{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA1144090\" and tax_phylum = \"Tubulinea\"", "rows": [[1561928, "PRJNA1144090_P_NODE_4222_length_1374_cov_5.331284_g3961_i0", "PRJNA1144090", "4222", "1374", "5.331284", "73.25184216", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "455", "1.5699999999999997e-155", "", "NR", "AAY34140.1", "5778", "g3961", "i0", "64.8", "4.22707423580786", "369", "125", "79.7", "3", "1360", "266", "1", "368", "AAY34140.1 Nop58p, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "5808", "455", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [1561962, "PRJNA1144090_P_NODE_46002_length_377_cov_3.108553_g45467_i0", "PRJNA1144090", "46002", "377", "3.108553", "11.71924481", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "87", "1.23e-17", "", "NR", "BAF75060.1", "5775", "g45467", "i0", "38.9", "0.89920424403183", "113", "46", "89.9", "1", "37", "375", "5", "94", "BAF75060.1 aquaporin [Amoeba proteus]", "diamond", "339", "87", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [2838485, "PRJNA1144090_P_NODE_75083_length_291_cov_2.756881_g74548_i0", "PRJNA1144090", "75083", "291", "2.756881", "8.02252371", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "115", "4.24e-29", "", "NR", "BAF75060.1", "5775", "g74548", "i0", "55.8", "0.979381443298969", "95", "42", "97.9", "0", "1", "285", "85", "179", "BAF75060.1 aquaporin [Amoeba proteus]", "diamond", "285", "115", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [5390049, "PRJNA1144090_P_NODE_106605_length_246_cov_3.763006_g106070_i0", "PRJNA1144090", "106605", "246", "3.763006", "9.25699476", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "145", "1.62e-39", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g106070", "i0", "90", "0.975609756097561", "80", "8", "97.6", "0", "6", "245", "384", "463", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "240", "145", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [5390643, "PRJNA1144090_P_NODE_55265_length_342_cov_1.698885_g54730_i0", "PRJNA1144090", "55265", "342", "1.698885", "5.8101867", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "88.2", "6.47e-20", "", "NR", "AAX99356.1", "5778", "g54730", "i0", "46.4", "0.736842105263158", "84", "45", "73.7", "0", "321", "70", "4", "87", "AAX99356.1 guanine deaminase-like protein, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "252", "88.2", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [9215507, "PRJNA1144090_P_NODE_5468_length_1222_cov_32.539600_g5167_i0", "PRJNA1144090", "5468", "1222", "32.5396", "397.633912", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "630", "5.099999999999998e-225", "", "NR", "AAP88974.1", "5775", "g5167", "i0", "78.5", "0.957446808510638", "390", "82", "95.7", "1", "1221", "52", "1", "388", "AAP88974.1 S-adenosylmethionine synthetase 2 [Amoeba proteus]", "diamond", "1170", "630", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [11765835, "PRJNA1144090_P_NODE_2990_length_1592_cov_101.592495_g2792_i0", "PRJNA1144090", "2990", "1592", "101.592495", "1617.3525204", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "771", "1.7e-277", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g2792", "i0", "81.7", "3.46356783919598", "464", "79", "86.3", "1", "22", "1395", "1", "464", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "5514", "771", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [15590109, "PRJNA1144090_P_NODE_33_length_5632_cov_7.663249_g25_i0", "PRJNA1144090", "33", "5632", "7.663249", "431.59418368", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "609", "1.1799999999999999e-179", "", "NR", "AAD33718.1", "5775", "g25", "i0", "51.8", "0.347301136363636", "652", "272", "34", "13", "2", "1918", "295", "917", "AAD33718.1 myosin heavy chain [Amoeba