{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA436017\" and tax_phylum = \"Bacillariophyta\"", "rows": [[430674, "PRJNA436017_P_NODE_1581_length_751_cov_2.628852_g1371_i0", "PRJNA436017", "1581", "751", "2.628852", "19.74267852", "Chaetoceros tenuissimus", "426638", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "198", "3.6e-60", "", "NR", "GFH59293.1", "426638", "g1371", "i0", "53.6", "3.73102529960053", "181", "83", "72.3", "1", "734", "192", "1", "180", "GFH59293.1 RL9, ribosomal protein 9 [Chaetoceros tenuissimus]", "diamond", "2802", "198", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Chaetocerotales", "Chaetocerotaceae", "Chaetoceros", "Chaetoceros tenuissimus"], [4257555, "PRJNA436017_P_NODE_10384_length_267_cov_2.521739_g10086_i0", "PRJNA436017", "10384", "267", "2.521739", "6.73304313", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "147", "1.31e-43", "", "NR", "AID23573.1", "2850", "g10086", "i0", "76.1", "3.95505617977528", "88", "21", "98.9", "0", "266", "3", "5", "92", "AID23573.1 ribosomal protein, partial [Phaeodactylum tricornutum]", "diamond", "1056", "147", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [4257769, "PRJNA436017_P_NODE_20864_length_179_cov_1.373239_g20566_i0", "PRJNA436017", "20864", "179", "1.373239", "2.45809781", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "110", "3.01e-26", "", "NR", "KAK1744626.1", "267567", "g20566", "i0", "89.8", "9.88826815642458", "59", "6", "98.9", "0", "178", "2", "2047", "2105", "KAK1744626.1 methionine synthase, vitamin B12-dependent, partial [Skeletonema marinoi]", "diamond", "1770", "110", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Skeletonemataceae", "Skeletonema", "Skeletonema marinoi"], [5534467, "PRJNA436017_P_NODE_19405_length_186_cov_1.033557_g19107_i0", "PRJNA436017", "19405", "186", "1.033557", "1.92241602", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "134", "6.47e-38", "", "NR", "CAJ1953473.1", "2856", "g19107", "i0", "93.4", "8.85483870967742", "61", "4", "98.4", "0", "2", "184", "91", "151", "CAJ1953473.1 unnamed protein product [Cylindrotheca closterium]", "diamond", "1647", "135", "0.992592592592593", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Cylindrotheca", "Cylindrotheca closterium"], [11292208, "PRJNA436017_P_NODE_20449_length_181_cov_1.076389_g20151_i0", "PRJNA436017", "20449", "181", "1.076389", "1.94826409", "Bacillariophyta", "2836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "87.4", "2.18e-18", "", "NR", "KAI2508213.1", "210448", "g20151", "i0", "62.5", "8.10497237569061", "64", "19", "97.8", "1", "179", "3", "6", "69", "KAI2508213.1 Type III restriction enzyme [Fragilaria crotonensis]", "diamond", "1467", "88.2", "0.99092970521542", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Fragilariophyceae", "Fragilariales", "Fragilariaceae", "Fragilaria", "Fragilaria crotonensis"], [13184474, "PRJNA436017_P_NODE_2311_length_624_cov_1.691652_g2062_i0", "PRJNA436017", "2311", "624", "1.691652", "10.55590848", "Seminavis robusta", "568900", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "214", "8.13e-62", "", "NR", "CAB9526840.1", "568900", "g2062", "i0", "59.6", "1.85576923076923", "193", "72", "92.8", "3", "579", "1", "5", "191", "CAB9526840.1 shock protein 81-1 [Seminavis robusta]", "diamond", "1158", "214", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Seminavis", "Seminavis robusta"], [14459852, "PRJNA436017_P_NODE_9112_length_289_cov_1.472222_g8814_i0", "PRJNA436017", "9112", "289", "1.472222", "4.25472158", "Cyclotella cryptica", "29204", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "189", "1.58e-57", "", "NR", "AAX09600.1", "29204", "g8814", "i0", "91.7", "0.996539792387543", "96", "8", "99.7", "0", "1", "288", "220", "315", "AAX09600.1 elongation factor 1 alpha, partial [Cyclotella cryptica]", "diamond", "288", "189", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella cryptica"], [22107610, "PRJNA436017_P_NODE_7678_length_320_cov_1.240283_g7381_i0", "PRJNA436017", "7678", "320", "1.240283", "3.9689056", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "130", "1.98e-32", "", "NR", "ANG60896.1", "267567", "g7381", "i0", "64.1", "3.721875", "92", "33", "86.3", "0", "43", "318", "71", "162", "ANG60896.1 heat shock protein 90 [Skeletonema marinoi]", "diamond", "1191", "131", "0.99236641221374", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Skeletonemataceae", "Skeletonema", "Skeletonema marinoi"], [26759221, "PRJNA436017_P_NODE_21561_length_176_cov_1.402878_g21263_i0", "PRJNA436017", "21561", "176", "1.402878", "2.46906528", "Chaetoceros tenuissimus", "426638", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "61.6", "3.27e-9", "", "NR", "GFH51745.1", "426638", "g21263", "i0", "54.1", "2.01136363636364", "61", "22", "95.5", "3", "168", "1", "480", "539", "GFH51745.1 t-complex protein 1 gamma subunit [Chaetoceros tenuissimus]", "diamond", "354", "61.