{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA698538\" and tax_clade = \"Embryophyta\"", "rows": [[10885401, "PRJNA698538_S_NODE_18969_length_289_cov_1.398148_g18803_i0", "PRJNA698538", "18969", "289", "1.398148", "4.04064772", "Lotus japonicus", "34305", "Plants", "Plants", "134", "6.35e-36", "", "NR", "AFK42829.1", "34305", "g18803", "i0", "89.4", "1.38062283737024", "66", "7", "68.5", "0", "6", "203", "268", "333", "AFK42829.1 unknown [Lotus japonicus]", "diamond", "399", "134", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Fabales", "Fabaceae", "Lotus", "Lotus japonicus"], [12160448, "PRJNA698538_S_NODE_15870_length_307_cov_2.320513_g15704_i0", "PRJNA698538", "15870", "307", "2.320513", "7.12397491", "Eukaryota", "2759", "Plants", "Plants", "143", "9.21e-42", "", "NR", "XP_047308679.1", "253017", "g15704", "i0", "85.2", "80.8241042345277", "88", "12", "85", "1", "47", "307", "22", "109", "XP_047308679.1 probable histone H2A variant 3 [Impatiens glandulifera]", "diamond", "24813", "143", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Ericales", "Balsaminaceae", "Impatiens", "Impatiens glandulifera"], [26861558, "PRJNA698538_S_NODE_26361_length_252_cov_2.150838_g26195_i0", "PRJNA698538", "26361", "252", "2.150838", "5.42011176", "Humulus scandens", "228586", "Plants", "Plants", "50.4", "5.6e-6", "", "NR", "AVY54507.1", "228586", "g26195", "i0", "45.1", "0.607142857142857", "51", "28", "60.7", "0", "7", "159", "23", "73", "AVY54507.1 Hum s 3 allergen [Humulus scandens]", "diamond", "153", "50.4", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Rosales", "Cannabaceae", "Humulus", "Humulus scandens"], [27051181, "PRJNA698538_S_NODE_20642_length_280_cov_1.806763_g20476_i0", "PRJNA698538", "20642", "280", "1.806763", "5.0589364", "Brachypodium distachyon", "15368", "Plants", "Plants", "43.9", "0.00257", "", "NR", "PNT67338.1", "15368", "g20476", "i0", "38.2", "0.589285714285714", "55", "22", "58.9", "1", "65", "229", "13", "55", "PNT67338.1 hypothetical protein BRADI_3g25594v3 [Brachypodium distachyon]", "diamond", "165", "43.9", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Poales", "Poaceae", "Brachypodium", "Brachypodium distachyon"], [27062284, "PRJNA698538_S_NODE_28162_length_246_cov_3.115607_g27996_i0", "PRJNA698538", "28162", "246", "3.115607", "7.66439322", "Magnoliopsida", "3398", "Plants", "Plants", "57.8", "1.98e-7", "", "NR", "KDO59476.1", "2711", "g27996", "i0", "100", "75.7317073170732", "27", "0", "32.9", "0", "1", "81", "563", "589", "KDO59476.1 hypothetical protein CISIN_1g007033mg [Citrus sinensis]", "diamond", "18630", "57.8", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Sapindales", "Rutaceae", "Citrus", "Citrus sinensis"], [27820605, "PRJNA698538_S_NODE_23104_length_267_cov_4.824742_g22938_i0", "PRJNA698538", "23104", "267", "4.824742", "12.88206114", "Magnoliopsida", "3398", "Plants", "Plants", "42.4", "0.00976", "", "NR", "PON55230.1", "3476", "g22938", "i0", "52.4", "0.921348314606742", "42", "17", "44.9", "2", "2", "121", "33", "73", "PON55230.1 Pollen allergen ole e [Parasponia andersonii]", "diamond", "246", "42.4", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Rosales", "Cannabaceae", "Parasponia", "Parasponia andersonii"], [27840619, "PRJNA698538_S_NODE_24104_length_263_cov_1.015789_g23938_i0", "PRJNA698538", "24104", "263", "1.015789", "2.67152507", "Humulus lupulus", "3486", "Plants", "Plants", "58.5", "3.04e-8", "", "NR", "XP_062104844.1", "3486", "g23938", "i0", "83.3", "0.4106463878327", "36", "6", "41.1", "0", "1", "108", "132", "167", "XP_062104844.1 GPI-anchored protein LLG3-like [Humulus