proteus]", "diamond", "1956", "609", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [16335408, "PRJNA1144090_P_NODE_16013_length_690_cov_3.298217_g15509_i0", "PRJNA1144090", "16013", "690", "3.298217", "22.7576973", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "287", "2.52e-85", "", "NR", "AAD33718.1", "5775", "g15509", "i0", "65.5", "1.03478260869565", "238", "72", "100", "6", "1", "690", "67", "302", "AAD33718.1 myosin heavy chain [Amoeba proteus]", "diamond", "714", "287", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [18139195, "PRJNA1144090_P_NODE_53915_length_346_cov_4.402930_g53380_i0", "PRJNA1144090", "53915", "346", "4.40293", "15.2341378", "Nolandella sp. ATCC 5", "1908693", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "171", "4.77e-50", "", "NR", "ACA04827.1", "498005", "g53380", "i0", "71.1", "7.82947976878613", "114", "33", "98.8", "0", "3", "344", "92", "205", "ACA04827.1 beta-tubulin, partial [Nolandella sp. ATCC 50913]", "diamond", "2709", "171", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Nolandella", "Nolandella sp. ATCC 50913"], [24513073, "PRJNA1144090_P_NODE_3000_length_1590_cov_113.974291_g2792_i1", "PRJNA1144090", "3000", "1590", "113.974291", "1812.1912269", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "771", "1.64e-277", "", "NR", "BAN33737.1", "931554", "g2792", "i1", "81.7", "3.46792452830189", "464", "79", "86.4", "1", "1571", "198", "1", "464", "BAN33737.1 elongation factor-like protein [Copromyxa protea]", "diamond", "5514", "771", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [26721816, "PRJNA1144090_P_NODE_103721_length_248_cov_1.731429_g103186_i0", "PRJNA1144090", "103721", "248", "1.731429", "4.29394392", "Vermamoeba vermiformis", "5778", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "110", "7.67e-26", "", "NR", "ACA13172.1", "5778", "g103186", "i0", "63.4", "0.991935483870968", "82", "30", "99.2", "0", "248", "3", "182", "263", "ACA13172.1 mismatch repair MutS-like protein, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "246", "110", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [27418419, "PRJNA1144090_P_NODE_71783_length_298_cov_2.195556_g71248_i0", "PRJNA1144090", "71783", "298", "2.195556", "6.54275688", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "123", "4.369999999999999e-31", "", "NR", "AAD37351.1", "5775", "g71248", "i0", "75.9", "0.795302013422819", "79", "18", "79.5", "1", "237", "1", "86", "163", "AAD37351.1 pepstatin-insensitive carboxyl proteinase 1, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "237", "123", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [27481269, "PRJNA1144090_P_NODE_26383_length_517_cov_3.128378_g25850_i0", "PRJNA1144090", "26383", "517", "3.128378", "16.17371426", "Copromyxa protea", "931554", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "207", "5.8600000000000005e-64", "", "NR", "AKA62191.1", "931554", "g25850", "i0", "61.2", "0.986460348162476", "170", "63", "97.5", "2", "1", "504", "84", "252", "AKA62191.1 putative rhodoquinone biosynthesis methyltransferase-like protein RQUA [Copromyxa protea]", "diamond", "510", "207", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Hartmannellidae", "Copromyxa", "Copromyxa protea"], [28901972, "PRJNA1144090_P_NODE_95728_length_256_cov_1.573770_g95193_i0", "PRJNA1144090", "95728", "256", "1.57377", "4.0288512", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "83.2", "2.58e-16", "", "NR", "AKN09694.1", "5775", "g95193", "i0", "46.8", "1.1015625", "94", "39", "98.4", "3", "256", "5", "343", "435", "AKN09694.1 Gem1 [Amoeba proteus]", "diamond", "282", "83.2", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [28965470, "PRJNA1144090_P_NODE_89968_length_264_cov_3.581152_g89433_i0", "PRJNA1144090", "89968", "264", "3.581152", "9.45424128", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "112", "4.37e-28", "", "NR", "BAF75060.1", "5775", "g89433", "i0", "69.7", "0.863636363636364", "76", "23", "86.4", "0", "3", "230", "209", "284", "BAF75060.1 