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Chaetocerotales", "Chaetocerotaceae", "Chaetoceros", "Chaetoceros tenuissimus"], [26791106, "PRJNA436017_P_NODE_27541_length_156_cov_0.857143_g27243_i0", "PRJNA436017", "27541", "156", "0.857143", "1.33714308", "Thalassiosira pseudonana CCMP1335", "296543", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "97.8", "2.03e-22", "", "NR", "XP_002287004.1", "296543", "g27243", "i0", "86.3", "1.96153846153846", "51", "7", "98.1", "0", "2", "154", "287", "337", "XP_002287004.1 predicted protein [Thalassiosira pseudonana CCMP1335]", "diamond", "306", "97.8", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Thalassiosiraceae", "Thalassiosira", "Thalassiosira pseudonana"], [26902601, "PRJNA436017_P_NODE_10141_length_271_cov_1.393162_g9843_i0", "PRJNA436017", "10141", "271", "1.393162", "3.77546902", "Cylindrotheca", "2852", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "63.2", "3.41e-9", "", "NR", "CAJ1939047.1", "2856", "g9843", "i0", "44.9", "1.52767527675277", "69", "34", "72", "1", "77", "271", "386", "454", "CAJ1939047.1 unnamed protein product [Cylindrotheca closterium]", "diamond", "414", "63.5", "0.995275590551181", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Cylindrotheca", "Cylindrotheca closterium"], [27581291, "PRJNA436017_P_NODE_21144_length_178_cov_1.106383_g20846_i0", "PRJNA436017", "21144", "178", "1.106383", "1.96936174", "Phaeodactylum tricornutum CCAP 1", "2850", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "58.5", "4.1e-8", "", "NR", "XP_002183371.1", "556484", "g20846", "i0", "46.6", "0.97752808988764", "58", "31", "97.8", "0", "177", "4", "243", "300", "XP_002183371.1 reductase with NAD or NADP as acceptor [Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1]", "diamond", "174", "58.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [27644736, "PRJNA436017_P_NODE_14884_length_215_cov_2.191011_g14586_i0", "PRJNA436017", "14884", "215", "2.191011", "4.71067365", "Cyclotella cryptica", "29204", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "48.9", "1.45e-4", "", "NR", "KAL3780735.1", "29204", "g14586", "i0", "41.5", "1.78604651162791", "65", "36", "89.3", "2", "192", "1", "28", "91", "KAL3780735.1 hypothetical protein HJC23_001017 [Cyclotella cryptica]", "diamond", "384", "48.9", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella cryptica"], [28071316, "PRJNA436017_P_NODE_9425_length_283_cov_1.556911_g9127_i0", "PRJNA436017", "9425", "283", "1.556911", "4.40605813", "Coscinodiscophyceae", "33836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "88.6", "5.49e-20", "", "NR", "EJK58599.1", "159749", "g9127", "i0", "60.8", "4.72791519434629", "74", "23", "72.1", "1", "283", "80", "71", "144", "EJK58599.1 hypothetical protein THAOC_21264 [Thalassiosira oceanica]", "diamond", "1338", "88.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Thalassiosiraceae", "Thalassiosira", "Thalassiosira oceanica"], [28260652, "PRJNA436017_P_NODE_9086_length_289_cov_3.154762_g8788_i0", "PRJNA436017", "9086", "289", "3.154762", "9.11726218", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "81.3", "2.56e-17", "", "NR", "YP_010047250.1", "444606", "g8788", "i0", "43.6", "4.91003460207612", "94", "52", "97.6", "1", "283", "2", "20", "112", "YP_010047250.1 ribosomal protein L14 [Eucampia zodiacus]", "diamond", "1419", "81.3", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Mediophyceae", "Hemiaulales", "Hemiaulaceae", "Eucampia", "Eucampia zodiacus"], [28528763, "PRJNA436017_P_NODE_24147_length_166_cov_1.209302_g23849_i0", "PRJNA436017", "24147", "166", "1.209302", "2.00744132", "Bacillariaceae sp.", "3061772", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "86.7", "3.52e-18", "", "NR", "KAL3904963.1", "3061772", "g23849", "i0", "74.5", "3.97590361445783", "55", "14", "99.4", "0", "2", "166", "332", "386", "KAL3904963.1 MAG: hypothetical protein SGARI_004678 [Bacillariaceae sp.]", "diamond", "660", "86.7", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", null, "Bacillariaceae sp."], [28812417, "PRJNA436017_P_NODE_24768_length_164_cov_1.212598_g24470_i0", "PRJNA436017", "24768", "164", "1.212598", "1.98866072", "Chaetoceros tenuissimus", "426638", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "85.9", "7.96e-18", "", "NR", "GFH45451.1", "426638", "g24470", "i0", "72.2", "1.97560975609756", "54", "15", "98.8", "0", "3", "164", "564", "617", "GFH45451.1 PLP-dependent transferase [Chaetoceros tenuissimus]", "diamond", "324", "85.9", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Chaetocerotales", "Chaetocerotaceae", "Chaetoceros", "Chaetoceros tenuissimus"], [28844139, "PRJNA436017_P_NODE_16308_length_204_cov_1.634731_g16010_i0", "PRJNA436017", "16308", "204", "1.634731", "3.33485124", "Phaeodactylum tricornutum", "2850", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "61.6", "3.55e-10", "", "NR", "AID23596.1", "2850", "g16010", "i0", "49.2", "0.897058823529412", "61", "31", "89.7", "0", "204", "22", "57", "117", "AID23596.1 putative voltage-dependent anion-selective channel protein, partial [Phaeodactylum tricornutum]", "diamond", "183", "61.