lupulus]", "diamond", "108", "58.5", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Rosales", "Cannabaceae", "Humulus", "Humulus lupulus"], [27978286, "PRJNA698538_S_NODE_14105_length_318_cov_3.142857_g13939_i0", "PRJNA698538", "14105", "318", "3.142857", "9.99428526", "Eukaryota", "2759", "Plants", "Plants", "57", "2.73e-7", "", "NR", "GAA0165535.1", "34254", "g13939", "i0", "47.2", "2.42452830188679", "53", "26", "50", "1", "1", "159", "124", "174", "GAA0165535.1 hypothetical protein LIER_20916 [Lithospermum erythrorhizon]", "diamond", "771", "57.4", "0.993031358885017", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Boraginales", "Boraginaceae", "Lithospermum", "Lithospermum erythrorhizon"], [28072954, "PRJNA698538_S_NODE_6705_length_384_cov_3.565916_g6539_i0", "PRJNA698538", "6705", "384", "3.565916", "13.69311744", "Eukaryota", "2759", "Plants", "Plants", "58.5", "1.9e-7", "", "NR", "KAJ8645526.1", "3435", "g6539", "i0", "33.7", "7.609375", "95", "60", "74.2", "2", "378", "94", "57", "148", "KAJ8645526.1 hypothetical protein MRB53_007274 [Persea americana]", "diamond", "2922", "58.5", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Laurales", "Lauraceae", "Persea", "Persea americana"], [28661856, "PRJNA698538_S_NODE_25467_length_256_cov_2.573770_g25301_i0", "PRJNA698538", "25467", "256", "2.57377", "6.5888512", "Parasponia andersonii", "3476", "Plants", "Plants", "55.8", "8.33e-8", "", "NR", "PON58107.1", "3476", "g25301", "i0", "84.2", "0.4453125", "38", "4", "44.5", "1", "255", "142", "65", "100", "PON58107.1 hypothetical protein PanWU01x14_168770 [Parasponia andersonii]", "diamond", "114", "55.8", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Rosales", "Cannabaceae", "Parasponia", "Parasponia andersonii"], [28862256, "PRJNA698538_S_NODE_31588_length_227_cov_2.097403_g31422_i0", "PRJNA698538", "31588", "227", "2.097403", "4.76110481", "Marchantia", "3196", "Plants", "Plants", "65.5", "2.29e-10", "", "NR", "KAG6552940.1", "56867", "g31422", "i0", "69.8", "3.64757709251101", "43", "12", "55.5", "1", "226", "101", "259", "301", "KAG6552940.1 hypothetical protein Mapa_005473 [Marchantia paleacea]", "diamond", "828", "65.5", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Marchantiopsida", "Marchantiales", "Marchantiaceae", "Marchantia", "Marchantia paleacea"], [29209811, "PRJNA698538_S_NODE_24009_length_263_cov_1.752632_g23843_i0", "PRJNA698538", "24009", "263", "1.752632", "4.60942216", "Magnoliopsida", "3398", "Plants", "Plants", "54.7", "7.93e-7", "", "NR", "CAF2239439.1", "3708", "g23843", "i0", "57.4", "8.32699619771863", "47", "20", "53.6", "0", "263", "123", "107", "153", "CAF2239439.1 unnamed protein product [Brassica napus]", "diamond", "2190", "54.7", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Brassicales", "Brassicaceae", "Brassica", "Brassica napus"], [29261442, "PRJNA698538_S_NODE_7069_length_380_cov_1.752443_g6903_i0", "PRJNA698538", "7069", "380", "1.752443", "6.6592834", "Urochloa decumbens", "240449", "Plants", "Plants", "79.7", "1.76e-14", "", "NR", "CAL5071761.1", "240449", "g6903", "i0", "67.3", "0.386842105263158", "49", "16", "38.7", "0", "378", "232", "413", "461", "CAL5071761.1 unnamed protein product [Urochloa decumbens]", "diamond", "147", "79.7", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Poales", "Poaceae", "Urochloa", "Urochloa decumbens"], [29450803, "PRJNA698538_S_NODE_19030_length_288_cov_4.939535_g18864_i0", "PRJNA698538", "19030", "288", "4.939535", "14.2258608", "Humulus lupulus", "3486", "Plants", "Plants", "68.6", "4.74e-13", "", "NR", "XP_062076519.1", "3486", "g18864", "i0", "97.3", "0.770833333333333", "37", "1", "38.5", "0", "287", "177", "26", "62", "XP_062076519.1 