{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA558770\" and tax_phylum = \"Chordata\"", "rows": [[10745956, "PRJNA558770_P_NODE_3889_length_811_cov_21.768041_g2869_i0", "PRJNA558770", "3889", "811", "21.768041", "176.53881251", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "386", "3.49e-125", "", "NR", "NP_031430.2", "10090", "g2869", "i0", "58.2", "9.29593094944513", "359", "35", "99.9", "4", "810", "1", "343", "675", "NP_031430.2 disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 9 isoform 2 precursor [Mus musculus]", "diamond", "7539", "386", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [26952222, "PRJNA558770_P_NODE_394542_length_161_cov_12.880952_g392537_i0", "PRJNA558770", "394542", "161", "12.880952", "20.73833272", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "43.1", "0.00182", "", "NR", "EDL00036.1", "10090", "g392537", "i0", "66.7", "0.559006211180124", "30", "10", "55.9", "0", "62", "151", "32", "61", "EDL00036.1 mCG146956 [Mus musculus]", "diamond", "90", "43.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [27521235, "PRJNA558770_P_NODE_347443_length_233_cov_1.853535_g345438_i0", "PRJNA558770", "347443", "233", "1.853535", "4.31873655", "Varanus komodoensis", "61221", "Chordata", "Chordata", "45.8", "0.00274", "", "NR", "KAF7254327.1", "61221", "g345438", "i0", "79.2", "1.51931330472103", "24", "5", "30.9", "0", "160", "231", "162", "185", "KAF7254327.1 Tudor domain-containing protein 1 [Varanus komodoensis]", "diamond", "354", "45.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Lepidosauria", "Squamata", "Varanidae", "Varanus", "Varanus komodoensis"], [27552592, "PRJNA558770_P_NODE_114864_length_234_cov_9.884422_g112859_i0", "PRJNA558770", "114864", "234", "9.884422", "23.12954748", "Cricetulus griseus", "10029", "Chordata", "Chordata", "54.3", "2.26e-6", "", "NR", "XP_035300100.1", "10029", "g112859", "i0", "60.5", "0.974358974358974", "76", "8", "97.4", "1", "233", "6", "57", "110", "XP_035300100.1 uncharacterized protein LOC118238741 [Cricetulus griseus]", "diamond", "228", "54.3", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Cricetidae", "Cricetulus", "Cricetulus griseus"], [27931724, "PRJNA558770_P_NODE_139165_length_234_cov_7.261307_g137160_i0", "PRJNA558770", "139165", "234", "7.261307", "16.99145838", "Bos mutus", "72004", "Chordata", "Chordata", "49.3", "1.61e-4", "", "NR", "MXQ87451.1", "72004", "g137160", "i0", "96", "0.320512820512821", "25", "1", "32.1", "0", "2", "76", "174", "198", "MXQ87451.1 hypothetical protein [Bos mutus]", "diamond", "75", "49.3", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos mutus"], [27963303, "PRJNA558770_P_NODE_268585_length_234_cov_1.934673_g266580_i0", "PRJNA558770", "268585", "234", "1.934673", "4.52713482", "Engystomops pustulosus", "76066", "Chordata", "Chordata", "44.7", "0.00169", "", "NR", "KAG8571038.1", "76066", "g266580", "i0", "79.2", "5.84615384615385", "24", "5", "30.8", "0", "73", "2", "14", "37", "KAG8571038.1 hypothetical protein GDO81_011511 [Engystomops pustulosus]", "diamond", "1368", "44.7", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Amphibia", "Anura", "Leptodactylidae", "Engystomops", "Engystomops pustulosus"], [28121208, "PRJNA558770_P_NODE_392945_length_166_cov_14.351145_g390940_i0", "PRJNA558770", "392945", "166", "14.351145", "23.8229007", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "57", "7.08e-8", "", "NR", "BAE33644.1", "10090", "g390940", "i0", "62.3", "0.957831325301205", "53", "20", "95.8", "0", "2", "160", "131", "183", "BAE33644.1 unnamed protein