{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJEB3181\", tax_clade = \"Sar\" and tax_phylum = \"Bacillariophyta\"", "rows": [[56050, "PRJEB3181_P_NODE_7801_length_302_cov_3.450185_g7539_i0", "PRJEB3181", "7801", "302", "3.450185", "10.4195587", "Helicotheca tamesis", "374047", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "115", "3.5400000000000006e-21", "", "NTclustered", "gi|2248495790|ref|NC_063455.1|", "374047", "g7539", "i0", "77.103", "29.1192052980132", "214", "40", "69", "7", "95", "302", "5601", "5391", "Helicotheca tamesis isolate Qingdao in China mitochondrion, complete genome", "blastn", "8794", "115", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Mediophyceae", "Lithodesmiales", "Lithodesmiaceae", "Helicotheca", "Helicotheca tamesis"], [988867, "PRJEB3181_S_NODE_1881_length_377_cov_19183.558480_g1589_i0", "PRJEB3181", "1881", "377", "19183.55848", "72322.0154696", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "90.1", "3.03e-20", "", "NR", "KAG7373989.1", "303405", "g1589", "i0", "53.6", "7.31299734748011", "84", "38", "66.8", "1", "18", "269", "48", "130", "KAG7373989.1 50S ribosomal protein L14e [Nitzschia inconspicua]", "diamond", "2757", "90.9", "0.991199119911991", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Nitzschia", "Nitzschia inconspicua"], [1330216, "PRJEB3181_P_NODE_1142_length_569_cov_155.524164_g1001_i0", "PRJEB3181", "1142", "569", "155.524164", "884.93249316", "Nitzschia traheaformis", "1881117", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "99", "7.11e-16", "", "NTclustered", "gi|2073953246|gb|MW849269.1|", "1881117", "g1001", "i0", "79.87", "1.30755711775044", "154", "16", "27", "8", "60", "211", "46505", "46645", "Nitzschia traheaformis isolate Qingdao in China mitochondrion, complete genome", "blastn", "744", "99", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Nitzschia", "Nitzschia traheaformis"], [12809481, "PRJEB3181_P_NODE_21491_length_176_cov_2.289655_g21226_i0", "PRJEB3181", "21491", "176", "2.289655", "4.0297928", "Skeletonema menzelii", "216823", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "139", "1.11e-28", "", "NTclustered", "gi|2739942921|dbj|LC814781.1|", "216823", "g21226", "i0", "81.183", "37.4659090909091", "186", "24", "100", "10", "1", "176", "32424", "32240", "Skeletonema menzelii NIES-2842 mitochondrial DNA, complete genome", "blastn", "6594", "139", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Skeletonemataceae", "Skeletonema", "Skeletonema menzelii"], [15016708, "PRJEB3181_S_NODE_2412_length_348_cov_20623.562300_g2119_i0", "PRJEB3181", "2412", "348", "20623.5623", "71769.996804", "Phaeodactylum tricornutum", "2850", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "94.7", "1.83e-22", "", "NR", "AID23573.1", "2850", "g2119", "i0", "82.4", "0.879310344827586", "51", "9", "44", "0", "2", "154", "61", "111", "AID23573.1 ribosomal protein, partial [Phaeodactylum tricornutum]", "diamond", "306", "94.7", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [15358030, "PRJEB3181_P_NODE_113_length_1178_cov_65.511770_g83_i0", "PRJEB3181", "113", "1178", "65.51177", "771.7286506", "Guinardia delicatula", "1244696", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "222", "8.65e-53", "", "NTclustered", "gi|2074156200|gb|MW413905.1|", "216802", "g83", "i0", "78.01", "37.0288624787776", "382", "64", "31", "15", "36", "405", "24602", "24229", "Guinardia delicatula mitochondrion, complete genome", "blastn", "43620", "222", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Rhizosoleniales", "Rhizosoleniaceae", "Guinardia", "Guinardia delicatula"], [20456828, "PRJEB3181_S_NODE_1117_length_450_cov_143.332530_g839_i0", "PRJEB3181", "1117", "450", "143.33253", "644.996385", "Phaeodactylum tricornutum", "2850", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "112", "3.21e-29", "", "NR", "AID23594.1", "2850", "g839", "i0", "78.8", "0.44", "66", "14", "44", "0", "450", "253", "32", "97", "AID23594.1 ubiquitin-ribosomal protein fusion S27a, partial [Phaeodactylum tricornutum]", "diamond", "198", "112", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [21732636, "PRJEB3181_P_NODE_118_length_1165_cov_54.198413_g83_i1", "PRJEB3181", "118", "1165", "54.198413", "631.41151145", "Guinardia