arabinogalactan protein 13-like [Humulus lupulus]", "diamond", "222", "68.6", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Rosales", "Cannabaceae", "Humulus", "Humulus lupulus"], [29577139, "PRJNA698538_S_NODE_17690_length_296_cov_3.372197_g17524_i0", "PRJNA698538", "17690", "296", "3.372197", "9.98170312", "Parasponia andersonii", "3476", "Plants", "Plants", "76.6", "4.75e-16", "", "NR", "PON40070.1", "3476", "g17524", "i0", "57.9", "0.577702702702703", "57", "23", "56.8", "1", "4", "171", "19", "75", "PON40070.1 hypothetical protein PanWU01x14_300130 [Parasponia andersonii]", "diamond", "171", "76.6", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Rosales", "Cannabaceae", "Parasponia", "Parasponia andersonii"], [29861595, "PRJNA698538_S_NODE_30211_length_240_cov_3.826347_g30045_i0", "PRJNA698538", "30211", "240", "3.826347", "9.1832328", "Catharanthus roseus", "4058", "Plants", "Plants", "55.1", "1.57e-6", "", "NR", "KAI5670966.1", "4058", "g30045", "i0", "64.3", "0.525", "42", "15", "52.5", "0", "2", "127", "515", "556", "KAI5670966.1 hypothetical protein M9H77_11330 [Catharanthus roseus]", "diamond", "126", "55.1", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Gentianales", "Apocynaceae", "Catharanthus", "Catharanthus roseus"], [30367507, "PRJNA698538_S_NODE_18092_length_294_cov_1.742081_g17926_i0", "PRJNA698538", "18092", "294", "1.742081", "5.12171814", "Picea sitchensis", "3332", "Plants", "Plants", "134", "2.1e-37", "", "NR", "ABK27059.1", "3332", "g17926", "i0", "80.8", "2.23469387755102", "73", "14", "74.5", "0", "2", "220", "119", "191", "ABK27059.1 unknown [Picea sitchensis]", "diamond", "657", "134", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Pinopsida", "Pinales", "Pinaceae", "Picea", "Picea sitchensis"], [30725781, "PRJNA698538_S_NODE_20574_length_280_cov_3.347826_g20408_i0", "PRJNA698538", "20574", "280", "3.347826", "9.3739128", "Eukaryota", "2759", "Plants", "Plants", "94.4", "4.669999999999999e-23", "", "NR", "KAJ3695878.1", "13579", "g20408", "i0", "70.5", "25.3285714285714", "61", "18", "65.4", "0", "1", "183", "16", "76", "KAJ3695878.1 hypothetical protein LUZ60_001255 [Juncus effusus]", "diamond", "7092", "95.1", "0.992639327024185", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Poales", "Juncaceae", "Juncus", "Juncus effusus"], [31251720, "PRJNA698538_S_NODE_11715_length_335_cov_4.297710_g11549_i0", "PRJNA698538", "11715", "335", "4.29771", "14.3973285", "Cryptomeria japonica", "3369", "Plants", "Plants", "156", "6.03e-46", "", "NR", "XP_057865288.2", "3369", "g11549", "i0", "74", "0.859701492537313", "96", "25", "86", "0", "1", "288", "86", "181", "XP_057865288.2 uncharacterized protein LOC131072982 [Cryptomeria japonica]", "diamond", "288", "156", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Pinopsida", "Cupressales", "Cupressaceae", "Cryptomeria", "Cryptomeria japonica"], [31505006, "PRJNA698538_S_NODE_4296_length_427_cov_4.389831_g4130_i0", "PRJNA698538", "4296", "427", "4.389831", "18.74457837", "Cannabis sativa", "3483", "Plants", "Plants", "77.4", "1.1e-15", "", "NR", "KAF4379259.1", "3483", "g4130", "i0", "50", "0.548009367681499", "78", "33", "54.1", "3", "3", "233", "5", "77", "KAF4379259.1 hypothetical protein G4B88_010653 [Cannabis sativa]", "diamond", "234", "77.4", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Rosales", "Cannabaceae", "Cannabis", "Cannabis sativa"], [32169406, "PRJNA698538_S_NODE_7378_length_376_cov_1.795380_g7212_i0", "PRJNA698538", "7378", "376", "1.79538", "6.7506288", "Kingdonia