product, partial [Mus musculus]", "diamond", "159", "57", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [28184113, "PRJNA558770_P_NODE_292766_length_234_cov_1.497487_g290761_i0", "PRJNA558770", "292766", "234", "1.497487", "3.50411958", "Engystomops pustulosus", "76066", "Chordata", "Chordata", "45.1", "0.00511", "", "NR", "KAG8571490.1", "76066", "g290761", "i0", "75", "19.3846153846154", "24", "6", "30.8", "0", "74", "3", "1134", "1157", "KAG8571490.1 hypothetical protein GDO81_011667 [Engystomops pustulosus]", "diamond", "4536", "45.4", "0.993392070484582", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Amphibia", "Anura", "Leptodactylidae", "Engystomops", "Engystomops pustulosus"], [28292973, "PRJNA558770_P_NODE_223926_length_234_cov_2.979899_g221921_i0", "PRJNA558770", "223926", "234", "2.979899", "6.97296366", "Aves", "8782", "Chordata", "Chordata", "42.4", "0.0419", "", "NR", "KQL33115.1", "12930", "g221921", "i0", "72", "2.56410256410256", "25", "7", "32.1", "0", "76", "2", "254", "278", "KQL33115.1 hypothetical protein AAES_29678 [Amazona aestiva]", "diamond", "600", "42.7", "0.992974238875878", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Psittaciformes", "Psittacidae", "Amazona", "Amazona aestiva"], [28373681, "PRJNA558770_P_NODE_161886_length_234_cov_5.643216_g159881_i0", "PRJNA558770", "161886", "234", "5.643216", "13.20512544", "Grus japonensis", "30415", "Chordata", "Chordata", "50.4", "3.14e-5", "", "NR", "GAB0193063.1", "30415", "g159881", "i0", "38", "1.83333333333333", "71", "37", "91", "1", "7", "219", "22", "85", "GAB0193063.1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha [Grus japonensis]", "diamond", "429", "50.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Gruiformes", "Gruidae", "Grus", "Grus japonensis"], [28437093, "PRJNA558770_P_NODE_392506_length_168_cov_3.120301_g390501_i0", "PRJNA558770", "392506", "168", "3.120301", "5.24210568", "Staurois parvus", "386267", "Chordata", "Chordata", "73.6", "3.06e-15", "", "NR", "CAI9547784.1", "386267", "g390501", "i0", "57.4", "1.92857142857143", "54", "23", "96.4", "0", "162", "1", "6", "59", "CAI9547784.1 unnamed protein product, partial [Staurois parvus]", "diamond", "324", "73.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Amphibia", "Anura", "Ranidae", "Staurois", "Staurois parvus"], [28910260, "PRJNA558770_P_NODE_78068_length_236_cov_2.810945_g76063_i0", "PRJNA558770", "78068", "236", "2.810945", "6.6338302", "Mauremys mutica", "74926", "Chordata", "Chordata", "50.4", "2.05e-5", "", "NR", "KAH1176600.1", "74926", "g76063", "i0", "52.6", "0.851694915254237", "38", "18", "48.3", "0", "31", "144", "98", "135", "KAH1176600.1 hypothetical protein KIL84_010302, partial [Mauremys mutica]", "diamond", "201", "50.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", null, "Testudines", "Geoemydidae", "Mauremys", "Mauremys mutica"], [29478595, "PRJNA558770_P_NODE_244310_length_234_cov_2.437186_g242305_i0", "PRJNA558770", "244310", "234", "2.437186", "5.70301524", "Scyliorhinus canicula", "7830", "Chordata", "Chordata", "43.5", "0.0127", "", "NR", "XP_038659988.1", "7830", "g242305", "i0", "89.5", "0.756410256410256", "19", "2", "24.4", "0", "219", "163", "101", "119", "XP_038659988.1 glutaredoxin-like protein C5orf63 homolog isoform X2 [Scyliorhinus canicula]", "diamond", "177", "43.5", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Chondrichthyes", "Carcharhiniformes", "Scyliorhinidae", "Scyliorhinus", "Scyliorhinus canicula"], [29573378, "PRJNA558770_P_NODE_133070_length_234_cov_7.819095_g131065_i0", "PRJNA558770", "133070", "234", "7.819095", "18.2966823", "Muntiacus