{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA1195374\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[8695727, "PRJNA1195374_P_NODE_44527_length_332_cov_2.081081_g44183_i0", "PRJNA1195374", "44527", "332", "2.081081", "6.90918892", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "189", "4.89e-59", "", "NR", "MCB0370127.1", "2053517", "g44183", "i0", "89.9", "7.87951807228916", "109", "10", "98.5", "1", "3", "329", "63", "170", "MCB0370127.1 40S ribosomal protein S14 [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "2616", "189", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [18173305, "PRJNA1195374_P_NODE_45115_length_330_cov_1.182879_g44771_i0", "PRJNA1195374", "45115", "330", "1.182879", "3.9035007", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "172", "9.65e-50", "", "NR", "WP_331339159.1", "28201", "g44771", "i0", "75.5", "21.6363636363636", "110", "27", "100", "0", "1", "330", "269", "378", "WP_331339159.1 cystathionine gamma-synthase [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "7140", "172", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [18173320, "PRJNA1195374_P_NODE_45675_length_327_cov_2.673228_g45331_i0", "PRJNA1195374", "45675", "327", "2.673228", "8.74145556", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "164", "2.46e-49", "", "NR", "MCB0370127.1", "2053517", "g45331", "i0", "88.7", "8.00917431192661", "97", "10", "89", "1", "36", "326", "72", "167", "MCB0370127.1 40S ribosomal protein S14 [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "2619", "164", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [26882747, "PRJNA1195374_P_NODE_58981_length_282_cov_1.669856_g58637_i0", "PRJNA1195374", "58981", "282", "1.669856", "4.70899392", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "58.2", "3.51e-8", "", "NR", "MBC7420391.1", "28201", "g58637", "i0", "40", "0.531914893617021", "50", "30", "53.2", "0", "277", "128", "93", "142", "MBC7420391.1 MAPEG family protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "150", "58.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [27009039, "PRJNA1195374_P_NODE_76862_length_247_cov_0.885057_g76518_i0", "PRJNA1195374", "76862", "247", "0.885057", "2.18609079", "Pseudobdellovibrio sp.", "2862747", "Bacteria", "Bacteria", "139", "5.45e-37", "", "NR", "MFN3698126.1", "2862747", "g76518", "i0", "85", "0.97165991902834", "80", "12", "97.2", "0", "244", "5", "415", "494", "MFN3698126.1 chemotaxis protein CheW [Pseudobdellovibrio sp.]", "diamond", "240", "139", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp."], [28039072, "PRJNA1195374_P_NODE_81265_length_244_cov_0.900585_g80921_i0", "PRJNA1195374", "81265", "244", "0.900585", "2.1974274", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "115", "3.74e-29", "", "NR", "MBC7466875.1", "28201", "g80921", "i0", "66.7", "1.97950819672131", "81", "27", "99.6", "0", "243", "1", "48", "128", "MBC7466875.1 GGDEF domain-containing protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "483", "115", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [28083062, "PRJNA1195374_P_NODE_69625_length_254_cov_1.276243_g69281_i0", "PRJNA1195374", "69625", "254", "1.276243", "3.24165722", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "57.4", "2.87e-7", "", "NR", "HUP56122.1", "3034175", "g69281", "i0", "48.6", "0.850393700787402", "72", "33", "85", "2", "251", "36", "83", "150", "HUP56122.1 TolC family protein [Bdellovibrionota bacterium]", "diamond", "216", "57.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [28177623, "PRJNA1195374_P_NODE_80866_length_244_cov_0.900585_g80522_i0", "PRJNA1195374", "80866", "244", "0.900585", "2.1974274", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "57.8", "1.84e-7", "", "NR", "MFN8790749.1", "2053517", "g80522", "i0", "41.3", "0.922131147540984", "75", "41", "88.5", "2", "221", "6", "536", "610", "MFN8790749.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "225", "57.