{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJEB43370\", tax_clade = \"Amoebozoa\" and tax_phylum = \"Tubulinea\"", "rows": [[60184, "PRJEB43370_P_NODE_1741_length_332_cov_1.466431_g1698_i0", "PRJEB43370", "1741", "332", "1.466431", "4.86855092", "Nolandella sp. LAK-2", "1908693", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "168", "1.12e-49", "", "NR", "AFX73095.1", "1260117", "g1698", "i0", "68.8", "3.94879518072289", "109", "34", "98.5", "0", "327", "1", "48", "156", "AFX73095.1 elongation factor 2 alpha, partial [Nolandella sp. LAK-2012]", "diamond", "1311", "168", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Nolandella", "Nolandella sp. LAK-2012"], [1334504, "PRJEB43370_P_NODE_1822_length_323_cov_1.937956_g1779_i0", "PRJEB43370", "1822", "323", "1.937956", "6.25959788", "Copromyxa laresi", "1789826", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "545", "1.14e-150", "", "NTclustered", "gi|1042160945|dbj|LC102279.1|", "1789826", "g1779", "i0", "97.492", "6.43034055727554", "319", "8", "99", "0", "5", "323", "509", "191", "Copromyxa sp. MK-2016 gene for elongation factor 2 alpha, partial cds, strain: ZEB1", "blastn", "2077", "545", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa laresi"], [5162544, "PRJEB43370_P_NODE_65_length_1410_cov_8.733284_g51_i0", "PRJEB43370", "65", "1410", "8.733284", "123.1393044", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "1563", "0", "", "NTclustered", "gi|508737347|dbj|AB766053.1|", "931554", "g51", "i0", "87.222", "27.4234042553191", "1393", "152", "97", "16", "15", "1385", "1", "1389", "Copromyxa protea EFL mRNA for elongation factor-like protein, complete cds, strain: ATCC PRA-324", "blastn", "38667", "1563", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [7712628, "PRJEB43370_P_NODE_7847_length_168_cov_1.310924_g7804_i0", "PRJEB43370", "7847", "168", "1.310924", "2.20235232", "Copromyxa sp. PKD 2011", "1215977", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "311", "2.11e-80", "", "NTclustered", "gi|399764167|gb|JQ271678.1|", "1215977", "g7804", "i0", "100", "76.3333333333333", "168", "0", "100", "0", "1", "168", "1721", "1554", "Copromyxa sp. PKD 2011 strain ZEB1 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "12824", "311", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa sp. PKD 2011"], [8987283, "PRJEB43370_P_NODE_10168_length_163_cov_1.350877_g10125_i0", "PRJEB43370", "10168", "163", "1.350877", "2.20192951", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "94.4", "8.42e-21", "", "NR", "AAD33718.1", "5775", "g10125", "i0", "87.5", "1.03067484662577", "56", "5", "99.4", "1", "162", "1", "180", "235", "AAD33718.1 myosin heavy chain [Amoeba proteus]", "diamond", "168", "94.4", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [11538444, "PRJEB43370_P_NODE_790_length_491_cov_2.115385_g747_i0", "PRJEB43370", "790", "491", "2.115385", "10.38654035", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "294", "1.1199999999999999e-96", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g747", "i0", "85.1", "0.983706720977597", "161", "24", "98.4", "0", "7", "489", "1", "161", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "483", "294", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [15362386, "PRJEB43370_P_NODE_2053_length_303_cov_2.181102_g2010_i0", "PRJEB43370", "2053", "303", "2.181102", "6.6087390600000004", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "164", "9.66e-47", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g2010", "i0", "81.3", "0.95049504950495", "96", "18", "95", "0", "303", "16", "295", "390", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "288", "164", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [15362398, "PRJEB43370_P_NODE_333_length_728_cov_3.811487_g294_i0", "PRJEB43370", "333", "728", "3.811487", "27.74762536", "Copromyxa laresi", "1789826", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "1158", "0", "", "NTclustered", "gi|1042160935|dbj|LC102274.1|", "1789826", "g294", "i0", "98.333", "96.6153846153846", "660", "11", "91", "0", "1", "660", "136", "795", "Copromyxa sp. MK-2016 gene for actin, partial cds, strain: ZEB1_cl3", "blastn", "70336", "1158", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa laresi"], [16636973, "PRJEB43370_P_NODE_1534_length_353_cov_2.907895_g1491_i0", "PRJEB43370", "1534", "353", "2.907895", "10.26486935", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "208", "1.14e-63", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g1491", "i0", "87.2", "0.994334277620397", "117", "15", "99.4", "0", "351", "1", "172", "288", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "351", "208", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [18841610, "PRJEB43370_P_NODE_3935_length_223_cov_1.488506_g3892_i0", "PRJEB43370", "3935", "223", "1.488506", "3.31936838", "Chaos