{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJNA1047551\" and tax_phylum = \"Bacillariophyta\"", "rows": [[12488741, "PRJNA1047551_S_NODE_10390_length_165_cov_4.761538_g10263_i0", "PRJNA1047551", "10390", "165", "4.761538", "7.8565377", "Bacillariophyceae", "33849", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "71.2", "8.64e-13", "", "NR", "VEU45061.1", "183589", "g10263", "i0", "97.1", "2.47272727272727", "34", "1", "61.8", "0", "163", "62", "310", "343", "VEU45061.1 unnamed protein product [Pseudo-nitzschia multistriata]", "diamond", "408", "71.2", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Pseudo-nitzschia", "Pseudo-nitzschia multistriata"], [26623651, "PRJNA1047551_S_NODE_1741_length_338_cov_2.438944_g1614_i0", "PRJNA1047551", "1741", "338", "2.438944", "8.24363072", "Fistulifera solaris", "1519565", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "69.3", "1.21e-12", "", "NR", "GAX11566.1", "1519565", "g1614", "i0", "57.1", "1.99704142011834", "56", "19", "45.3", "1", "6", "158", "44", "99", "GAX11566.1 chaperonin GroES [Fistulifera solaris]", "diamond", "675", "69.3", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Fistulifera", "Fistulifera solaris"], [27161428, "PRJNA1047551_S_NODE_3302_length_256_cov_2.796380_g3175_i0", "PRJNA1047551", "3302", "256", "2.79638", "7.1587328", "Cyclostephanos tholiformis", "382380", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "90.5", "1.44e-19", "", "NR", "KAL3810479.1", "382380", "g3175", "i0", "90", "0.5859375", "50", "5", "58.6", "0", "254", "105", "252", "301", "KAL3810479.1 hypothetical protein ACHAXA_010173 [Cyclostephanos tholiformis]", "diamond", "150", "90.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclostephanos", "Cyclostephanos tholiformis"], [27256502, "PRJNA1047551_S_NODE_9623_length_170_cov_1.925926_g9496_i0", "PRJNA1047551", "9623", "170", "1.925926", "3.2740742", "Nitzschia inconspicua", "303405", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "60.1", "1.05e-8", "", "NR", "KAG7340592.1", "303405", "g9496", "i0", "81.8", "1.16470588235294", "33", "6", "58.2", "0", "155", "57", "831", "863", "KAG7340592.1 elongation factor EF-2 [Nitzschia inconspicua]", "diamond", "198", "60.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Nitzschia", "Nitzschia inconspicua"], [27446362, "PRJNA1047551_S_NODE_13423_length_151_cov_1.689655_g13296_i0", "PRJNA1047551", "13423", "151", "1.689655", "2.55137905", "Fragilaria crotonensis", "210448", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "62.4", "5.26e-10", "", "NR", "KAI2502065.1", "210448", "g13296", "i0", "93.1", "0.576158940397351", "29", "2", "57.6", "0", "146", "60", "197", "225", "KAI2502065.1 hypothetical protein MHU86_12384 [Fragilaria crotonensis]", "diamond", "87", "62.4", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Fragilariophyceae", "Fragilariales", "Fragilariaceae", "Fragilaria", "Fragilaria crotonensis"], [28045970, "PRJNA1047551_S_NODE_6205_length_200_cov_1.181818_g6078_i0", "PRJNA1047551", "6205", "200", "1.181818", "2.363636", "Seminavis robusta", "568900", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "50.1", "5.39e-5", "", "NR", "CAB9503380.1", "568900", "g6078", "i0", "95.7", "0.345", "23", "1", "34.5", "0", "199", "131", "375", "397", "CAB9503380.1 Acetyl-CoA acetyltransferase [Seminavis robusta]", "diamond", "69", "50.