{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA1105232\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[15515178, "PRJNA1105232_S_NODE_11533_length_190_cov_1.475177_g11317_i0", "PRJNA1105232", "11533", "190", "1.475177", "2.8028363", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "107", "2.08e-25", "", "NR", "HWU43318.1", "28201", "g11317", "i0", "87.1", "10.7368421052632", "62", "8", "97.9", "0", "3", "188", "347", "408", "HWU43318.1 polyribonucleotide nucleotidyltransferase [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "2040", "108", "0.990740740740741", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [18064286, "PRJNA1105232_S_NODE_9795_length_204_cov_1.206452_g9579_i0", "PRJNA1105232", "9795", "204", "1.206452", "2.46116208", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "141", "3.84e-41", "", "NR", "HWU43228.1", "28201", "g9579", "i0", "100", "1", "68", "0", "100", "0", "204", "1", "46", "113", "HWU43228.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "204", "141", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [20146787, "PRJNA1105232_S_NODE_4916_length_267_cov_3.100917_g4700_i0", "PRJNA1105232", "4916", "267", "3.100917", "8.27944839", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "109", "1.67e-25", "", "NR", "MCB0385061.1", "2053517", "g4700", "i0", "73.3", "5.25842696629214", "75", "20", "84.3", "0", "14", "238", "285", "359", "MCB0385061.1 S8 family peptidase [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "1404", "109", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [26719140, "PRJNA1105232_S_NODE_8521_length_215_cov_1.006024_g8305_i0", "PRJNA1105232", "8521", "215", "1.006024", "2.1629516", "Halobacteriovorax sp.", "2020862", "Bacteria", "Bacteria", "111", "2.53e-28", "", "NR", "MAE58778.1", "2020862", "g8305", "i0", "70.4", "0.990697674418605", "71", "21", "99.1", "0", "213", "1", "146", "216", "MAE58778.1 type 1 glutamine amidotransferase domain-containing protein [Halobacteriovorax sp.]", "diamond", "213", "111", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax sp."], [27036075, "PRJNA1105232_S_NODE_15562_length_168_cov_0.873950_g15346_i0", "PRJNA1105232", "15562", "168", "0.87395", "1.468236", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "98.2", "3.4e-24", "", "NR", "HND85665.1", "2026715", "g15346", "i0", "80", "0.982142857142857", "55", "11", "98.2", "0", "167", "3", "12", "66", "HND85665.1 translation initiation factor IF-2 [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "165", "98.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [27099251, "PRJNA1105232_S_NODE_4142_length_285_cov_4.686441_g3926_i0", "PRJNA1105232", "4142", "285", "4.686441", "13.35635685", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "85.5", "5.21e-17", "", "NR", "MAE74034.1", "2026715", "g3926", "i0", "52.7", "0.978947368421053", "93", "43", "96.8", "1", "5", "280", "359", "451", "MAE74034.1 hypothetical protein [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "279", "85.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [28457433, "PRJNA1105232_S_NODE_12226_length_185_cov_3.058824_g12010_i0", "PRJNA1105232", "12226", "185", "3.058824", "5.6588244", "Bdellovibrionia bacterium", "3034169", "Bacteria", "Bacteria", "116", "1.99e-29", "", "NR", "MFP5520261.1", "3034169", "g12010", "i0", "91.8", "2.95135135135135", "61", "5", "98.9", "0", "3", "185", "267", "327", "MFP5520261.1 recombinase RecA [Bdellovibrionia bacterium]", "diamond", "546", "116", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", null, null, null, "Bdellovibrionia bacterium"], [29562260, "PRJNA1105232_S_NODE_7490_length_226_cov_1.762712_g7274_i0", "PRJNA1105232", "7490", "226", "1.762712", "3.98372912", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "68.6", "7.54e-12", "", "NR", "MCB0416831.1", "2053517", "g7274", "i0", "50", "0.902654867256637", "68", "34", "90.3", "0", "221", "18", "138", "205", "MCB0416831.1 DUF1028 domain-containing protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "204", "68.6", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29656708, "PRJNA1105232_S_NODE_6090_length_245_cov_2.561224_g5874_i0", "PRJNA1105232", "6090", "245", "2.561224", "6.2749988", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "58.5", "7.82e-8", "", "NR", "MBS1971504.1", "2053517", "g5874", "i0", "72.4", "3.66122448979592", "76", "21", "93.1", "0", "18", "245", "150", "225", "MBS1971504.1 hypothetical protein [Bdellovibrionales bacterium]", "diamond", "897", "58.5", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [29869471, "PRJNA1105232_S_NODE_18771_length_152_cov_2.252427_g18555_i0", "PRJNA1105232", "18771", "152", "2.252427", "3.42368904", "Bacteria", "2", "Bacteria", "Bacteria", "64.7", "1.18e-11", "", "NR", "MEZ0393028.1", "2026715", "g18555", "i0", "76", "2.96052631578947", "50", "12", "98.7", "0", "3", "152", "46", "95", "MEZ0393028.1 50S ribosomal protein L18 [Pseudobdellovibrionaceae bacterium]", "diamond", "450", "64.