODE_93925_length_268_cov_1.482051_g93743_i0", "PRJEB75230", "93925", "268", "1.482051", "3.97189668", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "52", "2.67e-5", "", "NR", "MBX2988612.1", "2026715", "g93743", "i0", "36.7", "1.00746268656716", "90", "49", "94", "2", "3", "254", "297", "384", "MBX2988612.1 glycosyltransferase family 9 protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "270", "52", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28297472, "PRJEB75230_P_NODE_65786_length_293_cov_1.159091_g65604_i0", "PRJEB75230", "65786", "293", "1.159091", "3.39613663", "Oligoflexaceae bacterium", "2957744", "Bacteria", "Bacteria", "44.7", "0.0112", "", "NR", "MDA9951656.1", "2957744", "g65604", "i0", "51.3", "0.399317406143345", "39", "18", "39.9", "1", "230", "114", "192", "229", "MDA9951656.1 SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase [Oligoflexaceae bacterium]", "diamond", "117", "44.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", "Oligoflexaceae", null, "Oligoflexaceae bacterium"], [28929035, "PRJEB75230_P_NODE_183868_length_241_cov_0.916667_g183686_i0", "PRJEB75230", "183868", "241", "0.916667", "2.20916747", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "139", "3.3999999999999996e-36", "", "NR", "PZP57031.1", "349221", "g183686", "i0", "87.2", "0.970954356846473", "78", "10", "97.1", "0", "236", "3", "166", "243", "PZP57031.1 MAG: ribonuclease R [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "234", "139", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [29276194, "PRJEB75230_P_NODE_146969_length_246_cov_1.734104_g146787_i0", "PRJEB75230", "146969", "246", "1.734104", "4.26589584", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "44.7", "0.00842", "", "NR", "MDY0029759.1", "2026715", "g146787", "i0", "32.8", "0.817073170731707", "67", "45", "81.7", "0", "222", "22", "233", "299", "MDY0029759.1 double-strand break repair protein AddB [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "201", "44.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [29529030, "PRJEB75230_P_NODE_107150_length_258_cov_1.378378_g106968_i0", "PRJEB75230", "107150", "258", "1.378378", "3.5562152400000002", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "81.3", "1.29e-15", "", "NR", "MDX9730787.1", "2053517", "g106968", "i0", "56.7", "1.04651162790698", "90", "32", "96.5", "1", "258", "10", "834", "923", "MDX9730787.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "270", "81.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29654817, "PRJEB75230_P_NODE_166030_length_243_cov_1.429412_g165848_i0", "PRJEB75230", "166030", "243", "1.429412", "3.47347116", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "68.6", "2.6e-11", "", "NR", "MBY0314892.1", "2053517", "g165848", "i0", "43.8", "0.987654320987654", "80", "45", "98.8", "0", "240", "1", "148", "227", "MBY0314892.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "240", "68.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29869032, "PRJEB75230_P_NODE_3571_length_719_cov_2.003096_g3399_i0", "PRJEB75230", "3571", "719", "2.003096", "14.40226024", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "64.7", "7.3900000000000007e-08", "", "NR", "PIP93190.1", "1975529", "g3399", "i0", "35.4", "2.94993045897079", "127", "66", "50.5", "4", "143", "505", "864", "980", "PIP93190.1 MAG: hypothetical protein COW78_16385 [Bdellovibrio sp. CG22_combo_CG10-13_8_21_14_all_39_27]", "diamond", "2121", "65.1", "0.993855606758833", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. CG22_combo_CG10-13_8_21_14_all_39_27"], [29971024, "PRJEB75230_P_NODE_163091_length_244_cov_0.900585_g162909_i0", "PRJEB75230", "163091", "244", "0.900585", "2.1974274", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "61.6", "7.36e-9", "", "NR", "WP_061834842.1", "959", "g162909", "i0", "45.7", "0.995901639344262", "81", "42", "98.4", "2", "3", "242", "175", "254", "WP_061834842.1 hypothetical protein [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "243", "61.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [30445120, "PRJEB75230_P_NODE_170673_length_243_cov_0.905882_g170491_i0", "PRJEB75230", "170673", "243", "0.905882", "2.20129326", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "47", "0.00109", "", "NR", "MBY0313984.1", "2053517", "g170491", "i0", "33.8", "0.987654320987654", "80", "53", "98.8", "0", "242", "3", "154", "233", "MBY0313984.1 tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "240", "47", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30943352, "PRJEB75230_P_NODE_101914_length_262_cov_1.222222_g101732_i0", "PRJEB75230", "101914", "262", "1.222222", "3.20222164", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "53.1", "8.28e-6", "", "NR", "MBC7421275.1", "28201", "g101732", "i0", "47.2", "2.40458015267176", "53", "28", "60.7", "0", "165", "7", "137", "189", "MBC7421275.1 MOSC domain-containing protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "630", "53.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [31424594, "PRJEB75230_P_NODE_133456_length_249_cov_0.875000_g133274_i0", "PRJEB75230", "133456", "249", "0.875", "2.17875", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "89", "2.02e-18", "", "NR", "MCB9073096.1", "2026715", "g133274", "i0", "56.1", "1.95180722891566", "82", "35", "97.6", "1", "2", "244", "334", "415", "MCB9073096.1 PAS domain-containing protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "486", "89", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [32500513, "PRJEB75230_P_NODE_89379_length_272_cov_1.160804_g89197_i0", "PRJEB75230", "89379", "272", "1.160804", "3.15738688", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "92", "2.47e-19", "", "NR", "MBX3041694.1", "2026715", "g89197", "i0", "47.2", "1.96323529411765", "89", "47", "98.2", "0", "270", "4", "566", "654", "MBX3041694.1 insulinase family protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "534", "92", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 19, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJEB75230", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJEB75230", "label": "PRJEB75230", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB75230", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 171.1077330110129}