{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA758770\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[11408512, "PRJNA758770_S_NODE_30109_length_245_cov_0.906977_g29983_i0", "PRJNA758770", "30109", "245", "0.906977", "2.22209365", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "147", "3.42e-42", "", "NR", "MDX9731524.1", "2053517", "g29983", "i0", "87.5", "1.97142857142857", "80", "10", "98", "0", "6", "245", "26", "105", "MDX9731524.1 glutamine-hydrolyzing GMP synthase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "483", "147", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [26736168, "PRJNA758770_S_NODE_31681_length_243_cov_0.917647_g31555_i0", "PRJNA758770", "31681", "243", "0.917647", "2.22988221", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "97.4", "1.91e-22", "", "NR", "MDX9731017.1", "2053517", "g31555", "i0", "87", "1.59259259259259", "54", "7", "66.7", "0", "162", "1", "45", "98", "MDX9731017.1 outer membrane beta-barrel protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "387", "97.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27084744, "PRJNA758770_S_NODE_16122_length_296_cov_0.946188_g15996_i0", "PRJNA758770", "16122", "296", "0.946188", "2.80071648", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "139", "8.62e-39", "", "NR", "MCB0379473.1", "2053517", "g15996", "i0", "82.5", "1.62162162162162", "80", "14", "81.1", "0", "242", "3", "87", "166", "MCB0379473.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "480", "139", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27147489, "PRJNA758770_S_NODE_23762_length_253_cov_0.866667_g23636_i0", "PRJNA758770", "23762", "253", "0.866667", "2.19266751", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "137", "1.69e-36", "", "NR", "MBK7889873.1", "2053517", "g23636", "i0", "80.2", "4.80237154150198", "81", "16", "96", "0", "11", "253", "281", "361", "MBK7889873.1 transposase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "1215", "137", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [27779774, "PRJNA758770_S_NODE_24324_length_252_cov_0.871508_g24198_i0", "PRJNA758770", "24324", "252", "0.871508", "2.19620016", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "126", "6.36e-33", "", "NR", "MDZ4676294.1", "2599941", "g24198", "i0", "72.6", "1", "84", "23", "100", "0", "252", "1", "32", "115", "MDZ4676294.1 ATP-binding protein [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "252", "126", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [27811440, "PRJNA758770_S_NODE_31684_length_243_cov_0.917647_g31558_i0", "PRJNA758770", "31684", "243", "0.917647", "2.22988221", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "172", "1.46e-49", "", "NR", "HRK02627.1", "2599941", "g31558", "i0", "100", "1", "81", "0", "100", "0", "1", "243", "323", "403", "HRK02627.1 IS1380 family transposase [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "243", "172", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"], [27842638, "PRJNA758770_S_NODE_15164_length_303_cov_1.017391_g15038_i0", "PRJNA758770", "15164", "303", "1.017391", "3.08269473", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "112", "1.48e-27", "", "NR", "MCB0367795.1", "2053517", "g15038", "i0", "60", "8.36633663366337", "85", "34", "84.2", "0", "1", "255", "206", "290", "MCB0367795.1 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "2535", "112", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28253169, "PRJNA758770_S_NODE_32426_length_242_cov_0.923077_g32300_i0", "PRJNA758770", "32426", "242", "0.923077", "2.23384634", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "139", "2.3299999999999997e-37", "", "NR", "MDZ4083043.1", "2053517", "g32300", "i0", "85", "1.98347107438017", "80", "11", "99.2", "1", "241", "2", "140", "218", "MDZ4083043.1 S8 family serine peptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "480", "139", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29926873, "PRJNA758770_S_NODE_26811_length_249_cov_0.886364_g26685_i0", "PRJNA758770", "26811", "249", "0.886364", "2.20704636", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "77", "8.79e-15", "", "NR", "HEY8280173.1", "3034175", "g26685", "i0", "52.4", "1.01204819277108", "84", "37", "97.6", "2", "248", "6", "72", "155", "HEY8280173.1 hypothetical protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "252", "77", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [29958279, "PRJNA758770_S_NODE_27111_length_249_cov_0.886364_g26985_i0", "PRJNA758770", "27111", "249", "0.886364", "2.20704636", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "181", "3.5799999999999995e-55", "", "NR", "WP_347359704.1", "28201", "g26985", "i0", "98.8", "2", "83", "1", "100", "0", "1", "249", "38", "120", "WP_347359704.1 peptide MFS transporter, partial [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "498", "181", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [29989952, "PRJNA758770_S_NODE_31491_length_243_cov_1.129412_g31365_i0", "PRJNA758770", "31491", "243", "1.129412", "2.74447116", "Bdellovibrio sp. ZAP7", "2231053", "Bacteria", "Bacteria", "60.5", "1.98e-8", "", "NR", "WP_142701551.1", "2231053", "g31365", "i0", "56", "0.617283950617284", "50", "22", "61.7", "0", "242", "93", "27", "76", "WP_142701551.1 KamA family radical SAM protein [Bdellovibrio sp. ZAP7]", "diamond", "150", "60.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. ZAP7"], [30021642, "PRJNA758770_S_NODE_30211_length_245_cov_0.906977_g30085_i0", "PRJNA758770", "30211", "245", "0.906977", "2.22209365", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "77.8", "1.72e-14", "", "NR", "MCB0349437.1", "2053517", "g30085", "i0", "52.1", "0.869387755102041", "71", "31", "83.3", "1", "40", "243", "376", "446", "MCB0349437.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "213", "77.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30274524, "PRJNA758770_S_NODE_24352_length_252_cov_0.871508_g24226_i0", "PRJNA758770", "24352", "252", "0.871508", "2.19620016", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "173", "2.01e-48", "", "NR", "MDY0029356.1", "2026715", "g24226", "i0", "100", "0.988095238095238", "83", "0", "98.8", "0", "3", "251", "482", "564", "MDY0029356.1 SLBB domain-containing protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "249", "173", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [30748238, "PRJNA758770_S_NODE_25334_length_251_cov_0.876404_g25208_i0", "PRJNA758770", "25334", "251", "0.876404", "2.19977404", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "117", "2.75e-29", "", "NR", "MDZ4084828.1", "2053517", "g25208", "i0", "68.4", "0.944223107569721", "79", "25", "94.4", "0", "239", "3", "9", "87", "MDZ4084828.1 TIGR03545 family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "237", "117", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31136753, "PRJNA758770_S_NODE_24495_length_252_cov_0.871508_g24369_i0", "PRJNA758770", "24495", "252", "0.871508", "2.19620016", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "143", "3.98e-41", "", "NR", "WP_226988008.1", "959", "g24369", "i0", "80.7", "4.94047619047619", "83", "16", "98.8", "0", "2", "250", "36", "118", "WP_226988008.1 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "1245", "144", "0.993055555555556", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [31475290, "PRJNA758770_S_NODE_24656_length_252_cov_0.871508_g24530_i0", "PRJNA758770", "24656", "252", "0.871508", "2.19620016", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "129", "4.48e-34", "", "NR", "QQG36762.1", "349221", "g24530", "i0", "78.3", "2.96428571428571", "83", "18", "98.8", "0", "3", "251", "145", "227", "QQG36762.1 MAG: NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "747", "129", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [32392620, "PRJNA758770_S_NODE_17139_length_289_cov_1.032407_g17013_i0", "PRJNA758770", "17139", "289", "1.032407", "2.98365623", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "77.4", "3.33e-14", "", "NR", "MCC6137581.1", "2026715", "g17013", "i0", "69.4", "0.508650519031142", "49", "15", "50.9", "0", "149", "3", "258", "306", "MCC6137581.1 site-specific integrase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "147", "77.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [32834228, "PRJNA758770_S_NODE_18720_length_279_cov_1.135922_g18594_i0", "PRJNA758770", "18720", "279", "1.135922", "3.16922238", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "124", "1.5599999999999998e-31", "", "NR", "MDZ4082220.1", "2053517", "g18594", "i0", "61.4", "0.946236559139785", "88", "34", "94.6", "0", "16", "279", "12", "99", "MDZ4082220.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "264", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 18, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA758770", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA758770", "label": "PRJNA758770", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA758770", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 243.32238500028325}