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Seminavis", "Seminavis robusta"], [28298517, "PRJNA1047551_S_NODE_12086_length_157_cov_1.172131_g11959_i0", "PRJNA1047551", "12086", "157", "1.172131", "1.84024567", "Seminavis robusta", "568900", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "58.2", "4.05e-8", "", "NR", "CAB9521096.1", "568900", "g11959", "i0", "61.4", "0.840764331210191", "44", "17", "84.1", "0", "12", "143", "806", "849", "CAB9521096.1 expressed unknown protein [Seminavis robusta]", "diamond", "132", "58.2", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Seminavis", "Seminavis robusta"], [28488141, "PRJNA1047551_S_NODE_6867_length_192_cov_1.656051_g6740_i0", "PRJNA1047551", "6867", "192", "1.656051", "3.17961792", "Mayamaea pseudoterrestris", "2872254", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "64.7", "3.34e-10", "", "NR", "GKY97133.1", "2872254", "g6740", "i0", "56.7", "2.84375", "60", "21", "85.9", "1", "190", "26", "499", "558", "GKY97133.1 hypothetical protein MPSEU_000671700 [Mayamaea pseudoterrestris]", "diamond", "546", "64.7", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Mayamaea", "Mayamaea pseudoterrestris"], [28803557, "PRJNA1047551_S_NODE_10288_length_166_cov_1.687023_g10161_i0", "PRJNA1047551", "10288", "166", "1.687023", "2.80045818", "Cyclotella atomus", "382360", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "61.6", "2.55e-9", "", "NR", "KAL3785207.1", "382360", "g10161", "i0", "88.2", "0.614457831325301", "34", "4", "61.4", "0", "19", "120", "295", "328", "KAL3785207.1 hypothetical protein ACHAWO_011952 [Cyclotella atomus]", "diamond", "102", "61.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella atomus"], [28803568, "PRJNA1047551_S_NODE_7288_length_188_cov_1.490196_g7161_i0", "PRJNA1047551", "7288", "188", "1.490196", "2.80156848", "Nitzschia inconspicua", "303405", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "75.9", "2.42e-14", "", "NR", "KAG7356048.1", "303405", "g7161", "i0", "81.3", "1.02127659574468", "64", "7", "94.1", "1", "182", "6", "269", "332", "KAG7356048.1 RRM domain containing RNA-binding protein [Nitzschia inconspicua]", "diamond", "192", "75.9", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Nitzschia", "Nitzschia inconspicua"], [28930121, "PRJNA1047551_S_NODE_4048_length_235_cov_1.520000_g3921_i0", "PRJNA1047551", "4048", "235", "1.52", "3.572", "Cyclotella cryptica", "29204", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "102", "4.63e-25", "", "NR", "KAL3791235.1", "29204", "g3921", "i0", "87", "0.68936170212766", "54", "7", "68.9", "0", "220", "59", "152", "205", "KAL3791235.1 hypothetical protein HJC23_000852 [Cyclotella cryptica]", "diamond", "162", "102", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella cryptica"], [29079951, "PRJNA1047551_S_NODE_9428_length_171_cov_6.007353_g9301_i0", "PRJNA1047551", "9428", "171", "6.007353", "10.27257363", "Coscinodiscophyceae", "33836", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "55.1", "2.5e-7", "", "NR", "8J7Z_A", "29205", "g9301", "i0", "100", "1.26315789473684", "24", "0", "42.1", "0", "1", "72", "158", "181", "8J7Z_A Chain A, FCP [Stephanocyclus meneghinianus]", "diamond", "216", "55.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Thalassiosirales", "Thalassiosiraceae", "Stephanocyclus", "Stephanocyclus meneghinianus"], [29277227, "PRJNA1047551_S_NODE_3689_length_244_cov_5.263158_g3562_i0", "PRJNA1047551", "3689", "244", "5.263158", "12.84210552", "Stephanodiscus triporus", "2934178", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "76.6", "1.75e-16", "", "NR", "KAL3770082.1", "2934178", "g3562", "i0", "76", "1.26639344262295", "50", "12", "61.5", "0", "225", "76", "9", "58", "KAL3770082.1 hypothetical protein ACHAW5_003458 [Stephanodiscus triporus]", "diamond", "309", "76.