muntjak", "9888", "Chordata", "Chordata", "46.6", "8.44e-4", "", "NR", "KAB0337909.1", "9888", "g131065", "i0", "87.5", "0.615384615384615", "24", "3", "30.8", "0", "2", "73", "151", "174", "KAB0337909.1 hypothetical protein FD754_024923, partial [Muntiacus muntjak]", "diamond", "144", "46.6", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Cervidae", "Muntiacus", "Muntiacus muntjak"], [29699470, "PRJNA558770_P_NODE_265790_length_234_cov_1.984925_g263785_i0", "PRJNA558770", "265790", "234", "1.984925", "4.6447245", "Crocuta crocuta", "9678", "Chordata", "Chordata", "47", "3.87e-4", "", "NR", "KAF0886930.1", "9678", "g263785", "i0", "90", "1.11538461538462", "20", "2", "25.6", "0", "74", "15", "14", "33", "KAF0886930.1 LORF2 protein, partial [Crocuta crocuta]", "diamond", "261", "47", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Hyaenidae", "Crocuta", "Crocuta crocuta"], [30314639, "PRJNA558770_P_NODE_315292_length_233_cov_10.353535_g313287_i0", "PRJNA558770", "315292", "233", "10.353535", "24.12373655", "Mammalia", "40674", "Chordata", "Chordata", "45.4", "0.00355", "", "NR", "XP_049562359.1", "9733", "g313287", "i0", "37.6", "5.39484978540773", "101", "35", "94", "2", "222", "4", "179", "279", "XP_049562359.1 protein farnesyltransferase subunit beta isoform X3 [Orcinus orca]", "diamond", "1257", "45.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Delphinidae", "Orcinus", "Orcinus orca"], [31121161, "PRJNA558770_P_NODE_122535_length_234_cov_8.909548_g120530_i0", "PRJNA558770", "122535", "234", "8.909548", "20.84834232", "Loxodonta africana", "9785", "Chordata", "Chordata", "44.7", "0.00696", "", "NR", "XP_064145590.1", "9785", "g120530", "i0", "79.2", "0.307692307692308", "24", "5", "30.8", "0", "3", "74", "888", "911", "XP_064145590.1 LOW QUALITY PROTEIN: ankyrin repeat domain-containing protein 42 [Loxodonta africana]", "diamond", "72", "44.7", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Proboscidea", "Elephantidae", "Loxodonta", "Loxodonta africana"], [31215948, "PRJNA558770_P_NODE_247795_length_234_cov_2.356784_g245790_i0", "PRJNA558770", "247795", "234", "2.356784", "5.51487456", "Charadrius vociferus", "50402", "Chordata", "Chordata", "52.4", "1.38e-5", "", "NR", "XP_009883999.1", "50402", "g245790", "i0", "91.7", "0.307692307692308", "24", "2", "30.8", "0", "4", "75", "412", "435", "XP_009883999.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC104287046, partial [Charadrius vociferus]", "diamond", "72", "52.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Charadriiformes", "Charadriidae", "Charadrius", "Charadrius vociferus"], [31374675, "PRJNA558770_P_NODE_393436_length_165_cov_2.738462_g391431_i0", "PRJNA558770", "393436", "165", "2.738462", "4.5184623", "Prionailurus viverrinus", "61388", "Chordata", "Chordata", "72", "6.06e-13", "", "NR", "XP_047697379.1", "61388", "g391431", "i0", "94.3", "0.636363636363636", "35", "2", "63.6", "0", "105", "1", "326", "360", "XP_047697379.1 interleukin enhancer-binding factor 2 isoform X2 [Prionailurus viverrinus]", "diamond", "105", "72", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Felidae", "Prionailurus", "Prionailurus viverrinus"], [31469553, "PRJNA558770_P_NODE_193116_length_234_cov_4.055276_g191111_i0", "PRJNA558770", "193116", "234", "4.055276", "9.48934584", "Tinamus guttatus", "94827", "Chordata", "Chordata", "52.8", "9.85e-6", "", "NR", "XP_010212325.1", "94827", "g191111", "i0", "96", "0.320512820512821", "25", "1", "32.1", "0", "234", "160", "142", "166", "XP_010212325.