aquaporin [Amoeba proteus]", "diamond", "228", "112", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [29344255, "PRJNA1144090_P_NODE_47469_length_371_cov_1.550336_g46934_i0", "PRJNA1144090", "47469", "371", "1.550336", "5.75174656", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "146", "1.35e-40", "", "NR", "AKN09689.1", "5775", "g46934", "i0", "58.5", "0.994609164420485", "123", "51", "99.5", "0", "369", "1", "131", "253", "AKN09689.1 Tom20 [Amoeba proteus]", "diamond", "369", "146", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [29470198, "PRJNA1144090_P_NODE_98070_length_252_cov_2.150838_g97535_i0", "PRJNA1144090", "98070", "252", "2.150838", "5.42011176", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "79", "6.51e-15", "", "NR", "AAD37351.1", "5775", "g97535", "i0", "78.4", "1.5952380952381", "51", "10", "60.7", "1", "252", "100", "161", "210", "AAD37351.1 pepstatin-insensitive carboxyl proteinase 1, partial [Amoeba proteus]", "diamond", "402", "79", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [29659461, "PRJNA1144090_P_NODE_29290_length_487_cov_2.577295_g28756_i0", "PRJNA1144090", "29290", "487", "2.577295", "12.55142665", "Rhizamoeba sp. ATCC 5", "2909502", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "176", "1.42e-47", "", "NR", "AEH95280.1", "497999", "g28756", "i0", "54.9", "6.87474332648871", "162", "73", "99.8", "0", "487", "2", "448", "609", "AEH95280.1 RNA polymerase II largest subunit, partial [Rhizamoeba sp. ATCC 50933]", "diamond", "3348", "176", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Leptomyxida", "Flabellulidae", "Rhizamoeba", "Rhizamoeba sp. ATCC 50933"], [30281051, "PRJNA1144090_P_NODE_57972_length_333_cov_3.130769_g57437_i0", "PRJNA1144090", "57972", "333", "3.130769", "10.42546077", "Eukaryota", "2759", "unresolved_Eukaryota", "other_Eukaryota", "158", "1.3799999999999998e-47", "", "NR", "AAX57202.1", "5778", "g57437", "i0", "69.1", "9.90990990990991", "110", "33", "99.1", "1", "2", "331", "18", "126", "AAX57202.1 vacuolar protein sorting protein 26, partial [Vermamoeba vermiformis]", "diamond", "3300", "158", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Echinamoebida", null, null, "Vermamoeba", "Vermamoeba vermiformis"], [31239478, "PRJNA1144090_P_NODE_90335_length_264_cov_1.612565_g89800_i0", "PRJNA1144090", "90335", "264", "1.612565", "4.2571716", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "81.3", "4.63e-16", "", "NR", "AKN09693.1", "5775", "g89800", "i0", "47.4", "0.886363636363636", "78", "41", "88.6", "0", "240", "7", "50", "127", "AKN09693.1 metaxin [Amoeba proteus]", "diamond", "234", "81.3", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"], [31461159, "PRJNA1144090_P_NODE_15776_length_696_cov_3.073836_g15280_i0", "PRJNA1144090", "15776", "696", "3.073836", "21.39389856", "Amoeba proteus", "5775", "Tubulinea", "other_Eukaryota", "201", "3.2e-60", "", "NR", "AKN09689.1", "5775", "g15280", "i0", "46.7", "0.969827586206897", "225", "106", "96.6", "3", "1", "672", "69", "280", "AKN09689.1 Tom20 [Amoeba proteus]", "diamond", "675", "201", "1", "Eukaryota", "Amoebozoa", null, "Tubulinea", "Elardia", "Euamoebida", "Amoebidae", "Amoeba", "Amoeba proteus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA1144090", "p2": "Tubulinea"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "PRJNA1144090", "label": "PRJNA1144090", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Amoebozoa", "label": "Amoebozoa", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea&tax_clade=Amoebozoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090&tax_phylum=Tubulinea", "results": [{"value": "Tubulinea", "label": "Tubulinea", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1144090", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 204.9918120028451}