{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJEB14664\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[21210, "PRJEB14664_P_NODE_16341_length_173_cov_0.847826_g16211_i0", "PRJEB14664", "16341", "173", "0.847826", "1.46673898", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "246", "6.2099999999999995e-61", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g16211", "i0", "92.135", "107.49132947976901", "178", "9", "100", "3", "1", "173", "512028", "511851", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "18596", "246", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [4813579, "PRJEB14664_P_NODE_13324_length_198_cov_1.417178_g13194_i0", "PRJEB14664", "13324", "198", "1.417178", "2.80601244", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "318", "1.53e-82", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g13194", "i0", "98.343", "163.646464646465", "181", "3", "91", "0", "1", "181", "776", "956", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "32402", "318", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [5123590, "PRJEB14664_P_NODE_16285_length_173_cov_1.195652_g16155_i0", "PRJEB14664", "16285", "173", "1.195652", "2.06847796", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "298", "1.69e-76", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g16155", "i0", "97.688", "244.35838150289", "173", "4", "100", "0", "1", "173", "512848", "512676", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "42274", "298", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [6399333, "PRJEB14664_P_NODE_17126_length_167_cov_1.325758_g16996_i0", "PRJEB14664", "17126", "167", "1.325758", "2.21401586", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "274", "2.75e-69", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g16996", "i0", "96.386", "84.7784431137725", "166", "6", "99", "0", "2", "167", "666654", "666819", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "14158", "274", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [6399347, "PRJEB14664_P_NODE_1866_length_676_cov_1.962559_g1759_i0", "PRJEB14664", "1866", "676", "1.962559", "13.26689884", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "246", "9.3e-80", "", "NR", "MCB0370127.1", "2053517", "g1759", "i0", "87.9", "0.625739644970414", "141", "17", "62.6", "0", "456", "34", "30", "170", "MCB0370127.1 40S ribosomal protein S14 [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "423", "246", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [6399364, "PRJEB14664_P_NODE_20186_length_151_cov_1.034483_g20056_i0", "PRJEB14664", "20186", "151", "1.034483", "1.56206933", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "87.9", "3.38e-13", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g20056", "i0", "81.308", "0.708609271523179", "107", "20", "71", "0", "43", "149", "3861887", "3861993", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "107", "87.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [7673380, "PRJEB14664_P_NODE_14427_length_188_cov_1.568627_g14297_i0", "PRJEB14664", "14427", "188", "1.568627", "2.94901876", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "167", "5.509999999999999e-37", "", "NTclustered", "gi|469926873|gb|CP003538.1|", "349215", "g14297", "i0", "88.889", "72.8776595744681", "135", "15", "72", "0", "3", "137", "1544969", "1544835", "Micavibrio aeruginosavorus EPB, complete genome", "blastn", "13701", "167", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [7673494, "PRJEB14664_P_NODE_5967_length_340_cov_1.196721_g5837_i0", "PRJEB14664", "5967", "340", "1.196721", "4.0688514", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "189", "2.6400000000000007e-59", "", "NR", "MCB0369869.1", "2053517", "g5837", "i0", "81.3", "0.988235294117647", "112", "21", "98.8", "0", "336", "1", "1", "112", "MCB0369869.1 uL15 family ribosomal protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "336", "189", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [7673506, "PRJEB14664_P_NODE_6927_length_309_cov_1.813869_g6797_i0", "PRJEB14664", "6927", "309", "1.813869", "5.60485521", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "459", "1.46e-124", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g6797", "i0", "93.528", "464.957928802589", "309", "19", "100", "1", "1", "309", "1292920", "1293227", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "143672", "459", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [8948291, "PRJEB14664_P_NODE_9688_length_247_cov_1.759434_g9558_i0", "PRJEB14664", "9688", "247", "1.759434", "4.34580198", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "103", "4.68e-26", "", "NR", "MCB0369389.1", "2053517", "g9558", "i0", "71", "0.838056680161943", "69", "19", "83.8", "1", "41", "247", "25", "92", "MCB0369389.