{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA716463\" and tax_phylum = \"Spirochaetota\"", "rows": [[13462218, "PRJNA716463_P_NODE_79991_length_268_cov_3.410256_g79574_i0", "PRJNA716463", "79991", "268", "3.410256", "9.13948608", "Treponema lecithinolyticum", "53418", "Bacteria", "Bacteria", "187", "7.85e-57", "", "NR", "WP_314847611.1", "53418", "g79574", "i0", "100", "0.996268656716418", "89", "0", "99.6", "0", "1", "267", "138", "226", "WP_314847611.1 formylglycine-generating enzyme family protein [Treponema lecithinolyticum]", "diamond", "267", "187", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema lecithinolyticum"], [14736545, "PRJNA716463_P_NODE_17812_length_310_cov_4.552743_g17395_i0", "PRJNA716463", "17812", "310", "4.552743", "14.1135033", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "181", "4.6499999999999994e-57", "", "NR", "WP_296844869.1", "166", "g17395", "i0", "92.8", "5.63225806451613", "97", "6", "93.9", "1", "294", "4", "1", "96", "WP_296844869.1 adenylosuccinate synthetase, partial [Treponema sp.]", "diamond", "1746", "181", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [26956924, "PRJNA716463_P_NODE_40002_length_298_cov_3.524444_g39585_i0", "PRJNA716463", "40002", "298", "3.524444", "10.50284312", "Treponema maltophilum", "51160", "Bacteria", "Bacteria", "103", "4.279999999999999e-23", "", "NR", "WP_016524832.1", "51160", "g39585", "i0", "98", "0.503355704697987", "50", "1", "50.3", "0", "150", "1", "656", "705", "WP_016524832.1 M16 family metallopeptidase [Treponema maltophilum]", "diamond", "150", "103", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"], [27209847, "PRJNA716463_P_NODE_105662_length_246_cov_3.479769_g105244_i0", "PRJNA716463", "105662", "246", "3.479769", "8.56023174", "Treponema phagedenis", "162", "Bacteria", "Bacteria", "87.8", "2.4e-18", "", "NR", "WP_174897236.1", "162", "g105244", "i0", "61.3", "0.975609756097561", "80", "28", "93.9", "2", "243", "13", "63", "142", "WP_174897236.1 LPP20 family lipoprotein [Treponema phagedenis]", "diamond", "240", "87.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema phagedenis"], [27209860, "PRJNA716463_P_NODE_36702_length_299_cov_3.141593_g36285_i0", "PRJNA716463", "36702", "299", "3.141593", "9.39336307", "Treponema vincentii", "69710", "Bacteria", "Bacteria", "134", "1.8299999999999997e-35", "", "NR", "WP_016519013.1", "69710", "g36285", "i0", "48.8", "3.21070234113712", "160", "21", "99.3", "1", "298", "2", "191", "350", "WP_016519013.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase [Treponema vincentii]", "diamond", "960", "134", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema vincentii"], [27273296, "PRJNA716463_P_NODE_39743_length_298_cov_3.791111_g39326_i0", "PRJNA716463", "39743", "298", "3.791111", "11.29751078", "Treponema sp. OMZ 857", "1643513", "Bacteria", "Bacteria", "80.5", "3.76e-15", "", "NR", "WP_253727479.1", "1643513", "g39326", "i0", "75.5", "1.47986577181208", "49", "12", "49.3", "0", "149", "3", "553", "601", "WP_253727479.1 hypothetical protein [Treponema sp. OMZ 857]", "diamond", "441", "80.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. OMZ 857"], [27473350, "PRJNA716463_P_NODE_76583_length_271_cov_2.313131_g76166_i0", "PRJNA716463", "76583", "271", "2.313131", "6.26858501", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "135", "7.38e-37", "", "NR", "MFC2331348.1", "166", "g76166", "i0", "76.7", "1.99261992619926", "90", "21", "99.6", "0", "271", "2", "15", "104", "MFC2331348.1 hypothetical protein [Treponema sp.]", "diamond", "540", "136", "0.992647058823529", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [27505099, "PRJNA716463_P_NODE_69503_length_276_cov_4.172414_g69086_i0", "PRJNA716463", "69503", "276", "4.172414", "11.51586264", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "187", "3.28e-59", "", "NR", "WP_238579928.1", "1580831", "g69086", "i0", "100", "2", "92", "0", "100", "0", "1", "276", "16", "107", "WP_238579928.1 hypothetical protein, partial [Treponema endosymbiont of Eucomonympha sp.]", "diamond", "552", "187", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema endosymbiont of Eucomonympha sp."], [27589238, "PRJNA716463_P_NODE_22384_length_310_cov_3.320675_g21967_i0", "PRJNA716463", "22384", "310", "3.320675", "10.2940925", "Leptospirales bacterium", "2604146", "Bacteria", "Bacteria", "77.4", "1.68e-14", "", "NR", "MBX7056637.1", "2604146", "g21967", "i0", "83.7", "0.474193548387097", "49", "8", "47.4", "0", "4", "150", "125", "173", "MBX7056637.1 enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein [Leptospirales bacterium]", "diamond", "147", "77.