carolinense", "160823", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "125", "1.01e-34", "", "NR", "AFX73058.1", "160823", "g3892", "i0", "82.4", "0.995515695067265", "74", "13", "99.6", "0", "223", "2", "49", "122", "AFX73058.1 14-3-3 protein, partial [Chaos carolinense]", "diamond", "222", "125", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Chaos", "Chaos carolinense"], [21736941, "PRJEB43370_P_NODE_9978_length_164_cov_0.904348_g9935_i0", "PRJEB43370", "9978", "164", "0.904348", "1.48313072", "Nolandella sp. LAK-2012", "1260117", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "117", "4.79e-22", "", "NTclustered", "gi|421976359|gb|JQ519496.1|", "1260117", "g9935", "i0", "85.586", "6.6280487804878", "111", "16", "68", "0", "6", "116", "626", "516", "Nolandella sp. LAK-2012 elongation factor 2 alpha gene, partial cds", "blastn", "1087", "117", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Nolandella", "Nolandella sp. LAK-2012"], [24285970, "PRJEB43370_P_NODE_1020_length_431_cov_2.400524_g977_i0", "PRJEB43370", "1020", "431", "2.400524", "10.34625844", "Copromyxa sp. PKD 2011", "1215977", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "797", "0", "", "NTclustered", "gi|399764167|gb|JQ271678.1|", "1215977", "g977", "i0", "100", "69.0069605568445", "431", "0", "100", "0", "1", "431", "574", "1004", "Copromyxa sp. PKD 2011 strain ZEB1 18S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "29742", "797", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa sp. PKD 2011"], [26843784, "PRJEB43370_P_NODE_6341_length_182_cov_1.563910_g6298_i0", "PRJEB43370", "6341", "182", "1.56391", "2.8463162", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "101", "4.039999999999999e-23", "", "NR", "AAD33718.1", "5775", "g6298", "i0", "84.5", "0.956043956043956", "58", "9", "95.6", "0", "2", "175", "694", "751", "AAD33718.1 myosin heavy chain [Amoeba proteus]", "diamond", "174", "101", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [27254617, "PRJEB43370_P_NODE_10703_length_162_cov_0.920354_g10660_i0", "PRJEB43370", "10703", "162", "0.920354", "1.49097348", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "97.1", "5.25e-22", "", "NR", "AAD37351.1", "5775", "g10660", "i0", "88.5", "0.962962962962963", "52", "6", "96.3", "0", "162", "7", "142", "193", "AAD37351.1 pepstatin-insensitive carboxyl proteinase 1, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "156", "97.1", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [28233374, "PRJEB43370_P_NODE_6506_length_180_cov_1.190840_g6463_i0", "PRJEB43370", "6506", "180", "1.19084", "2.143512", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "58.9", "3.07e-8", "", "NR", "AAY34140.1", "5778", "g6463", "i0", "51.7", "0.966666666666667", "58", "27", "96.7", "1", "174", "1", "70", "126", "AAY34140.1 Nop58p, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "174", "58.9", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [29149710, "PRJEB43370_P_NODE_9989_length_164_cov_0.904348_g9946_i0", "PRJEB43370", "9989", "164", "0.904348", "1.48313072", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "85.1", "1.49e-17", "", "NR", "AKN09691.1", "5775", "g9946", "i0", "64.8", "0.98780487804878", "54", "19", "98.8", "0", "162", "1", "811", "864", "AKN09691.1 Tom70 [Amoeba proteus]", "diamond", "162", "85.1", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [30886570, "PRJEB43370_P_NODE_7294_length_170_cov_1.173554_g7251_i0", "PRJEB43370", "7294", "170", "1.173554", "1.9950418", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "81.3", "3.08e-16", "", "NR", "AAD37351.1", "5775", "g7251", "i0", "73.6", "0.935294117647059", "53", "13", "93.5", "1", "11", "169", "86", "137", "AAD37351.1 pepstatin-insensitive carboxyl proteinase 1, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "159", "81.3", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [32656963, "PRJEB43370_P_NODE_3900_length_224_cov_1.485714_g3857_i0", "PRJEB43370", "3900", "224", "1.485714", "3.32799936", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "133", "1.35e-37", "", "NR", "AAW58116.1", "5775", "g3857", "i0", "83.6", "0.977678571428571", "73", "12", "97.8", "0", "224", "6", "59", "131", "AAW58116.1 peroxiredoxin, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "219", "133", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 18, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_clade\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJEB43370", "p1": "Amoebozoa", "p2": "Tubulinea"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "PRJEB43370", "label": "PRJEB43370", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 6, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Amoebozoa", "label": "Amoebozoa", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Tubulinea", "label": "Tubulinea", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB43370&tax_clade=Amoebozoa", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 207.74827399873175}