uniflora", "39325", "Plants", "Plants", "59.3", "2.48e-7", "", "NR", "KAF6145608.1", "39325", "g7212", "i0", "44.3", "2.91223404255319", "70", "37", "55.9", "1", "95", "304", "3", "70", "KAF6145608.1 hypothetical protein GIB67_037641 [Kingdonia uniflora]", "diamond", "1095", "59.3", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Ranunculales", "Circaeasteraceae", "Kingdonia", "Kingdonia uniflora"], [32180513, "PRJNA698538_S_NODE_22638_length_270_cov_1.172589_g22472_i0", "PRJNA698538", "22638", "270", "1.172589", "3.1659903", "Magnoliopsida", "3398", "Plants", "Plants", "53.9", "6.34e-6", "", "NR", "KAG7598815.1", "45249", "g22472", "i0", "57.5", "2.25555555555556", "40", "17", "44.4", "0", "1", "120", "1440", "1479", "KAG7598815.1 GAG-pre-integrase domain [Arabidopsis suecica]", "diamond", "609", "53.9", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Magnoliopsida", "Brassicales", "Brassicaceae", "Arabidopsis", "Arabidopsis suecica"], [32674699, "PRJNA698538_S_NODE_11620_length_336_cov_2.490494_g11454_i0", "PRJNA698538", "11620", "336", "2.490494", "8.36805984", "Cryptomeria japonica", "3369", "Plants", "Plants", "87", "3.31e-17", "", "NR", "GLJ22641.1", "3369", "g11454", "i0", "46.8", "0.991071428571429", "111", "56", "99.1", "1", "334", "2", "1783", "1890", "GLJ22641.1 hypothetical protein SUGI_0426380 [Cryptomeria japonica]", "diamond", "333", "87", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Pinopsida", "Cupressales", "Cupressaceae", "Cryptomeria", "Cryptomeria japonica"], [32769239, "PRJNA698538_S_NODE_12100_length_332_cov_5.015444_g11934_i0", "PRJNA698538", "12100", "332", "5.015444", "16.65127408", "Sphagnum fallax", "53036", "Plants", "Plants", "102", "8.89e-23", "", "NR", "KAH8948750.1", "53036", "g11934", "i0", "51.4", "1.00301204819277", "111", "51", "99.4", "2", "3", "332", "76", "184", "KAH8948750.1 hypothetical protein BDL97_11G109700 [Sphagnum fallax]", "diamond", "333", "102", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Sphagnopsida", "Sphagnales", "Sphagnaceae", "Sphagnum", "Sphagnum fallax"], [32769241, "PRJNA698538_S_NODE_18440_length_292_cov_1.757991_g18274_i0", "PRJNA698538", "18440", "292", "1.757991", "5.13333372", "Cryptomeria japonica", "3369", "Plants", "Plants", "55.8", "1.48e-6", "", "NR", "XP_057817356.1", "3369", "g18274", "i0", "64.9", "0.729452054794521", "37", "13", "38", "0", "2", "112", "279", "315", "XP_057817356.1 protein EXORDIUM-like 2 [Cryptomeria japonica]", "diamond", "213", "55.8", "1", "Eukaryota", "Embryophyta", "Viridiplantae", "Streptophyta", "Pinopsida", "Cupressales", "Cupressaceae", "Cryptomeria", "Cryptomeria japonica"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 25, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_clade\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA698538", "p2": "Embryophyta"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta", "results": [{"value": "PRJNA698538", "label": "PRJNA698538", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_clade=Embryophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta", "results": [{"value": "Embryophyta", "label": "Embryophyta", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta", "results": [{"value": "Viridiplantae", "label": "Viridiplantae", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta&tax_kingdom=Viridiplantae", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta", "results": [{"value": "Streptophyta", "label": "Streptophyta", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA698538&tax_clade=Embryophyta&tax_phylum=Streptophyta", "selected": false}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 389.09837499977584}