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", null, null, "Leptospirales bacterium"], [27599817, "PRJNA716463_P_NODE_122404_length_221_cov_4.581081_g121986_i0", "PRJNA716463", "122404", "221", "4.581081", "10.12418901", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "53.1", "5.95e-6", "", "NR", "TXG81242.1", "2202144", "g121986", "i0", "50", "1.80542986425339", "60", "28", "78.7", "1", "182", "9", "570", "629", "TXG81242.1 MAG: hypothetical protein E6R13_06515 [Spirochaetota bacterium]", "diamond", "399", "53.5", "0.992523364485981", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", null, null, null, null, "Spirochaetota bacterium"], [27652432, "PRJNA716463_P_NODE_42584_length_296_cov_5.843049_g42167_i0", "PRJNA716463", "42584", "296", "5.843049", "17.29542504", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "88.6", "2.9e-20", "", "NR", "MCR5402157.1", "166", "g42167", "i0", "78.3", "0.952702702702703", "46", "10", "46.6", "0", "2", "139", "71", "116", "MCR5402157.1 ribosome silencing factor [Treponema sp.]", "diamond", "282", "88.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [27841560, "PRJNA716463_P_NODE_120364_length_227_cov_8.051948_g119946_i0", "PRJNA716463", "120364", "227", "8.051948", "18.27792196", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "80.1", "5.83e-16", "", "NR", "MBQ2234548.1", "166", "g119946", "i0", "55.4", "0.977973568281938", "74", "33", "97.8", "0", "225", "4", "74", "147", "MBQ2234548.1 ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase [Treponema sp.]", "diamond", "222", "80.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [28357251, "PRJNA716463_P_NODE_17726_length_310_cov_4.616034_g17309_i0", "PRJNA716463", "17726", "310", "4.616034", "14.3097054", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "73.2", "3.24e-14", "", "NR", "WP_100736474.1", "408139", "g17309", "i0", "61.1", "2.10967741935484", "54", "21", "52.3", "0", "305", "144", "22", "75", "WP_100736474.1 DUF1330 domain-containing protein [Leptospira kmetyi]", "diamond", "654", "73.6", "0.994565217391304", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Leptospira", "Leptospira kmetyi"], [28473275, "PRJNA716463_P_NODE_121726_length_225_cov_4.519737_g121308_i0", "PRJNA716463", "121726", "225", "4.519737", "10.16940825", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "111", "1.2200000000000002e-27", "", "NR", "MCR5400703.1", "166", "g121308", "i0", "77", "0.986666666666667", "74", "17", "98.7", "0", "224", "3", "103", "176", "MCR5400703.1 branched-chain amino acid ABC transporter permease [Treponema sp.]", "diamond", "222", "111", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [28567851, "PRJNA716463_P_NODE_54587_length_287_cov_3.060748_g54170_i0", "PRJNA716463", "54587", "287", "3.060748", "8.78434676", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "151", "1.29e-40", "", "NR", "WP_385981747.1", "166", "g54170", "i0", "81.1", "1.98606271777003", "95", "18", "99.3", "0", "1", "285", "193", "287", "WP_385981747.1 DNA polymerase I, partial [Treponema sp.]", "diamond", "570", "151", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [28599646, "PRJNA716463_P_NODE_32667_length_300_cov_4.647577_g32250_i0", "PRJNA716463", "32667", "300", "4.647577", "13.942731", "Treponema sp. Marseille-Q413", "166", "Bacteria", "Bacteria", "147", "9.56e-39", "", "NR", "WP_255422679.1", "2766702", "g32250", "i0", "76.1", "1.09", "109", "16", "99", "1", "3", "299", "83", "191", "WP_255422679.1 fibronectin type III domain-containing protein [Treponema sp. Marseille-Q4130]", "diamond", "327", "147", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q4130"], [28704828, "PRJNA716463_P_NODE_21347_length_310_cov_3.464135_g20930_i0", "PRJNA716463", "21347", "310", "3.464135", "10.7388185", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "98.2", "1.16e-23", "", "NR", "WP_059370784.1", "1580831", "g20930", "i0", "100", "0.967741935483871", "50", "0", "48.4", "0", "1", "150", "47", "96", "WP_059370784.1 sigma-70 family RNA polymerase sigma factor, partial [Treponema endosymbiont of Eucomonympha sp.]", "diamond", "300", "98.