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "207", "103", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [21697889, "PRJEB14664_P_NODE_15318_length_180_cov_1.924138_g15188_i0", "PRJEB14664", "15318", "180", "1.924138", "3.4634484", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "233", "5.08e-57", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g15188", "i0", "90.11", "9.56111111111111", "182", "14", "100", "3", "1", "180", "510888", "510709", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "1721", "233", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [22662701, "PRJEB14664_P_NODE_3098_length_512_cov_5.643606_g2976_i0", "PRJEB14664", "3098", "512", "5.643606", "28.89526272", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "564", "5.21e-156", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g2976", "i0", "86.745", "139.119140625", "513", "60", "99", "8", "4", "512", "1660853", "1660345", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "71229", "564", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [26843402, "PRJEB14664_P_NODE_9501_length_251_cov_1.291667_g9371_i0", "PRJEB14664", "9501", "251", "1.291667", "3.24208417", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "116", "3.829999999999999e-31", "", "NR", "MCB0368309.1", "2053517", "g9371", "i0", "71.1", "0.99203187250996006", "83", "24", "99.2", "0", "3", "251", "17", "99", "MCB0368309.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "249", "116", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28043794, "PRJEB14664_P_NODE_11725_length_216_cov_2.038674_g11595_i0", "PRJEB14664", "11725", "216", "2.038674", "4.40353584", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "94", "1.48e-22", "", "NR", "MCB0368309.1", "2053517", "g11595", "i0", "70.4", "0.986111111111111", "71", "21", "98.6", "0", "214", "2", "29", "99", "MCB0368309.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "213", "94", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29464217, "PRJEB14664_P_NODE_4670_length_400_cov_1.884932_g4540_i0", "PRJEB14664", "4670", "400", "1.884932", "7.539728", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "223", "1.6299999999999998e-72", "", "NR", "MCB0369869.1", "2053517", "g4540", "i0", "84.1", "0.99", "132", "21", "99", "0", "397", "2", "1", "132", "MCB0369869.1 uL15 family ribosomal protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "396", "223", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29622060, "PRJEB14664_P_NODE_6090_length_335_cov_2.266667_g5960_i0", "PRJEB14664", "6090", "335", "2.266667", "7.59333445", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "45.8", "0.00914", "", "NR", "MCB0348069.1", "2053517", "g5960", "i0", "48", "0.447761194029851", "50", "23", "44.8", "1", "153", "302", "409", "455", "MCB0348069.1 PKD domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "150", "45.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29780346, "PRJEB14664_P_NODE_16691_length_170_cov_1.481481_g16561_i0", "PRJEB14664", "16691", "170", "1.481481", "2.5185177", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "85.9", "1.23e-19", "", "NR", "MCB0370359.1", "2053517", "g16561", "i0", "80.9", "0.829411764705882", "47", "9", "82.9", "0", "30", "170", "18", "64", "MCB0370359.1 cation transporting ATPase C-terminal domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "141", "85.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29906835, "PRJEB14664_P_NODE_15571_length_178_cov_1.958042_g15441_i0", "PRJEB14664", "15571", "178", "1.958042", "3.48531476", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "97.4", "4.319999999999999e-24", "", "NR", "MCB0370715.1", "2053517", "g15441", "i0", "79.7", "0.99438202247191", "59", "12", "99.4", "0", "2", "178", "84", "142", "MCB0370715.1 fibrillarin-like rRNA/tRNA 2'-O-methyltransferase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "177", "97.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31518510, "PRJEB14664_P_NODE_9976_length_242_cov_1.913043_g9846_i0", "PRJEB14664", "9976", "242", "1.913043", "4.62956406", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "119", "4.72e-32", "", "NR", "MCB0369646.1", "2053517", "g9846", "i0", "66.7", "1.07851239669421", "87", "22", "99.2", "1", "240", "1", "10", "96", "MCB0369646.1 50S ribosomal protein L22 [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "261", "119", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31644769, "PRJEB14664_P_NODE_9377_length_253_cov_1.467890_g9247_i0", "PRJEB14664", "9377", "253", "1.46789", "3.7137617", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "143", "3.07e-42", "", "NR", "MCB0370921.1", "2053517", "g9247", "i0", "79.5", "0.984189723320158", "83", "17", "98.4", "0", "3", "251", "6", "88", "MCB0370921.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "249", "143", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 20, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_phylum\" = :p1 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJEB14664", "p1": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJEB14664", "label": "PRJEB14664", "count": 20, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 11, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}, {"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 9, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 20, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 20, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 20, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 144.6319910028251}