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28304079, "PRJNA1195374_P_NODE_1286_length_1468_cov_2.609319_g1161_i0", "PRJNA1195374", "1286", "1468", "2.609319", "38.30480292", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "77.4", "2.16e-11", "", "NR", "MFN8790750.1", "2053517", "g1161", "i0", "37.5", "0.245231607629428", "120", "70", "24.3", "3", "1433", "1077", "208", "323", "MFN8790750.1 site-specific integrase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "360", "77.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [28493686, "PRJNA1195374_P_NODE_60487_length_278_cov_1.804878_g60143_i0", "PRJNA1195374", "60487", "278", "1.804878", "5.01756084", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "112", "1.02e-27", "", "NR", "MCB0369784.1", "2053517", "g60143", "i0", "65", "0.863309352517986", "80", "28", "86.3", "0", "243", "4", "183", "262", "MCB0369784.1 insulinase family protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "240", "112", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29535529, "PRJNA1195374_P_NODE_58970_length_282_cov_1.813397_g58626_i0", "PRJNA1195374", "58970", "282", "1.813397", "5.11377954", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "111", "1.51e-26", "", "NR", "MCB0336345.1", "2053517", "g58626", "i0", "54.4", "1.8936170212766", "90", "39", "95.7", "1", "273", "4", "322", "409", "MCB0336345.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "534", "111", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29629853, "PRJNA1195374_P_NODE_22150_length_482_cov_2.303178_g21806_i0", "PRJNA1195374", "22150", "482", "2.303178", "11.10131796", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "45.1", "0.0463", "", "NR", "MBC61350.1", "2026715", "g21806", "i0", "40.2", "0.510373443983402", "82", "37", "43.6", "3", "131", "340", "99", "180", "MBC61350.1 CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "246", "45.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [29693023, "PRJNA1195374_P_NODE_16150_length_563_cov_1.720408_g15809_i0", "PRJNA1195374", "16150", "563", "1.720408", "9.68589704", "Bacteriovorax sp. DB6_IX", "1353530", "Bacteria", "Bacteria", "107", "4.94e-26", "", "NR", "WP_021278338.1", "1353530", "g15809", "i0", "44.8", "2.81882770870337", "134", "57", "71.4", "3", "6", "407", "38", "154", "WP_021278338.1 GAF domain-containing protein [Bacteriovorax sp. DB6_IX]", "diamond", "1587", "107", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax sp. DB6_IX"], [29977592, "PRJNA1195374_P_NODE_71791_length_251_cov_0.865169_g71447_i0", "PRJNA1195374", "71791", "251", "0.865169", "2.17157419", "Bdellovibrio sp. NC", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "56.2", "1.39e-7", "", "NR", "WP_142697642.1", "2220073", "g71447", "i0", "69.4", "0.430278884462151", "36", "11", "43", "0", "129", "236", "2", "37", "WP_142697642.1 TIGR02530 family flagellar biosynthesis protein [Bdellovibrio sp. NC01]", "diamond", "108", "56.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [30040850, "PRJNA1195374_P_NODE_74151_length_249_cov_0.875000_g73807_i0", "PRJNA1195374", "74151", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "45.8", "0.00319", "", "NR", "MCB0339571.1", "2053517", "g73807", "i0", "31.3", "5.2289156626506", "64", "43", "75.9", "1", "59", "247", "366", "429", "MCB0339571.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "1302", "45.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30293978, "PRJNA1195374_P_NODE_46752_length_323_cov_1.492000_g46408_i0", "PRJNA1195374", "46752", "323", "1.492", "4.81916", "Pseudobdellovibrio sp.", "2862747", "Bacteria", "Bacteria", "80.1", "1.51e-16", "", "NR", "MFN3697587.1", "2862747", "g46408", "i0", "55.9", "0.631578947368421", "68", "30", "63.2", "0", "210", "7", "30", "97", "MFN3697587.1 Hsp20/alpha crystallin family protein [Pseudobdellovibrio sp.]", "diamond", "204", "80.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp."], [30325752, "PRJNA1195374_P_NODE_79932_length_245_cov_0.895349_g79588_i0", "PRJNA1195374", "79932", "245", "0.895349", "2.19360505", "Halobacteriovoraceae bacterium", "2026745", "Bacteria", "Bacteria", "72.8", "1e-12", "", "NR", "MCB9060932.1", "2026745", "g79588", "i0", "46.3", "2.98775510204082", "82", "41", "99.2", "2", "243", "1", "559", "638", "MCB9060932.1 BspA family leucine-rich repeat surface protein [Halobacteriovoraceae bacterium]", "diamond", "732", "72.