{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA493828\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[22783628, "PRJNA493828_P_NODE_25278_length_270_cov_1.172589_g24859_i0", "PRJNA493828", "25278", "270", "1.172589", "3.1659903", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "95.9", "1.59e-21", "", "NR", "WP_088564899.1", "959", "g24859", "i0", "67.9", "2.72222222222222", "81", "24", "87.8", "1", "239", "3", "1", "81", "WP_088564899.1 hypothetical protein [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "735", "95.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [27123801, "PRJNA493828_P_NODE_31442_length_252_cov_2.173184_g31023_i0", "PRJNA493828", "31442", "252", "2.173184", "5.47642368", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "135", "1.6e-38", "", "NR", "MBC7741563.1", "28201", "g31023", "i0", "72.6", "7", "84", "23", "100", "0", "1", "252", "26", "109", "MBC7741563.1 DoxX family protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "1764", "136", "0.992647058823529", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [27677430, "PRJNA493828_P_NODE_41484_length_235_cov_3.074074_g41065_i0", "PRJNA493828", "41484", "235", "3.074074", "7.2240739", "Pseudobdellovibrio sp.", "2862747", "Bacteria", "Bacteria", "58.9", "6.56e-8", "", "NR", "MFN3696400.1", "2862747", "g41065", "i0", "75.8", "1.26382978723404", "33", "8", "42.1", "0", "136", "234", "1", "33", "MFN3696400.1 cysteine--tRNA ligase [Pseudobdellovibrio sp.]", "diamond", "297", "58.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp."], [27740603, "PRJNA493828_P_NODE_46264_length_209_cov_4.948529_g45845_i0", "PRJNA493828", "46264", "209", "4.948529", "10.34242561", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "97.8", "4.43e-22", "", "NR", "MBX3020441.1", "2053517", "g45845", "i0", "65.2", "1.99521531100478", "69", "24", "99", "0", "1", "207", "232", "300", "MBX3020441.1 radical SAM family heme chaperone HemW [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "417", "97.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29019134, "PRJNA493828_P_NODE_30368_length_255_cov_1.956044_g29949_i0", "PRJNA493828", "30368", "255", "1.956044", "4.9879122", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "150", "5.85e-40", "", "NR", "HVK61956.1", "2053517", "g29949", "i0", "87.5", "2.82352941176471", "80", "10", "94.1", "0", "251", "12", "749", "828", "HVK61956.1 DNA polymerase III subunit alpha [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "720", "150", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30266787, "PRJNA493828_P_NODE_25092_length_270_cov_2.319797_g24673_i0", "PRJNA493828", "25092", "270", "2.319797", "6.2634519", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "109", "1.4e-25", "", "NR", "MFN8792485.1", "2053517", "g24673", "i0", "66.7", "2.82222222222222", "84", "28", "93.3", "0", "267", "16", "460", "543", "MFN8792485.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "762", "109", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30298533, "PRJNA493828_P_NODE_41232_length_236_cov_2.914110_g40813_i0", "PRJNA493828", "41232", "236", "2.91411", "6.8772996", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "94.7", "3.36e-23", "", "NR", "PZQ43931.1", "349221", "g40813", "i0", "84.7", "1.5", "59", "8", "73.7", "1", "63", "236", "1", "59", "PZQ43931.1 MAG: 50S ribosomal protein L21 [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "354", "94.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [30393295, "PRJNA493828_P_NODE_30193_length_255_cov_3.615385_g29774_i0", "PRJNA493828", "30193", "255", "3.615385", "9.21923175", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "54.7", "1.2e-7", "", "NR", "HLB58800.1", "3034175", "g29774", "i0", "61.9", "0.494117647058824", "42", "16", "49.4", "0", "240", "115", "6", "47", "HLB58800.1 DUF2283 domain-containing protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "126", "54.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [30993207, "PRJNA493828_P_NODE_15274_length_310_cov_3.156118_g14855_i0", "PRJNA493828", "15274", "310", "3.156118", "9.7839658", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "55.5", "1.66e-6", "", "NR", "PZP55900.1", "349221", "g14855", "i0", "54.2", "0.464516129032258", "48", "22", "46.5", "0", "163", "306", "50", "97", "PZP55900.1 MAG: hypothetical protein DI586_05470 [Micavibrio aeruginosavorus]", "diamond", "144", "55.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [32574889, "PRJNA493828_P_NODE_47279_length_203_cov_5.330769_g46860_i0", "PRJNA493828", "47279", "203", "5.330769", "10.82146107", "Micavibrio sp.", "2024841", "Bacteria", "Bacteria", "44.7", "0.00457", "", "NR", "MFA5591923.1", "2024841", "g46860", "i0", "41.4", "0.857142857142857", "58", "31", "81.3", "1", "167", "3", "24", "81", "MFA5591923.1 TcpQ domain-containing protein [Micavibrio sp.]", "diamond", "174", "44.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio sp."], [32794767, "PRJNA493828_P_NODE_14600_length_310_cov_4.421941_g14181_i0", "PRJNA493828", "14600", "310", "4.421941", "13.7080171", "Micavibrio sp.", "2024841", "Bacteria", "Bacteria", "92.8", "1.84e-19", "", "NR", "MDE1153379.1", "2024841", "g14181", "i0", "67.1", "0.67741935483871", "70", "23", "67.7", "0", "309", "100", "413", "482", "MDE1153379.1 signal recognition particle protein [Micavibrio sp.]", "diamond", "210", "92.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio sp."]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 11, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA493828", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA493828", "label": "PRJNA493828", "count": 11, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 11, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 11, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 11, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 11, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA493828", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 370.79468600131804}