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema endosymbiont of Eucomonympha sp."], [28947049, "PRJNA716463_P_NODE_45948_length_293_cov_4.163636_g45531_i0", "PRJNA716463", "45948", "293", "4.163636", "12.19945348", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "66.2", "6.03e-12", "", "NR", "WP_385980954.1", "166", "g45531", "i0", "59.6", "0.583617747440273", "57", "23", "58.4", "0", "172", "2", "1", "57", "WP_385980954.1 hypothetical protein, partial [Treponema sp.]", "diamond", "171", "66.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [29010339, "PRJNA716463_P_NODE_26948_length_310_cov_2.818565_g26531_i0", "PRJNA716463", "26948", "310", "2.818565", "8.7375515", "Treponema maltophilum", "51160", "Bacteria", "Bacteria", "125", "2.3e-34", "", "NR", "MFC2419960.1", "51160", "g26531", "i0", "57.4", "2.09032258064516", "108", "29", "88.1", "1", "274", "2", "3", "110", "MFC2419960.1 MBL fold metallo-hydrolase [Treponema maltophilum]", "diamond", "648", "125", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"], [29041730, "PRJNA716463_P_NODE_68028_length_278_cov_1.185366_g67611_i0", "PRJNA716463", "68028", "278", "1.185366", "3.29531748", "Treponema pedis", "409322", "Bacteria", "Bacteria", "127", "2.2299999999999998e-32", "", "NR", "WP_024469562.1", "409322", "g67611", "i0", "71.7", "0.992805755395683", "92", "26", "99.3", "0", "278", "3", "93", "184", "WP_024469562.1 tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE [Treponema pedis]", "diamond", "276", "127", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema pedis"], [29546542, "PRJNA716463_P_NODE_31030_length_308_cov_4.940426_g30613_i0", "PRJNA716463", "31030", "308", "4.940426", "15.21651208", "Leptospira sp.", "178", "Bacteria", "Bacteria", "69.3", "5.11e-12", "", "NR", "NCN11570.1", "178", "g30613", "i0", "29.5", "1.09090909090909", "112", "62", "92.5", "1", "6", "290", "53", "164", "NCN11570.1 hypothetical protein [Leptospira sp.]", "diamond", "336", "69.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Leptospira", "Leptospira sp."], [29746392, "PRJNA716463_P_NODE_17790_length_310_cov_4.569620_g17373_i0", "PRJNA716463", "17790", "310", "4.56962", "14.165822", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "91.7", "4.22e-19", "", "NR", "WP_206181587.1", "58231", "g17373", "i0", "89.8", "1.43225806451613", "49", "5", "47.4", "0", "1", "147", "48", "96", "WP_206181587.1 MATE family efflux transporter [Treponema medium]", "diamond", "444", "91.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [29830824, "PRJNA716463_P_NODE_55751_length_286_cov_4.145540_g55334_i0", "PRJNA716463", "55751", "286", "4.14554", "11.8562444", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "143", "7.74e-40", "", "NR", "MBP5602590.1", "166", "g55334", "i0", "64.2", "4.97202797202797", "95", "34", "99.7", "0", "2", "286", "44", "138", "MBP5602590.1 GNAT family N-acetyltransferase [Treponema sp.]", "diamond", "1422", "143", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [30525858, "PRJNA716463_P_NODE_108553_length_244_cov_1.795322_g108135_i0", "PRJNA716463", "108553", "244", "1.795322", "4.38058568", "Leptospiraceae bacterium", "2026757", "Bacteria", "Bacteria", "54.7", "2.33e-6", "", "NR", "MEQ8353695.1", "2026757", "g108135", "i0", "41.7", "2.36065573770492", "72", "42", "88.5", "0", "242", "27", "405", "476", "MEQ8353695.1 GAF domain-containing protein [Leptospiraceae bacterium]", "diamond", "576", "54.