delicatula", "1244696", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "222", "8.55e-53", "", "NTclustered", "gi|2074156200|gb|MW413905.1|", "216802", "g83", "i1", "78.01", "37.4420600858369", "382", "64", "32", "15", "36", "405", "24602", "24229", "Guinardia delicatula mitochondrion, complete genome", "blastn", "43620", "222", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Rhizosoleniales", "Rhizosoleniaceae", "Guinardia", "Guinardia delicatula"], [21732670, "PRJEB3181_P_NODE_198_length_1004_cov_18.943474_g149_i0", "PRJEB3181", "198", "1004", "18.943474", "190.19247896", "Haslea pseudostrearia", "197756", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "158", "2.1e-33", "", "NTclustered", "gi|2328347954|ref|NC_067578.1|", "197756", "g149", "i0", "75.401", "24.7529880478088", "374", "67", "36", "19", "24", "387", "27552", "27910", "Haslea pseudostrearia strain SCCAP K-1594 mitochondrion, complete genome", "blastn", "24852", "158", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Haslea", "Haslea pseudostrearia"], [23008215, "PRJEB3181_S_NODE_8839_length_212_cov_65.192090_g8546_i0", "PRJEB3181", "8839", "212", "65.19209", "138.2072308", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "86.3", "5.07e-18", "", "NR", "CAJ1950770.1", "2856", "g8546", "i0", "69.8", "3.79245283018868", "53", "16", "75", "0", "2", "160", "279", "331", "CAJ1950770.1 unnamed protein product [Cylindrotheca closterium]", "diamond", "804", "86.7", "0.995386389850058", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Cylindrotheca", "Cylindrotheca closterium"], [26678302, "PRJEB3181_P_NODE_6561_length_324_cov_6.597270_g6302_i0", "PRJEB3181", "6561", "324", "6.59727", "21.3751548", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "110", "1.2e-28", "", "NR", "AID23573.1", "2850", "g6302", "i0", "78.1", "1.77777777777778", "64", "14", "59.3", "0", "324", "133", "48", "111", "AID23573.1 ribosomal protein, partial [Phaeodactylum tricornutum]", "diamond", "576", "110", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [26906758, "PRJEB3181_P_NODE_20782_length_179_cov_7.297297_g20518_i0", "PRJEB3181", "20782", "179", "7.297297", "13.06216163", "Thalassiosira pseudonana CCMP1335", "296543", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "40.8", "0.0439", "", "NR", "XP_002295703.1", "296543", "g20518", "i0", "56.3", "0.536312849162011", "32", "14", "53.6", "0", "177", "82", "104", "135", "XP_002295703.1 predicted protein [Thalassiosira pseudonana CCMP1335]", "diamond", "96", "40.8", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Thalassiosiraceae", "Thalassiosira", "Thalassiosira pseudonana"], [27690551, "PRJEB3181_P_NODE_5104_length_358_cov_7.006116_g4855_i0", "PRJEB3181", "5104", "358", "7.006116", "25.08189528", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "88.2", "2.87e-19", "", "NR", "KAL3823683.1", "382380", "g4855", "i0", "72.7", "1.84357541899441", "55", "15", "46.1", "0", "356", "192", "110", "164", "KAL3823683.1 hypothetical protein ACHAXA_007254 [Cyclostephanos tholiformis]", "diamond", "660", "88.2", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclostephanos", "Cyclostephanos tholiformis"], [28423125, "PRJEB3181_S_NODE_1326_length_423_cov_361.510309_g839_i1", "PRJEB3181", "1326", "423", "361.510309", "1529.18860707", "Phaeodactylum tricornutum", "2850", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "112", "2.34e-29", "", "NR", "AID23594.1", "2850", "g839", "i1", "78.8", "0.468085106382979", "66", "14", "46.8", "0", "1", "198", "32", "97", "AID23594.1 ubiquitin-ribosomal protein fusion S27a, partial [Phaeodactylum tricornutum]", "diamond", "198", "112", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [28959917, "PRJEB3181_P_NODE_15828_length_211_cov_1.327778_g15564_i0", "PRJEB3181", "15828", "211", "1.327778", "2.80161158", "Pseudo-nitzschia multistriata", "183589", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "42", "0.0251", "", "NR", "VEU34762.1", "183589", "g15564", "i0", "43.9", "0.582938388625592", "41", "23", "58.3", "0", "210", "88", "105", "145", "VEU34762.1 unnamed protein product [Pseudo-nitzschia multistriata]", "diamond", "123", "42", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Pseudo-nitzschia", "Pseudo-nitzschia