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", null, "Halobacteriovoraceae bacterium"], [30514734, "PRJNA1195374_P_NODE_40513_length_351_cov_0.726619_g40169_i0", "PRJNA1195374", "40513", "351", "0.726619", "2.55043269", "Micavibrio sp.", "2024841", "Bacteria", "Bacteria", "114", "1.7600000000000003e-27", "", "NR", "MFA5591951.1", "2024841", "g40169", "i0", "55.4", "1.76923076923077", "101", "45", "86.3", "0", "48", "350", "2", "102", "MFA5591951.1 acyl-CoA dehydrogenase [Micavibrio sp.]", "diamond", "621", "114", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio sp."], [30798956, "PRJNA1195374_P_NODE_24014_length_463_cov_1.992308_g23670_i0", "PRJNA1195374", "24014", "463", "1.992308", "9.22438604", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "167", "1.29e-49", "", "NR", "MCB0370127.1", "2053517", "g23670", "i0", "88.8", "0.634989200863931", "98", "9", "62.2", "1", "289", "2", "72", "169", "MCB0370127.1 40S ribosomal protein S14 [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "294", "167", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [30894077, "PRJNA1195374_P_NODE_57954_length_285_cov_1.287736_g57610_i0", "PRJNA1195374", "57954", "285", "1.287736", "3.6700476", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "65.9", "1.86e-10", "", "NR", "WP_331337745.1", "28201", "g57610", "i0", "46.3", "1.36842105263158", "67", "36", "70.5", "0", "3", "203", "175", "241", "WP_331337745.1 HEAT repeat domain-containing protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "390", "65.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [31146256, "PRJNA1195374_P_NODE_74275_length_249_cov_0.875000_g73931_i0", "PRJNA1195374", "74275", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "124", "3.19e-31", "", "NR", "MBU6376802.1", "2053517", "g73931", "i0", "72", "14.8192771084337", "82", "23", "98.8", "0", "247", "2", "364", "445", "MBU6376802.1 L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "3690", "124", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [31956250, "PRJNA1195374_P_NODE_68477_length_257_cov_1.304348_g68133_i0", "PRJNA1195374", "68477", "257", "1.304348", "3.35217436", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "42.7", "0.0354", "", "NR", "MBT3235718.1", "2053517", "g68133", "i0", "36.1", "1.96108949416342", "83", "42", "96.9", "3", "250", "2", "59", "130", "MBT3235718.1 thiopurine S-methyltransferase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "504", "42.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32727632, "PRJNA1195374_P_NODE_13240_length_617_cov_1.597426_g12903_i0", "PRJNA1195374", "13240", "617", "1.597426", "9.85611842", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "205", "2.19e-63", "", "NR", "MBX9767865.1", "2053517", "g12903", "i0", "54.2", "0.860615883306321", "177", "81", "86.1", "0", "617", "87", "25", "201", "MBX9767865.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "531", "205", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [32853474, "PRJNA1195374_P_NODE_69020_length_255_cov_2.538462_g68676_i0", "PRJNA1195374", "69020", "255", "2.538462", "6.4730781", "Oligoflexia bacterium", "2599941", "Bacteria", "Bacteria", "99.4", "1e-23", "", "NR", "MCO5142558.1", "2599941", "g68676", "i0", "55", "2.87058823529412", "80", "36", "94.1", "0", "254", "15", "115", "194", "MCO5142558.1 FMN-binding negative transcriptional regulator [Oligoflexia bacterium]", "diamond", "732", "99.4", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", null, null, null, "Oligoflexia bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 24, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA1195374", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA1195374", "label": "PRJNA1195374", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 24, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1195374", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 436.2971710070269}