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC104567219, partial [Tinamus guttatus]", "diamond", "75", "52.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Tinamiformes", "Tinamidae", "Tinamus", "Tinamus guttatus"], [31532818, "PRJNA558770_P_NODE_151436_length_234_cov_6.316583_g149431_i0", "PRJNA558770", "151436", "234", "6.316583", "14.78080422", "Kogia breviceps", "27615", "Chordata", "Chordata", "49.3", "1.67e-4", "", "NR", "XP_066867270.1", "27615", "g149431", "i0", "88", "0.320512820512821", "25", "3", "32.1", "0", "234", "160", "699", "723", "XP_066867270.1 constitutive coactivator of peroxisome proliferator-activated receptor gamma isoform X4 [Kogia breviceps]", "diamond", "75", "49.3", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Physeteridae", "Kogia", "Kogia breviceps"], [31564540, "PRJNA558770_P_NODE_247616_length_234_cov_2.361809_g245611_i0", "PRJNA558770", "247616", "234", "2.361809", "5.52663306", "Staurois parvus", "386267", "Chordata", "Chordata", "58.2", "8.11e-9", "", "NR", "CAI9547784.1", "386267", "g245611", "i0", "38.5", "1", "78", "46", "97.4", "1", "229", "2", "11", "88", "CAI9547784.1 unnamed protein product, partial [Staurois parvus]", "diamond", "234", "58.2", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Amphibia", "Anura", "Ranidae", "Staurois", "Staurois parvus"], [31848932, "PRJNA558770_P_NODE_362317_length_232_cov_5.446701_g360312_i0", "PRJNA558770", "362317", "232", "5.446701", "12.63634632", "Ovis aries", "9940", "Chordata", "Chordata", "57.4", "4.37e-8", "", "NR", "KAG5207521.1", "9940", "g360312", "i0", "100", "0.310344827586207", "24", "0", "31", "0", "73", "2", "118", "141", "KAG5207521.1 hypothetical protein JEQ12_017285 [Ovis aries]", "diamond", "72", "57.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Ovis", "Ovis aries"], [32545305, "PRJNA558770_P_NODE_379959_length_218_cov_3.207650_g377954_i0", "PRJNA558770", "379959", "218", "3.20765", "6.992677", "Equus caballus", "9796", "Chordata", "Chordata", "43.1", "0.0197", "", "NR", "XP_070092295.1", "9796", "g377954", "i0", "42.7", "1.12844036697248", "82", "34", "95", "5", "4", "210", "446", "527", "XP_070092295.1 paired box protein Pax-8 isoform X2 [Equus caballus]", "diamond", "246", "43.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Perissodactyla", "Equidae", "Equus", "Equus caballus"], [32734197, "PRJNA558770_P_NODE_178240_length_234_cov_4.728643_g176235_i0", "PRJNA558770", "178240", "234", "4.728643", "11.06502462", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "52.4", "1.3e-5", "", "NR", "DAA19446.1", "9913", "g176235", "i0", "91.7", "0.307692307692308", "24", "2", "30.8", "0", "161", "232", "116", "139", "DAA19446.1 TPA: repressor transcriptional factor-like [Bos taurus]", "diamond", "72", "52.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 25, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA558770", "p2": "Chordata"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "PRJNA558770", "label": "PRJNA558770", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Opisthokonta", "label": "Opisthokonta", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata&tax_clade=Opisthokonta", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Metazoa", "label": "Metazoa", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata&tax_kingdom=Metazoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Chordata", "label": "Chordata", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA558770", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 217.24312600053963}