{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"diamond\", bioproject = \"PRJEB20058\" and tax_phylum = \"Oomycota\"", "rows": [[25792559, "PRJEB20058_P_NODE_53947_length_572_cov_10.708415_g51206_i0", "PRJEB20058", "53947", "572", "10.708415", "61.2521338", "Phytophthora pseudosyringae", "221518", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "259", "8.05e-82", "", "NR", "KAG7382785.1", "221518", "g51206", "i0", "72.7", "4.83041958041958", "187", "46", "96", "2", "549", "1", "71", "256", "KAG7382785.1 regulator of nonsense transcription [Phytophthora pseudosyringae]", "diamond", "2763", "259", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora pseudosyringae"], [25928388, "PRJEB20058_P_NODE_47028_length_613_cov_59.710145_g44327_i0", "PRJEB20058", "47028", "613", "59.710145", "366.02318885", "Phytophthora", "4783", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "114", "1.52e-25", "", "NR", "KAG2522616.1", "325452", "g44327", "i0", "52.8", "3.62153344208809", "106", "50", "51.9", "0", "585", "268", "600", "705", "KAG2522616.1 hypothetical protein JM16_003408 [Phytophthora kernoviae]", "diamond", "2220", "114", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora kernoviae"], [26331003, "PRJEB20058_P_NODE_143375_length_323_cov_20.007634_g140554_i0", "PRJEB20058", "143375", "323", "20.007634", "64.62465782", "Pythium insidiosum", "114742", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "76.3", "1.8e-15", "", "NR", "YP_009167020.1", "114742", "g140554", "i0", "52.6", "2.1733746130031", "78", "37", "72.4", "0", "76", "309", "10", "87", "YP_009167020.1 NADH dehydrogenase subunit 4L [Pythium insidiosum]", "diamond", "702", "76.3", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Pythium", "Pythium insidiosum"], [32910578, "PRJEB20058_P_NODE_140025_length_328_cov_44.779026_g137204_i0", "PRJEB20058", "140025", "328", "44.779026", "146.87520528", "Aphanomyces stellatus", "120398", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "63.5", "2.47e-9", "", "NR", "KAF0694661.1", "120398", "g137204", "i0", "57.9", "0.521341463414634", "57", "24", "52.1", "0", "284", "114", "197", "253", "KAF0694661.1 hypothetical protein As57867_014446 [Aphanomyces stellatus]", "diamond", "171", "63.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces stellatus"], [32922715, "PRJEB20058_P_NODE_102265_length_402_cov_2.252199_g99458_i0", "PRJEB20058", "102265", "402", "2.252199", "9.05383998", "Saprolegniales", "4763", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "141", "2.95e-40", "", "NR", "OQS00817.1", "74557", "g99458", "i0", "62.3", "10.2611940298507", "114", "43", "85.1", "0", "20", "361", "22", "135", "OQS00817.1 60S ribosomal protein L32-1 [Thraustotheca clavata]", "diamond", "4125", "141", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Achlyaceae", "Thraustotheca", "Thraustotheca clavata"], [32922746, "PRJEB20058_P_NODE_132745_length_341_cov_2.542857_g129925_i0", "PRJEB20058", "132745", "341", "2.542857", "8.67114237", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "59.3", "1.61e-7", "", "NR", "RLN45717.1", "325452", "g129925", "i0", "81.8", "1.74193548387097", "33", "6", "29", "0", "313", "215", "348", "380", "RLN45717.1 hypothetical protein BBI17_005902 [Phytophthora kernoviae]", "diamond", "594", "59.3", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora kernoviae"], [32940013, "PRJEB20058_P_NODE_176177_length_280_cov_3.762557_g173354_i0", "PRJEB20058", "176177", "280", "3.762557", "10.5351596", "Oomycota", "4762", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "67.4", "8.75e-11", "", "NR", "KAF1794368.1", "29920", "g173354", "i0", "66.7", "3.66428571428571", "42", "14", "45", "0", "56", "181", "1", "42", "KAF1794368.1 hypothetical protein GQ600_2384 [Phytophthora