multistriata"], [29016624, "PRJEB3181_P_NODE_15188_length_216_cov_2.037838_g14924_i0", "PRJEB3181", "15188", "216", "2.037838", "4.40173008", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "58.9", "5.09e-8", "", "NR", "KAG7352108.1", "303405", "g14924", "i0", "47.2", "1.47222222222222", "53", "28", "73.6", "0", "215", "57", "857", "909", "KAG7352108.1 bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase [Nitzschia inconspicua]", "diamond", "318", "58.9", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Nitzschia", "Nitzschia inconspicua"], [29363729, "PRJEB3181_P_NODE_3069_length_426_cov_6.356962_g2843_i0", "PRJEB3181", "3069", "426", "6.356962", "27.08065812", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "184", "3.99e-56", "", "NR", "CAJ1966769.1", "2856", "g2843", "i0", "68.5", "69.7323943661972", "127", "40", "89.4", "0", "2", "382", "84", "210", "CAJ1966769.1 unnamed protein product [Cylindrotheca closterium]", "diamond", "29706", "185", "0.994594594594595", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Cylindrotheca", "Cylindrotheca closterium"], [29963648, "PRJEB3181_P_NODE_8911_length_284_cov_5.936759_g8647_i0", "PRJEB3181", "8911", "284", "5.936759", "16.86039556", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "55.5", "3.49e-7", "", "NR", "CAB9499426.1", "568900", "g8647", "i0", "92.3", "3.02112676056338", "26", "2", "27.5", "0", "2", "79", "112", "137", "CAB9499426.1 40S ribosomal protein S15a [Seminavis robusta]", "diamond", "858", "55.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Seminavis", "Seminavis robusta"], [30191158, "PRJEB3181_P_NODE_17432_length_199_cov_2.017857_g17168_i0", "PRJEB3181", "17432", "199", "2.017857", "4.01553543", "Bacillariaceae sp.", "3061772", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "42", "0.0388", "", "NR", "KAL3930063.1", "3061772", "g17168", "i0", "51.1", "0.678391959798995", "45", "10", "49.7", "2", "199", "101", "290", "334", "KAL3930063.1 MAG: hypothetical protein SGBAC_011929 [Bacillariaceae sp.]", "diamond", "135", "42", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", null, "Bacillariaceae sp."], [30381255, "PRJEB3181_P_NODE_17233_length_200_cov_4.372781_g16969_i0", "PRJEB3181", "17233", "200", "4.372781", "8.745562", "Discostella pseudostelligera", "259834", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "71.6", "1.38e-12", "", "NR", "KAL3766514.1", "259834", "g16969", "i0", "61.4", "1.71", "57", "22", "85.5", "0", "199", "29", "982", "1038", "KAL3766514.1 hypothetical protein ACHAWU_000309 [Discostella pseudostelligera]", "diamond", "342", "71.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Discostella", "Discostella pseudostelligera"], [31512298, "PRJEB3181_S_NODE_16316_length_161_cov_1.174603_g16023_i0", "PRJEB3181", "16316", "161", "1.174603", "1.89111083", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "55.8", "1.17e-7", "", "NR", "EJK65315.1", "159749", "g16023", "i0", "54", "3.70807453416149", "50", "21", "89.4", "2", "9", "152", "124", "173", "EJK65315.1 hypothetical protein THAOC_13837 [Thalassiosira oceanica]", "diamond", "597", "55.8", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Thalassiosiraceae", "Thalassiosira", "Thalassiosira oceanica"], [32713534, "PRJEB3181_P_NODE_22120_length_173_cov_3.661972_g21855_i0", "PRJEB3181", "22120", "173", "3.661972", "6.33521156", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "71.2", "2.42e-13", "", "NR", "KAL3805673.1", "29204", "g21855", "i0", "59.6", "8.70520231213873", "57", "23", "98.8", "0", "2", "172", "53", "109", "KAL3805673.1 hypothetical protein HJC23_005917 [Cyclotella cryptica]", "diamond", "1506", "71.2", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella cryptica"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_clade\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJEB3181", "p1": "Sar", "p2": "Bacillariophyta"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "PRJEB3181", "label": "PRJEB3181", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 6, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Sar", "label": "Sar", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_phylum=Bacillariophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Bacillariophyta", "label": "Bacillariophyta", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB3181&tax_clade=Sar", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 330.29717199679}