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [29191751, "PRJNA436017_P_NODE_27189_length_156_cov_2.571429_g26891_i0", "PRJNA436017", "27189", "156", "2.571429", "4.01142924", "Melosira undulata", "2133757", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "68.6", "7.08e-12", "", "NR", "YP_009485500.1", "2133757", "g26891", "i0", "66.7", "2.75", "48", "16", "92.3", "0", "144", "1", "3", "50", "YP_009485500.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Melosira undulata]", "diamond", "429", "68.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Melosirales", "Melosiraceae", "Melosira", "Melosira undulata"], [29443987, "PRJNA436017_P_NODE_23090_length_170_cov_1.157895_g22792_i0", "PRJNA436017", "23090", "170", "1.157895", "1.9684215", "Phaeodactylum tricornutum CCAP 1", "2850", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "60.1", "9.49e-9", "", "NR", "XP_002183496.1", "556484", "g22792", "i0", "57.8", "3.28235294117647", "45", "19", "79.4", "0", "145", "11", "92", "136", "XP_002183496.1 predicted protein, partial [Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1]", "diamond", "558", "60.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [29934473, "PRJNA436017_P_NODE_28751_length_152_cov_1.356522_g28453_i0", "PRJNA436017", "28751", "152", "1.356522", "2.06191344", "Coscinodiscophyceae", "33836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "46.2", "6.39e-4", "", "NR", "KAL3760247.1", "259834", "g28453", "i0", "51.3", "1.5", "39", "19", "77", "0", "151", "35", "295", "333", "KAL3760247.1 hypothetical protein ACHAWU_001757 [Discostella pseudostelligera]", "diamond", "228", "46.2", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Discostella", "Discostella pseudostelligera"], [29981102, "PRJNA436017_P_NODE_18931_length_188_cov_1.549669_g18633_i0", "PRJNA436017", "18931", "188", "1.549669", "2.91337772", "Cylindrotheca closterium", "2856", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "57", "1.66e-7", "", "NR", "CAJ1936289.1", "2856", "g18633", "i0", "46.8", "2.96808510638298", "62", "33", "98.9", "0", "186", "1", "273", "334", "CAJ1936289.1 unnamed protein product [Cylindrotheca closterium]", "diamond", "558", "57", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Cylindrotheca", "Cylindrotheca closterium"], [30692517, "PRJNA436017_P_NODE_25053_length_163_cov_1.230159_g24755_i0", "PRJNA436017", "25053", "163", "1.230159", "2.00515917", "Cyclotella", "29203", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "57.4", "8.28e-8", "", "NR", "KAL3805288.1", "29204", "g24755", "i0", "52.9", "1.87730061349693", "51", "24", "93.9", "0", "163", "11", "177", "227", "KAL3805288.1 hypothetical protein HJC23_008995 [Cyclotella cryptica]", "diamond", "306", "57.4", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella cryptica"], [30897500, "PRJNA436017_P_NODE_26634_length_158_cov_1.289256_g26336_i0", "PRJNA436017", "26634", "158", "1.289256", "2.03702448", "Chaetoceros tenuissimus", "426638", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "55.5", "3.78e-7", "", "NR", "GFH60747.1", "426638", "g26336", "i0", "51", "1.91772151898734", "49", "24", "93", "0", "148", "2", "142", "190", "GFH60747.1 hypothetical protein CTEN210_17223 [Chaetoceros tenuissimus]", "diamond", "303", "55.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Chaetocerotales", "Chaetocerotaceae", "Chaetoceros", "Chaetoceros tenuissimus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 24, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA436017", "p2": "Bacillariophyta"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "PRJNA436017", "label": "PRJNA436017", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Bacillariophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Sar", "label": "Sar", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta&tax_clade=Sar", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Bacillariophyta", "label": "Bacillariophyta", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA436017", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 440.30609901528805}