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [30920974, "PRJNA1105232_S_NODE_11834_length_188_cov_1.496403_g11618_i0", "PRJNA1105232", "11834", "188", "1.496403", "2.81323764", "uncultured Bdellovibrio sp.", "239744", "Bacteria", "Bacteria", "46.2", "0.00105", "", "NR", "WP_295900119.1", "239744", "g11618", "i0", "46.9", "0.781914893617021", "49", "25", "78.2", "1", "2", "148", "199", "246", "WP_295900119.1 porin [uncultured Bdellovibrio sp.]", "diamond", "147", "46.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "uncultured Bdellovibrio sp."], [31101522, "PRJNA1105232_S_NODE_6235_length_243_cov_2.139175_g6019_i0", "PRJNA1105232", "6235", "243", "2.139175", "5.19819525", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "82.8", "2.87e-16", "", "NR", "WP_290732337.1", "2014617", "g6019", "i0", "55.8", "3.88888888888889", "77", "30", "95.1", "1", "3", "233", "559", "631", "WP_290732337.1 prolyl oligopeptidase family serine peptidase [Halobacteriovorax sp. JY17]", "diamond", "945", "82.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Halobacteriovoraceae", "Halobacteriovorax", "Halobacteriovorax sp. JY17"], [31173221, "PRJNA1105232_S_NODE_13635_length_177_cov_1.218750_g13419_i0", "PRJNA1105232", "13635", "177", "1.21875", "2.1571875", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "63.9", "2.75e-11", "", "NR", "MBO9668465.1", "28201", "g13419", "i0", "60.4", "0.898305084745763", "53", "21", "89.8", "0", "164", "6", "1", "53", "MBO9668465.1 hypothetical protein [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "159", "63.9", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [31417813, "PRJNA1105232_S_NODE_9596_length_205_cov_3.000000_g9380_i0", "PRJNA1105232", "9596", "205", "3", "6.15", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "119", "6.1099999999999994e-30", "", "NR", "HEY1079752.1", "28201", "g9380", "i0", "92.5", "12.7463414634146", "67", "5", "98", "0", "3", "203", "366", "432", "HEY1079752.1 ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "2613", "119", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [32344226, "PRJNA1105232_S_NODE_14579_length_172_cov_1.268293_g14363_i0", "PRJNA1105232", "14579", "172", "1.268293", "2.18146396", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "110", "1.89e-26", "", "NR", "WP_015089232.1", "959", "g14363", "i0", "94.7", "1.98837209302326", "57", "3", "99.4", "0", "1", "171", "12", "68", "WP_015089232.1 fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein subunit [Bdellovibrio bacteriovorus]", "diamond", "342", "110", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [32597073, "PRJNA1105232_S_NODE_10980_length_194_cov_1.434483_g10764_i0", "PRJNA1105232", "10980", "194", "1.434483", "2.78289702", "Bdellovibrio sp.", "28201", "Bacteria", "Bacteria", "87.8", "2.59e-18", "", "NR", "HWU41837.1", "28201", "g10764", "i0", "76.6", "1.97938144329897", "64", "15", "99", "0", "193", "2", "845", "908", "HWU41837.1 chromosome segregation protein SMC [Bdellovibrio sp.]", "diamond", "384", "87.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [32785732, "PRJNA1105232_S_NODE_17100_length_163_cov_0.859649_g16884_i0", "PRJNA1105232", "17100", "163", "0.859649", "1.40122787", "Bdellovibrio sp. GT3", "3136282", "Bacteria", "Bacteria", "74.7", "5.53e-14", "", "NR", "WP_340598136.1", "3136282", "g16884", "i0", "69.8", "1.95092024539877", "53", "15", "95.7", "1", "7", "162", "112", "164", "WP_340598136.1 S8 family peptidase [Bdellovibrio sp. GT3]", "diamond", "318", "74.7", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. GT3"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 17, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA1105232", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA1105232", "label": "PRJNA1105232", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1105232", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 198.50308400054928}