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Stephanodiscus", "Stephanodiscus triporus"], [29498372, "PRJNA1047551_S_NODE_8710_length_176_cov_2.489362_g8583_i0", "PRJNA1047551", "8710", "176", "2.489362", "4.38127712", "Phaeodactylum tricornutum CCAP 1", "2850", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "58.2", "2.17e-8", "", "NR", "XP_002183291.1", "556484", "g8583", "i0", "59.3", "1.89204545454545", "59", "17", "92", "2", "163", "2", "139", "195", "XP_002183291.1 protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein [Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1]", "diamond", "333", "58.2", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Phaeodactylaceae", "Phaeodactylum", "Phaeodactylum tricornutum"], [29592731, "PRJNA1047551_S_NODE_7570_length_185_cov_2.166667_g7443_i0", "PRJNA1047551", "7570", "185", "2.166667", "4.00833395", "Seminavis robusta", "568900", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "115", "1.17e-30", "", "NR", "CAB9512099.1", "568900", "g7443", "i0", "86.9", "0.989189189189189", "61", "8", "98.9", "0", "2", "184", "130", "190", "CAB9512099.1 chloroplastic [Seminavis robusta]", "diamond", "183", "115", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Seminavis", "Seminavis robusta"], [29845740, "PRJNA1047551_S_NODE_5411_length_210_cov_2.040000_g5284_i0", "PRJNA1047551", "5411", "210", "2.04", "4.284", "Cyclostephanos tholiformis", "382380", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "43.5", "0.0123", "", "NR", "KAL3810479.1", "382380", "g5284", "i0", "95.5", "0.314285714285714", "22", "1", "31.4", "0", "18", "83", "280", "301", "KAL3810479.1 hypothetical protein ACHAXA_010173 [Cyclostephanos tholiformis]", "diamond", "66", "43.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclostephanos", "Cyclostephanos tholiformis"], [29972074, "PRJNA1047551_S_NODE_8411_length_179_cov_1.361111_g8284_i0", "PRJNA1047551", "8411", "179", "1.361111", "2.43638869", "Cyclotella cryptica", "29204", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "84.3", "3.45e-17", "", "NR", "KAL3795052.1", "29204", "g8284", "i0", "78.8", "0.871508379888268", "52", "11", "87.2", "0", "179", "24", "844", "895", "KAL3795052.1 hypothetical protein HJC23_006373 [Cyclotella cryptica]", "diamond", "156", "84.3", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella cryptica"], [30129733, "PRJNA1047551_S_NODE_6412_length_197_cov_1.870370_g6285_i0", "PRJNA1047551", "6412", "197", "1.87037", "3.6846289", "Cyclostephanos tholiformis", "382380", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "60.1", "1.27e-8", "", "NR", "KAL3810479.1", "382380", "g6285", "i0", "86.1", "0.548223350253807", "36", "5", "54.8", "0", "195", "88", "266", "301", "KAL3810479.1 hypothetical protein ACHAXA_010173 [Cyclostephanos tholiformis]", "diamond", "108", "60.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclostephanos", "Cyclostephanos tholiformis"], [30572183, "PRJNA1047551_S_NODE_10513_length_165_cov_1.307692_g10386_i0", "PRJNA1047551", "10513", "165", "1.307692", "2.1576918", "Mayamaea pseudoterrestris", "2872254", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "99", "5.14e-25", "", "NR", "GKY91065.1", "2872254", "g10386", "i0", "84.9", "0.963636363636364", "53", "8", "96.4", "0", "161", "3", "71", "123", "GKY91065.1 hypothetical protein MPSEU_000079300 [Mayamaea pseudoterrestris]", "diamond", "159", "99", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Mayamaea", "Mayamaea pseudoterrestris"], [30603891, "PRJNA1047551_S_NODE_5953_length_202_cov_7.401198_g5826_i0", "PRJNA1047551", "5953", "202", "7.401198", "14.95041996", "Seminavis robusta", "568900", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "67.4", "4.4e-11", "", "NR", "CAB9521483.1", "568900", "g5826", "i0", "64.4", "0.668316831683168", "45", "16", "66.8", "0", "13", "147", "543", "587", "CAB9521483.1 expressed unknown protein [Seminavis robusta]", "diamond", "135", "67.4", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Seminavis", "Seminavis