{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where bioproject = \"PRJDB9741\", tax_kingdom = \"Pseudomonadati\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[981833, "PRJDB9741_P_NODE_34521_length_164_cov_0.886957_g34204_i0", "PRJDB9741", "34521", "164", "0.886957", "1.45460948", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "215", "1.65e-51", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g34204", "i0", "90.244", "7.67682926829268", "164", "16", "100", "0", "1", "164", "664222", "664385", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "1259", "215", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [2560804, "PRJDB9741_P_NODE_32703_length_164_cov_3.373913_g32386_i0", "PRJDB9741", "32703", "164", "3.373913", "5.53321732", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "294", "2.06e-75", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g32386", "i0", "99.383", "118.65243902439", "162", "1", "99", "0", "1", "162", "1292811", "1292650", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "19459", "294", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [3532565, "PRJDB9741_P_NODE_8083_length_221_cov_2.366279_g7766_i0", "PRJDB9741", "8083", "221", "2.366279", "5.22947659", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "375", "1.0199999999999998e-99", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g7766", "i0", "97.285", "86.9773755656109", "221", "6", "100", "0", "1", "221", "784641", "784421", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "19222", "375", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [14039060, "PRJDB9741_P_NODE_36732_length_162_cov_2.584071_g36415_i0", "PRJDB9741", "36732", "162", "2.584071", "4.18619502", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "100", "2.37e-25", "", "NR", "PZP56992.1", "349221", "g36415", "i0", "90.6", "0.981481481481482", "53", "5", "98.1", "0", "162", "4", "85", "137", "PZP56992.1 MAG: 30S ribosomal protein S11 [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "159", "100", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [15009730, "PRJDB9741_P_NODE_34212_length_164_cov_0.886957_g33895_i0", "PRJDB9741", "34212", "164", "0.886957", "1.45460948", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "91.7", "6.81e-20", "", "NR", "MBL7687417.1", "2026715", "g33895", "i0", "85.2", "1.97560975609756", "54", "8", "98.8", "0", "2", "163", "330", "383", "MBL7687417.1 polyribonucleotide nucleotidyltransferase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "324", "91.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [16284449, "PRJDB9741_P_NODE_2213_length_502_cov_6.028698_g1900_i0", "PRJDB9741", "2213", "502", "6.028698", "30.26406396", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "582", "1.4099999999999996e-161", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g1900", "i0", "87.795", "241.474103585657", "508", "49", "99", "12", "2", "502", "2950431", "2949930", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "121220", "582", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [17862632, "PRJDB9741_P_NODE_12915_length_190_cov_2.390071_g12598_i0", "PRJDB9741", "12915", "190", "2.390071", "4.5411349", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "335", "1.4499999999999993e-87", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g12598", "i0", "98.421", "4.62631578947368", "190", "3", "100", "0", "1", "190", "512329", "512140", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "879", "335", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [17862705, "PRJDB9741_P_NODE_22235_length_174_cov_1.632000_g21918_i0", "PRJDB9741", "22235", "174", "1.632", "2.83968", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "294", "2.1999999999999998e-75", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g21918", "i0", "97.126", "128.425287356322", "174", "5", "100", "0", "1", "174", "1292273", "1292446", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "22346", "294", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [17862759, "PRJDB9741_P_NODE_2975_length_408_cov_3.977716_g2660_i0", "PRJDB9741", "2975", "408", "3.977716", "16.22908128", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "649", "0", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g2660", "i0", "95.343", "192.28921568627501", "408", "19", "100", "0", "1", "408", "750758", "750351", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "78454", "649", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [20108317, "PRJDB9741_P_NODE_18256_length_181_cov_1.416667_g17939_i0", "PRJDB9741", "18256", "181", "1.416667", "2.56416727", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "329", "6.340000000000001e-86", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g17939", "i0", "99.448", "89.4254143646409", "181", "1", "100", "0", "1", "181", "2949231", "2949051", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "16186", "329", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [20108447, "PRJDB9741_P_NODE_9076_length_210_cov_5.385093_g8759_i0", "PRJDB9741", "9076", "210", "5.385093", "11.3086953", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "185", "1.74e-42", "", "NTclustered", "gi|2663425168|dbj|AP029173.1|", "3113893", "g8759", "i0", "100", "2.82857142857143", "100", "0", "94", "0", "1", "100", "3475981", "3475882", "Bdellovibrio