cactorum]", "diamond", "1026", "67.4", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora cactorum"], [32945587, "PRJEB20058_P_NODE_46170_length_619_cov_4.593190_g43473_i0", "PRJEB20058", "46170", "619", "4.59319", "28.4318461", "Peronospora farinosa", "134698", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "312", "1.81e-94", "", "NR", "CAI5724092.1", "134698", "g43473", "i0", "95.4", "1.69628432956381", "175", "6", "83.8", "1", "618", "100", "2126", "2300", "CAI5724092.1 unnamed protein product [Peronospora farinosa]", "diamond", "1050", "312", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Peronospora", "Peronospora farinosa"], [32962356, "PRJEB20058_P_NODE_179050_length_277_cov_2.060185_g176227_i0", "PRJEB20058", "179050", "277", "2.060185", "5.70671245", "Aphanomyces stellatus", "120398", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "44.7", "0.0115", "", "NR", "KAF0688124.1", "120398", "g176227", "i0", "35.7", "0.75812274368231", "70", "39", "69.3", "1", "245", "54", "371", "440", "KAF0688124.1 hypothetical protein As57867_020164 [Aphanomyces stellatus]", "diamond", "210", "44.7", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces stellatus"], [32962667, "PRJEB20058_P_NODE_236434_length_223_cov_4.740741_g233609_i0", "PRJEB20058", "236434", "223", "4.740741", "10.57185243", "Peronospora belbahrii", "622444", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "92.4", "3.44e-22", "", "NR", "CAH0475341.1", "622444", "g233609", "i0", "71.6", "0.901345291479821", "67", "17", "90.1", "2", "223", "23", "21", "85", "CAH0475341.1 unnamed protein product [Peronospora belbahrii]", "diamond", "201", "92.4", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Peronospora", "Peronospora belbahrii"], [32979047, "PRJEB20058_P_NODE_110387_length_384_cov_2.606811_g107575_i0", "PRJEB20058", "110387", "384", "2.606811", "10.01015424", "Globisporangium splendens", "82926", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "155", "3.29e-41", "", "NR", "KAF1334048.1", "82926", "g107575", "i0", "83", "1.3671875", "88", "15", "68.8", "0", "376", "113", "626", "713", "KAF1334048.1 Trehalase, partial [Globisporangium splendens]", "diamond", "525", "155", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Globisporangium", "Globisporangium splendens"], [32979214, "PRJEB20058_P_NODE_137315_length_333_cov_3.996324_g134494_i0", "PRJEB20058", "137315", "333", "3.996324", "13.30775892", "Globisporangium ultimum", "2052682", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "140", "5.99e-39", "", "NR", "YP_003734820.1", "2052682", "g134494", "i0", "91", "0.702702702702703", "78", "7", "70.3", "0", "22", "255", "77", "154", "YP_003734820.1 orf245 [Globisporangium ultimum]", "diamond", "234", "140", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Globisporangium", "Globisporangium ultimum"], [33008358, "PRJEB20058_P_NODE_245651_length_203_cov_10.373239_g242826_i0", "PRJEB20058", "245651", "203", "10.373239", "21.05767517", "Peronosporaceae", "4777", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "66.6", "5.98e-11", "", "NR", "XP_067742527.1", "164328", "g242826", "i0", "86.5", "1.61083743842365", "37", "5", "54.7", "0", "185", "75", "273", "309", "XP_067742527.1 uncharacterized protein KRP23_9349 [Phytophthora ramorum]", "diamond", "327", "66.6", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora ramorum"], [33025432, "PRJEB20058_P_NODE_114828_length_374_cov_35.536741_g112013_i0", "PRJEB20058", "114828", "374", "35.536741", "132.90741134", "Phytophthora", "4783", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "63.2", "4.09e-10", "", "NR", "KAG6967645.1", "29920", "g112013", "i0", "41", "4.1951871657754", "83", "41", "65.8", "2", "298", "53", "18", "93", "KAG6967645.1 hypothetical protein JG687_00004185 [Phytophthora