robusta"], [31299182, "PRJNA1047551_S_NODE_8695_length_176_cov_3.439716_g8568_i0", "PRJNA1047551", "8695", "176", "3.439716", "6.05390016", "Seminavis robusta", "568900", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "72.8", "3.35e-13", "", "NR", "CAB9513735.1", "568900", "g8568", "i0", "86.7", "0.767045454545455", "45", "6", "76.7", "0", "176", "42", "344", "388", "CAB9513735.1 Phosphoribulokinase, chloroplastic [Seminavis robusta]", "diamond", "135", "72.8", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Naviculales", "Naviculaceae", "Seminavis", "Seminavis robusta"], [31615494, "PRJNA1047551_S_NODE_7436_length_186_cov_4.039735_g7309_i0", "PRJNA1047551", "7436", "186", "4.039735", "7.5139071", "Didymosphenia geminata", "1115533", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "71.6", "1.51e-14", "", "NR", "YP_009329932.1", "1115533", "g7309", "i0", "52.6", "0.919354838709677", "57", "27", "91.9", "0", "173", "3", "25", "81", "YP_009329932.1 ribosomal protein S19 [Didymosphenia geminata]", "diamond", "171", "71.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Cymbellales", "Gomphonemataceae", "Didymosphenia", "Didymosphenia geminata"], [31646953, "PRJNA1047551_S_NODE_12677_length_154_cov_1.773109_g12550_i0", "PRJNA1047551", "12677", "154", "1.773109", "2.73058786", "Nitzschia inconspicua", "303405", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "56.2", "1.84e-7", "", "NR", "KAG7349058.1", "303405", "g12550", "i0", "100", "0.545454545454545", "28", "0", "54.5", "0", "3", "86", "428", "455", "KAG7349058.1 translation elongation factor EF-1 subunit alpha [Nitzschia inconspicua]", "diamond", "84", "56.2", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Bacillariophyceae", "Bacillariales", "Bacillariaceae", "Nitzschia", "Nitzschia inconspicua"], [32153352, "PRJNA1047551_S_NODE_8638_length_177_cov_1.542254_g8511_i0", "PRJNA1047551", "8638", "177", "1.542254", "2.72978958", "Fragilaria crotonensis", "210448", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "103", "3.55e-27", "", "NR", "KAI2491939.1", "210448", "g8511", "i0", "98.2", "0.932203389830508", "55", "1", "93.2", "0", "175", "11", "52", "106", "KAI2491939.1 ribosomal eL36-like protein [Fragilaria crotonensis]", "diamond", "165", "103", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Fragilariophyceae", "Fragilariales", "Fragilariaceae", "Fragilaria", "Fragilaria crotonensis"], [32879451, "PRJNA1047551_S_NODE_3640_length_246_cov_1.521327_g3513_i0", "PRJNA1047551", "3640", "246", "1.521327", "3.74246442", "Cyclotella cryptica", "29204", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "67", "1.1e-10", "", "NR", "KAL3797856.1", "29204", "g3513", "i0", "63.8", "0.707317073170732", "58", "21", "70.7", "0", "230", "57", "985", "1042", "KAL3797856.1 hypothetical protein HJC23_006894 [Cyclotella cryptica]", "diamond", "174", "67", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Bacillariophyta", "Coscinodiscophyceae", "Stephanodiscales", "Stephanodiscaceae", "Cyclotella", "Cyclotella cryptica"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 25, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJNA1047551", "p2": "Bacillariophyta"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "PRJNA1047551", "label": "PRJNA1047551", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Bacillariophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Sar", "label": "Sar", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta&tax_clade=Sar", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551&tax_phylum=Bacillariophyta", "results": [{"value": "Bacillariophyta", "label": "Bacillariophyta", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJNA1047551", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 209.74888400087366}