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", null, "Leptospiraceae bacterium"], [30525870, "PRJNA716463_P_NODE_18993_length_310_cov_4.012658_g18576_i0", "PRJNA716463", "18993", "310", "4.012658", "12.4392398", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "112", "5.38e-28", "", "NR", "MFC2604024.1", "166", "g18576", "i0", "58.9", "1.03548387096774", "107", "40", "99.7", "1", "309", "1", "11", "117", "MFC2604024.1 PrsW family glutamic-type intramembrane protease [Treponema sp.]", "diamond", "321", "112", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [30778730, "PRJNA716463_P_NODE_105334_length_247_cov_0.885057_g104917_i0", "PRJNA716463", "105334", "247", "0.885057", "2.18609079", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "145", "9.92e-43", "", "NR", "MFC2331301.1", "166", "g104917", "i0", "93.8", "0.983805668016194", "81", "5", "98.4", "0", "3", "245", "58", "138", "MFC2331301.1 transcriptional regulator NrdR [Treponema sp.]", "diamond", "243", "145", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [30936833, "PRJNA716463_P_NODE_68234_length_277_cov_3.941176_g67817_i0", "PRJNA716463", "68234", "277", "3.941176", "10.91705752", "Treponema lecithinolyticum", "53418", "Bacteria", "Bacteria", "187", "9.7e-54", "", "NR", "WP_314848038.1", "53418", "g67817", "i0", "100", "2.98916967509025", "92", "0", "99.6", "0", "276", "1", "527", "618", "WP_314848038.1 NAD-dependent DNA ligase LigA [Treponema lecithinolyticum]", "diamond", "828", "187", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema lecithinolyticum"], [31073632, "PRJNA716463_P_NODE_101315_length_250_cov_2.197740_g100898_i0", "PRJNA716463", "101315", "250", "2.19774", "5.49435", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "140", "2.2e-39", "", "NR", "WP_162502539.1", "1580831", "g100898", "i0", "100", "1.824", "76", "0", "91.2", "0", "2", "229", "175", "250", "WP_162502539.1 hypothetical protein [Treponema endosymbiont of Eucomonympha sp.]", "diamond", "456", "140", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema endosymbiont of Eucomonympha sp."], [31125899, "PRJNA716463_P_NODE_75375_length_272_cov_2.185930_g74958_i0", "PRJNA716463", "75375", "272", "2.18593", "5.9457296", "Treponema porcinum", "261392", "Bacteria", "Bacteria", "155", "2.67e-46", "", "NR", "WP_320874359.1", "261392", "g74958", "i0", "84.4", "7.94117647058824", "90", "14", "99.3", "0", "3", "272", "58", "147", "WP_320874359.1 flagellar hook-basal body complex protein, partial [Treponema porcinum]", "diamond", "2160", "155", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema porcinum"], [31695514, "PRJNA716463_P_NODE_89197_length_261_cov_1.638298_g88780_i0", "PRJNA716463", "89197", "261", "1.638298", "4.27595778", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "79.7", "4.37e-15", "", "NR", "MEE0887558.1", "166", "g88780", "i0", "53.8", "4.06896551724138", "65", "30", "74.7", "0", "3", "197", "178", "242", "MEE0887558.1 phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase [Treponema sp.]", "diamond", "1062", "79.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [31790203, "PRJNA716463_P_NODE_75797_length_272_cov_1.472362_g75380_i0", "PRJNA716463", "75797", "272", "1.472362", "4.00482464", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "93.2", "5.71e-22", "", "NR", "UKI52841.1", "166", "g75380", "i0", "90", "2.20588235294118", "50", "5", "55.1", "0", "272", "123", "89", "138", "UKI52841.1 MAG: flagellar basal body rod protein FlgB [Treponema sp.]", "diamond", "600", "93.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [32117401, "PRJNA716463_P_NODE_18158_length_310_cov_4.367089_g17741_i0", "PRJNA716463", "18158", "310", "4.367089", "13.5379759", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "48.1", "3.16e-4", "", "NR", "WP_206182240.1", "58231", "g17741", "i0", "60", "2.32258064516129", "40", "16", "38.7", "0", "9", "128", "101", "140", "WP_206182240.1 leucine-rich repeat protein [Treponema medium]", "diamond", "720", "48.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [32170272, "PRJNA716463_P_NODE_120958_length_227_cov_2.116883_g120540_i0", "PRJNA716463", "120958", "227", "2.116883", "4.80532441", "Treponema medium", "58231", "Bacteria", "Bacteria", "121", "3.14e-30", "", "NR", "WP_206181939.1", "58231", "g120540", "i0", "85.3", "0.991189427312775", "75", "11", "99.1", "0", "3", "227", "417", "491", "WP_206181939.1 ABC transporter permease [Treponema medium]", "diamond", "225", "121", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [32170279, "PRJNA716463_P_NODE_27318_length_310_cov_2.784810_g26901_i0", "PRJNA716463", "27318", "310", "2.78481", "8.632911", "Treponema