cactorum]", "diamond", "1569", "63.5", "0.995275590551181", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora cactorum"], [33030214, "PRJEB20058_P_NODE_129820_length_346_cov_3.421053_g127001_i0", "PRJEB20058", "129820", "346", "3.421053", "11.83684338", "Phytophthora citrophthora", "4793", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "44.3", "0.0346", "", "NR", "KAK1946811.1", "4793", "g127001", "i0", "45.6", "0.494219653179191", "57", "28", "46.8", "1", "213", "52", "9", "65", "KAK1946811.1 Craniofacial development protein 2 [Phytophthora citrophthora]", "diamond", "171", "44.3", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora citrophthora"], [33042514, "PRJEB20058_P_NODE_39644_length_668_cov_11.461285_g37010_i0", "PRJEB20058", "39644", "668", "11.461285", "76.5613838", "Phytophthora", "4783", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "229", "6.5e-72", "", "NR", "XP_009536013.1", "67593", "g37010", "i0", "59.5", "1.74251497005988", "195", "75", "86.2", "2", "34", "609", "70", "263", "XP_009536013.1 hypothetical protein PHYSODRAFT_339745 [Phytophthora sojae]", "diamond", "1164", "229", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora sojae"], [33059584, "PRJEB20058_P_NODE_61805_length_532_cov_236.991507_g59043_i0", "PRJEB20058", "61805", "532", "236.991507", "1260.79481724", "Peronosporomycetes", "3418804", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "114", "2.5099999999999996e-29", "", "NR", "KAJ0391848.1", "114742", "g59043", "i0", "51.3", "2.43609022556391", "113", "55", "63.7", "0", "98", "436", "7", "119", "KAJ0391848.1 hypothetical protein P43SY_006045 [Pythium insidiosum]", "diamond", "1296", "114", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Pythium", "Pythium insidiosum"], [33076614, "PRJEB20058_P_NODE_60077_length_540_cov_38.787056_g57318_i0", "PRJEB20058", "60077", "540", "38.787056", "209.4501024", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "55.8", "2.72e-6", "", "NR", "TMW67786.1", "41045", "g57318", "i0", "38.7", "3.32222222222222", "93", "55", "50.6", "1", "159", "431", "48", "140", "TMW67786.1 hypothetical protein Poli38472_007458 [Pythium oligandrum]", "diamond", "1794", "55.8", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Pythium", "Pythium oligandrum"], [33081605, "PRJEB20058_P_NODE_183022_length_272_cov_14.360190_g180199_i0", "PRJEB20058", "183022", "272", "14.36019", "39.0597168", "Bremia lactucae", "4779", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "43.5", "0.0289", "", "NR", "XP_067815656.1", "4779", "g180199", "i0", "39.1", "0.507352941176471", "46", "28", "50.7", "0", "252", "115", "401", "446", "XP_067815656.1 hypothetical protein CCR75_009096 [Bremia lactucae]", "diamond", "138", "43.5", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Bremia", "Bremia lactucae"], [33098250, "PRJEB20058_P_NODE_10926_length_1259_cov_17.828881_g9404_i0", "PRJEB20058", "10926", "1259", "17.828881", "224.46561179", "Pythium insidiosum", "114742", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "177", "5.14e-46", "", "NR", "GLD97938.1", "114742", "g9404", "i0", "39.7", "0.569499602859412", "239", "133", "54.6", "4", "27", "713", "172", "409", "GLD97938.1 hypothetical protein PINS_up006635 [Pythium insidiosum]", "diamond", "717", "177", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Pythium", "Pythium insidiosum"], [33127680, "PRJEB20058_P_NODE_112415_length_379_cov_48.783019_g109602_i0", "PRJEB20058", "112415", "379", "48.783019", "184.88764201", "Oomycota", "4762", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "43.9", "0.0141", "", "NR", "XP_067821031.1", "4779", "g109602", "i0", "47.4", "2.98416886543536", "57", "23", "41.2", "2", "74", "229", "50", "104", "XP_067821031.1 hypothetical protein CCR75_002175 [Bremia lactucae]", "diamond", "1131", "43.9", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Bremia", "Bremia