{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA929952\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[2184533, "PRJNA929952_P_NODE_622_length_1317_cov_74.841615_g424_i0", "PRJNA929952", "622", "1317", "74.841615", "985.66406955", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "1402", "0", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g424", "i0", "85.86", "193.273348519362", "1372", "133", "100", "28", "1", "1317", "3446654", "3448019", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "254541", "1402", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [3460034, "PRJNA929952_P_NODE_1763_length_883_cov_10.576112_g253_i2", "PRJNA929952", "1763", "883", "10.576112", "93.38706896", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "135", "8.6e-27", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g253", "i2", "78.341", "10.2049830124575", "217", "41", "24", "6", "49", "262", "609805", "609592", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "9011", "135", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [3806823, "PRJNA929952_P_NODE_15103_length_265_cov_6.953390_g13809_i0", "PRJNA929952", "15103", "265", "6.95339", "18.4264835", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "412", "9.64e-111", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g13809", "i0", "94.757", "145.958490566038", "267", "11", "100", "2", "1", "265", "945277", "945012", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "38679", "412", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [10183479, "PRJNA929952_P_NODE_16988_length_244_cov_433.288372_g15694_i0", "PRJNA929952", "16988", "244", "433.288372", "1057.22362768", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "353", "5.389999999999998e-93", "", "NTclustered", "gi|2800920897|gb|CP168968.1|", "959", "g15694", "i0", "93.333", "262.180327868852", "240", "15", "98", "1", "5", "244", "1606714", "1606952", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd5 chromosome, complete genome", "blastn", "63972", "353", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [10183481, "PRJNA929952_P_NODE_17568_length_238_cov_8.650718_g16274_i0", "PRJNA929952", "17568", "238", "8.650718", "20.58870884", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "270", "5.42e-68", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g16274", "i0", "87.342", "87.0210084033613", "237", "28", "99", "2", "3", "238", "1512", "1277", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "20711", "270", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [11458523, "PRJNA929952_P_NODE_10669_length_348_cov_7.501567_g9380_i0", "PRJNA929952", "10669", "348", "7.501567", "26.10545316", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "503", "7.57e-138", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g9380", "i0", "92.614", "93.4080459770115", "352", "22", "100", "4", "1", "348", "1163", "1514", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "32506", "503", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [12734223, "PRJNA929952_P_NODE_190_length_1921_cov_54.182347_g122_i0", "PRJNA929952", "190", "1921", "54.182347", "1040.84288587", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "1435", "0", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g122", "i0", "84.015", "139.377407600208", "1564", "176", "78", "39", "419", "1921", "1676689", "1678239", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "267744", "1448", "0.991022099447514", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [12734237, "PRJNA929952_P_NODE_5230_length_544_cov_14.592233_g4180_i0", "PRJNA929952", "5230", "544", "14.592233", "79.38174752", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "889", "0", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g4180", "i0", "96.147", "92.3345588235294", "545", "20", "100", "1", "1", "544", "784366", "784910", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "50230", "889", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [13662787, "PRJNA929952_P_NODE_191_length_1919_cov_52.726984_g123_i0", "PRJNA929952", "191", "1919", "52.726984", "1011.83082296", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "1467", "0", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g123", "i0", "84.19", "139.108910891089", "1575", "182", "79", "34", "403", "1919", "3448219", "3446654", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "266950", "1467", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [17487446, "PRJNA929952_P_NODE_494_length_1420_cov_51.859813_g331_i0", "PRJNA929952", "494", "1420", "51.859813", "736.4093446", "Bdellovibrionales bacterium", "2053517", "Bacteria", "Bacteria", "894", "0", "", "NTclustered", "gi|2893356071|emb|OZ220494.1|", "2053517", "g331", "i0", "78.854", "229.026056338028", "1466", "206", "97", "67", "40", "1420", "966956", "965510", "MAG: Bdellovibrionales bacterium isolate 95f108ca-4012-4f55-a596-77f5f94b2342 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "325217", "894", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", null, null, "Bdellovibrionales bacterium"], [18760802, "PRJNA929952_P_NODE_7615_length_439_cov_6.836585_g1671_i1", "PRJNA929952", "7615", "439", "6.836585", "30.01260815", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "381", "4.759999999999999e-101", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g1671", "i1", "83.135", "165.305239179954", "421", "67", "95", "3", "1", "418", "3448494", "3448075", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "72569", "381", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [20035749, "PRJNA929952_P_NODE_12056_length_317_cov_4.065972_g10763_i0", "PRJNA929952", "12056", "317", "4.065972", "12.88913124", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "492", "1.48e-134", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g10763", "i0", "94.637", "44.7728706624606", "317", "17", "100", "0", "1", "317", "1292356", "1292672", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "14193", "492", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [20381134, "PRJNA929952_P_NODE_12356_length_311_cov_4.152482_g11063_i0", "PRJNA929952", "12356", "311", "4.152482", "12.91421902", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "553", "6.539999999999998e-153", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g11063", "i0", "98.714", "252.781350482315", "311", "4", "100", "0", "1", "311", "511507", "511197", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "78615", "553", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [22932647, "PRJNA929952_P_NODE_7398_length_446_cov_37.014388_g6186_i0", "PRJNA929952", "7398", "446", "37.014388", "165.08417048", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "652", "0", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g6186", "i0", "93.258", "191.784753363229", "445", "27", "99", "3", "2", "445", "747621", "748063", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "85536", "652", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [23861472, "PRJNA929952_P_NODE_2939_length_717_cov_44.811047_g2193_i0", "PRJNA929952", "2939", "717", "44.811047", "321.29520699", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "1153", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g2193", "i0", "96.051", "131.507670850767", "709", "26", "99", "1", "11", "717", "512512", "511804", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "94291", "1153", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [24206406, "PRJNA929952_P_NODE_6339_length_488_cov_62.607843_g5203_i0", "PRJNA929952", "6339", "488", "62.607843", "305.52627384", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "261", "7.26e-65", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g5203", "i0", "77.273", "101.762295081967", "506", "75", "97", "21", "1", "472", "1676863", "1676364", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "49660", "261", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [25135326, "PRJNA929952_P_NODE_6340_length_488_cov_48.662309_g5204_i0", "PRJNA929952", "6340", "488", "48.662309", "237.47206792", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "261", "7.26e-65", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g5204", "i0", "77.439", "100.559426229508", "492", "75", "95", "17", "27", "488", "665461", "665946", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "49073", "261", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 17, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA929952", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA929952", "label": "PRJNA929952", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 17, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA929952", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 154.41186799580464}