sp. Marseille-Q39", "166", "Bacteria", "Bacteria", "104", "1.4000000000000002e-23", "", "NR", "WP_187382796.1", "2766703", "g26901", "i0", "98", "0.474193548387097", "49", "1", "47.4", "0", "148", "2", "125", "173", "WP_187382796.1 S41 family peptidase [Treponema sp. Marseille-Q3903]", "diamond", "147", "104", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q3903"], [32360189, "PRJNA716463_P_NODE_44179_length_295_cov_4.405405_g43762_i0", "PRJNA716463", "44179", "295", "4.405405", "12.99594475", "Treponema lecithinolyticum", "53418", "Bacteria", "Bacteria", "175", "1.27e-50", "", "NR", "WP_021687119.1", "53418", "g43762", "i0", "86.7", "1.14915254237288", "113", "0", "99.7", "1", "294", "1", "100", "212", "WP_021687119.1 replicative DNA helicase [Treponema lecithinolyticum]", "diamond", "339", "175", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema lecithinolyticum"], [32455043, "PRJNA716463_P_NODE_19439_length_310_cov_3.877637_g19022_i0", "PRJNA716463", "19439", "310", "3.877637", "12.0206747", "Treponema socranskii", "53419", "Bacteria", "Bacteria", "101", "3.13e-24", "", "NR", "WP_021329538.1", "53419", "g19022", "i0", "82", "0.590322580645161", "61", "11", "59", "0", "126", "308", "119", "179", "WP_021329538.1 helix-turn-helix domain-containing protein [Treponema socranskii]", "diamond", "183", "101", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema socranskii"], [32486655, "PRJNA716463_P_NODE_76239_length_271_cov_3.207071_g75822_i0", "PRJNA716463", "76239", "271", "3.207071", "8.69116241", "Treponema denticola ATCC 3352", "158", "Bacteria", "Bacteria", "69.3", "2.27e-11", "", "NR", "EMB41671.1", "999428", "g75822", "i0", "62.7", "2.13653136531365", "67", "22", "72", "3", "18", "212", "530", "595", "EMB41671.1 polymorphic outer membrane protein [Treponema denticola ATCC 33520]", "diamond", "579", "69.3", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema denticola"], [32707204, "PRJNA716463_P_NODE_64960_length_280_cov_1.971014_g64543_i0", "PRJNA716463", "64960", "280", "1.971014", "5.5188392", "Treponema maltophilum", "51160", "Bacteria", "Bacteria", "156", "2.88e-42", "", "NR", "WP_016524925.1", "51160", "g64543", "i0", "78.5", "1.99285714285714", "93", "20", "99.6", "0", "279", "1", "292", "384", "WP_016524925.1 hypothetical protein [Treponema maltophilum]", "diamond", "558", "156", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"], [32833184, "PRJNA716463_P_NODE_108940_length_243_cov_4.617647_g108522_i0", "PRJNA716463", "108940", "243", "4.617647", "11.22088221", "Treponema maltophilum", "51160", "Bacteria", "Bacteria", "164", "4.3199999999999997e-47", "", "NR", "WP_016526577.1", "51160", "g108522", "i0", "97.5", "1.97530864197531", "80", "2", "98.8", "0", "2", "241", "54", "133", "WP_016526577.1 THUMP domain-containing class I SAM-dependent RNA methyltransferase [Treponema maltophilum]", "diamond", "480", "164", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"], [32864662, "PRJNA716463_P_NODE_21660_length_310_cov_3.421941_g21243_i0", "PRJNA716463", "21660", "310", "3.421941", "10.6080171", "Treponema maltophilum", "51160", "Bacteria", "Bacteria", "99.8", "2.72e-22", "", "NR", "WP_016525059.1", "51160", "g21243", "i0", "76.5", "0.658064516129032", "68", "16", "65.8", "0", "206", "3", "29", "96", "WP_016525059.1 FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein [Treponema maltophilum]", "diamond", "204", "99.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema maltophilum"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 40, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA716463", "p2": "Spirochaetota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "PRJNA716463", "label": "PRJNA716463", "count": 40, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Spirochaetota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 40, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 40, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 40, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Spirochaetota", "label": "Spirochaetota", "count": 40, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA716463", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 388.6485700004414}