lactucae"], [33132464, "PRJEB20058_P_NODE_115735_length_373_cov_1.487179_g112920_i0", "PRJEB20058", "115735", "373", "1.487179", "5.54717767", "Globisporangium splendens", "82926", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "112", "7.810000000000001e-26", "", "NR", "KAF1336094.1", "82926", "g112920", "i0", "81.1", "0.595174262734584", "74", "13", "58.7", "1", "50", "268", "550", "623", "KAF1336094.1 Acyl-coa dehydrogenase family member 9, mitochondrial precursor, partial [Globisporangium splendens]", "diamond", "222", "112", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Globisporangium", "Globisporangium splendens"], [33144768, "PRJEB20058_P_NODE_106599_length_392_cov_5.791541_g103791_i0", "PRJEB20058", "106599", "392", "5.791541", "22.70284072", "Phytophthora", "4783", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "122", "3.5e-29", "", "NR", "RAW31032.1", "29920", "g103791", "i0", "76", "4.01785714285714", "75", "18", "57.4", "0", "266", "42", "1", "75", "RAW31032.1 hypothetical protein PC110_g12609 [Phytophthora cactorum]", "diamond", "1575", "122", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora cactorum"], [33161739, "PRJEB20058_P_NODE_152168_length_310_cov_12.767068_g149345_i0", "PRJEB20058", "152168", "310", "12.767068", "39.5779108", "Peronosporaceae", "4777", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "99.4", "1.11e-21", "", "NR", "KAG1695779.1", "4784", "g149345", "i0", "81.4", "5.16774193548387", "59", "11", "57.1", "0", "11", "187", "706", "764", "KAG1695779.1 hypothetical protein DVH05_019118 [Phytophthora capsici]", "diamond", "1602", "100", "0.994", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora capsici"], [33161748, "PRJEB20058_P_NODE_157576_length_303_cov_2.359504_g154753_i0", "PRJEB20058", "157576", "303", "2.359504", "7.14929712", "Globisporangium", "1448052", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "121", "3e-30", "", "NR", "KAF1322691.1", "82926", "g154753", "i0", "96.9", "1.93069306930693", "65", "2", "64.4", "0", "303", "109", "370", "434", "KAF1322691.1 Alcohol dehydrogenase 3, partial [Globisporangium splendens]", "diamond", "585", "122", "0.991803278688525", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Globisporangium", "Globisporangium splendens"], [33179061, "PRJEB20058_P_NODE_175584_length_281_cov_1.645455_g172761_i0", "PRJEB20058", "175584", "281", "1.645455", "4.62372855", "Globisporangium", "1448052", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "70.1", "1.37e-11", "", "NR", "KAF1336683.1", "82926", "g172761", "i0", "100", "4.44128113879004", "32", "0", "34.2", "0", "3", "98", "466", "497", "KAF1336683.1 Nadh-ubiquinone oxidoreductase, partial [Globisporangium splendens]", "diamond", "1248", "70.1", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Pythiales", "Pythiaceae", "Globisporangium", "Globisporangium splendens"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 26, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "diamond", "p1": "PRJEB20058", "p2": "Oomycota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "PRJEB20058", "label": "PRJEB20058", "count": 26, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&tax_phylum=Oomycota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "diamond", "label": "diamond", "count": 26, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 26, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "Sar", "label": "Sar", "count": 26, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota&tax_clade=Sar", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "Oomycota", "label": "Oomycota", "count": 26, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=diamond&bioproject=PRJEB20058", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 205.87490599973535}