sp. CKG001 DNA, complete genome", "blastn", "594", "185", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. CKG001"], [22658925, "PRJDB9741_P_NODE_7038_length_236_cov_2.700535_g6721_i0", "PRJDB9741", "7038", "236", "2.700535", "6.3732626", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "363", "8.609999999999998e-96", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g6721", "i0", "94.468", "270.021186440678", "235", "13", "99", "0", "2", "236", "511892", "512126", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "63725", "363", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [25207925, "PRJDB9741_P_NODE_22260_length_174_cov_1.632000_g21943_i0", "PRJDB9741", "22260", "174", "1.632", "2.83968", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "322", "1.01e-83", "", "NTclustered", "gi|2663428595|dbj|AP029174.1|", "3113894", "g21943", "i0", "100", "4.00574712643678", "174", "0", "100", "0", "1", "174", "308648", "308821", "Bdellovibrio sp. HM001 DNA, complete genome", "blastn", "697", "322", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HM001"], [25208028, "PRJDB9741_P_NODE_7860_length_224_cov_1.760000_g7543_i0", "PRJDB9741", "7860", "224", "1.76", "3.9424", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "385", "1.73e-102", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g7543", "i0", "97.758", "177.633928571429", "223", "5", "99", "0", "1", "223", "512340", "512562", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "39790", "385", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [26620961, "PRJDB9741_P_NODE_28201_length_167_cov_0.864407_g27884_i0", "PRJDB9741", "28201", "167", "0.864407", "1.44355969", "Bdellovibrio sp. ArHS", "1569284", "Bacteria", "Bacteria", "58.9", "2.58e-8", "", "NR", "WP_041875954.1", "1569284", "g27884", "i0", "100", "0.413173652694611", "23", "0", "41.3", "0", "99", "167", "416", "438", "WP_041875954.1 catalase/peroxidase HPI [Bdellovibrio sp. ArHS]", "diamond", "69", "58.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. ArHS"], [29274491, "PRJDB9741_P_NODE_18809_length_180_cov_1.496183_g18492_i0", "PRJDB9741", "18809", "180", "1.496183", "2.6931294", "Bdellovibrio svalbardensis", "2972972", "Bacteria", "Bacteria", "87.4", "2.96e-18", "", "NR", "WP_277576255.1", "2972972", "g18492", "i0", "65", "1", "60", "21", "100", "0", "1", "180", "311", "370", "WP_277576255.1 hypothetical protein [Bdellovibrio svalbardensis]", "diamond", "180", "87.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio svalbardensis"], [29653201, "PRJDB9741_P_NODE_17170_length_183_cov_1.208955_g16853_i0", "PRJDB9741", "17170", "183", "1.208955", "2.21238765", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "68.9", "9.64e-12", "", "NR", "HMN67505.1", "2053517", "g16853", "i0", "85.7", "0.573770491803279", "35", "5", "57.4", "0", "183", "79", "399", "433", "HMN67505.1 translational GTPase TypA [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "105", "68.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31454665, "PRJDB9741_P_NODE_35876_length_163_cov_0.894737_g35559_i0", "PRJDB9741", "35876", "163", "0.894737", "1.45842131", "Bacteriovorax antarcticus", "3088717", "Bacteria", "Bacteria", "93.2", "3.4e-21", "", "NR", "WP_323578651.1", "3088717", "g35559", "i0", "82.7", "0.957055214723926", "52", "9", "95.7", "0", "6", "161", "218", "269", "WP_323578651.1 trypsin-like serine peptidase [Bacteriovorax antarcticus]", "diamond", "156", "93.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax antarcticus"], [32435636, "PRJDB9741_P_NODE_33519_length_164_cov_0.947826_g33202_i0", "PRJDB9741", "33519", "164", "0.947826", "1.55443464", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "67.4", "1.02e-11", "", "NR", "HEY8278642.1", "3034175", "g33202", "i0", "62.3", "0.969512195121951", "53", "20", "97", "0", "2", "160", "183", "235", "HEY8278642.1 RsmE family RNA methyltransferase [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "159", "67.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 19, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"bioproject\" = :p0 and \"tax_kingdom\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "PRJDB9741", "p1": "Pseudomonadati", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJDB9741", "label": "PRJDB9741", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=blastn", "selected": false}, {"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 7, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&analysis=diamond", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJDB9741&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 507.28880800306797}